MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 11481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003106	A	6	6	55871	55876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_003106	AT	3	6	55921	55926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_003106	TG	3	6	55928	55933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_003106	GTA	2	6	55976	55981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_003106	CTAA	2	8	55983	55990	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
506	NC_003106	GAA	2	6	56006	56011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_003106	AAGAA	2	10	56030	56039	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
508	NC_003106	AATA	2	8	56040	56047	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_003106	ATG	2	6	56063	56068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_003106	GTT	2	6	57583	57588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_003106	ATA	2	6	57595	57600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_003106	ATC	2	6	57714	57719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_003106	TCT	2	6	57788	57793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_003106	AGTT	2	8	57804	57811	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
515	NC_003106	TGG	2	6	57837	57842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_003106	TAT	2	6	57867	57872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_003106	CCT	3	9	57901	57909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_003106	AAT	2	6	59639	59644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_003106	TA	3	6	60378	60383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_003106	ATCC	2	8	60427	60434	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
521	NC_003106	TATAT	2	10	60558	60567	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_003106	TTTA	2	8	60576	60583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_003106	A	6	6	60596	60601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_003106	A	6	6	60700	60705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_003106	AT	3	6	60722	60727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_003106	CTT	2	6	60762	60767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_003106	AAAT	2	8	60813	60820	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_003106	TTC	2	6	60849	60854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_003106	TTC	2	6	60867	60872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_003106	CTT	2	6	60892	60897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_003106	TCT	2	6	60899	60904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_003106	ATT	2	6	61062	61067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_003106	TAA	2	6	61068	61073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_003106	ACT	2	6	61103	61108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_003106	AAC	2	6	61157	61162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_003106	TAT	2	6	61816	61821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_003106	TCA	2	6	61850	61855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_003106	CTT	2	6	62908	62913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_003106	A	6	6	62929	62934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_003106	CAT	2	6	62948	62953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_003106	ATA	2	6	65438	65443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_003106	ATC	2	6	67173	67178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_003106	TTA	2	6	67185	67190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_003106	TTAT	2	8	67194	67201	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_003106	CAT	2	6	67299	67304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_003106	TAT	2	6	67414	67419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_003106	ATA	2	6	67420	67425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_003106	ATT	2	6	67429	67434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_003106	TAC	2	6	67438	67443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_003106	T	6	6	67507	67512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_003106	TCT	2	6	67558	67563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_003106	AAT	2	6	67631	67636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_003106	ATA	2	6	68387	68392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_003106	TCTAC	2	10	69860	69869	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
555	NC_003106	TAT	2	6	72261	72266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_003106	ATA	2	6	72292	72297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_003106	ATA	2	6	72308	72313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_003106	AGCC	2	8	72381	72388	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
559	NC_003106	AT	3	6	72426	72431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_003106	TA	3	6	72463	72468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_003106	AAT	2	6	72518	72523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_003106	TCTT	2	8	72524	72531	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
563	NC_003106	TAAGG	2	10	72556	72565	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
564	NC_003106	AG	3	6	72593	72598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_003106	TTTA	2	8	72632	72639	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_003106	TTA	2	6	72748	72753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_003106	AGA	3	9	72826	72834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_003106	AAC	2	6	72871	72876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_003106	ATTT	2	8	72886	72893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_003106	AAGAT	2	10	72909	72918	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
571	NC_003106	AATT	2	8	74249	74256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_003106	TAA	2	6	74275	74280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_003106	TTG	2	6	74561	74566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_003106	TTAT	2	8	74569	74576	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_003106	TTAA	2	8	74608	74615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_003106	AT	3	6	74681	74686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_003106	TTA	2	6	74691	74696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_003106	TATT	2	8	74748	74755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_003106	T	6	6	74778	74783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_003106	ACT	2	6	74805	74810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_003106	ACA	2	6	74840	74845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_003106	TTC	2	6	74942	74947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_003106	TTA	2	6	74960	74965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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585	NC_003106	TTAT	2	8	75027	75034	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_003106	GGTAT	2	10	75035	75044	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
587	NC_003106	AAT	2	6	75250	75255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_003106	ATA	2	6	75313	75318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_003106	ATA	2	6	75321	75326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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593	NC_003106	A	6	6	75433	75438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_003106	ATT	2	6	77099	77104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_003106	ATT	2	6	77152	77157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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600	NC_003106	AGA	2	6	77248	77253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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603	NC_003106	TAAT	2	8	78415	78422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_003106	AAT	2	6	78435	78440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_003106	TAA	2	6	78447	78452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_003106	TAT	2	6	78474	78479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_003106	ATT	2	6	78487	78492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_003106	TA	3	6	80482	80487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_003106	TTA	2	6	80490	80495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_003106	AAT	2	6	80513	80518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_003106	ATT	2	6	80523	80528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_003106	ATAAA	2	10	80658	80667	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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615	NC_003106	TTAAC	2	10	80718	80727	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
616	NC_003106	AAT	2	6	80745	80750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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619	NC_003106	T	6	6	80946	80951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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623	NC_003106	TA	3	6	84404	84409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_003106	TACCT	2	10	84435	84444	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
625	NC_003106	TAT	2	6	84491	84496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_003106	A	6	6	84582	84587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_003106	AT	3	6	84603	84608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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632	NC_003106	TAAT	2	8	86243	86250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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634	NC_003106	ATT	2	6	86316	86321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_003106	AAAATT	2	12	86322	86333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_003106	ATT	2	6	86361	86366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_003106	TAA	2	6	86379	86384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_003106	A	6	6	86383	86388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_003106	TTA	2	6	86393	86398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_003106	TAAT	3	12	87813	87824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_003106	AT	3	6	87833	87838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_003106	TA	3	6	87879	87884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_003106	AAT	2	6	87895	87900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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645	NC_003106	TCTT	2	8	87978	87985	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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