MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 542

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187149	ATC	2	6	693	698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995568
2	NT_187149	GCT	2	6	839	844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995568
3	NT_187149	ATC	2	6	1179	1184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995568
4	NT_187149	ACG	2	6	1513	1518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995568
5	NT_187149	GTC	2	6	1545	1550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995568
6	NT_187149	TCA	2	6	1637	1642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995568
7	NT_187149	CCG	2	6	1827	1832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995569
8	NT_187149	GAA	2	6	1878	1883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995569
9	NT_187149	TGA	2	6	1908	1913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995569
10	NT_187149	TCT	2	6	2101	2106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995569
11	NT_187149	CCG	2	6	2212	2217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995570
12	NT_187149	CGT	2	6	2244	2249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995570
13	NT_187149	CGA	2	6	2379	2384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995570
14	NT_187149	TCG	2	6	2521	2526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995570
15	NT_187149	TCT	2	6	2529	2534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995570
16	NT_187149	GAG	3	9	2635	2643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995570
17	NT_187149	ATC	2	6	2644	2649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995570
18	NT_187149	TGT	2	6	2717	2722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995570
19	NT_187149	TCT	2	6	2802	2807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995570
20	NT_187149	CGA	2	6	2862	2867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995570
21	NT_187149	AGG	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995570
22	NT_187149	TCC	2	6	2956	2961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995570
23	NT_187149	CAT	2	6	2973	2978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995570
24	NT_187149	TCT	2	6	3042	3047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995570
25	NT_187149	AGG	2	6	3125	3130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995570
26	NT_187149	GAC	2	6	3258	3263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995570
27	NT_187149	CGC	2	6	3270	3275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995570
28	NT_187149	AGA	2	6	3379	3384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995570
29	NT_187149	CAA	2	6	3528	3533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995570
30	NT_187149	CTC	2	6	3782	3787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995570
31	NT_187149	CAT	2	6	3894	3899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995570
32	NT_187149	CCG	2	6	3916	3921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995570
33	NT_187149	TGA	2	6	3969	3974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995570
34	NT_187149	TGA	2	6	4164	4169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995571
35	NT_187149	GGC	2	6	4234	4239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995571
36	NT_187149	GAT	2	6	4258	4263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995571
37	NT_187149	GCG	3	9	4310	4318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995571
38	NT_187149	CGT	2	6	4497	4502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995571
39	NT_187149	CGC	2	6	4584	4589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995571
40	NT_187149	CGC	2	6	4677	4682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995572
41	NT_187149	GAT	2	6	4736	4741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995572
42	NT_187149	TCT	2	6	5027	5032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995573
43	NT_187149	GAA	2	6	5051	5056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995573
44	NT_187149	CCG	2	6	5272	5277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995573
45	NT_187149	GAC	2	6	5296	5301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995573
46	NT_187149	GAT	2	6	5349	5354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995573
47	NT_187149	CCT	2	6	5414	5419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995573
48	NT_187149	CGG	3	9	5528	5536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995573
49	NT_187149	CGT	2	6	5639	5644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995573
50	NT_187149	GCC	2	6	5708	5713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995573
51	NT_187149	CCA	2	6	6011	6016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995574
52	NT_187149	TCT	2	6	6141	6146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995574
53	NT_187149	AGT	2	6	6162	6167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995574
54	NT_187149	CAG	2	6	6229	6234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995574
55	NT_187149	GCG	2	6	6300	6305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995574
56	NT_187149	GGC	2	6	6335	6340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995574
57	NT_187149	CGT	2	6	6470	6475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995574
58	NT_187149	ATT	2	6	6505	6510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995574
59	NT_187149	GGC	2	6	6559	6564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995574
60	NT_187149	GTG	2	6	6600	6605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995574
61	NT_187149	GCC	2	6	6647	6652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995574
62	NT_187149	CGG	2	6	6662	6667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995574
63	NT_187149	CTT	2	6	6727	6732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995574
64	NT_187149	CCA	2	6	6744	6749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995574
65	NT_187149	TCG	2	6	6755	6760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995574
66	NT_187149	GAT	2	6	6865	6870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995574
67	NT_187149	CGA	2	6	6971	6976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995574
68	NT_187149	GTC	2	6	7433	7438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995576
69	NT_187149	CGG	2	6	7457	7462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995576
70	NT_187149	CAG	2	6	7473	7478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995576
71	NT_187149	ATC	2	6	7490	7495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995576
72	NT_187149	TCG	2	6	7530	7535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995576
73	NT_187149	GTT	2	6	7564	7569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995576
74	NT_187149	AGG	2	6	7623	7628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995576
75	NT_187149	AAG	2	6	7694	7699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995576
76	NT_187149	TGG	2	6	7908	7913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995577
77	NT_187149	TGA	2	6	8037	8042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995577
78	NT_187149	CTG	3	9	8054	8062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995577
79	NT_187149	GAT	2	6	8084	8089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995577
80	NT_187149	ACG	2	6	8097	8102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995577
81	NT_187149	ACA	2	6	8166	8171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995577
82	NT_187149	CTG	2	6	8203	8208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995577
83	NT_187149	CCA	2	6	8235	8240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995577
84	NT_187149	TGC	2	6	8385	8390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995577
85	NT_187149	ACG	2	6	8414	8419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995577
86	NT_187149	CCG	2	6	8432	8437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995577
87	NT_187149	ACA	2	6	8537	8542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995577
88	NT_187149	CGA	2	6	8956	8961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995578
89	NT_187149	GCA	2	6	8978	8983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995578
90	NT_187149	CGA	2	6	8989	8994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995578
91	NT_187149	GTC	2	6	8996	9001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995578
92	NT_187149	GGC	2	6	9087	9092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995578
93	NT_187149	TGT	2	6	9109	9114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995578
94	NT_187149	TGC	3	9	9213	9221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995578
95	NT_187149	TCG	2	6	9393	9398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995579
96	NT_187149	CCA	2	6	9401	9406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995579
97	NT_187149	GCG	2	6	9456	9461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995579
98	NT_187149	GTC	2	6	9566	9571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995579
99	NT_187149	GCC	2	6	9624	9629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995579
100	NT_187149	CGA	2	6	9669	9674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995579
101	NT_187149	GCC	2	6	9718	9723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995579
102	NT_187149	GCA	2	6	9771	9776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995579
103	NT_187149	GCC	2	6	9835	9840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995579
104	NT_187149	CCG	2	6	9868	9873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995579
105	NT_187149	ATC	2	6	9931	9936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995579
106	NT_187149	CAA	2	6	9940	9945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995579
107	NT_187149	ACG	2	6	10202	10207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995580
108	NT_187149	TGG	2	6	10225	10230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995580
109	NT_187149	GCG	2	6	10343	10348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995580
110	NT_187149	CAT	2	6	10374	10379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995580
111	NT_187149	GCC	2	6	10410	10415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995580
112	NT_187149	GCT	2	6	10454	10459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995580
113	NT_187149	CGT	2	6	10463	10468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995580
114	NT_187149	GCG	3	9	10469	10477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995580
115	NT_187149	CCG	2	6	10497	10502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995580
116	NT_187149	GAT	2	6	10518	10523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995580
117	NT_187149	CAT	2	6	10556	10561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995580
118	NT_187149	TCG	2	6	10657	10662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995580
119	NT_187149	CGG	2	6	10673	10678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995580
120	NT_187149	TCG	2	6	10768	10773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995580
121	NT_187149	GCC	2	6	10818	10823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995580
122	NT_187149	GCT	2	6	10838	10843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995580
123	NT_187149	GCC	2	6	10848	10853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995580
124	NT_187149	CGC	2	6	10881	10886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995580
125	NT_187149	CGC	2	6	10898	10903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995580
126	NT_187149	TGC	2	6	10987	10992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995580
127	NT_187149	GGC	2	6	11101	11106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995580
128	NT_187149	CGA	2	6	11252	11257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995580
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499	NT_187149	GAC	2	6	41998	42003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995617
500	NT_187149	CGG	2	6	42030	42035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995617

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