MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 11481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_003106	AC	3	6	280691	280696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_003106	TAA	2	6	280735	280740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_003106	TA	3	6	280849	280854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_003106	TAT	2	6	280861	280866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_003106	TA	3	6	280869	280874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_003106	TTAT	2	8	280897	280904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_003106	TAAA	2	8	280924	280931	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_003106	TTC	2	6	280936	280941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_003106	A	6	6	280958	280963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_003106	ATTCT	2	10	280966	280975	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1511	NC_003106	AT	3	6	280986	280991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_003106	TAAA	2	8	281021	281028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_003106	TA	4	8	281035	281042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_003106	ATA	2	6	281058	281063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_003106	TGA	2	6	281065	281070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_003106	TCA	2	6	281824	281829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_003106	T	6	6	281836	281841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_003106	TAAA	2	8	282872	282879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_003106	TAA	2	6	282886	282891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_003106	ATA	2	6	282915	282920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_003106	GGC	2	6	283000	283005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_003106	CG	3	6	283030	283035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_003106	TAT	2	6	283082	283087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_003106	TA	3	6	283092	283097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_003106	AT	3	6	283108	283113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_003106	TA	4	8	283114	283121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_003106	ATT	2	6	283127	283132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_003106	ATA	2	6	283203	283208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_003106	TC	3	6	283236	283241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_003106	TTA	2	6	283313	283318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_003106	TAA	2	6	283336	283341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_003106	AT	3	6	283358	283363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_003106	TCT	2	6	283372	283377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_003106	GA	3	6	283382	283387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_003106	T	6	6	283418	283423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_003106	TAA	2	6	283429	283434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_003106	ATT	2	6	283452	283457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_003106	ATA	2	6	283486	283491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_003106	A	6	6	283511	283516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_003106	T	6	6	283534	283539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_003106	ATT	2	6	283585	283590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_003106	ATA	2	6	283612	283617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_003106	GAAA	2	8	283628	283635	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_003106	ATAA	2	8	283643	283650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_003106	GAT	2	6	283660	283665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_003106	TCC	2	6	283706	283711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_003106	TA	3	6	283738	283743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_003106	AGA	2	6	283754	283759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_003106	T	6	6	283774	283779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_003106	TACA	2	8	283786	283793	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1551	NC_003106	TAT	2	6	283844	283849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_003106	TA	3	6	283868	283873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_003106	AT	3	6	283879	283884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_003106	ATAAAT	2	12	283898	283909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_003106	TAA	2	6	283932	283937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_003106	AT	3	6	283961	283966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_003106	GAATA	2	10	283968	283977	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_003106	TAA	2	6	283992	283997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_003106	A	6	6	284330	284335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_003106	TA	3	6	286369	286374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_003106	A	7	7	295585	295591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_003106	ATA	2	6	299377	299382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_003106	AG	3	6	299384	299389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_003106	T	6	6	299411	299416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_003106	TCA	2	6	301817	301822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_003106	ATC	2	6	301845	301850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_003106	ATA	2	6	301855	301860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_003106	ATTT	2	8	301874	301881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_003106	CTG	2	6	303200	303205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_003106	AAG	2	6	303221	303226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_003106	GGTTT	2	10	303242	303251	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_003106	TAA	2	6	303268	303273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_003106	CTA	2	6	305691	305696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_003106	AT	4	8	305710	305717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_003106	TA	3	6	305732	305737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_003106	CTT	2	6	306728	306733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1579	NC_003106	ATT	2	6	308172	308177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_003106	AGT	2	6	308183	308188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_003106	T	6	6	308197	308202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_003106	TA	3	6	310332	310337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_003106	AG	3	6	310344	310349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_003106	T	6	6	312796	312801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_003106	ATT	2	6	312815	312820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_003106	TAAA	2	8	314381	314388	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_003106	AAT	2	6	314577	314582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_003106	T	6	6	314588	314593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_003106	TA	4	8	314596	314603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_003106	TCA	2	6	315837	315842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_003106	AAAT	2	8	316368	316375	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_003106	CTT	2	6	317387	317392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_003106	TAA	2	6	317402	317407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_003106	TAT	2	6	317862	317867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_003106	AT	3	6	317875	317880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_003106	ATT	2	6	317902	317907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_003106	TGA	2	6	320318	320323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_003106	TAA	2	6	320326	320331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_003106	AG	3	6	320351	320356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_003106	CCA	2	6	320755	320760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1601	NC_003106	ATATT	2	10	320769	320778	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_003106	T	6	6	320777	320782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_003106	TAT	2	6	320787	320792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_003106	AT	3	6	320791	320796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_003106	C	6	6	323489	323494	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1606	NC_003106	ATA	2	6	323533	323538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_003106	AG	3	6	324074	324079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_003106	A	6	6	324082	324087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_003106	TAA	3	9	324099	324107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_003106	TTA	3	9	324118	324126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_003106	ATT	2	6	324129	324134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_003106	TAT	2	6	324150	324155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_003106	T	6	6	324155	324160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_003106	CAA	2	6	324164	324169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_003106	GCT	2	6	324202	324207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_003106	AT	3	6	324310	324315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_003106	TTTA	2	8	324683	324690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_003106	TGT	2	6	324693	324698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_003106	AT	4	8	324721	324728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_003106	AGGGGT	2	12	326086	326097	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_003106	AGATGA	2	12	326141	326152	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_003106	TC	3	6	326217	326222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_003106	TAAT	2	8	326842	326849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_003106	AATT	2	8	327194	327201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_003106	ATT	2	6	327295	327300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_003106	A	6	6	327365	327370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_003106	A	7	7	327498	327504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_003106	TTA	2	6	328438	328443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_003106	TTA	2	6	328446	328451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_003106	ATCT	2	8	328465	328472	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1631	NC_003106	GGT	2	6	328518	328523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_003106	CGG	2	6	328539	328544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_003106	TTA	2	6	328633	328638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_003106	AT	3	6	328654	328659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_003106	TAG	2	6	330014	330019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_003106	CTA	2	6	330063	330068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1637	NC_003106	TA	3	6	330086	330091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_003106	AT	4	8	330138	330145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1639	NC_003106	CTG	2	6	330191	330196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1917	NC_003106	TAT	2	6	416233	416238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1918	NC_003106	TTA	2	6	416254	416259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1919	NC_003106	TAT	2	6	416269	416274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1920	NC_003106	GTA	2	6	416280	416285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1934	NC_003106	ATT	2	6	418883	418888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1935	NC_003106	TAT	2	6	418935	418940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1936	NC_003106	TC	3	6	418986	418991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1937	NC_003106	A	6	6	419018	419023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1938	NC_003106	AT	3	6	419053	419058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1948	NC_003106	ATG	2	6	419387	419392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1951	NC_003106	A	6	6	419493	419498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1952	NC_003106	A	6	6	419512	419517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1954	NC_003106	A	6	6	419548	419553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1955	NC_003106	ATA	2	6	419648	419653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1956	NC_003106	GAA	2	6	419671	419676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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