MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfolobus solfataricus P2 chromosome

Total Repeats: 508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002754	TATAA	2	10	11953	11962	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002754	AGATA	2	10	32195	32204	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002754	ATATA	2	10	38356	38365	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002754	ACTAA	2	10	38367	38376	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_002754	TAATA	2	10	43414	43423	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002754	CAAAA	2	10	72892	72901	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_002754	CTTCA	2	10	111605	111614	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_002754	ATATT	2	10	112888	112897	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002754	GAAGA	2	10	115092	115101	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002754	ATGTT	2	10	118382	118391	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002754	TTTTC	3	15	120737	120751	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_002754	ACAAA	2	10	121215	121224	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_002754	AGGAA	2	10	126967	126976	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002754	TCAAT	2	10	127041	127050	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_002754	ATTAT	2	10	138213	138222	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002754	AAAAT	2	10	140746	140755	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002754	ATAAA	2	10	149707	149716	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002754	ATTCT	2	10	151349	151358	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_002754	AGAAA	2	10	156898	156907	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002754	ACTAT	2	10	165583	165592	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_002754	TAAAA	2	10	175962	175971	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002754	AGTAT	2	10	184513	184522	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002754	CAATA	2	10	185087	185096	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_002754	TACGT	2	10	227173	227182	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_002754	TTGAA	2	10	247284	247293	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002754	ATAAC	2	10	265055	265064	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_002754	AAAGC	2	10	265272	265281	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_002754	AATTA	2	10	274440	274449	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002754	TATAG	2	10	275346	275355	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002754	CCTTA	2	10	286981	286990	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_002754	TAAAA	2	10	289562	289571	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002754	AAAAG	2	10	294363	294372	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002754	TAAAT	2	10	294473	294482	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002754	ATTTA	2	10	338836	338845	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002754	ACTTT	2	10	341248	341257	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_002754	ACGGG	2	10	341417	341426	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_002754	TTTAA	2	10	341620	341629	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002754	CTTAA	2	10	362303	362312	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_002754	TTATT	2	10	375384	375393	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002754	TAATT	2	10	380103	380112	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002754	TTTAC	2	10	385412	385421	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_002754	ATTTT	2	10	395478	395487	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002754	AAAAT	2	10	398937	398946	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002754	ATTTA	2	10	412092	412101	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002754	TAACT	2	10	420433	420442	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_002754	AATTA	2	10	434395	434404	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002754	AAATA	2	10	441759	441768	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002754	AAGAA	2	10	449974	449983	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002754	TTAAA	2	10	453436	453445	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002754	TAACG	2	10	453758	453767	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_002754	TAACG	2	10	454780	454789	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_002754	ATGTT	2	10	455574	455583	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002754	CTAAC	2	10	467553	467562	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_002754	ATTAT	2	10	468832	468841	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002754	CTCAC	2	10	469361	469370	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
56	NC_002754	TATAA	2	10	471938	471947	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002754	TTTTG	2	10	476806	476815	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002754	AATTC	2	10	479968	479977	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_002754	GTAAA	2	10	480112	480121	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002754	ATAAG	2	10	480817	480826	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002754	TTATA	2	10	480886	480895	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002754	AACAT	2	10	481014	481023	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_002754	GATGT	2	10	483474	483483	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002754	TTAAT	2	10	483723	483732	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002754	TGCGT	2	10	485595	485604	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_002754	AGCTT	2	10	529698	529707	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_002754	TTACA	2	10	564203	564212	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_002754	TTTAT	2	10	576855	576864	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002754	TCAAA	2	10	576989	576998	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_002754	AGAAA	2	10	596633	596642	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002754	TAGCT	2	10	640504	640513	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_002754	TAGAA	2	10	640746	640755	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002754	TTTCT	2	10	646716	646725	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_002754	TTGAA	2	10	647158	647167	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002754	TTTTA	2	10	664854	664863	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002754	GTAAG	2	10	667548	667557	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002754	AACAT	2	10	670519	670528	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_002754	TTTCA	2	10	676041	676050	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_002754	TAATA	2	10	676287	676296	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002754	CTTTA	2	10	676745	676754	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_002754	TGAAA	2	10	682627	682636	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002754	TAAAA	2	10	686509	686518	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002754	TGAGG	2	10	687144	687153	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002754	ATGAA	2	10	688416	688425	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002754	TACCA	2	10	688616	688625	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_002754	GTTAT	2	10	688747	688756	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002754	AATAA	2	10	690062	690071	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002754	AAAAC	2	10	690851	690860	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_002754	GAAGA	2	10	692252	692261	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002754	CTTTA	2	10	693092	693101	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_002754	TAAAT	2	10	695225	695234	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002754	ATTAA	2	10	695243	695252	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002754	ATTTG	2	10	708567	708576	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002754	CAAAG	2	10	711329	711338	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_002754	TCTCT	2	10	715403	715412	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_002754	AAGCT	2	10	716278	716287	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_002754	TTTTA	2	10	719646	719655	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002754	ATGTA	2	10	721762	721771	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002754	TCGTA	2	10	725651	725660	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_002754	TCTTT	2	10	725663	725672	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_002754	GGTGA	2	10	726521	726530	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002754	GAGAA	2	10	740464	740473	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002754	AGATC	2	10	755740	755749	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_002754	GAAGT	2	10	789634	789643	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002754	ATATT	2	10	792732	792741	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002754	ATCTT	2	10	803767	803776	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_002754	GAAAA	2	10	824091	824100	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002754	AGTAA	2	10	837796	837805	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002754	ATTCT	2	10	870207	870216	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_002754	CCGGG	2	10	872769	872778	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
111	NC_002754	GGCTC	2	10	873384	873393	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_002754	CAAAC	2	10	873615	873624	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_002754	TAAAT	2	10	905666	905675	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002754	AGCTA	2	10	913759	913768	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_002754	CTTTT	3	15	918756	918770	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_002754	TAATA	2	10	920404	920413	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002754	AGTAC	2	10	929189	929198	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_002754	GTGAT	2	10	946061	946070	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002754	ATATA	2	10	954666	954675	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002754	AAATT	2	10	971995	972004	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002754	TCAAG	2	10	990570	990579	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_002754	GAAGG	2	10	1020421	1020430	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002754	CCTTA	2	10	1020469	1020478	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_002754	AACTT	2	10	1020584	1020593	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_002754	AACAT	2	10	1022443	1022452	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_002754	ATAGT	2	10	1026971	1026980	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002754	TTCAA	2	10	1027130	1027139	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_002754	TCAAA	2	10	1027263	1027272	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_002754	ATAGA	2	10	1031583	1031592	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002754	GAATA	2	10	1033485	1033494	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002754	ATGAA	2	10	1033690	1033699	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002754	TTTCT	2	10	1034552	1034561	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_002754	AGTTA	2	10	1038329	1038338	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002754	GCTGT	2	10	1042529	1042538	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_002754	CAACG	2	10	1052720	1052729	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_002754	ATTGC	2	10	1052791	1052800	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_002754	AGAGA	2	10	1053454	1053463	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002754	TGAAA	2	10	1057308	1057317	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002754	ATATT	2	10	1078827	1078836	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002754	GATTA	2	10	1103498	1103507	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002754	ATGTT	2	10	1106137	1106146	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002754	TTTAG	2	10	1110776	1110785	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002754	ATATT	2	10	1112019	1112028	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002754	TGGTA	2	10	1113799	1113808	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002754	TATAT	2	10	1123293	1123302	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002754	ATTTT	2	10	1123572	1123581	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002754	AACAT	2	10	1131120	1131129	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_002754	TTTTA	2	10	1136057	1136066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002754	TTAAA	2	10	1145925	1145934	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002754	ATTAA	2	10	1145969	1145978	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002754	ATGTT	2	10	1148713	1148722	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_002754	TCCTC	2	10	1158783	1158792	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
153	NC_002754	TATCT	2	10	1172870	1172879	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NC_002754	ATTAT	2	10	1186912	1186921	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_002754	TATTT	2	10	1194824	1194833	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_002754	TAATT	2	10	1195780	1195789	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_002754	TAATA	2	10	1196910	1196919	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_002754	AACAT	2	10	1201414	1201423	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
159	NC_002754	AACCT	2	10	1209935	1209944	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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161	NC_002754	TAACG	2	10	1228081	1228090	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
162	NC_002754	TCCTT	2	10	1231745	1231754	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
163	NC_002754	TTGAT	2	10	1237879	1237888	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_002754	GCCTC	2	10	1240305	1240314	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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182	NC_002754	AGGAT	2	10	1310072	1310081	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
183	NC_002754	GAAAA	2	10	1318037	1318046	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_002754	CCATT	2	10	1329335	1329344	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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189	NC_002754	TAGTA	2	10	1334593	1334602	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_002754	TAACG	2	10	1345764	1345773	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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425	NC_002754	ATGTA	2	10	2537299	2537308	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_002754	GTTGA	2	10	2651427	2651436	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_002754	TACGT	2	10	2682900	2682909	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
453	NC_002754	CCTTA	2	10	2683230	2683239	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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467	NC_002754	TACGT	2	10	2778678	2778687	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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475	NC_002754	ATCGA	2	10	2811543	2811552	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
476	NC_002754	TTAAA	2	10	2814885	2814894	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_002754	AGTAT	2	10	2951377	2951386	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

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