MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 16898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_003198	CAG	2	6	437352	437357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_003198	GC	3	6	437402	437407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1503	NC_003198	ACG	2	6	437413	437418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_003198	CGG	3	9	437447	437455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_003198	A	6	6	437549	437554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_003198	T	6	6	437559	437564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_003198	ACC	2	6	437568	437573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_003198	CG	3	6	437596	437601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_003198	ATT	2	6	437690	437695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_003198	A	7	7	442088	442094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_003198	CCG	2	6	442145	442150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_003198	ATC	2	6	442186	442191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_003198	GCC	2	6	442206	442211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_003198	T	9	9	442212	442220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_003198	TAAC	2	8	442264	442271	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1516	NC_003198	T	6	6	444441	444446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_003198	TTC	2	6	444626	444631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_003198	A	6	6	444670	444675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_003198	CGC	2	6	444676	444681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_003198	TCC	2	6	444689	444694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1521	NC_003198	ACA	2	6	444720	444725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_003198	T	6	6	446116	446121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_003198	TTA	2	6	446181	446186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_003198	CAA	2	6	446239	446244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_003198	AG	3	6	446777	446782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_003198	GGA	2	6	446819	446824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_003198	TATT	2	8	446825	446832	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_003198	TCC	2	6	448290	448295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_003198	TCC	2	6	448303	448308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_003198	TAA	2	6	448311	448316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_003198	GAT	2	6	448324	448329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_003198	TAG	2	6	448371	448376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_003198	GGT	2	6	450212	450217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_003198	ATA	2	6	450220	450225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_003198	A	6	6	450236	450241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_003198	AACGC	2	10	450912	450921	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1537	NC_003198	AGGG	2	8	450931	450938	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_003198	CAAT	2	8	450966	450973	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1539	NC_003198	ATCG	2	8	450990	450997	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1540	NC_003198	ATG	2	6	451015	451020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_003198	CGG	2	6	451055	451060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_003198	ACGC	2	8	451066	451073	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_003198	GGT	2	6	452900	452905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_003198	TTA	2	6	452956	452961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_003198	TAA	2	6	454157	454162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_003198	T	6	6	457410	457415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_003198	CTC	2	6	457476	457481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_003198	AGG	2	6	457502	457507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_003198	AG	3	6	457892	457897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_003198	TCA	2	6	458641	458646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_003198	CCTT	2	8	458662	458669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_003198	AT	3	6	458676	458681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_003198	TAT	2	6	458742	458747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_003198	CTG	2	6	459118	459123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_003198	CTCCA	2	10	459164	459173	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1556	NC_003198	ATT	2	6	459200	459205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_003198	T	6	6	459235	459240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_003198	T	7	7	459320	459326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_003198	GCA	2	6	459693	459698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_003198	GAC	2	6	459720	459725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_003198	T	6	6	459733	459738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_003198	TAT	2	6	460692	460697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_003198	TATC	2	8	460735	460742	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1564	NC_003198	GCG	2	6	460784	460789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_003198	CAA	2	6	460852	460857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_003198	TGT	2	6	461539	461544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_003198	ATC	2	6	461578	461583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_003198	GCC	2	6	461675	461680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1569	NC_003198	GT	3	6	461695	461700	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_003198	CG	3	6	461744	461749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_003198	A	6	6	461822	461827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_003198	GAT	2	6	461842	461847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_003198	GAT	2	6	461917	461922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_003198	AGC	2	6	461940	461945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_003198	A	6	6	461948	461953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_003198	GAA	2	6	462023	462028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_003198	TCGC	2	8	462030	462037	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1578	NC_003198	AGC	2	6	463176	463181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_003198	ATT	2	6	463188	463193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_003198	C	6	6	463207	463212	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1581	NC_003198	AG	3	6	463236	463241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_003198	T	6	6	463716	463721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_003198	CGAT	2	8	464180	464187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1584	NC_003198	CCG	2	6	464190	464195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1585	NC_003198	CTTTT	2	10	464204	464213	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1586	NC_003198	T	7	7	464210	464216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_003198	CTG	2	6	464217	464222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_003198	GGC	2	6	465719	465724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_003198	GCCT	2	8	465741	465748	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_003198	GCGCC	2	10	465782	465791	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1591	NC_003198	CT	3	6	469881	469886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_003198	GCA	2	6	469893	469898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_003198	GCT	2	6	470017	470022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_003198	GGC	2	6	471540	471545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_003198	AAAT	2	8	475453	475460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_003198	GAT	2	6	475473	475478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_003198	ACGAT	2	10	475505	475514	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1598	NC_003198	GCC	2	6	476301	476306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_003198	T	6	6	476327	476332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_003198	CGC	2	6	478414	478419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1601	NC_003198	TCC	2	6	479904	479909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_003198	TCA	2	6	479952	479957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_003198	TAT	2	6	479988	479993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_003198	GCAAC	2	10	479994	480003	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1605	NC_003198	GTT	2	6	480518	480523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_003198	CGC	2	6	480540	480545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_003198	TGC	2	6	480556	480561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_003198	AGT	2	6	481953	481958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_003198	A	6	6	482030	482035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_003198	TCAT	2	8	482091	482098	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1611	NC_003198	ATAGCA	2	12	482195	482206	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1612	NC_003198	TGGC	2	8	482250	482257	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1613	NC_003198	TTTGC	2	10	482277	482286	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1614	NC_003198	CAA	2	6	482355	482360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_003198	GC	3	6	482394	482399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1616	NC_003198	TCA	2	6	482421	482426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_003198	TTAT	2	8	482430	482437	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_003198	TAT	2	6	482440	482445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_003198	A	7	7	483598	483604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_003198	TC	3	6	483615	483620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1621	NC_003198	GCT	2	6	484256	484261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_003198	AAAG	2	8	485461	485468	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_003198	CGC	2	6	486396	486401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_003198	TGG	2	6	490321	490326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_003198	CG	3	6	490404	490409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_003198	TAT	2	6	490551	490556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_003198	AAATTT	2	12	490581	490592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_003198	AAT	2	6	490638	490643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_003198	AT	3	6	490675	490680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_003198	T	6	6	490680	490685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_003198	TTA	2	6	490725	490730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_003198	AAT	2	6	490739	490744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_003198	TTG	3	9	492255	492263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_003198	CAT	2	6	492894	492899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_003198	TCG	2	6	492942	492947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_003198	AAT	2	6	493039	493044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_003198	TGT	2	6	493064	493069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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