MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 16898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_003198	TCA	2	6	2896855	2896860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_003198	ATT	2	6	2896908	2896913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_003198	CAG	2	6	2896983	2896988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_003198	GCT	3	9	2896995	2897003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_003198	T	7	7	2897003	2897009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_003198	AC	3	6	2897191	2897196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10007	NC_003198	CAAG	2	8	2897216	2897223	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10008	NC_003198	ACC	2	6	2897253	2897258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10009	NC_003198	AGC	2	6	2897272	2897277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_003198	GCC	2	6	2897337	2897342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10011	NC_003198	CT	3	6	2897403	2897408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10012	NC_003198	TCT	3	9	2897406	2897414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_003198	CCG	2	6	2897434	2897439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10014	NC_003198	TAC	2	6	2897456	2897461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_003198	ATCA	2	8	2897471	2897478	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10016	NC_003198	A	6	6	2897491	2897496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_003198	AT	3	6	2897508	2897513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_003198	TGA	2	6	2897527	2897532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_003198	AAT	2	6	2897553	2897558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_003198	CTT	2	6	2897609	2897614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10021	NC_003198	TAT	2	6	2897670	2897675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_003198	AGG	2	6	2897699	2897704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_003198	AAT	2	6	2898538	2898543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_003198	CAA	2	6	2898622	2898627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_003198	CCATCG	3	18	2898651	2898668	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10026	NC_003198	CACC	2	8	2898672	2898679	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10027	NC_003198	GCC	2	6	2898709	2898714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10028	NC_003198	ACT	2	6	2898749	2898754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_003198	AAC	2	6	2898756	2898761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_003198	CTTT	2	8	2898774	2898781	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10031	NC_003198	TGC	2	6	2898794	2898799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_003198	TAA	2	6	2898894	2898899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_003198	CAT	2	6	2898902	2898907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_003198	TTAA	2	8	2899091	2899098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_003198	AT	4	8	2899111	2899118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_003198	TAA	2	6	2899150	2899155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_003198	CTT	2	6	2899193	2899198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_003198	TA	3	6	2899911	2899916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_003198	CCCT	2	8	2899924	2899931	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10040	NC_003198	TCA	2	6	2900014	2900019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_003198	A	6	6	2900035	2900040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_003198	TGT	2	6	2900598	2900603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_003198	ATG	2	6	2900613	2900618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_003198	A	6	6	2900724	2900729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_003198	GC	3	6	2903348	2903353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10046	NC_003198	C	11	11	2903677	2903687	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10047	NC_003198	CGC	2	6	2903708	2903713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10048	NC_003198	AAT	2	6	2903723	2903728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_003198	TTC	2	6	2903729	2903734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_003198	TCC	2	6	2904961	2904966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10051	NC_003198	AAT	2	6	2905035	2905040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_003198	CGGA	2	8	2905998	2906005	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10053	NC_003198	TTG	2	6	2908476	2908481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_003198	CAC	2	6	2910077	2910082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10055	NC_003198	CGC	2	6	2910094	2910099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10056	NC_003198	AGCG	2	8	2910136	2910143	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10057	NC_003198	CAG	2	6	2910146	2910151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_003198	TGC	2	6	2910198	2910203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_003198	CAGC	2	8	2910211	2910218	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10060	NC_003198	CTGA	2	8	2910266	2910273	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10061	NC_003198	CG	3	6	2910307	2910312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10062	NC_003198	GC	3	6	2910329	2910334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10063	NC_003198	TGT	2	6	2910360	2910365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_003198	CTG	2	6	2910380	2910385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_003198	CG	3	6	2910422	2910427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10066	NC_003198	CCG	2	6	2910513	2910518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10067	NC_003198	TCCT	2	8	2910602	2910609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10068	NC_003198	TCA	2	6	2910651	2910656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_003198	CGC	2	6	2910676	2910681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10070	NC_003198	TGCGCC	2	12	2910690	2910701	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10071	NC_003198	CGC	2	6	2910768	2910773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10072	NC_003198	CGC	2	6	2910820	2910825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10073	NC_003198	CGC	2	6	2910869	2910874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10074	NC_003198	TCA	2	6	2910937	2910942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_003198	GGC	2	6	2910986	2910991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_003198	GAC	2	6	2910995	2911000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_003198	ACG	2	6	2911020	2911025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_003198	CTGGCG	2	12	2911038	2911049	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10079	NC_003198	C	6	6	2911108	2911113	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10080	NC_003198	GC	3	6	2911128	2911133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10081	NC_003198	CCCATT	2	12	2911152	2911163	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
10082	NC_003198	TGT	2	6	2911202	2911207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_003198	GTT	2	6	2911287	2911292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_003198	A	6	6	2911297	2911302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_003198	T	6	6	2911318	2911323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_003198	AAAG	2	8	2911390	2911397	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_003198	GCG	2	6	2912176	2912181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_003198	T	6	6	2912644	2912649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_003198	ACGA	2	8	2912742	2912749	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10090	NC_003198	T	7	7	2915059	2915065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_003198	CCG	2	6	2916124	2916129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10092	NC_003198	A	6	6	2917266	2917271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_003198	AAC	2	6	2917279	2917284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10094	NC_003198	TCA	2	6	2917394	2917399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_003198	CAT	3	9	2921376	2921384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_003198	TTG	2	6	2921499	2921504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_003198	GGT	2	6	2921912	2921917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_003198	GGC	2	6	2923953	2923958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_003198	T	6	6	2924892	2924897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_003198	TGAA	2	8	2924940	2924947	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_003198	AGT	2	6	2924964	2924969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_003198	A	6	6	2925006	2925011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_003198	CAGA	2	8	2926234	2926241	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10104	NC_003198	AC	3	6	2926268	2926273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10105	NC_003198	CGC	3	9	2926287	2926295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10106	NC_003198	CCG	2	6	2926361	2926366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10107	NC_003198	GC	3	6	2926421	2926426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10108	NC_003198	T	6	6	2926597	2926602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_003198	A	6	6	2926610	2926615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_003198	CCA	2	6	2926617	2926622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10111	NC_003198	CTTC	2	8	2930994	2931001	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10112	NC_003198	TATT	2	8	2932559	2932566	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_003198	TACC	2	8	2932584	2932591	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10114	NC_003198	TAC	2	6	2932643	2932648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_003198	ATAA	2	8	2932669	2932676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_003198	T	6	6	2932709	2932714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_003198	A	7	7	2932824	2932830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_003198	TAT	2	6	2932856	2932861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_003198	CCT	2	6	2932880	2932885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10120	NC_003198	A	6	6	2932890	2932895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_003198	TGC	2	6	2935162	2935167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_003198	CAG	2	6	2935170	2935175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_003198	TTACG	2	10	2935247	2935256	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10124	NC_003198	AG	3	6	2935330	2935335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_003198	TGA	2	6	2935390	2935395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_003198	CTG	2	6	2935405	2935410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10127	NC_003198	A	6	6	2935413	2935418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_003198	TCCG	2	8	2935427	2935434	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10129	NC_003198	TGG	2	6	2935442	2935447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_003198	A	7	7	2935449	2935455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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