MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfolobus solfataricus P2 chromosome

Total Repeats: 173

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002754	AATATT	2	12	36544	36555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002754	CAGCTG	2	12	115214	115225	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_002754	GCAGAG	2	12	124416	124427	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_002754	TCCATT	2	12	137112	137123	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_002754	AAACTC	2	12	138261	138272	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_002754	ATTACA	2	12	188098	188109	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_002754	GTTCAT	2	12	200619	200630	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_002754	TTTATT	2	12	222709	222720	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002754	TATAGG	2	12	279594	279605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002754	TCAGTA	2	12	290708	290719	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_002754	AAGGTT	2	12	290851	290862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002754	TACGAA	2	12	327975	327986	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_002754	AAGATG	2	12	330863	330874	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002754	CTTTTT	2	12	338693	338704	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_002754	TTCATA	2	12	379895	379906	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_002754	ATTTGT	2	12	420356	420367	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002754	TTAGGA	2	12	434604	434615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002754	ATTTAA	2	12	441567	441578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002754	AATATT	2	12	452829	452840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002754	TTCCCC	2	12	469418	469429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_002754	AAACCC	2	12	483651	483662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_002754	TTTTAT	2	12	504225	504236	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002754	TTATAT	2	12	537268	537279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002754	ATTAAA	2	12	598450	598461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002754	ATAAAT	2	12	689407	689418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002754	TGAATA	2	12	690773	690784	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002754	CTTTTA	2	12	692359	692370	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_002754	TCTAGA	2	12	709177	709188	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_002754	AGGGTA	2	12	711488	711499	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002754	AACAAG	2	12	751193	751204	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_002754	CAACTT	2	12	856692	856703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_002754	AAAGCT	2	12	866810	866821	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_002754	TGGGGG	2	12	898252	898263	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002754	CATAAT	2	12	916198	916209	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_002754	GGCAAC	2	12	931309	931320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_002754	AAATAT	2	12	954619	954630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002754	AGAAAG	2	12	1049929	1049940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002754	TAATGG	2	12	1050130	1050141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002754	TAATGA	2	12	1052829	1052840	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002754	ATTTTT	2	12	1053294	1053305	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002754	AGCATA	2	12	1053429	1053440	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_002754	GGCAAC	2	12	1057064	1057075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_002754	ACATAA	2	12	1062771	1062782	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_002754	GAGAAG	2	12	1073813	1073824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002754	CAAGTT	2	12	1129353	1129364	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_002754	TTCCGC	2	12	1146436	1146447	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_002754	AAAATA	2	12	1153766	1153777	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002754	CAAGAA	2	12	1159008	1159019	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_002754	AACTTG	2	12	1183185	1183196	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_002754	AAATTA	2	12	1208951	1208962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002754	TTAATA	2	12	1208976	1208987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002754	AATATT	2	12	1213710	1213721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002754	ATTTTC	2	12	1235279	1235290	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_002754	AATTAT	2	12	1237255	1237266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002754	AGGTCA	2	12	1246239	1246250	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_002754	AATCCA	2	12	1255392	1255403	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_002754	TGAAAT	2	12	1259151	1259162	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002754	AATAAA	2	12	1261582	1261593	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002754	AATATT	2	12	1274554	1274565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002754	TTAATA	2	12	1275054	1275065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002754	ATTTCT	2	12	1295984	1295995	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_002754	AAACAT	2	12	1306685	1306696	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_002754	GATGTT	2	12	1310383	1310394	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002754	CTAGCA	2	12	1311524	1311535	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_002754	GTTAAC	2	12	1311809	1311820	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_002754	TATAAA	2	12	1317962	1317973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002754	TTGGTA	2	12	1326979	1326990	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002754	ATACTT	2	12	1329432	1329443	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_002754	GGTTGA	2	12	1331179	1331190	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002754	AATATT	2	12	1338578	1338589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002754	TTTCAT	2	12	1370552	1370563	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_002754	ATAAAA	2	12	1402301	1402312	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002754	CAAGTT	2	12	1414758	1414769	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_002754	GCTTTA	2	12	1452268	1452279	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_002754	AGATGT	2	12	1457821	1457832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002754	AATTTT	2	12	1459774	1459785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002754	AATATT	2	12	1465813	1465824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002754	AGGGGT	2	12	1476646	1476657	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002754	CCACGT	2	12	1496672	1496683	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_002754	AATAGT	2	12	1519770	1519781	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002754	CCTTTA	2	12	1550987	1550998	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_002754	AATATA	2	12	1551233	1551244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002754	AATATA	2	12	1572263	1572274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002754	AATATT	2	12	1583801	1583812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002754	CATAAT	2	12	1620029	1620040	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_002754	AATATT	2	12	1630816	1630827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002754	TCTTTT	2	12	1635096	1635107	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_002754	TAAACA	2	12	1638722	1638733	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_002754	AATATT	2	12	1644930	1644941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002754	CTTTAC	2	12	1649773	1649784	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_002754	AATATA	2	12	1652562	1652573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002754	AATATA	2	12	1673379	1673390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002754	AATATT	2	12	1687102	1687113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002754	AATATT	2	12	1698366	1698377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002754	TAAAAA	2	12	1703017	1703028	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002754	CATAAT	2	12	1713289	1713300	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_002754	TATTTT	2	12	1760617	1760628	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002754	GAGAAG	2	12	1784591	1784602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002754	GATCTT	2	12	1789076	1789087	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_002754	TTCCAG	2	12	1811431	1811442	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_002754	ATAAGT	2	12	1823207	1823218	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002754	CTATTT	2	12	1895762	1895773	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_002754	TATACT	2	12	1913487	1913498	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_002754	GGAAAT	2	12	1914210	1914221	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002754	AAACTG	2	12	1919489	1919500	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_002754	ATATTC	2	12	1919515	1919526	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_002754	CAATTT	2	12	1920673	1920684	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_002754	AATATT	2	12	1921857	1921868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002754	AGTGAA	2	12	1923864	1923875	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002754	TATATT	2	12	1931671	1931682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002754	TAAGAT	2	12	1943840	1943851	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002754	AATGAG	2	12	1945645	1945656	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002754	ATCTTA	2	12	1960543	1960554	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_002754	ACGTTT	2	12	1966360	1966371	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_002754	TAAAAA	2	12	1966883	1966894	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002754	AATCTA	2	12	1966989	1967000	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_002754	CTGGTA	2	12	1971131	1971142	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_002754	AGATAC	2	12	1974080	1974091	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_002754	CATAAT	2	12	1978075	1978086	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_002754	AATCTC	2	12	1998174	1998185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_002754	TTACTT	2	12	1998186	1998197	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_002754	ATAATT	2	12	1998198	1998209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002754	TTTTGT	2	12	2012145	2012156	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002754	AATAGA	2	12	2014628	2014639	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002754	TATTTA	2	12	2047182	2047193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002754	TATTTA	2	12	2047386	2047397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002754	TCTTAG	2	12	2116948	2116959	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_002754	GTATTA	2	12	2121393	2121404	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002754	ATTTTT	2	12	2127059	2127070	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002754	AAAATA	2	12	2144447	2144458	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002754	GAAGTA	2	12	2189913	2189924	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002754	GTAAGC	2	12	2240296	2240307	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_002754	TTACAT	2	12	2242471	2242482	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_002754	GAAGAG	2	12	2250090	2250101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.