MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 16898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003198	CTG	2	6	323637	323642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_003198	GAT	2	6	323714	323719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_003198	CGA	2	6	323723	323728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_003198	AGG	2	6	323776	323781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_003198	GCG	3	9	323815	323823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_003198	AAC	2	6	323845	323850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_003198	ACCG	2	8	323894	323901	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_003198	CAG	2	6	323943	323948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_003198	T	6	6	323970	323975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_003198	A	6	6	323991	323996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_003198	GTG	2	6	324021	324026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_003198	TGAT	2	8	324055	324062	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_003198	TGC	2	6	324076	324081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_003198	CGG	2	6	324200	324205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_003198	CTG	2	6	324225	324230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_003198	CGG	2	6	324253	324258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_003198	TGG	2	6	324274	324279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_003198	GTG	2	6	324303	324308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_003198	CGGG	2	8	324323	324330	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_003198	TGG	2	6	325166	325171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_003198	GAA	2	6	325196	325201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_003198	GCAAGG	2	12	326165	326176	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1023	NC_003198	AAT	2	6	326187	326192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_003198	GAA	2	6	326228	326233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_003198	GCA	2	6	327206	327211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_003198	TGG	2	6	327247	327252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_003198	A	7	7	327256	327262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_003198	TGG	2	6	328301	328306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_003198	TTA	2	6	328359	328364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_003198	AATGC	2	10	328380	328389	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1031	NC_003198	TAA	2	6	328404	328409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_003198	ATA	2	6	328420	328425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_003198	TTAT	2	8	328443	328450	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_003198	TATGT	2	10	328464	328473	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_003198	TTC	2	6	328524	328529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_003198	TATT	2	8	328600	328607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_003198	ACG	2	6	336449	336454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_003198	TAA	2	6	339794	339799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_003198	GAAA	2	8	339806	339813	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_003198	T	6	6	339829	339834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_003198	ATT	2	6	339835	339840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_003198	ATC	2	6	340169	340174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_003198	AATC	2	8	340181	340188	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_003198	ATC	2	6	340239	340244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_003198	CGGA	2	8	340268	340275	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_003198	CCA	2	6	340315	340320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_003198	CGG	2	6	340343	340348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_003198	AAC	2	6	340425	340430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_003198	CGT	2	6	340498	340503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_003198	TGT	2	6	340518	340523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_003198	TGA	2	6	340524	340529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_003198	TGC	2	6	340633	340638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_003198	GTA	2	6	340698	340703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_003198	GAA	2	6	340733	340738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_003198	GGA	2	6	340895	340900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_003198	GGT	2	6	341052	341057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_003198	AAGG	2	8	341088	341095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_003198	GTCA	2	8	341135	341142	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_003198	TAA	2	6	341243	341248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_003198	ATGT	2	8	341269	341276	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_003198	CT	3	6	341317	341322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_003198	GTG	2	6	341349	341354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_003198	T	7	7	341479	341485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_003198	AT	3	6	341505	341510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_003198	GTT	2	6	341564	341569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_003198	CCAG	2	8	341574	341581	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_003198	CAT	2	6	341613	341618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_003198	T	6	6	341661	341666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_003198	TAT	2	6	342185	342190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_003198	ATT	2	6	342248	342253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_003198	GCT	2	6	342344	342349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_003198	GTT	2	6	342351	342356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_003198	GCTC	2	8	342363	342370	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_003198	CGG	2	6	342396	342401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_003198	TGG	2	6	342459	342464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_003198	TGA	2	6	342481	342486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_003198	ATT	2	6	342543	342548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_003198	TG	3	6	342581	342586	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_003198	G	7	7	342630	342636	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_003198	GTG	2	6	342683	342688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_003198	AT	3	6	342690	342695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_003198	GACA	2	8	342701	342708	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_003198	AAC	2	6	342800	342805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_003198	TTA	2	6	342818	342823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_003198	AATA	2	8	342830	342837	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_003198	T	7	7	342850	342856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_003198	GA	3	6	346156	346161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_003198	TGAT	2	8	346765	346772	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_003198	T	7	7	346793	346799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_003198	AAT	2	6	346828	346833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_003198	TAT	2	6	346854	346859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_003198	TTTG	2	8	346875	346882	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_003198	GTTT	2	8	346927	346934	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_003198	ATTT	2	8	347013	347020	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_003198	T	6	6	347018	347023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_003198	TGC	2	6	347885	347890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_003198	TCC	2	6	347899	347904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_003198	CAT	2	6	347907	347912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_003198	CGG	2	6	347913	347918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_003198	ATG	2	6	347944	347949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_003198	GCA	2	6	348019	348024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_003198	GTT	3	9	348102	348110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_003198	ATT	2	6	348119	348124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_003198	GAG	2	6	348188	348193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_003198	TCTGT	2	10	348239	348248	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1106	NC_003198	TCC	2	6	348250	348255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_003198	AAT	2	6	348265	348270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_003198	AAT	2	6	348299	348304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_003198	TAT	2	6	348431	348436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_003198	GATG	2	8	348525	348532	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_003198	T	6	6	348575	348580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_003198	ATG	2	6	348584	348589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_003198	CA	3	6	348608	348613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_003198	ATG	3	9	349669	349677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_003198	GGCC	2	8	349707	349714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_003198	GTC	2	6	349716	349721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_003198	ATC	2	6	349906	349911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_003198	AATC	2	8	349918	349925	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_003198	ATC	2	6	349976	349981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_003198	CGGA	2	8	350005	350012	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_003198	CCA	2	6	350052	350057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_003198	CGG	2	6	350080	350085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_003198	CTG	2	6	350178	350183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_003198	TC	3	6	350351	350356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_003198	TTTG	2	8	350373	350380	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_003198	CAG	2	6	350418	350423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_003198	GAA	2	6	350427	350432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_003198	GTT	2	6	350504	350509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_003198	TCA	2	6	350546	350551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_003198	AAC	2	6	350579	350584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_003198	CAG	2	6	350658	350663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_003198	GAC	2	6	350712	350717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_003198	CGAT	2	8	350722	350729	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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