MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 chromosome

Total Repeats: 13511

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_003197	GCA	2	6	2093676	2093681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_003197	TTC	2	6	2093723	2093728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_003197	GAAA	2	8	2093796	2093803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_003197	CCA	2	6	2093878	2093883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6005	NC_003197	TG	3	6	2093904	2093909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_003197	CTC	2	6	2094164	2094169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_003197	CCG	2	6	2094207	2094212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_003197	A	7	7	2094297	2094303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_003197	TGC	2	6	2094311	2094316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_003197	TGA	2	6	2094352	2094357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_003197	AAT	2	6	2095838	2095843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_003197	A	6	6	2095880	2095885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_003197	CAA	2	6	2095898	2095903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_003197	TGA	2	6	2095906	2095911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_003197	CCG	2	6	2095966	2095971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6016	NC_003197	CGG	2	6	2096018	2096023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_003197	A	7	7	2096111	2096117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_003197	ACT	2	6	2096244	2096249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_003197	CCTT	2	8	2097232	2097239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6020	NC_003197	T	6	6	2097269	2097274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_003197	TAA	2	6	2098389	2098394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_003197	GCT	2	6	2103689	2103694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_003197	GTC	2	6	2111459	2111464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_003197	GGT	2	6	2113820	2113825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_003197	GTT	2	6	2113896	2113901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_003197	CAGG	2	8	2113914	2113921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6027	NC_003197	TCT	2	6	2113922	2113927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_003197	TCC	2	6	2113937	2113942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6029	NC_003197	GTC	2	6	2113985	2113990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_003197	CAG	2	6	2113998	2114003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_003197	TAA	2	6	2114100	2114105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_003197	TAA	2	6	2114214	2114219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_003197	TCA	2	6	2114245	2114250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_003197	TAT	2	6	2114288	2114293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_003197	TTG	2	6	2114295	2114300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_003197	TTTC	2	8	2114334	2114341	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6037	NC_003197	AAACA	2	10	2115341	2115350	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6038	NC_003197	ATT	2	6	2115352	2115357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_003197	TTA	2	6	2115370	2115375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_003197	CAT	2	6	2115496	2115501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_003197	GCC	2	6	2116407	2116412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6042	NC_003197	TTG	2	6	2116419	2116424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_003197	AGC	2	6	2116494	2116499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_003197	CAT	2	6	2116501	2116506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_003197	ATA	2	6	2116542	2116547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_003197	ATA	2	6	2116655	2116660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_003197	AAT	2	6	2116668	2116673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_003197	AAT	2	6	2116683	2116688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_003197	ATT	2	6	2116753	2116758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_003197	TCT	2	6	2116801	2116806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_003197	ACG	2	6	2132664	2132669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_003197	TAA	2	6	2132688	2132693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_003197	GATTCG	2	12	2134006	2134017	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6054	NC_003197	GCC	2	6	2134069	2134074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6055	NC_003197	AGC	2	6	2134195	2134200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_003197	ATTC	2	8	2134206	2134213	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6057	NC_003197	A	6	6	2135311	2135316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_003197	CGGA	2	8	2135355	2135362	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6059	NC_003197	TCCG	2	8	2135371	2135378	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6060	NC_003197	GT	4	8	2136008	2136015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_003197	AAAC	2	8	2137246	2137253	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6062	NC_003197	ATT	2	6	2137303	2137308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_003197	CTC	2	6	2138667	2138672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_003197	CCT	2	6	2140956	2140961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6065	NC_003197	TTA	2	6	2140963	2140968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_003197	TAT	2	6	2140997	2141002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_003197	GTT	2	6	2141034	2141039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_003197	TTTTA	2	10	2141068	2141077	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_003197	AAT	2	6	2141121	2141126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_003197	CAG	2	6	2141127	2141132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6072	NC_003197	TAA	2	6	2141187	2141192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_003197	ATT	2	6	2141209	2141214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_003197	TTCT	2	8	2141247	2141254	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6075	NC_003197	CCG	2	6	2141272	2141277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6076	NC_003197	ACCCG	2	10	2141356	2141365	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6077	NC_003197	ATG	2	6	2141421	2141426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_003197	GAAA	2	8	2141445	2141452	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_003197	ATG	2	6	2141548	2141553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_003197	T	6	6	2143995	2144000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_003197	AATCAG	2	12	2144047	2144058	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6082	NC_003197	TGA	2	6	2144116	2144121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_003197	CAA	2	6	2144166	2144171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_003197	CAAT	2	8	2144192	2144199	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6085	NC_003197	CATATA	2	12	2144229	2144240	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6086	NC_003197	CGC	2	6	2145741	2145746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6087	NC_003197	ACAA	2	8	2145769	2145776	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6088	NC_003197	A	6	6	2145775	2145780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_003197	ATA	2	6	2145814	2145819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_003197	CG	3	6	2145820	2145825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6091	NC_003197	A	6	6	2147223	2147228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_003197	ACA	2	6	2147256	2147261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_003197	TAAG	2	8	2147274	2147281	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_003197	TATC	2	8	2147282	2147289	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6095	NC_003197	ATG	2	6	2147319	2147324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_003197	A	7	7	2147335	2147341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_003197	T	6	6	2147376	2147381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_003197	GCG	2	6	2147386	2147391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_003197	A	6	6	2147441	2147446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_003197	GATT	2	8	2147462	2147469	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_003197	ACC	2	6	2148411	2148416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6102	NC_003197	TGAC	2	8	2149308	2149315	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6103	NC_003197	A	6	6	2149340	2149345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_003197	GCTT	2	8	2149348	2149355	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6105	NC_003197	ACC	2	6	2149440	2149445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6106	NC_003197	ATC	2	6	2149446	2149451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_003197	CAT	2	6	2149454	2149459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_003197	TG	3	6	2149481	2149486	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_003197	GTG	2	6	2149510	2149515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_003197	ATC	2	6	2149544	2149549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_003197	T	9	9	2149560	2149568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_003197	GC	3	6	2149570	2149575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6113	NC_003197	GCGCT	2	10	2150529	2150538	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6114	NC_003197	A	7	7	2156756	2156762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_003197	T	6	6	2156778	2156783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_003197	ACC	2	6	2156811	2156816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6117	NC_003197	AAG	2	6	2156825	2156830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_003197	CTAA	2	8	2157823	2157830	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6119	NC_003197	A	7	7	2157829	2157835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_003197	AT	3	6	2157870	2157875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_003197	ATT	2	6	2157904	2157909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_003197	ATC	2	6	2157926	2157931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_003197	TCA	2	6	2157937	2157942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_003197	ATG	2	6	2159158	2159163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_003197	TA	3	6	2159206	2159211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_003197	ATT	2	6	2159265	2159270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_003197	A	8	8	2159315	2159322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_003197	ATT	3	9	2160904	2160912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_003197	TAAA	2	8	2162392	2162399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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