MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 11481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003106	T	6	6	174604	174609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_003106	ATCC	2	8	175898	175905	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_003106	T	6	6	175939	175944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_003106	ATT	2	6	175961	175966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_003106	ATA	3	9	176051	176059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_003106	TA	3	6	176058	176063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_003106	TAT	2	6	176067	176072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_003106	TA	3	6	176091	176096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_003106	TAA	2	6	176100	176105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_003106	A	6	6	176104	176109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_003106	ATT	2	6	176150	176155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_003106	CT	3	6	176160	176165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_003106	AT	3	6	176189	176194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_003106	TACTTC	2	12	176224	176235	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_003106	TAT	2	6	176254	176259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_003106	TCA	2	6	176261	176266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_003106	A	6	6	176307	176312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_003106	TAG	2	6	177411	177416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_003106	TG	3	6	177463	177468	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_003106	TAA	2	6	177600	177605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_003106	TTTAC	2	10	177646	177655	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1022	NC_003106	GGA	2	6	177674	177679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_003106	AAGG	2	8	177697	177704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_003106	TAA	2	6	177728	177733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_003106	GAG	2	6	177795	177800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_003106	GGA	2	6	177821	177826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_003106	AGAA	2	8	178368	178375	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_003106	CTC	2	6	178491	178496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_003106	TTA	2	6	178641	178646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_003106	CTT	2	6	178689	178694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_003106	TA	3	6	178726	178731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_003106	ATT	2	6	178737	178742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_003106	TAA	2	6	178779	178784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_003106	AGA	2	6	178804	178809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_003106	TTAG	2	8	178814	178821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_003106	AAT	2	6	178869	178874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_003106	GAA	2	6	178880	178885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_003106	ATA	2	6	178886	178891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_003106	TTA	2	6	178892	178897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_003106	TA	3	6	178896	178901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_003106	TCA	2	6	178902	178907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_003106	TC	3	6	178932	178937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_003106	ATT	2	6	178959	178964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_003106	ATAAA	2	10	178978	178987	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_003106	TA	3	6	182343	182348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_003106	AAC	2	6	182362	182367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_003106	ATTT	2	8	182402	182409	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_003106	CAT	2	6	182410	182415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_003106	TAAT	2	8	182428	182435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_003106	AGG	2	6	182461	182466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_003106	ATT	3	9	182505	182513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_003106	ATT	2	6	182569	182574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_003106	TTA	2	6	182581	182586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_003106	TAT	3	9	182587	182595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_003106	TAA	2	6	182599	182604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_003106	A	6	6	182622	182627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_003106	TTTTTA	2	12	182645	182656	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_003106	GAG	2	6	182667	182672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_003106	AGA	2	6	182714	182719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_003106	TGCTTA	2	12	182761	182772	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1061	NC_003106	AG	3	6	182820	182825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_003106	TATT	2	8	182922	182929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_003106	CAA	2	6	182978	182983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_003106	TCC	2	6	183004	183009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_003106	ATA	2	6	183024	183029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_003106	TA	3	6	183060	183065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_003106	TAA	2	6	183081	183086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_003106	AGG	2	6	183154	183159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_003106	TAT	2	6	183314	183319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_003106	AAG	2	6	183344	183349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_003106	A	6	6	183398	183403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_003106	ATT	2	6	183413	183418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_003106	ATT	2	6	183460	183465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_003106	AGA	2	6	183469	183474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_003106	ATA	2	6	183505	183510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1083	NC_003106	ATT	2	6	183848	183853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_003106	TCC	2	6	183861	183866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_003106	TA	3	6	183869	183874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_003106	T	6	6	183895	183900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_003106	T	6	6	184794	184799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_003106	AT	3	6	184841	184846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_003106	CAG	2	6	184881	184886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1091	NC_003106	TAA	2	6	185254	185259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_003106	ATTA	2	8	185270	185277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_003106	CT	3	6	185289	185294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1098	NC_003106	AT	3	6	185484	185489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_003106	AG	3	6	185551	185556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_003106	AAT	2	6	185563	185568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_003106	TCA	2	6	186100	186105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_003106	T	7	7	186111	186117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_003106	CTT	2	6	186119	186124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_003106	TGT	2	6	186134	186139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_003106	TCC	2	6	186154	186159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_003106	CTT	2	6	186186	186191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_003106	T	6	6	186217	186222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_003106	GTAA	2	8	186264	186271	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_003106	TTAC	2	8	186313	186320	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_003106	AACT	2	8	186324	186331	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_003106	TAG	2	6	186456	186461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1113	NC_003106	AGG	2	6	186554	186559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_003106	ATTAC	2	10	186590	186599	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1115	NC_003106	CTA	2	6	186603	186608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_003106	CTA	2	6	186615	186620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_003106	AG	3	6	186636	186641	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_003106	AACTA	2	10	186655	186664	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1119	NC_003106	GA	3	6	186672	186677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_003106	AGA	2	6	186688	186693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_003106	AT	3	6	186744	186749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_003106	CA	3	6	186774	186779	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_003106	T	6	6	186812	186817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_003106	TCAT	2	8	186839	186846	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_003106	CGA	2	6	186963	186968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1127	NC_003106	TTG	2	6	187020	187025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_003106	GGA	2	6	187041	187046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_003106	TCTGCT	2	12	187114	187125	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_003106	TAA	2	6	187141	187146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_003106	TAT	3	9	187151	187159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_003106	ATA	2	6	187170	187175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_003106	A	6	6	187189	187194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_003106	GAT	2	6	187246	187251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_003106	CACGA	2	10	187255	187264	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1136	NC_003106	CTGAC	2	10	187292	187301	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1137	NC_003106	C	7	7	187301	187307	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1138	NC_003106	TCC	2	6	187326	187331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1414	NC_003106	TTTA	2	8	265203	265210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_003106	ACTAT	2	10	265236	265245	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1416	NC_003106	TAT	2	6	265271	265276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_003106	T	6	6	265366	265371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_003106	TTA	2	6	265398	265403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_003106	TA	3	6	266032	266037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_003106	TATT	2	8	266044	266051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_003106	AT	3	6	266056	266061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1423	NC_003106	T	6	6	266069	266074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_003106	TTA	2	6	266078	266083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_003106	AT	3	6	266102	266107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1426	NC_003106	CTT	2	6	266121	266126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1427	NC_003106	CCTA	2	8	266212	266219	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1428	NC_003106	TAATA	2	10	266233	266242	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1429	NC_003106	TA	3	6	266273	266278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_003106	CAAA	2	8	266373	266380	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1431	NC_003106	CT	3	6	269229	269234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1432	NC_003106	TAT	2	6	269272	269277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_003106	TAT	2	6	269309	269314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_003106	ACT	2	6	269349	269354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1436	NC_003106	AAT	2	6	269416	269421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1439	NC_003106	AAC	2	6	269904	269909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1441	NC_003106	T	6	6	269976	269981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_003106	GGA	2	6	270034	270039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1447	NC_003106	GGA	2	6	270160	270165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1448	NC_003106	TGT	2	6	270187	270192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1449	NC_003106	GAG	2	6	270200	270205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_003106	TAT	3	9	270287	270295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1451	NC_003106	TTG	2	6	270730	270735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_003106	TGA	2	6	270754	270759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_003106	AAG	2	6	271156	271161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_003106	AAT	2	6	271176	271181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1455	NC_003106	ATA	2	6	271703	271708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1456	NC_003106	TGA	2	6	271796	271801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1457	NC_003106	CTGAC	2	10	271814	271823	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1458	NC_003106	TCC	2	6	271848	271853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1459	NC_003106	TCT	2	6	271868	271873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1460	NC_003106	GTC	2	6	271918	271923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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