MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 chromosome

Total Repeats: 13511

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_003197	AAT	2	6	1327649	1327654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_003197	TCA	2	6	1327895	1327900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_003197	GC	3	6	1327958	1327963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3504	NC_003197	CAA	2	6	1327985	1327990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_003197	AATA	2	8	1328054	1328061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_003197	TA	3	6	1328996	1329001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_003197	ATAG	2	8	1329004	1329011	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_003197	TAA	2	6	1329045	1329050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_003197	TGA	2	6	1329145	1329150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_003197	TAA	2	6	1329229	1329234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_003197	ACA	2	6	1329235	1329240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_003197	TTG	2	6	1329287	1329292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_003197	CAA	3	9	1329362	1329370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_003197	AGG	2	6	1329455	1329460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_003197	TA	3	6	1329751	1329756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_003197	GCC	2	6	1329774	1329779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_003197	GTAAA	2	10	1329805	1329814	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_003197	TGT	2	6	1329847	1329852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_003197	CT	3	6	1329874	1329879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3520	NC_003197	ATT	2	6	1330421	1330426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_003197	AAAT	2	8	1330434	1330441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_003197	GC	3	6	1330545	1330550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_003197	AGCC	2	8	1330551	1330558	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3524	NC_003197	TA	3	6	1330576	1330581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_003197	TTC	2	6	1330637	1330642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_003197	G	7	7	1330662	1330668	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_003197	AT	3	6	1330675	1330680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_003197	AAAT	2	8	1330710	1330717	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_003197	A	6	6	1330812	1330817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_003197	AAT	2	6	1331093	1331098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_003197	AGT	2	6	1331142	1331147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_003197	ATAA	2	8	1331166	1331173	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_003197	CCT	2	6	1331444	1331449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3534	NC_003197	TA	4	8	1331452	1331459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_003197	T	6	6	1331505	1331510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_003197	TAA	3	9	1331535	1331543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_003197	T	6	6	1331566	1331571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_003197	GTTA	2	8	1331592	1331599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_003197	T	7	7	1331603	1331609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_003197	TC	3	6	1331621	1331626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3541	NC_003197	ATTCT	2	10	1331665	1331674	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3542	NC_003197	TATAA	2	10	1331675	1331684	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_003197	TGT	2	6	1331692	1331697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_003197	GATA	2	8	1331702	1331709	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_003197	CAT	2	6	1331751	1331756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_003197	TGT	2	6	1331959	1331964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_003197	AT	4	8	1332000	1332007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_003197	GTA	2	6	1332092	1332097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_003197	ATT	2	6	1332143	1332148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_003197	AC	3	6	1332214	1332219	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_003197	ATA	2	6	1332225	1332230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_003197	AGT	2	6	1332231	1332236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_003197	GTT	2	6	1332245	1332250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_003197	CTT	2	6	1332865	1332870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_003197	CCTG	2	8	1332886	1332893	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3556	NC_003197	TC	3	6	1332899	1332904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3557	NC_003197	CT	3	6	1332914	1332919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_003197	AGGT	2	8	1332999	1333006	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_003197	AGGA	2	8	1333014	1333021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_003197	TCA	2	6	1333093	1333098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3562	NC_003197	GTAT	2	8	1333161	1333168	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_003197	T	6	6	1333187	1333192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_003197	GCC	2	6	1333213	1333218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3565	NC_003197	CCT	2	6	1333245	1333250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3566	NC_003197	TTA	2	6	1333310	1333315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_003197	TGA	2	6	1333330	1333335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3569	NC_003197	TTA	2	6	1333412	1333417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_003197	A	6	6	1333439	1333444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_003197	TTA	2	6	1333467	1333472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3573	NC_003197	T	6	6	1333603	1333608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3575	NC_003197	CAA	2	6	1333871	1333876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_003197	TAC	2	6	1333954	1333959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3580	NC_003197	GTA	2	6	1334467	1334472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_003197	TAT	2	6	1334509	1334514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_003197	TGA	2	6	1334538	1334543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3593	NC_003197	T	6	6	1335061	1335066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3595	NC_003197	AGG	2	6	1335504	1335509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_003197	TAT	2	6	1336090	1336095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_003197	TCG	2	6	1336111	1336116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3599	NC_003197	ACT	2	6	1336266	1336271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3601	NC_003197	AAT	3	9	1337396	1337404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_003197	CT	3	6	1337420	1337425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3603	NC_003197	AAC	2	6	1337996	1338001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_003197	ACAG	2	8	1338063	1338070	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3605	NC_003197	CGG	2	6	1338102	1338107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_003197	GTG	2	6	1338509	1338514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3608	NC_003197	AT	3	6	1338593	1338598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_003197	A	7	7	1338657	1338663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_003197	TCA	2	6	1338664	1338669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3615	NC_003197	CTT	2	6	1338826	1338831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_003197	TAA	2	6	1338848	1338853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3618	NC_003197	ATG	2	6	1339024	1339029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_003197	TTCTG	2	10	1339051	1339060	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3620	NC_003197	T	6	6	1339067	1339072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_003197	AGG	2	6	1339104	1339109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3624	NC_003197	TTC	2	6	1345647	1345652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3627	NC_003197	TATAA	2	10	1345793	1345802	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_003197	ATC	2	6	1345805	1345810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_003197	AAGA	2	8	1345816	1345823	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_003197	T	7	7	1346528	1346534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_003197	CAAT	2	8	1346558	1346565	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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