MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu50 chromosome

Total Repeats: 642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002758	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_002758	GTAGG	2	10	14408	14417	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002758	TCGAT	2	10	23821	23830	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_002758	ATATT	2	10	24358	24367	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002758	TTTCA	2	10	34314	34323	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_002758	TAAAA	2	10	35767	35776	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002758	AGATA	2	10	35925	35934	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002758	TAAAA	2	10	38332	38341	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002758	AAGTA	2	10	39759	39768	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002758	ATGAG	2	10	43525	43534	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002758	TTTAA	2	10	49611	49620	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002758	AAAAT	2	10	49703	49712	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002758	GAATT	2	10	50906	50915	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002758	ATATA	2	10	54458	54467	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002758	ATAAA	2	10	63302	63311	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002758	CTAGT	2	10	70044	70053	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_002758	TAATA	2	10	72839	72848	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002758	TATAA	2	10	72968	72977	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002758	ATTTT	2	10	77012	77021	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002758	GTGAG	2	10	81378	81387	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002758	TTTTA	2	10	89389	89398	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002758	GTGTT	2	10	95199	95208	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002758	ATTCA	2	10	97791	97800	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_002758	GTAAT	2	10	119888	119897	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002758	AGATG	2	10	126460	126469	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002758	ATTTT	2	10	142012	142021	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002758	CAAAA	2	10	186716	186725	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_002758	TAAAG	2	10	187065	187074	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002758	TATCA	2	10	197093	197102	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_002758	ATCAT	2	10	205225	205234	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_002758	CAACT	2	10	217356	217365	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_002758	GCTTT	2	10	221868	221877	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_002758	TGATT	2	10	222214	222223	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002758	GAAAA	2	10	232862	232871	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002758	CTAAG	2	10	233027	233036	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_002758	TAACA	2	10	233233	233242	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_002758	AATAT	2	10	252428	252437	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002758	TATTT	2	10	258419	258428	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002758	AACAT	2	10	266762	266771	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_002758	GATAA	2	10	270699	270708	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002758	ATAAC	2	10	275346	275355	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_002758	TGAAT	2	10	275457	275466	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002758	ATTAA	2	10	275598	275607	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002758	AAAGT	2	10	279342	279351	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002758	TAAAA	2	10	281055	281064	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002758	AAATT	2	10	282371	282380	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002758	TAAAA	2	10	296516	296525	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002758	GAAAA	2	10	304306	304315	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002758	ATAAA	2	10	304424	304433	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002758	TCATA	2	10	312886	312895	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_002758	ATTTA	2	10	326806	326815	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002758	TAAAT	2	10	358108	358117	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002758	ATTTT	2	10	363665	363674	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002758	ATAGA	2	10	369909	369918	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002758	TGACA	2	10	370101	370110	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_002758	GATAA	2	10	382405	382414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002758	ATTAA	2	10	387827	387836	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002758	TATCA	2	10	397146	397155	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_002758	AGAAT	2	10	418514	418523	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002758	ATTGT	2	10	419797	419806	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002758	TAAAT	2	10	426036	426045	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002758	AGATA	2	10	426139	426148	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002758	ACAGT	2	10	430130	430139	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_002758	AGTAT	2	10	439691	439700	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002758	CCTTT	2	10	455595	455604	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_002758	CATAA	2	10	466415	466424	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_002758	TAAAA	2	10	466639	466648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002758	AATAT	2	10	468784	468793	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002758	AAAGT	2	10	478338	478347	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002758	AAATT	2	10	481516	481525	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002758	TAAAG	2	10	492517	492526	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002758	CTCAC	2	10	494422	494431	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
73	NC_002758	CAAAG	2	10	494447	494456	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_002758	CTTAA	2	10	511872	511881	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_002758	TGGTG	2	10	529691	529700	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002758	CAACT	2	10	530262	530271	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_002758	GGTAA	2	10	530736	530745	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002758	TCGTG	2	10	531555	531564	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_002758	GATTG	2	10	533889	533898	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002758	GATTT	2	10	538820	538829	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002758	ATATA	2	10	541238	541247	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002758	CAAAG	2	10	547786	547795	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_002758	TTGAT	2	10	550947	550956	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002758	AGACA	2	10	564971	564980	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_002758	AAGTA	2	10	567406	567415	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002758	TTAAA	2	10	569529	569538	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002758	GATAA	2	10	569568	569577	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002758	GGTAA	2	10	575097	575106	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002758	TCGTG	2	10	575916	575925	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_002758	GATTG	2	10	578221	578230	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002758	ATATA	2	10	584835	584844	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002758	AAAAT	2	10	589610	589619	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002758	TTTAT	2	10	589719	589728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002758	TTATG	2	10	592725	592734	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002758	ATTTA	2	10	592870	592879	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002758	ACAAT	2	10	594675	594684	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_002758	TGAAT	2	10	599142	599151	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002758	GTATA	2	10	599199	599208	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002758	TATAA	2	10	602916	602925	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002758	GTTTA	2	10	619086	619095	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002758	TAAAG	2	10	623280	623289	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002758	GAAGC	2	10	624636	624645	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_002758	ATATT	2	10	629417	629426	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002758	TTAAC	2	10	632329	632338	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_002758	AATTT	2	10	632414	632423	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002758	ATAAA	2	10	640738	640747	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002758	TTATA	2	10	655116	655125	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002758	CACAT	2	10	655512	655521	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_002758	ATGAT	2	10	664535	664544	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002758	TGACA	2	10	664995	665004	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_002758	TAATT	2	10	668022	668031	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002758	TAAAT	2	10	677423	677432	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002758	AAATT	2	10	679427	679436	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002758	TAAAA	2	10	686322	686331	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002758	ATTAA	2	10	688510	688519	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002758	TTATT	2	10	688559	688568	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002758	CAATA	2	10	688625	688634	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_002758	TTAAT	2	10	691253	691262	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002758	AAATA	2	10	693518	693527	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002758	ATTTT	2	10	693540	693549	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002758	ATAAA	2	10	700232	700241	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002758	TTTTA	2	10	704018	704027	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002758	AAAGG	2	10	704339	704348	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002758	ATATA	2	10	707576	707585	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002758	AAACT	2	10	711101	711110	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_002758	TTCAC	2	10	716314	716323	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_002758	TTTGT	2	10	720220	720229	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002758	AATGA	2	10	720293	720302	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002758	GGTTG	2	10	727295	727304	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002758	AGTAG	2	10	737004	737013	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002758	AAGTT	2	10	737451	737460	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002758	AATTG	2	10	737483	737492	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002758	AAACT	2	10	739358	739367	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_002758	ATTTA	2	10	739749	739758	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002758	AAAGT	2	10	741997	742006	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002758	AATTT	2	10	744606	744615	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002758	CATGA	2	10	746766	746775	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_002758	ACGAA	2	10	747619	747628	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_002758	ATCAT	2	10	751150	751159	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_002758	AATTT	2	10	756042	756051	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002758	AATTA	2	10	762844	762853	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002758	ATTTA	2	10	767025	767034	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002758	AAAGT	2	10	767118	767127	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002758	TAAAG	2	10	768953	768962	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002758	ATTTT	2	10	779505	779514	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002758	TAACA	2	10	781656	781665	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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148	NC_002758	TAAAA	2	10	785343	785352	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_002758	AATTT	2	10	2191309	2191318	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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