MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 16898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_003198	ATG	2	6	1197473	1197478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_003198	T	6	6	1197511	1197516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_003198	GC	3	6	1197589	1197594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4004	NC_003198	GTT	2	6	1197644	1197649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_003198	CGT	2	6	1197749	1197754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_003198	CGC	3	9	1197787	1197795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4007	NC_003198	GTG	2	6	1198086	1198091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_003198	GGC	2	6	1198093	1198098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_003198	TTA	2	6	1198134	1198139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_003198	GTC	2	6	1198472	1198477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_003198	GCC	2	6	1198532	1198537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_003198	CAT	2	6	1198541	1198546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_003198	CCAG	2	8	1198625	1198632	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4014	NC_003198	CCG	2	6	1198635	1198640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_003198	CAT	2	6	1198712	1198717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_003198	GCT	2	6	1198784	1198789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_003198	GAA	2	6	1198800	1198805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_003198	TTTA	2	8	1198806	1198813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_003198	TAC	2	6	1198847	1198852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_003198	GC	3	6	1198853	1198858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4021	NC_003198	TGC	2	6	1198874	1198879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_003198	T	6	6	1198931	1198936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_003198	CCAG	2	8	1199027	1199034	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4024	NC_003198	ATT	2	6	1199040	1199045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_003198	GCT	2	6	1199120	1199125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_003198	TGG	2	6	1199174	1199179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_003198	TCA	2	6	1199228	1199233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_003198	CGC	2	6	1199243	1199248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_003198	ACC	2	6	1199251	1199256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4030	NC_003198	CG	3	6	1199363	1199368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4031	NC_003198	TCA	2	6	1199426	1199431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_003198	CTG	2	6	1199451	1199456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_003198	TTC	2	6	1199562	1199567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_003198	GTC	2	6	1199587	1199592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_003198	GGC	2	6	1199628	1199633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_003198	GCG	2	6	1199677	1199682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_003198	CGG	2	6	1199704	1199709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_003198	TGAA	2	8	1199713	1199720	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_003198	CTTG	2	8	1199736	1199743	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4040	NC_003198	T	6	6	1199880	1199885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_003198	TAA	2	6	1199951	1199956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_003198	TAT	2	6	1200046	1200051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_003198	T	7	7	1203919	1203925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_003198	TTG	2	6	1204049	1204054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_003198	TTAA	2	8	1204055	1204062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_003198	TAA	2	6	1204072	1204077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_003198	TTAA	2	8	1204081	1204088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_003198	TAA	2	6	1204097	1204102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_003198	GCT	2	6	1205442	1205447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_003198	AGG	2	6	1205587	1205592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_003198	T	7	7	1206189	1206195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_003198	CGT	2	6	1206207	1206212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_003198	TC	3	6	1206877	1206882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4054	NC_003198	TAT	2	6	1206883	1206888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_003198	AAAC	2	8	1206891	1206898	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4056	NC_003198	AAAT	2	8	1206928	1206935	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_003198	TA	3	6	1206973	1206978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_003198	ATCG	2	8	1207035	1207042	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4059	NC_003198	TCA	2	6	1207082	1207087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_003198	T	6	6	1207419	1207424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_003198	GTCA	2	8	1207425	1207432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4062	NC_003198	TAA	2	6	1208238	1208243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_003198	ATT	2	6	1208251	1208256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_003198	CGC	2	6	1211859	1211864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4065	NC_003198	GCT	2	6	1211886	1211891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_003198	GC	3	6	1211904	1211909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4067	NC_003198	TAT	2	6	1211968	1211973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_003198	GTT	2	6	1211982	1211987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_003198	CCG	2	6	1212004	1212009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4070	NC_003198	GCG	2	6	1215327	1215332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_003198	A	7	7	1216244	1216250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_003198	GTT	2	6	1216254	1216259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4074	NC_003198	ACGTT	2	10	1217121	1217130	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4075	NC_003198	CTT	2	6	1219025	1219030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4077	NC_003198	TC	3	6	1219092	1219097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4078	NC_003198	CAG	2	6	1219117	1219122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4080	NC_003198	ACA	2	6	1219162	1219167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_003198	A	7	7	1219186	1219192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_003198	ATCCG	2	10	1219215	1219224	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4083	NC_003198	ATT	2	6	1219237	1219242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_003198	CGT	2	6	1219317	1219322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_003198	AAG	2	6	1220526	1220531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_003198	GAT	2	6	1220542	1220547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_003198	GGC	2	6	1220567	1220572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_003198	CTT	2	6	1220575	1220580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_003198	T	6	6	1220588	1220593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4091	NC_003198	ACC	2	6	1222737	1222742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4092	NC_003198	TTG	2	6	1222757	1222762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4095	NC_003198	CGG	2	6	1225482	1225487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4098	NC_003198	GAA	2	6	1228948	1228953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_003198	CA	3	6	1228966	1228971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4100	NC_003198	AAATA	2	10	1231008	1231017	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_003198	GGC	2	6	1232208	1232213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_003198	AAT	2	6	1233707	1233712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_003198	GGC	2	6	1233726	1233731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_003198	GTA	2	6	1233742	1233747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_003198	A	6	6	1233775	1233780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_003198	GCA	2	6	1233799	1233804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_003198	AAAAAC	2	12	1235135	1235146	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4108	NC_003198	TTA	2	6	1235232	1235237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_003198	CAA	2	6	1235290	1235295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_003198	AG	3	6	1235828	1235833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_003198	GGA	2	6	1235870	1235875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_003198	TATT	2	8	1235876	1235883	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_003198	AAG	2	6	1237031	1237036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_003198	T	7	7	1237059	1237065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_003198	T	6	6	1237071	1237076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_003198	T	7	7	1237100	1237106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_003198	TCC	2	6	1237186	1237191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4118	NC_003198	TAA	2	6	1237202	1237207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_003198	CTT	2	6	1241965	1241970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_003198	A	6	6	1241991	1241996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_003198	A	6	6	1242003	1242008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_003198	GCC	2	6	1242089	1242094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4123	NC_003198	AGAC	2	8	1242124	1242131	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4124	NC_003198	T	6	6	1242155	1242160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_003198	TAA	2	6	1242186	1242191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_003198	TGA	2	6	1242209	1242214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_003198	ATCAA	2	10	1242274	1242283	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4128	NC_003198	GCG	2	6	1243715	1243720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_003198	T	8	8	1243732	1243739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4131	NC_003198	AAG	2	6	1243771	1243776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4398	NC_003198	T	6	6	1315946	1315951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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