MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 11481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_003106	A	6	6	980640	980645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_003106	TATC	2	8	980651	980658	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4003	NC_003106	TAA	2	6	980671	980676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_003106	AAT	2	6	980712	980717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_003106	TAA	2	6	980834	980839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_003106	TTAT	2	8	980849	980856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_003106	AGG	2	6	981464	981469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_003106	TCA	3	9	981478	981486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_003106	AC	3	6	982376	982381	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4010	NC_003106	ATA	2	6	982384	982389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_003106	CCT	2	6	982428	982433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_003106	ACT	2	6	982450	982455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_003106	GT	3	6	982474	982479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_003106	TAA	2	6	982551	982556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_003106	ATT	2	6	982666	982671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_003106	TCT	2	6	982679	982684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_003106	CCT	2	6	982744	982749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4018	NC_003106	CAA	2	6	982764	982769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_003106	CTT	3	9	982821	982829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_003106	TTA	2	6	982846	982851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_003106	GTAA	2	8	982890	982897	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_003106	AAAGA	2	10	982935	982944	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_003106	TA	3	6	983005	983010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_003106	GTCT	2	8	983021	983028	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4025	NC_003106	TTG	2	6	983060	983065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_003106	ATA	2	6	983085	983090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_003106	TA	3	6	983108	983113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_003106	GATT	2	8	983144	983151	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_003106	ATT	2	6	983215	983220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_003106	TA	3	6	983274	983279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_003106	AT	3	6	984778	984783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_003106	TATT	2	8	984786	984793	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_003106	ATT	2	6	984824	984829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_003106	TATT	2	8	984836	984843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_003106	T	6	6	984854	984859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_003106	GAA	2	6	984896	984901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_003106	T	6	6	984911	984916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_003106	GAG	2	6	984942	984947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_003106	T	6	6	984978	984983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_003106	CAAT	2	8	985001	985008	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4041	NC_003106	TAG	2	6	985009	985014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_003106	TTTA	2	8	985060	985067	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_003106	TAG	2	6	985112	985117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_003106	AGTTG	2	10	985138	985147	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_003106	GTT	2	6	985151	985156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_003106	AT	3	6	986806	986811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_003106	T	6	6	988276	988281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_003106	CTA	2	6	988290	988295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4050	NC_003106	AGTT	2	8	988969	988976	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_003106	T	6	6	992917	992922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_003106	TTA	2	6	993004	993009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_003106	ATAA	2	8	993018	993025	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_003106	AAT	2	6	993038	993043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_003106	AGG	2	6	993044	993049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_003106	TAG	2	6	993061	993066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_003106	TGT	2	6	993074	993079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_003106	CAT	2	6	993099	993104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_003106	ATG	2	6	993126	993131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_003106	TCA	2	6	993138	993143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_003106	ATG	2	6	993159	993164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_003106	TTC	2	6	993212	993217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_003106	TCC	2	6	993228	993233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4064	NC_003106	TGG	2	6	993254	993259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_003106	T	6	6	993292	993297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_003106	T	6	6	993317	993322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_003106	TTA	2	6	993329	993334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_003106	ATAA	2	8	993340	993347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_003106	CAT	2	6	993360	993365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_003106	ATTAA	2	10	993401	993410	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_003106	AATTA	2	10	993413	993422	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_003106	ATAG	2	8	993433	993440	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_003106	ATTTT	2	10	993459	993468	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_003106	A	6	6	993490	993495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_003106	ATT	2	6	994838	994843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4077	NC_003106	TA	3	6	994864	994869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_003106	TTAA	2	8	996432	996439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_003106	T	6	6	996452	996457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_003106	ATT	2	6	996470	996475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_003106	TAAGA	2	10	996480	996489	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_003106	ATA	4	12	996497	996508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_003106	TTTAT	2	10	996512	996521	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_003106	GA	3	6	999519	999524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_003106	TAA	2	6	999532	999537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_003106	ATTTAA	2	12	999538	999549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_003106	TA	3	6	999574	999579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_003106	ATA	2	6	1000930	1000935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_003106	TCT	2	6	1000960	1000965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4091	NC_003106	TAAA	2	8	1000995	1001002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_003106	T	6	6	1001013	1001018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_003106	TA	3	6	1001043	1001048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_003106	T	7	7	1002664	1002670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_003106	ATA	2	6	1004594	1004599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_003106	AGT	2	6	1006826	1006831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_003106	AT	3	6	1007189	1007194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_003106	AAT	2	6	1007216	1007221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_003106	ATC	2	6	1007228	1007233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_003106	TCA	2	6	1007241	1007246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_003106	ATA	2	6	1007267	1007272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_003106	ATC	2	6	1007305	1007310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_003106	ATT	2	6	1007313	1007318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_003106	TTCA	2	8	1007325	1007332	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4105	NC_003106	TGAT	2	8	1007339	1007346	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_003106	ATA	2	6	1007406	1007411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_003106	TTAC	2	8	1007472	1007479	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4108	NC_003106	TGT	2	6	1007508	1007513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_003106	ATTT	2	8	1007520	1007527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_003106	AAG	2	6	1007691	1007696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_003106	TCTA	2	8	1007721	1007728	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4112	NC_003106	AT	3	6	1007730	1007735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_003106	TGT	2	6	1007771	1007776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4115	NC_003106	T	7	7	1007856	1007862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_003106	ATA	2	6	1008394	1008399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_003106	ATA	2	6	1008406	1008411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_003106	TCA	2	6	1009347	1009352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_003106	A	7	7	1009406	1009412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_003106	AAT	2	6	1010605	1010610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_003106	AAT	2	6	1010640	1010645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_003106	ATA	2	6	1013558	1013563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_003106	TA	3	6	1013579	1013584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_003106	A	6	6	1013603	1013608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_003106	ATT	2	6	1013769	1013774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_003106	TA	3	6	1013787	1013792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_003106	GGA	2	6	1014850	1014855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_003106	ATAA	2	8	1014977	1014984	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_003106	TA	4	8	1015025	1015032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_003106	T	6	6	1015066	1015071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_003106	A	6	6	1015083	1015088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_003106	TTA	2	6	1015157	1015162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_003106	AGA	2	6	1015182	1015187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_003106	TTTA	2	8	1015188	1015195	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_003106	TTAA	2	8	1015214	1015221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_003106	AGAC	2	8	1015228	1015235	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4137	NC_003106	TAT	2	6	1015259	1015264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4257	NC_003106	TAT	2	6	1031612	1031617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4262	NC_003106	AGTT	2	8	1032085	1032092	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_003106	TAA	2	6	1032128	1032133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_003106	TTG	2	6	1032168	1032173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_003106	AAATA	2	10	1032184	1032193	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4266	NC_003106	TAA	2	6	1032196	1032201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_003106	AGA	2	6	1032202	1032207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4268	NC_003106	CTCTTT	2	12	1032231	1032242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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