MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 1600

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003106	GTTT	2	8	9	16	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003106	AAGA	2	8	285	292	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003106	ATAA	2	8	1725	1732	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003106	TAAG	3	12	2649	2660	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003106	CTTC	2	8	2998	3005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_003106	ATAA	2	8	5651	5658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003106	ATTA	2	8	8968	8975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003106	AATG	2	8	9028	9035	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003106	TACT	2	8	9063	9070	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_003106	TTCT	2	8	9362	9369	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_003106	TTAA	2	8	10673	10680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003106	TCTT	2	8	11596	11603	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_003106	AAAT	2	8	11966	11973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003106	TTTC	2	8	12073	12080	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_003106	AAAG	2	8	15165	15172	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003106	CTTA	2	8	20339	20346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_003106	AGTA	2	8	20770	20777	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003106	CAAA	2	8	23821	23828	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_003106	TTTC	2	8	26101	26108	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_003106	ATCT	2	8	26690	26697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_003106	TTTC	2	8	26887	26894	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_003106	CAGA	2	8	28092	28099	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_003106	TCCT	2	8	28228	28235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_003106	TAAA	2	8	28467	28474	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003106	TTTC	2	8	28480	28487	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_003106	CTTC	2	8	28517	28524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_003106	CAGT	2	8	29473	29480	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_003106	ATCT	2	8	29712	29719	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_003106	AGAA	2	8	29862	29869	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003106	TTTC	2	8	30328	30335	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_003106	TGAT	2	8	33106	33113	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003106	TCAT	2	8	33756	33763	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_003106	CAGA	2	8	33895	33902	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_003106	TTTC	2	8	34676	34683	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_003106	TTAA	2	8	35483	35490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003106	AGTG	2	8	35813	35820	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003106	CTAA	2	8	37020	37027	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_003106	AATG	2	8	38242	38249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003106	AATG	2	8	38378	38385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003106	TTTG	2	8	38639	38646	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003106	TAAA	2	8	39339	39346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003106	GAAA	2	8	39635	39642	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003106	GAAG	2	8	39831	39838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003106	AATT	2	8	39859	39866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003106	ATAG	2	8	39897	39904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003106	ATAG	2	8	39942	39949	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003106	CTAA	2	8	41167	41174	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_003106	TTTA	2	8	48493	48500	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003106	CTTA	2	8	48541	48548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_003106	GAGG	2	8	48746	48753	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003106	TAAT	2	8	48976	48983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003106	TTAT	2	8	51401	51408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003106	TTAG	2	8	52123	52130	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003106	TTCC	2	8	52198	52205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_003106	AACT	2	8	53057	53064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_003106	TAGT	2	8	53238	53245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003106	TACA	2	8	53396	53403	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_003106	GAAG	2	8	53695	53702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003106	TTAT	2	8	54232	54239	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003106	TAGT	2	8	54640	54647	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003106	TTAC	2	8	55208	55215	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_003106	AAAT	2	8	55350	55357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003106	ATAG	2	8	55832	55839	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003106	CTAA	2	8	55983	55990	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_003106	AATA	2	8	56040	56047	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003106	AGTT	2	8	57804	57811	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003106	ATCC	2	8	60427	60434	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_003106	TTTA	2	8	60576	60583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003106	AAAT	2	8	60813	60820	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003106	TTAT	2	8	67194	67201	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003106	AGCC	2	8	72381	72388	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_003106	TCTT	2	8	72524	72531	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_003106	TTTA	2	8	72632	72639	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003106	ATTT	2	8	72886	72893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003106	AATT	2	8	74249	74256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003106	TTAT	2	8	74569	74576	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003106	TTAA	2	8	74608	74615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003106	TATT	2	8	74748	74755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003106	TTAT	2	8	75027	75034	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003106	TAAT	2	8	78415	78422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003106	ATTA	2	8	80865	80872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003106	TAAT	2	8	86243	86250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003106	TAAT	3	12	87813	87824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003106	TCTT	2	8	87978	87985	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_003106	ATTA	2	8	88084	88091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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88	NC_003106	TATT	2	8	91238	91245	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003106	TCTT	2	8	95906	95913	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_003106	TTAC	2	8	96908	96915	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_003106	AAAT	2	8	97012	97019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003106	TTTA	2	8	98580	98587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003106	TCAA	2	8	103238	103245	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_003106	AATA	2	8	103247	103254	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003106	TTAA	2	8	103339	103346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003106	TTTA	2	8	103519	103526	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003106	AAAT	2	8	107585	107592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003106	AAAT	2	8	109944	109951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003106	ATTA	2	8	111240	111247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003106	ATTT	2	8	111248	111255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003106	TTAG	2	8	111590	111597	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003106	ATTT	3	12	111724	111735	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003106	CAAG	2	8	120758	120765	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_003106	TAGG	2	8	121953	121960	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003106	TAAT	2	8	128829	128836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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107	NC_003106	AATT	2	8	128880	128887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003106	TTAA	2	8	128891	128898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003106	ATGA	2	8	136647	136654	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003106	ACAT	2	8	145119	145126	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_003106	ATTT	2	8	145221	145228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003106	TAAG	2	8	145271	145278	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003106	TTAT	2	8	145384	145391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003106	AGTT	2	8	145404	145411	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003106	TCAC	2	8	145486	145493	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_003106	ATTT	2	8	146223	146230	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003106	AAAT	2	8	146370	146377	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003106	AATC	2	8	146464	146471	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_003106	ATTT	2	8	148945	148952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003106	AATA	2	8	148961	148968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003106	TAAA	2	8	151606	151613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003106	ATAA	2	8	152617	152624	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003106	TTAT	2	8	154557	154564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003106	GAAA	2	8	159106	159113	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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127	NC_003106	TTAA	2	8	164749	164756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003106	TAAA	2	8	166066	166073	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003106	CTTT	2	8	167996	168003	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_003106	AAAT	2	8	168412	168419	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003106	AAAT	2	8	168616	168623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003106	AAAG	2	8	168702	168709	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003106	TAAG	2	8	168904	168911	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003106	TTTA	2	8	170556	170563	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003106	ATTT	2	8	170587	170594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_003106	TATT	2	8	174026	174033	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_003106	AAGG	2	8	177697	177704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003106	AGAA	2	8	178368	178375	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003106	TTAG	2	8	178814	178821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003106	ATTT	2	8	182402	182409	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003106	TAAT	2	8	182428	182435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003106	TATT	2	8	182922	182929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_003106	ATTA	2	8	185270	185277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_003106	TTTG	2	8	185327	185334	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_003106	GTAA	2	8	186264	186271	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_003106	TTAC	2	8	186313	186320	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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