MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae R6 chromosome

Total Repeats: 1084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003098	ATAA	2	8	1503	1510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003098	TTAG	2	8	2923	2930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003098	GCTT	2	8	15230	15237	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_003098	CCTG	2	8	15278	15285	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_003098	GTGA	2	8	15558	15565	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003098	AGCG	2	8	15729	15736	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_003098	AGCC	2	8	16610	16617	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_003098	GTAA	2	8	17032	17039	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003098	GCGA	2	8	17188	17195	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_003098	ATTC	2	8	18054	18061	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_003098	CTAA	2	8	18408	18415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_003098	GTCT	2	8	18433	18440	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_003098	TAGG	2	8	19064	19071	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003098	CTTT	2	8	21158	21165	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_003098	ATGT	2	8	22593	22600	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003098	AATA	2	8	24724	24731	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003098	AGAA	2	8	27693	27700	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003098	TTGA	2	8	28545	28552	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003098	AATA	2	8	29647	29654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003098	TTCT	2	8	30021	30028	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_003098	AATT	2	8	31114	31121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003098	CTAT	2	8	31218	31225	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_003098	GAAT	2	8	39265	39272	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003098	ATTT	2	8	40090	40097	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003098	GGGA	2	8	41650	41657	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003098	GAAG	2	8	41673	41680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003098	TGAC	2	8	41787	41794	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_003098	ATAG	2	8	50239	50246	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003098	TTTC	2	8	55546	55553	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_003098	TAAT	2	8	65790	65797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003098	GTTT	2	8	71793	71800	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003098	TTCT	2	8	74480	74487	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_003098	TCCA	2	8	74669	74676	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_003098	TGCT	2	8	75161	75168	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_003098	AGAA	2	8	78848	78855	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003098	TAGC	2	8	79205	79212	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_003098	AAAT	2	8	79248	79255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003098	AAGG	2	8	79432	79439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003098	TAAT	2	8	80064	80071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003098	AAAG	2	8	80161	80168	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003098	AAAT	2	8	83682	83689	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003098	CTTT	2	8	83743	83750	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_003098	AATT	2	8	86784	86791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003098	TGAT	2	8	87439	87446	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003098	TTTG	2	8	87635	87642	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003098	ATTC	2	8	91428	91435	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_003098	AAAT	2	8	91586	91593	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003098	ATAA	2	8	91629	91636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003098	TTAG	2	8	94798	94805	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003098	ACAT	2	8	96706	96713	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_003098	AAAG	2	8	96724	96731	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003098	GTAT	2	8	101179	101186	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003098	TCCA	2	8	101252	101259	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_003098	AGAA	2	8	103888	103895	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003098	AGCC	2	8	104612	104619	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_003098	TAGA	2	8	104699	104706	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003098	GAAG	2	8	105123	105130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003098	AAAT	2	8	105207	105214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003098	TCCC	2	8	105500	105507	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
60	NC_003098	TTCA	2	8	108293	108300	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_003098	AAAT	2	8	113182	113189	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003098	GTAG	2	8	113241	113248	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003098	GTAT	2	8	113299	113306	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003098	AAAT	2	8	113462	113469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003098	ATCA	2	8	113649	113656	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_003098	TTAT	2	8	118154	118161	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003098	TTTG	2	8	118260	118267	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003098	GTAG	2	8	119204	119211	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003098	GTAT	2	8	119262	119269	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003098	TGCT	2	8	119399	119406	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_003098	AGGA	2	8	119595	119602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003098	TCTA	2	8	120388	120395	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_003098	TGAA	2	8	120480	120487	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003098	TTTA	2	8	120501	120508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003098	AAGC	2	8	120586	120593	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_003098	TTAT	2	8	122274	122281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003098	ATAA	2	8	122307	122314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003098	GTAT	2	8	123481	123488	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003098	TTTA	2	8	123533	123540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003098	ATTT	2	8	126703	126710	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003098	AATT	2	8	127297	127304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003098	GAAA	2	8	128044	128051	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003098	GAAG	2	8	128154	128161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003098	TTAT	2	8	130399	130406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003098	TGAA	2	8	130417	130424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003098	AAAG	2	8	134401	134408	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003098	TAGA	2	8	134524	134531	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003098	TTGC	2	8	136888	136895	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_003098	TCAA	2	8	140292	140299	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_003098	GGAT	2	8	140814	140821	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003098	TAGG	2	8	141787	141794	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003098	GTAG	2	8	141885	141892	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003098	AAGC	2	8	141906	141913	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_003098	GGGA	2	8	146390	146397	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003098	ATTT	2	8	146863	146870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003098	TTTA	2	8	147062	147069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003098	GGCT	2	8	149409	149416	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_003098	AATT	2	8	153707	153714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003098	AGAT	2	8	154394	154401	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003098	GGTG	2	8	155328	155335	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003098	CAAA	2	8	155403	155410	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_003098	TTTC	2	8	166789	166796	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_003098	TTCT	2	8	168002	168009	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_003098	TAAT	2	8	168030	168037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003098	AGCT	2	8	177348	177355	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_003098	AGAA	2	8	179202	179209	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003098	GGTA	2	8	183223	183230	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003098	AGAA	2	8	183681	183688	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003098	AAAT	2	8	184273	184280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003098	ATTG	2	8	185789	185796	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003098	AGAA	2	8	189317	189324	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003098	AGAA	2	8	191148	191155	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003098	AAGA	2	8	193478	193485	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003098	GCTT	2	8	193488	193495	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_003098	AGAA	2	8	195325	195332	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003098	GTTT	2	8	203188	203195	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003098	ACAA	2	8	203196	203203	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_003098	TAAA	2	8	212279	212286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003098	TTTA	2	8	212353	212360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003098	CTTG	2	8	213169	213176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_003098	AGTG	2	8	216087	216094	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003098	AATT	2	8	217251	217258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003098	GAAA	2	8	218429	218436	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003098	ACGA	2	8	218444	218451	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_003098	GAAA	2	8	222544	222551	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003098	GAAA	2	8	222565	222572	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003098	AATT	2	8	226919	226926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003098	TATT	2	8	227018	227025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003098	ATTA	2	8	227034	227041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003098	ATTT	2	8	229774	229781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003098	TAAA	2	8	231144	231151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003098	TTTA	2	8	231163	231170	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003098	TTTA	2	8	231351	231358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003098	AATA	2	8	233832	233839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003098	CTGA	2	8	240115	240122	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_003098	GAAA	2	8	240197	240204	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003098	CAAT	2	8	247155	247162	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_003098	CAAG	2	8	247399	247406	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_003098	CTAA	2	8	248697	248704	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_003098	AAAT	2	8	248865	248872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003098	AAAC	2	8	248878	248885	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_003098	GAAG	2	8	250986	250993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003098	CTTT	2	8	255524	255531	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_003098	GAAA	2	8	256262	256269	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003098	ATAA	2	8	262173	262180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003098	GATT	2	8	264423	264430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003098	AAAG	2	8	264491	264498	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_003098	GCAG	2	8	265581	265588	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_003098	CAAA	2	8	265601	265608	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_003098	CAAA	2	8	265640	265647	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_003098	GGAA	2	8	272346	272353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_003098	AAAC	2	8	275939	275946	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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