MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae R6 chromosome

Total Repeats: 7780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003098	GTAG	2	8	119204	119211	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
502	NC_003098	A	7	7	119241	119247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_003098	GTAT	2	8	119262	119269	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
504	NC_003098	GTT	2	6	119337	119342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_003098	GGA	2	6	119346	119351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_003098	TAG	2	6	119369	119374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_003098	TAA	2	6	119390	119395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_003098	TGCT	2	8	119399	119406	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
509	NC_003098	TAT	3	9	119414	119422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_003098	TGT	2	6	119448	119453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_003098	ATG	2	6	119461	119466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_003098	TTG	2	6	119479	119484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_003098	TTA	2	6	119485	119490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_003098	AGGA	2	8	119595	119602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_003098	TAA	2	6	119667	119672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_003098	A	6	6	119671	119676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_003098	A	6	6	120351	120356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_003098	TCTA	2	8	120388	120395	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
519	NC_003098	TA	3	6	120394	120399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_003098	ATA	2	6	120430	120435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_003098	T	6	6	120458	120463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_003098	TTC	2	6	120468	120473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_003098	TGAA	2	8	120480	120487	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
524	NC_003098	GA	3	6	120491	120496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
525	NC_003098	TTTA	2	8	120501	120508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_003098	AAGC	2	8	120586	120593	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
527	NC_003098	AT	3	6	120634	120639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_003098	TGG	2	6	120640	120645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_003098	AGG	2	6	120712	120717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_003098	T	7	7	120797	120803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_003098	T	6	6	120824	120829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_003098	TTATT	2	10	120831	120840	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_003098	TAT	2	6	120878	120883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_003098	GAT	2	6	120916	120921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_003098	AAT	2	6	120938	120943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_003098	GCTTT	2	10	121005	121014	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
537	NC_003098	ATA	2	6	121067	121072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_003098	TGA	2	6	122265	122270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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540	NC_003098	ATAA	2	8	122307	122314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_003098	AAT	2	6	122338	122343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_003098	TAG	2	6	122346	122351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_003098	AGT	2	6	122424	122429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_003098	ATT	2	6	122430	122435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_003098	AAT	2	6	123440	123445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_003098	GTAT	2	8	123481	123488	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_003098	TTA	2	6	123499	123504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_003098	TTTA	2	8	123533	123540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_003098	A	8	8	123580	123587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_003098	AAT	2	6	123660	123665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_003098	GTC	2	6	123750	123755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_003098	TAA	2	6	123789	123794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_003098	A	6	6	123793	123798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_003098	TAA	2	6	126558	126563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_003098	ATTT	2	8	126703	126710	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_003098	AT	4	8	126739	126746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_003098	GCT	2	6	126755	126760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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559	NC_003098	AT	3	6	127186	127191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_003098	A	7	7	127201	127207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_003098	TAG	2	6	127246	127251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_003098	AATT	2	8	127297	127304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_003098	CTA	2	6	127343	127348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_003098	TAG	2	6	127395	127400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_003098	TAA	2	6	127454	127459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_003098	TTCTA	2	10	127841	127850	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
567	NC_003098	GTT	2	6	127860	127865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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569	NC_003098	GAAA	2	8	128044	128051	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
570	NC_003098	T	6	6	128092	128097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_003098	GTT	2	6	128098	128103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_003098	A	6	6	128114	128119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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575	NC_003098	ATG	2	6	128162	128167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_003098	AGT	2	6	128200	128205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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611	NC_003098	ACATG	2	10	137155	137164	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
612	NC_003098	TTA	2	6	137184	137189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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618	NC_003098	T	7	7	137770	137776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_003098	ATT	2	6	137779	137784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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622	NC_003098	T	6	6	140075	140080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_003098	TCA	2	6	140092	140097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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625	NC_003098	ATT	2	6	140165	140170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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632	NC_003098	GTA	2	6	140482	140487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_003098	ATA	2	6	140698	140703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_003098	TGA	2	6	140724	140729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_003098	CT	4	8	140749	140756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
636	NC_003098	GGAT	2	8	140814	140821	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
637	NC_003098	AGG	2	6	140992	140997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
638	NC_003098	T	6	6	141008	141013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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