MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 chromosome

Total Repeats: 13511

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003197	TAA	3	9	223687	223695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_003197	TCA	2	6	223721	223726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_003197	CAATAT	2	12	229780	229791	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
504	NC_003197	CTGTC	2	10	229847	229856	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
505	NC_003197	AAG	2	6	229893	229898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_003197	GC	3	6	229942	229947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
507	NC_003197	TGA	2	6	230000	230005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_003197	AAT	2	6	230028	230033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_003197	TAA	3	9	230122	230130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_003197	ATA	2	6	230151	230156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_003197	ATT	2	6	230161	230166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_003197	T	7	7	230165	230171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_003197	TAA	2	6	230179	230184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_003197	A	6	6	230183	230188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_003197	AAAT	2	8	230200	230207	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_003197	A	8	8	230226	230233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_003197	T	6	6	230246	230251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_003197	T	8	8	230253	230260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_003197	AAAT	2	8	230278	230285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_003197	TA	3	6	230301	230306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_003197	T	7	7	230328	230334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_003197	T	7	7	230357	230363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_003197	CTTG	2	8	230375	230382	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
524	NC_003197	TTTG	2	8	230384	230391	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
525	NC_003197	T	6	6	230392	230397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_003197	TAT	2	6	230414	230419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_003197	TAAA	2	8	230438	230445	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_003197	A	6	6	230443	230448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_003197	TTAT	2	8	230500	230507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_003197	GTT	2	6	230514	230519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_003197	CTT	2	6	230522	230527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_003197	ATATA	2	10	230561	230570	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_003197	CTA	2	6	230574	230579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_003197	TG	3	6	230609	230614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
535	NC_003197	TAA	2	6	230642	230647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_003197	ATC	2	6	231225	231230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_003197	GAT	2	6	231250	231255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_003197	A	7	7	231265	231271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_003197	TA	3	6	231277	231282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_003197	A	9	9	237150	237158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_003197	GGC	2	6	237165	237170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_003197	GTT	2	6	237190	237195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_003197	TCT	2	6	238654	238659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_003197	C	6	6	245971	245976	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
545	NC_003197	TGCTC	2	10	246049	246058	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
546	NC_003197	AGG	2	6	246061	246066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_003197	CGG	2	6	247233	247238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_003197	AT	3	6	247264	247269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_003197	AC	3	6	247309	247314	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_003197	TCA	2	6	247716	247721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_003197	AAT	2	6	247736	247741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_003197	CCA	2	6	247763	247768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_003197	A	7	7	247777	247783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_003197	AGA	2	6	247798	247803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_003197	GCG	2	6	247831	247836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_003197	G	6	6	249259	249264	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
557	NC_003197	ATAA	2	8	250130	250137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_003197	CT	3	6	252957	252962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_003197	GCC	2	6	252964	252969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_003197	GAT	2	6	253867	253872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_003197	AAT	2	6	253879	253884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_003197	TCAG	2	8	253907	253914	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
563	NC_003197	T	6	6	253983	253988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_003197	ACTG	2	8	253999	254006	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
565	NC_003197	TGC	2	6	254035	254040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_003197	CAA	2	6	254085	254090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_003197	GC	3	6	254124	254129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
568	NC_003197	AC	3	6	254155	254160	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
569	NC_003197	AAC	2	6	254193	254198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_003197	AC	4	8	254197	254204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
571	NC_003197	GGC	2	6	255064	255069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_003197	GTA	2	6	255177	255182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_003197	GAG	2	6	256139	256144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_003197	CTT	2	6	256159	256164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_003197	CT	3	6	256172	256177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
576	NC_003197	GAAA	2	8	256267	256274	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
577	NC_003197	TTA	2	6	257050	257055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_003197	TG	3	6	257100	257105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
579	NC_003197	GTCTG	2	10	257109	257118	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
580	NC_003197	GTG	2	6	257756	257761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_003197	AGA	2	6	257777	257782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_003197	GCG	2	6	257801	257806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_003197	AGA	2	6	259058	259063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_003197	T	6	6	259130	259135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_003197	T	6	6	259165	259170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_003197	CG	3	6	259259	259264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
587	NC_003197	A	6	6	259343	259348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_003197	TTAG	2	8	262353	262360	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
589	NC_003197	GAA	2	6	262361	262366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_003197	ATA	2	6	262370	262375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_003197	TTA	2	6	266496	266501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_003197	T	8	8	274047	274054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_003197	GCAG	2	8	274150	274157	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
594	NC_003197	T	6	6	276005	276010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_003197	GCGCT	2	10	279966	279975	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
596	NC_003197	CAC	2	6	280023	280028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_003197	CAA	2	6	280036	280041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_003197	TAA	2	6	281750	281755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_003197	GGC	2	6	281789	281794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_003197	GCA	2	6	281810	281815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_003197	GCG	2	6	281824	281829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_003197	TGC	2	6	281830	281835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_003197	TGA	2	6	281896	281901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_003197	GAA	2	6	281925	281930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_003197	CGG	2	6	281968	281973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_003197	TAT	2	6	282012	282017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_003197	CG	3	6	282018	282023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
608	NC_003197	GTAT	4	16	282139	282154	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
609	NC_003197	GCG	2	6	282166	282171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_003197	GGC	2	6	282243	282248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_003197	TGC	2	6	282272	282277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_003197	CACT	2	8	282384	282391	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
613	NC_003197	CAA	2	6	282453	282458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_003197	A	7	7	284238	284244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_003197	AATG	2	8	285416	285423	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
616	NC_003197	AAT	2	6	285489	285494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_003197	TGTGT	2	10	286361	286370	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
618	NC_003197	TAT	2	6	288063	288068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_003197	AATGA	2	10	288072	288081	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
620	NC_003197	ATCA	2	8	288156	288163	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
621	NC_003197	CTG	2	6	288191	288196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_003197	TTC	2	6	288851	288856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_003197	CGG	2	6	288903	288908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_003197	CA	3	6	288922	288927	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
625	NC_003197	CGGT	2	8	288934	288941	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
626	NC_003197	TG	3	6	289062	289067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
627	NC_003197	GGC	2	6	289216	289221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_003197	AGC	2	6	289256	289261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_003197	TGC	2	6	289263	289268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_003197	ACT	2	6	289330	289335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_003197	CGA	2	6	289455	289460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_003197	GCA	2	6	289529	289534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_003197	GAA	2	6	289588	289593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_003197	GGA	2	6	289624	289629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_003197	TAA	2	6	289642	289647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_003197	GCA	2	6	289650	289655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_003197	AGA	2	6	289671	289676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_003197	CAG	2	6	289697	289702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_003197	G	6	6	289844	289849	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
640	NC_003197	GGA	2	6	289888	289893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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