MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 plasmid pNGR234a

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000914	AGCTCG	2	12	25549	25560	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_000914	GCAGTT	2	12	29222	29233	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_000914	AATTCA	2	12	29906	29917	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_000914	AAAGAA	2	12	44959	44970	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000914	GCCAAG	2	12	62532	62543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_000914	TCGGCC	2	12	67716	67727	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_000914	TGCGGG	2	12	120085	120096	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_000914	GATCTC	2	12	125468	125479	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_000914	AGCACC	2	12	163053	163064	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_000914	GCGACC	2	12	207027	207038	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_000914	TTTTCA	2	12	218055	218066	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_000914	ACGTCA	2	12	262367	262378	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_000914	ACGCAC	2	12	290988	290999	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_000914	GACGCC	2	12	292312	292323	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_000914	TTCCGC	2	12	292979	292990	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_000914	CTCGAT	2	12	293487	293498	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_000914	CGAATA	2	12	296672	296683	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_000914	GCAGGC	2	12	331670	331681	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_000914	CAACGG	2	12	338980	338991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_000914	AATCGG	2	12	339336	339347	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_000914	GGCGAT	2	12	344427	344438	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_000914	CGATGG	2	12	356372	356383	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_000914	TCCCCT	2	12	391592	391603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_000914	CAACCA	2	12	424081	424092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_000914	GCAGGA	2	12	425026	425037	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_000914	ACATTC	2	12	451184	451195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_000914	GAATAT	2	12	477573	477584	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000914	TCGACG	5	30	484086	484115	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_000914	GACGGC	2	12	484151	484162	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_000914	CGAAGA	2	12	490525	490536	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_000914	TCGGCA	2	12	491781	491792	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_000914	CTGGAA	2	12	494791	494802	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_000914	ACGCCT	2	12	495381	495392	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_000914	CTGCCG	2	12	502137	502148	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_000914	CGAACT	2	12	502613	502624	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_000914	AAGGCG	2	12	519209	519220	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_000914	GGAAGC	2	12	520106	520117	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_000914	ACCATC	2	12	523373	523384	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_000914	AATCGG	2	12	535504	535515	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_000914	ACAAAT	2	12	535678	535689	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.