MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 chromosome

Total Repeats: 162

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000911	TCAAAA	2	12	42381	42392	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_000911	TTGAAA	2	12	53268	53279	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000911	GGGTGG	2	12	54320	54331	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000911	TTAAAT	2	12	74876	74887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000911	CGTTTA	2	12	120210	120221	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_000911	TTATAG	2	12	141088	141099	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000911	AAGGGT	2	12	153372	153383	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000911	TAGCCC	2	12	172973	172984	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_000911	TTAAGT	2	12	182226	182237	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000911	GGGAAA	2	12	208451	208462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000911	ACCATT	2	12	260416	260427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_000911	TAGGCT	2	12	299439	299450	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_000911	ATCCCC	2	12	327008	327019	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_000911	GTTTTA	2	12	334544	334555	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000911	ATGCTA	2	12	335712	335723	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_000911	GGCAAA	2	12	345299	345310	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_000911	TCGAAA	2	12	359509	359520	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_000911	TCAACG	2	12	382935	382946	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_000911	TGACCA	2	12	450286	450297	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_000911	TTTGAC	2	12	454460	454471	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_000911	CCATTG	2	12	454681	454692	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_000911	GTAACT	2	12	468690	468701	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_000911	CGGCCC	2	12	484749	484760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_000911	GGTTAT	2	12	491472	491483	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000911	AAAATC	2	12	539084	539095	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_000911	TTCTCT	2	12	550452	550463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_000911	GGTTAG	2	12	566008	566019	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000911	AATGAT	2	12	583595	583606	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000911	ATTTTC	2	12	606102	606113	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_000911	CGGACG	2	12	633299	633310	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_000911	CTTGAA	2	12	663767	663778	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_000911	TCCGCC	2	12	668657	668668	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_000911	TCTTAA	2	12	692665	692676	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_000911	TTTCCC	2	12	728582	728593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_000911	TCCCCC	2	12	755874	755885	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
36	NC_000911	CCTTAC	2	12	763296	763307	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_000911	AAAATC	2	12	797682	797693	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_000911	AAGTTA	2	12	800022	800033	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000911	CTAGGA	2	12	826376	826387	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_000911	GCTTTA	2	12	843576	843587	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_000911	GAGGAT	2	12	844087	844098	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000911	CCCCAG	2	12	845919	845930	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_000911	CTCTTA	2	12	853300	853311	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_000911	GGCAAT	2	12	883199	883210	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_000911	AGCAAC	2	12	891241	891252	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_000911	GGGAAT	2	12	903654	903665	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000911	TCAGTT	2	12	914585	914596	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_000911	ATTTTA	2	12	920044	920055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000911	ACACCA	2	12	930025	930036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_000911	AGAAAA	2	12	961130	961141	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000911	TTGAGT	2	12	988004	988015	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000911	TACTCC	2	12	1025401	1025412	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_000911	TATTAA	2	12	1031167	1031178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000911	TTAATT	2	12	1039059	1039070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000911	TTAACT	2	12	1039838	1039849	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_000911	AGTCCA	2	12	1075860	1075871	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_000911	TTGGCC	2	12	1116737	1116748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_000911	AGAAGC	2	12	1116837	1116848	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_000911	TTAGGT	2	12	1166090	1166101	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000911	ACCTCC	2	12	1170489	1170500	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_000911	GCTTAG	2	12	1190509	1190520	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_000911	TTTCCC	2	12	1196788	1196799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_000911	GTTAAG	2	12	1292725	1292736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000911	CTTTGC	2	12	1322593	1322604	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_000911	ATCATT	2	12	1325604	1325615	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_000911	AATTCA	2	12	1334396	1334407	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_000911	CCATCC	2	12	1347257	1347268	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_000911	TTACCA	2	12	1375287	1375298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_000911	TAAGAG	2	12	1384794	1384805	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000911	GTATTT	2	12	1524532	1524543	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000911	GGCAAA	2	12	1558381	1558392	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_000911	TAGCGA	2	12	1568204	1568215	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_000911	TTTAAC	2	12	1584523	1584534	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_000911	GCTCCC	2	12	1587171	1587182	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_000911	GCCAAA	2	12	1606800	1606811	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_000911	AATTTA	2	12	1607340	1607351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000911	GAATCT	2	12	1648320	1648331	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_000911	TAAAAG	2	12	1655223	1655234	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000911	CATTAA	2	12	1655846	1655857	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_000911	CCCAGT	2	12	1669071	1669082	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_000911	CATTGA	2	12	1671996	1672007	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_000911	TCAAAC	2	12	1688192	1688203	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_000911	ACTGGG	2	12	1722103	1722114	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_000911	ACTCAA	2	12	1785787	1785798	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_000911	GGTAAA	2	12	1815323	1815334	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000911	GTTGTA	2	12	1831543	1831554	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000911	CTGTTA	2	12	1833598	1833609	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_000911	TAATGG	2	12	1850616	1850627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000911	AAACGA	2	12	1886987	1886998	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_000911	TGGCAA	2	12	1922010	1922021	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_000911	TTATCT	2	12	1924046	1924057	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_000911	ACAGAA	2	12	1972567	1972578	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_000911	GATTTC	2	12	1980332	1980343	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_000911	AGTCAA	2	12	2004595	2004606	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_000911	CCCCAT	2	12	2012631	2012642	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_000911	GATTTT	2	12	2080237	2080248	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000911	ATGGGG	2	12	2134064	2134075	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000911	TGATCG	2	12	2138573	2138584	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_000911	CTAAAC	2	12	2157413	2157424	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_000911	TTTCAT	2	12	2193523	2193534	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_000911	CCCCTT	2	12	2230455	2230466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_000911	ATCGTA	2	12	2262603	2262614	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_000911	GCAAAA	2	12	2264901	2264912	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_000911	TAGAAA	2	12	2290489	2290500	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000911	TTTGCA	2	12	2290593	2290604	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_000911	AATCCC	2	12	2337046	2337057	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_000911	TGGCTC	2	12	2389037	2389048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_000911	TTTCTT	2	12	2404552	2404563	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_000911	GACCAT	2	12	2422816	2422827	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_000911	AGCTCA	2	12	2436396	2436407	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_000911	AAAAAC	2	12	2448135	2448146	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_000911	ATCGCC	2	12	2461301	2461312	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
113	NC_000911	CCATTG	2	12	2556649	2556660	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_000911	CCATAT	2	12	2561387	2561398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_000911	CCCATT	2	12	2599299	2599310	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_000911	CTTTCC	2	12	2604585	2604596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_000911	TAAATC	2	12	2632098	2632109	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_000911	TGGGCT	2	12	2646524	2646535	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_000911	TCTACC	2	12	2656046	2656057	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_000911	GACAGT	2	12	2708097	2708108	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_000911	CTAGTC	2	12	2770644	2770655	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_000911	CCTGAC	2	12	2777410	2777421	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_000911	AGTAAG	2	12	2793139	2793150	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000911	GAATAA	2	12	2831647	2831658	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000911	GGAACT	2	12	2831803	2831814	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_000911	TAGGGA	2	12	2837710	2837721	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000911	GGCAAA	2	12	2853493	2853504	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_000911	TCTAAG	2	12	2857457	2857468	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_000911	GATTGA	2	12	2862408	2862419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000911	ATTTCC	2	12	2884857	2884868	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_000911	TAGAGC	2	12	2917507	2917518	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_000911	AGACAG	2	12	2941695	2941706	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_000911	TAATTA	2	12	2948166	2948177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_000911	TATTCT	2	12	2950693	2950704	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_000911	TATAAT	2	12	2954277	2954288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000911	TAGCCC	2	12	2966630	2966641	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
137	NC_000911	TCTGTT	2	12	2998112	2998123	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_000911	TATCAT	2	12	3032283	3032294	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_000911	CATAGT	2	12	3044069	3044080	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_000911	TTGACA	2	12	3058351	3058362	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_000911	TAAGAG	2	12	3066337	3066348	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_000911	ATTTCT	2	12	3103754	3103765	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_000911	TGATAC	2	12	3118358	3118369	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_000911	AATCAA	2	12	3188204	3188215	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_000911	CCCAGG	2	12	3214557	3214568	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
148	NC_000911	TGGGAT	2	12	3268973	3268984	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_000911	GCCCTG	2	12	3285003	3285014	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
150	NC_000911	TTGAAC	2	12	3342108	3342119	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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153	NC_000911	AGGGGA	2	12	3420356	3420367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_000911	TTTAAT	2	12	3423006	3423017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_000911	TTATTT	2	12	3428354	3428365	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_000911	TGGTTG	2	12	3461747	3461758	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_000911	GGCAAC	2	12	3482386	3482397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_000911	ATTTTT	2	12	3523444	3523455	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_000911	TGCCAT	2	12	3524800	3524811	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_000911	GGACTT	2	12	3526879	3526890	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
161	NC_000911	GTTTAC	2	12	3537672	3537683	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.