MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 16898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003198	TTA	2	6	184013	184018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_003198	TGT	2	6	184045	184050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_003198	GAT	2	6	184103	184108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_003198	CCG	2	6	184129	184134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_003198	TCT	2	6	185581	185586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_003198	T	7	7	185635	185641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_003198	ATG	2	6	185667	185672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_003198	GCA	2	6	185709	185714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_003198	TGTC	2	8	185752	185759	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
510	NC_003198	TCA	2	6	185808	185813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_003198	ATA	2	6	185838	185843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_003198	TC	3	6	188622	188627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_003198	TGCC	2	8	188657	188664	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
514	NC_003198	T	6	6	188834	188839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_003198	T	6	6	188847	188852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_003198	CTA	2	6	188917	188922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_003198	ACT	2	6	188923	188928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_003198	CAA	2	6	188960	188965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_003198	GAG	2	6	188992	188997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_003198	GGC	2	6	191654	191659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_003198	CTG	2	6	191720	191725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_003198	T	7	7	191733	191739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_003198	GCT	2	6	191747	191752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_003198	CT	3	6	192156	192161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
525	NC_003198	CAC	2	6	192221	192226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_003198	T	6	6	192252	192257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_003198	T	6	6	192270	192275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_003198	TTA	2	6	192281	192286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_003198	TTGA	2	8	192328	192335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
530	NC_003198	CAA	2	6	192364	192369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_003198	GTG	2	6	196381	196386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_003198	CCT	2	6	197193	197198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_003198	A	7	7	198094	198100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_003198	CAT	2	6	198109	198114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_003198	ATT	2	6	198143	198148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_003198	GGA	2	6	198165	198170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_003198	CGA	2	6	198571	198576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_003198	TAT	2	6	198581	198586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_003198	TTG	2	6	198613	198618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_003198	T	6	6	202825	202830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_003198	TG	3	6	202858	202863	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_003198	TCA	2	6	202868	202873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_003198	GAAT	2	8	202902	202909	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
544	NC_003198	GCG	2	6	202946	202951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_003198	TTA	2	6	202952	202957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_003198	ATT	2	6	204319	204324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_003198	AT	3	6	204331	204336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_003198	AAGT	2	8	204353	204360	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
549	NC_003198	TCA	2	6	206111	206116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_003198	ACT	2	6	206140	206145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_003198	AGG	2	6	206155	206160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_003198	GAC	2	6	206619	206624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_003198	T	6	6	206646	206651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_003198	AT	3	6	206665	206670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_003198	TGA	2	6	209256	209261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_003198	GCGCT	2	10	209274	209283	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
557	NC_003198	CGCGT	2	10	209326	209335	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
558	NC_003198	ATA	2	6	210168	210173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_003198	TGA	2	6	210175	210180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_003198	TTGCG	2	10	210239	210248	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
561	NC_003198	TAA	2	6	211460	211465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_003198	TTC	2	6	215844	215849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_003198	TTC	2	6	215886	215891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_003198	AGA	2	6	216666	216671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_003198	TGAA	2	8	216702	216709	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
566	NC_003198	AAT	2	6	216726	216731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_003198	TTA	2	6	216802	216807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_003198	TAA	2	6	217439	217444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_003198	TAT	2	6	217520	217525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_003198	TTA	2	6	217526	217531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_003198	T	6	6	217539	217544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_003198	TTA	2	6	217600	217605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_003198	GT	3	6	217621	217626	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
574	NC_003198	T	6	6	217651	217656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_003198	AT	3	6	217672	217677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_003198	TA	3	6	217693	217698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_003198	ATT	2	6	217718	217723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_003198	ATTTA	2	10	217736	217745	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_003198	TTG	2	6	217779	217784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_003198	ATA	2	6	217790	217795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_003198	TAA	2	6	219705	219710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_003198	AG	3	6	219755	219760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
583	NC_003198	CAT	2	6	219782	219787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_003198	CGC	2	6	219791	219796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_003198	AACG	2	8	220795	220802	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
586	NC_003198	ACGC	2	8	221396	221403	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
587	NC_003198	TAA	2	6	221416	221421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_003198	GCG	2	6	222727	222732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_003198	AAAG	2	8	222734	222741	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
590	NC_003198	GA	3	6	225255	225260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_003198	TCT	3	9	225263	225271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_003198	GTC	2	6	225272	225277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_003198	GAA	2	6	225283	225288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_003198	TCC	2	6	227962	227967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_003198	ATAA	2	8	227968	227975	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_003198	TTA	2	6	227990	227995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_003198	CCTT	2	8	227998	228005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
598	NC_003198	GTT	2	6	228014	228019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_003198	CGA	2	6	228065	228070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_003198	TGC	2	6	228085	228090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_003198	TAA	3	9	228096	228104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_003198	TCA	2	6	228130	228135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_003198	CTC	2	6	228176	228181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_003198	GTA	2	6	228201	228206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_003198	TGTC	2	8	228226	228233	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
606	NC_003198	GGC	2	6	228242	228247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_003198	AGA	2	6	228260	228265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_003198	CGC	2	6	228329	228334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_003198	ACC	2	6	228351	228356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_003198	A	6	6	228376	228381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_003198	GGT	2	6	228398	228403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_003198	AGATGC	2	12	228415	228426	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
613	NC_003198	CAGT	2	8	228435	228442	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
614	NC_003198	AAG	2	6	228445	228450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_003198	ATCC	2	8	228612	228619	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
616	NC_003198	GTTGA	2	10	228632	228641	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
617	NC_003198	ACT	2	6	228716	228721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_003198	GAAA	2	8	228730	228737	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
619	NC_003198	TTCAA	2	10	228738	228747	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
620	NC_003198	GGAC	2	8	228753	228760	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
621	NC_003198	GC	3	6	228839	228844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
622	NC_003198	AGC	2	6	228855	228860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_003198	TGA	2	6	228916	228921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_003198	GAAC	2	8	228955	228962	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
625	NC_003198	CTA	2	6	228973	228978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_003198	GGCT	2	8	228980	228987	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
627	NC_003198	ACA	2	6	229062	229067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_003198	TGG	2	6	229089	229094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_003198	A	6	6	229173	229178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_003198	GCG	2	6	229199	229204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_003198	ATGCGT	2	12	229337	229348	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
632	NC_003198	GC	3	6	229374	229379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
633	NC_003198	CGG	2	6	229426	229431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_003198	AAAC	2	8	229460	229467	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
635	NC_003198	GGAAT	2	10	229492	229501	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
636	NC_003198	CGG	2	6	229519	229524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_003198	AT	3	6	229588	229593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_003198	ACC	2	6	229605	229610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_003198	GTT	3	9	229793	229801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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645	NC_003198	GATG	2	8	230164	230171	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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671	NC_003198	GC	3	6	245165	245170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
672	NC_003198	T	6	6	245173	245178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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917	NC_003198	ATTA	2	8	320451	320458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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