MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003106	ATATC	2	10	5569	5578	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_003106	CAGTT	2	10	5849	5858	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_003106	TAAAA	2	10	11879	11888	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003106	AAAGA	2	10	20132	20141	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003106	TTATG	2	10	20198	20207	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003106	TATAT	2	10	23907	23916	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003106	TTAAA	2	10	23974	23983	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003106	CCGTA	2	10	25237	25246	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_003106	AACTC	2	10	26931	26940	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_003106	AATTC	2	10	27142	27151	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_003106	CCTTT	2	10	28664	28673	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_003106	GGTGA	2	10	29037	29046	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003106	GTTTT	2	10	30611	30620	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003106	TTTTC	2	10	30708	30717	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_003106	AATTC	2	10	32557	32566	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_003106	AAAAC	2	10	32691	32700	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_003106	TTATC	2	10	33454	33463	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_003106	CTTTT	2	10	35031	35040	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_003106	TATCT	2	10	35621	35630	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_003106	ATTTA	2	10	36266	36275	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003106	GTAAT	2	10	37407	37416	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003106	GAAAG	2	10	38346	38355	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003106	CAACA	2	10	38497	38506	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_003106	AGTAA	2	10	48625	48634	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003106	CTAAA	2	10	49353	49362	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_003106	TGATA	2	10	53683	53692	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003106	TACGT	2	10	55241	55250	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_003106	AAGAA	2	10	56030	56039	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003106	TATAT	2	10	60558	60567	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003106	TCTAC	2	10	69860	69869	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_003106	TAAGG	2	10	72556	72565	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003106	AAGAT	2	10	72909	72918	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003106	GGTAT	2	10	75035	75044	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003106	TCTTT	2	10	77238	77247	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_003106	ATAAA	2	10	80658	80667	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003106	TTAAC	2	10	80718	80727	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_003106	TACCT	2	10	84435	84444	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_003106	TTTTA	2	10	97045	97054	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003106	ATATA	2	10	97618	97627	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003106	TCAAT	2	10	99843	99852	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_003106	TTACT	2	10	103221	103230	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_003106	ACTTT	2	10	110804	110813	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_003106	AAATA	2	10	122751	122760	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003106	TAAGA	2	10	122867	122876	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003106	TAACG	2	10	123034	123043	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_003106	ATTTA	2	10	145440	145449	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003106	TTACG	2	10	145608	145617	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_003106	ATATA	2	10	150592	150601	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003106	ATTTA	2	10	150655	150664	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003106	CTTTT	2	10	151537	151546	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_003106	AAATA	2	10	152654	152663	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003106	TGATT	2	10	159153	159162	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003106	ATTTT	2	10	159263	159272	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003106	ATTAA	2	10	159279	159288	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003106	ATTTT	2	10	162685	162694	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003106	TAATT	2	10	164365	164374	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003106	AAAAT	2	10	165959	165968	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003106	TAAAC	2	10	168375	168384	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_003106	TTGTA	2	10	169045	169054	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003106	TATTG	2	10	173412	173421	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003106	TACGT	2	10	173935	173944	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_003106	TTTAC	2	10	177646	177655	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_003106	ATAAA	2	10	178978	178987	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003106	ATTAC	2	10	186590	186599	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_003106	AACTA	2	10	186655	186664	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_003106	CACGA	2	10	187255	187264	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_003106	CTGAC	2	10	187292	187301	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_003106	TTACT	2	10	190634	190643	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_003106	AAGTT	2	10	197159	197168	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003106	GTATT	2	10	199040	199049	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003106	TGATA	2	10	199166	199175	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003106	TTTTA	2	10	199252	199261	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003106	TTTAA	2	10	211683	211692	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003106	TATTT	2	10	211875	211884	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003106	AATTA	2	10	221746	221755	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003106	AAACT	2	10	223742	223751	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_003106	CCATA	2	10	224531	224540	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_003106	ATTAT	2	10	233595	233604	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003106	AGATT	2	10	238067	238076	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003106	AGTTT	2	10	245872	245881	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003106	GTAAA	2	10	265188	265197	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003106	ACTAT	2	10	265236	265245	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_003106	TAATA	2	10	266233	266242	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003106	CTGAC	2	10	271814	271823	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_003106	TTATT	2	10	272051	272060	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003106	ATTCT	2	10	280966	280975	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_003106	GAATA	2	10	283968	283977	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003106	GGTTT	2	10	303242	303251	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003106	AAAAT	2	10	306800	306809	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003106	ATATT	2	10	320769	320778	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003106	ATTTA	2	10	334254	334263	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003106	AAATG	2	10	334264	334273	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003106	TTAAA	2	10	335671	335680	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003106	TTAAG	2	10	355271	355280	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003106	TATAA	2	10	355411	355420	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003106	TTAAA	2	10	361419	361428	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003106	TCTAT	2	10	361536	361545	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_003106	TCTAA	2	10	365797	365806	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_003106	TTTTA	2	10	366976	366985	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003106	AATAA	2	10	367143	367152	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003106	TTACT	2	10	370919	370928	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_003106	TATAT	2	10	371058	371067	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003106	ATATT	2	10	371492	371501	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003106	ACTTC	2	10	386048	386057	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_003106	CTTTC	2	10	391595	391604	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_003106	GGTAA	2	10	399074	399083	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003106	TACTT	2	10	418850	418859	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_003106	AAATA	2	10	431416	431425	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003106	TAACT	2	10	446117	446126	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_003106	TAATA	2	10	447932	447941	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003106	AAAAT	2	10	457701	457710	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003106	TATAA	2	10	457730	457739	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003106	TATAA	2	10	457762	457771	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003106	TTCTT	2	10	461684	461693	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_003106	TAAAT	2	10	468507	468516	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003106	ATCAA	2	10	469664	469673	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_003106	TATTT	2	10	474334	474343	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003106	TACTT	2	10	474400	474409	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_003106	TAGAT	2	10	482439	482448	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003106	ATTTC	2	10	490702	490711	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_003106	GAGTC	2	10	502106	502115	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_003106	GTTTT	2	10	502842	502851	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003106	CTTTT	2	10	532715	532724	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_003106	ATAAA	2	10	599221	599230	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003106	TAATA	2	10	604932	604941	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003106	TACTC	2	10	619012	619021	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_003106	AAAAT	2	10	622141	622150	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003106	AGATT	2	10	627706	627715	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003106	AACTT	2	10	628114	628123	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_003106	TACTT	2	10	646350	646359	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_003106	CTAAG	2	10	650859	650868	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_003106	ATATA	2	10	650869	650878	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003106	ATTAC	2	10	660656	660665	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_003106	AATTT	2	10	662504	662513	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003106	ATTAA	2	10	665375	665384	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003106	AACTG	2	10	672876	672885	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_003106	ATATA	2	10	673760	673769	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003106	AAAAG	2	10	676220	676229	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003106	AGTAA	2	10	695135	695144	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003106	TTTAT	2	10	696468	696477	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003106	CACTA	2	10	700312	700321	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_003106	ATTTA	2	10	703354	703363	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003106	TAACG	2	10	706236	706245	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_003106	TTTAT	2	10	706298	706307	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003106	CTTTT	2	10	716148	716157	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_003106	TAATA	2	10	722745	722754	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003106	ACTTT	2	10	724296	724305	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_003106	ATTTA	2	10	724478	724487	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_003106	AGATA	2	10	2433004	2433013	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

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