MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae R6 chromosome

Total Repeats: 7780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003098	TCT	2	6	265562	265567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_003098	GCAG	2	8	265581	265588	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_003098	CAAA	2	8	265601	265608	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_003098	A	6	6	265606	265611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_003098	CAAA	2	8	265640	265647	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_003098	C	6	6	267158	267163	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1007	NC_003098	T	6	6	267164	267169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_003098	CTA	2	6	267926	267931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_003098	TCTTTT	2	12	267958	267969	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1010	NC_003098	ATA	2	6	267987	267992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_003098	TGA	2	6	267993	267998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_003098	T	6	6	272107	272112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_003098	A	7	7	272145	272151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_003098	TA	3	6	272202	272207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_003098	TAG	2	6	272284	272289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_003098	GGAA	2	8	272346	272353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_003098	TA	4	8	272382	272389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_003098	T	7	7	273304	273310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_003098	GTT	2	6	273344	273349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_003098	T	6	6	273467	273472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_003098	T	6	6	273478	273483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_003098	CTA	2	6	273599	273604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_003098	TAT	2	6	273605	273610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_003098	TG	3	6	273652	273657	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_003098	TCC	2	6	273686	273691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_003098	A	6	6	273833	273838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_003098	AAG	2	6	273855	273860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_003098	A	6	6	273901	273906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_003098	T	7	7	273933	273939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_003098	AAG	2	6	274376	274381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_003098	CTT	2	6	274409	274414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_003098	TAA	2	6	274467	274472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_003098	AGG	2	6	274486	274491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_003098	A	6	6	274492	274497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_003098	AAAC	2	8	275939	275946	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_003098	ATT	2	6	275951	275956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_003098	GTTT	2	8	275961	275968	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_003098	T	7	7	276227	276233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_003098	TTTAT	2	10	276276	276285	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_003098	AATA	2	8	276688	276695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_003098	ATA	2	6	276746	276751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_003098	AT	3	6	276759	276764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_003098	AGG	2	6	276780	276785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_003098	AGG	2	6	279097	279102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_003098	ATT	2	6	279666	279671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_003098	AGG	2	6	279683	279688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_003098	A	6	6	281048	281053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1049	NC_003098	AAT	2	6	281085	281090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_003098	TTC	2	6	281130	281135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_003098	ATTTT	2	10	281147	281156	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_003098	T	7	7	281153	281159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_003098	AGT	2	6	281188	281193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_003098	CTG	2	6	281217	281222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_003098	A	7	7	281229	281235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_003098	TAAAG	2	10	281239	281248	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_003098	A	6	6	281278	281283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1059	NC_003098	AGG	2	6	281412	281417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_003098	TA	3	6	281649	281654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_003098	TTC	2	6	281665	281670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_003098	AGGA	2	8	281688	281695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_003098	A	6	6	281695	281700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_003098	ATT	2	6	281745	281750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_003098	AGT	2	6	281781	281786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_003098	TAA	2	6	281836	281841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_003098	T	7	7	281878	281884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_003098	TAT	2	6	281893	281898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_003098	AAT	2	6	281935	281940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_003098	AGG	2	6	281988	281993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_003098	AAT	2	6	284220	284225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_003098	ACA	2	6	284311	284316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_003098	ACA	2	6	284325	284330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_003098	A	6	6	284381	284386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_003098	TCA	2	6	284396	284401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1078	NC_003098	TTG	2	6	284981	284986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1080	NC_003098	TTG	2	6	285065	285070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_003098	TCA	2	6	288345	288350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1084	NC_003098	T	6	6	288452	288457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_003098	CAT	2	6	288499	288504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1088	NC_003098	A	7	7	288654	288660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_003098	A	6	6	288713	288718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_003098	CA	3	6	288747	288752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_003098	AGT	2	6	288824	288829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_003098	ATG	2	6	288983	288988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_003098	TTA	2	6	289048	289053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_003098	TAA	2	6	289072	289077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_003098	GAT	2	6	289124	289129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1097	NC_003098	AT	3	6	289170	289175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_003098	AGAAC	2	10	289190	289199	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1099	NC_003098	CTA	2	6	289272	289277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_003098	GTAA	2	8	289332	289339	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_003098	AAC	2	6	289391	289396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_003098	GCTG	2	8	289419	289426	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1103	NC_003098	ACC	2	6	289455	289460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_003098	GGT	2	6	289470	289475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_003098	TCT	2	6	291800	291805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_003098	AATA	3	12	292700	292711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_003098	TTTA	2	8	292714	292721	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_003098	ATTT	2	8	292729	292736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_003098	T	7	7	292807	292813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_003098	A	7	7	292814	292820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_003098	AAATA	2	10	299948	299957	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_003098	ATT	2	6	299984	299989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1114	NC_003098	ACT	2	6	300055	300060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_003098	ATG	2	6	300094	300099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_003098	GGTT	2	8	300137	300144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_003098	GAG	2	6	300165	300170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_003098	AGA	2	6	300173	300178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_003098	GAA	2	6	300232	300237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_003098	AGGAGT	2	12	300240	300251	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_003098	ATGA	2	8	300317	300324	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_003098	AGT	2	6	300327	300332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_003098	CTAG	2	8	300333	300340	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1124	NC_003098	TA	3	6	300838	300843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_003098	TAT	2	6	300852	300857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1128	NC_003098	TAG	2	6	300909	300914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_003098	GCT	2	6	305579	305584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_003098	ATATA	2	10	305589	305598	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_003098	A	6	6	305757	305762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_003098	GTA	2	6	305807	305812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_003098	TAT	2	6	305813	305818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_003098	GAAAAA	2	12	305933	305944	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_003098	T	6	6	305985	305990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_003098	TAA	3	9	306021	306029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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