MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 chromosome

Total Repeats: 1363

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000911	CCGG	2	8	488	495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_000911	AATT	2	8	567	574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000911	CTCC	2	8	1501	1508	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_000911	TTCA	2	8	3013	3020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_000911	CAAT	2	8	4303	4310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_000911	AGGG	2	8	5415	5422	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000911	ACTG	2	8	6868	6875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_000911	ATCG	2	8	8418	8425	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_000911	CCTA	2	8	13483	13490	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_000911	ATTG	2	8	14580	14587	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000911	TGTT	2	8	14607	14614	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000911	TTCA	2	8	17757	17764	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_000911	TGGG	2	8	17780	17787	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000911	TCTT	2	8	20430	20437	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_000911	TTTG	2	8	20568	20575	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000911	TAAT	2	8	27865	27872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000911	GGAC	2	8	27913	27920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_000911	ATTA	2	8	32487	32494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000911	ATTT	2	8	35532	35539	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000911	TAAT	2	8	46852	46859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000911	ATAA	2	8	46981	46988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000911	TGGT	2	8	52124	52131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000911	GGTC	2	8	53368	53375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_000911	CCCT	2	8	58890	58897	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_000911	GTAT	2	8	59658	59665	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000911	ATAC	2	8	59700	59707	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_000911	CTGG	2	8	60458	60465	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_000911	ATTT	2	8	61627	61634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000911	ATTT	2	8	61649	61656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000911	TTAA	2	8	61693	61700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000911	TTAC	2	8	61715	61722	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_000911	ATTA	2	8	61760	61767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000911	ATTT	2	8	64365	64372	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000911	ATGT	2	8	65764	65771	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000911	ATCC	2	8	69233	69240	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_000911	CCCG	2	8	69258	69265	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_000911	TAAT	2	8	77973	77980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000911	CCGA	2	8	78286	78293	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_000911	TAAA	2	8	82281	82288	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000911	CTAT	2	8	92796	92803	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_000911	CCGT	2	8	92809	92816	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_000911	ATTG	2	8	101869	101876	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000911	TAAA	2	8	105117	105124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000911	TAAA	2	8	106563	106570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000911	CTAA	2	8	106807	106814	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_000911	ATTA	2	8	106866	106873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000911	GTGG	2	8	106988	106995	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000911	TGGC	2	8	107262	107269	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_000911	CTAA	2	8	112624	112631	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_000911	AATT	2	8	114248	114255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000911	AATG	2	8	120088	120095	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000911	ATTT	2	8	120143	120150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000911	TTGC	2	8	122017	122024	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_000911	CTTG	2	8	127077	127084	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_000911	TAAC	2	8	127111	127118	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_000911	TTTC	2	8	131091	131098	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_000911	AGCC	2	8	132423	132430	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_000911	GTTA	2	8	134252	134259	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000911	CTGT	2	8	134353	134360	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_000911	GATA	2	8	143874	143881	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000911	CCTA	2	8	146869	146876	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_000911	AATT	2	8	153105	153112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000911	AGGG	2	8	153173	153180	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000911	AGAT	2	8	153533	153540	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000911	GAAA	2	8	156715	156722	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000911	CAAG	2	8	168172	168179	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_000911	TAAA	2	8	168236	168243	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000911	TAAT	2	8	168273	168280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000911	GGAA	2	8	168445	168452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000911	AATT	2	8	185675	185682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000911	ATTA	2	8	185718	185725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000911	TTGT	2	8	189110	189117	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000911	CGGA	2	8	189751	189758	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_000911	GGAC	2	8	194817	194824	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_000911	TAAA	2	8	197601	197608	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000911	AAGT	2	8	206546	206553	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000911	CTAA	2	8	206646	206653	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_000911	GACA	2	8	210763	210770	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_000911	CCTG	2	8	211661	211668	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_000911	ACAA	2	8	215074	215081	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_000911	AACT	2	8	215254	215261	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_000911	AGGA	2	8	218379	218386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000911	CAAA	2	8	219192	219199	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_000911	GATT	2	8	219636	219643	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000911	ATAA	2	8	219788	219795	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000911	TTAA	2	8	219954	219961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000911	CCAA	2	8	221535	221542	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_000911	GAAC	2	8	226781	226788	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_000911	TATC	2	8	230628	230635	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_000911	AGGA	2	8	234220	234227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000911	TTAC	2	8	234259	234266	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_000911	GGAT	2	8	242224	242231	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000911	AGGA	2	8	247028	247035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000911	TAAA	2	8	255722	255729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000911	CTTG	2	8	256441	256448	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_000911	CTAC	2	8	257310	257317	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_000911	GATA	2	8	259415	259422	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000911	AAGC	2	8	259553	259560	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_000911	GAGG	2	8	261791	261798	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000911	ACTT	2	8	263993	264000	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_000911	GAAT	2	8	265392	265399	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_000911	AGTT	2	8	266642	266649	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000911	TACT	2	8	271589	271596	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_000911	TTTG	2	8	273405	273412	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000911	TCCT	2	8	273438	273445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_000911	CAAA	2	8	274442	274449	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_000911	GGAA	2	8	275694	275701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_000911	TTTG	2	8	276361	276368	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000911	ATGT	2	8	282838	282845	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000911	TCAA	2	8	284491	284498	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_000911	TATT	2	8	286147	286154	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000911	TAAA	2	8	287897	287904	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000911	TAAA	2	8	287906	287913	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000911	ATTT	2	8	291503	291510	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000911	ATTA	2	8	293704	293711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000911	GGTT	2	8	298060	298067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000911	GGTT	2	8	298715	298722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000911	ATTT	2	8	299084	299091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000911	ATTT	2	8	299221	299228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_000911	TTTG	2	8	299297	299304	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_000911	TAAT	2	8	303670	303677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000911	CTAG	2	8	303679	303686	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_000911	TTAA	2	8	314224	314231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000911	CTTC	2	8	315111	315118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_000911	ATGA	2	8	316926	316933	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000911	CAAT	2	8	316961	316968	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_000911	ATCC	2	8	316989	316996	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_000911	TGAA	2	8	317876	317883	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000911	CGCC	2	8	318596	318603	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_000911	TTCG	2	8	320610	320617	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_000911	AGGA	2	8	321486	321493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000911	GGAA	2	8	321529	321536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_000911	CCAA	2	8	323744	323751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_000911	TTTC	2	8	324803	324810	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_000911	CCTT	2	8	326120	326127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_000911	AGGG	2	8	335655	335662	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
137	NC_000911	TAAA	2	8	338459	338466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000911	ATTG	2	8	342781	342788	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_000911	TCAG	2	8	343694	343701	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_000911	TAAT	2	8	344728	344735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_000911	GCCT	2	8	345423	345430	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_000911	TTTA	2	8	347885	347892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000911	AATT	2	8	351508	351515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_000911	ATTC	2	8	359642	359649	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_000911	AAAT	2	8	359985	359992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_000911	AGCA	2	8	363424	363431	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_000911	ATTG	2	8	365235	365242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_000911	ATTT	2	8	369129	369136	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_000911	TTAT	2	8	372554	372561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_000911	TAAA	2	8	380018	380025	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_000911	AATA	2	8	382922	382929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_000911	TGAA	2	8	383814	383821	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_000911	GAAT	2	8	402244	402251	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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486	NC_000911	ATTG	2	8	1292160	1292167	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_000911	TGAG	2	8	1311598	1311605	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
492	NC_000911	TTGT	2	8	1312819	1312826	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
493	NC_000911	CAAA	2	8	1314834	1314841	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
494	NC_000911	TAGA	2	8	1325577	1325584	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_000911	TTAA	2	8	1334494	1334501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
498	NC_000911	CTGA	2	8	1335544	1335551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
499	NC_000911	ACTG	2	8	1337111	1337118	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
500	NC_000911	ACCT	2	8	1342665	1342672	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

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