MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 4644

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NT_187148	GC	3	6	183804	183809	0 %	0 %	50 %	50 %	399995498
3502	NT_187148	TCGTCA	2	12	183849	183860	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	399995498
3503	NT_187148	TCC	2	6	183949	183954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995498
3504	NT_187148	CGG	2	6	183975	183980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995498
3505	NT_187148	AAGG	2	8	184028	184035	50 %	0 %	50 %	0 %	399995498
3506	NT_187148	GAT	2	6	184076	184081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995498
3507	NT_187148	GAC	2	6	184148	184153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995498
3508	NT_187148	CCG	2	6	184216	184221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995498
3509	NT_187148	CGC	3	9	184232	184240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995498
3510	NT_187148	GAC	2	6	184241	184246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995498
3511	NT_187148	CGA	2	6	184254	184259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995498
3512	NT_187148	GGAC	2	8	184261	184268	25 %	0 %	50 %	25 %	399995498
3513	NT_187148	GTC	2	6	184287	184292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995498
3514	NT_187148	CAAC	2	8	184321	184328	50 %	0 %	0 %	50 %	399995498
3515	NT_187148	CGC	2	6	184332	184337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995498
3516	NT_187148	CAA	2	6	184343	184348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995498
3517	NT_187148	AAGGA	2	10	184395	184404	60 %	0 %	40 %	0 %	399995498
3518	NT_187148	AGTGC	2	10	184444	184453	20 %	20 %	40 %	20 %	399995498
3519	NT_187148	AGA	2	6	185033	185038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995499
3520	NT_187148	CTT	2	6	185049	185054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995499
3521	NT_187148	CTT	3	9	185079	185087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995499
3522	NT_187148	GAATT	2	10	185146	185155	40 %	40 %	20 %	0 %	399995499
3523	NT_187148	TA	3	6	185177	185182	50 %	50 %	0 %	0 %	399995499
3524	NT_187148	GC	3	6	185315	185320	0 %	0 %	50 %	50 %	399995499
3525	NT_187148	GATCTT	2	12	185334	185345	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	399995499
3526	NT_187148	CGA	2	6	185363	185368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995499
3527	NT_187148	CCA	2	6	185381	185386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995499
3528	NT_187148	TGG	2	6	185551	185556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995500
3529	NT_187148	GC	4	8	185592	185599	0 %	0 %	50 %	50 %	399995500
3530	NT_187148	CGT	2	6	185606	185611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995500
3531	NT_187148	GGA	2	6	185623	185628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995500
3532	NT_187148	AGCTTC	2	12	185679	185690	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	399995500
3533	NT_187148	TCGC	2	8	185691	185698	0 %	25 %	25 %	50 %	399995500
3534	NT_187148	GGC	2	6	185731	185736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995500
3535	NT_187148	AGA	2	6	185744	185749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995500
3536	NT_187148	GAG	2	6	185874	185879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995500
3537	NT_187148	GCG	2	6	185980	185985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995501
3538	NT_187148	GCG	2	6	186049	186054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995501
3539	NT_187148	AGC	2	6	186072	186077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995501
3540	NT_187148	ACC	2	6	186081	186086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995501
3541	NT_187148	TGC	2	6	186130	186135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995501
3542	NT_187148	CGG	2	6	186460	186465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995501
3543	NT_187148	CTT	2	6	186488	186493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995501
3544	NT_187148	CGA	2	6	186508	186513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995501
3545	NT_187148	GGCC	2	8	186515	186522	0 %	0 %	50 %	50 %	399995501
3546	NT_187148	TTC	2	6	186525	186530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995501
3547	NT_187148	TTG	2	6	186558	186563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995501
3548	NT_187148	TGT	2	6	186592	186597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995501
3549	NT_187148	CGAG	2	8	186721	186728	25 %	0 %	50 %	25 %	399995501
3550	NT_187148	ATC	2	6	186738	186743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995501
3551	NT_187148	CG	3	6	186764	186769	0 %	0 %	50 %	50 %	399995501
3552	NT_187148	GGC	2	6	186896	186901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995501
3553	NT_187148	CCA	2	6	186904	186909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995501
3554	NT_187148	GGC	2	6	186917	186922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995501
3555	NT_187148	CGAC	2	8	186976	186983	25 %	0 %	25 %	50 %	399995501
3556	NT_187148	CGCT	2	8	187026	187033	0 %	25 %	25 %	50 %	399995501
3557	NT_187148	TCG	2	6	187038	187043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995501
3558	NT_187148	GC	3	6	187099	187104	0 %	0 %	50 %	50 %	399995502
3559	NT_187148	GCG	3	9	187154	187162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995502
3560	NT_187148	CGC	2	6	187166	187171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995502
3561	NT_187148	GC	3	6	187218	187223	0 %	0 %	50 %	50 %	399995502
3562	NT_187148	GTC	2	6	187503	187508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995503
3563	NT_187148	CGA	2	6	187529	187534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995504
3564	NT_187148	GC	3	6	187648	187653	0 %	0 %	50 %	50 %	399995504
3565	NT_187148	GGC	2	6	187668	187673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995504
3566	NT_187148	CGG	2	6	187715	187720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995504
3567	NT_187148	CAC	2	6	187733	187738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995504
3568	NT_187148	GGT	2	6	187745	187750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995504
3569	NT_187148	TCTTT	2	10	187772	187781	0 %	80 %	0 %	20 %	399995504
3570	NT_187148	TCG	2	6	187825	187830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995504
3571	NT_187148	GAG	2	6	187866	187871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995504
3572	NT_187148	GGC	2	6	187884	187889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995504
3573	NT_187148	CGT	2	6	187898	187903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995504
3574	NT_187148	GGC	2	6	187952	187957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995504
3575	NT_187148	CCG	2	6	187988	187993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995504
3576	NT_187148	GGC	2	6	187996	188001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995504
3577	NT_187148	TGC	2	6	188065	188070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995504
3578	NT_187148	GTCG	2	8	188097	188104	0 %	25 %	50 %	25 %	399995504
3579	NT_187148	GC	3	6	188106	188111	0 %	0 %	50 %	50 %	399995504
3580	NT_187148	TGGC	2	8	188112	188119	0 %	25 %	50 %	25 %	399995504
3581	NT_187148	GAGG	2	8	188145	188152	25 %	0 %	75 %	0 %	399995504
3582	NT_187148	TCA	2	6	188158	188163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995504
3583	NT_187148	TCTT	2	8	188195	188202	0 %	75 %	0 %	25 %	399995504
3584	NT_187148	CCGA	2	8	188212	188219	25 %	0 %	25 %	50 %	399995504
3585	NT_187148	CGC	2	6	188258	188263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995505
3586	NT_187148	TGG	2	6	188264	188269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995505
3587	NT_187148	CGC	2	6	188301	188306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995505
3588	NT_187148	GCCG	2	8	188349	188356	0 %	0 %	50 %	50 %	399995505
3589	NT_187148	TGA	2	6	188387	188392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995505
3590	NT_187148	CGG	2	6	188405	188410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995505
3591	NT_187148	CGT	2	6	188466	188471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995505
3592	NT_187148	TCC	2	6	188481	188486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995505
3593	NT_187148	ATC	2	6	188494	188499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995505
3594	NT_187148	ATC	2	6	188519	188524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995505
3595	NT_187148	GCG	2	6	188596	188601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995505
3596	NT_187148	GCG	2	6	188620	188625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995505
3597	NT_187148	CAC	2	6	188640	188645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995505
3598	NT_187148	CTC	2	6	188709	188714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995505
3599	NT_187148	CGG	2	6	188726	188731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995505
3600	NT_187148	CGC	2	6	188781	188786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995505
3601	NT_187148	GCCGA	2	10	188863	188872	20 %	0 %	40 %	40 %	399995505
3602	NT_187148	CGATC	2	10	188874	188883	20 %	20 %	20 %	40 %	399995505
3603	NT_187148	TCG	2	6	188897	188902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995505
3604	NT_187148	GCCGA	2	10	188920	188929	20 %	0 %	40 %	40 %	399995505
3605	NT_187148	GCC	2	6	188963	188968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995505
3606	NT_187148	GCG	2	6	189015	189020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995505
3607	NT_187148	ACA	2	6	189047	189052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995505
3608	NT_187148	CGT	2	6	189215	189220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995505
3609	NT_187148	GAA	2	6	189229	189234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995505
3610	NT_187148	CGC	2	6	189251	189256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995505
3611	NT_187148	CGG	2	6	189279	189284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995505
3612	NT_187148	CGG	3	9	189356	189364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995505
3613	NT_187148	GCC	2	6	189399	189404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995505
3614	NT_187148	GCG	3	9	189489	189497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995505
3615	NT_187148	GC	3	6	189504	189509	0 %	0 %	50 %	50 %	399995505
3616	NT_187148	GTG	2	6	189537	189542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995505
3617	NT_187148	ACT	2	6	189575	189580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995505
3618	NT_187148	TCG	2	6	189581	189586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995505
3619	NT_187148	GAT	2	6	189592	189597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995505
3620	NT_187148	CAC	2	6	189713	189718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995506
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3622	NT_187148	GCG	2	6	189736	189741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995506
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3743	NT_187148	TGC	2	6	196339	196344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995512
3744	NT_187148	GGA	2	6	196399	196404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995512
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3983	NT_187148	CGC	2	6	209183	209188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995521
3984	NT_187148	GC	3	6	209187	209192	0 %	0 %	50 %	50 %	399995521
3985	NT_187148	CGG	2	6	209194	209199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995521
3986	NT_187148	GCT	2	6	209200	209205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995521
3987	NT_187148	TCGC	2	8	209288	209295	0 %	25 %	25 %	50 %	399995521
3988	NT_187148	TGCCGA	2	12	209392	209403	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	399995521
3989	NT_187148	CGGC	3	12	209406	209417	0 %	0 %	50 %	50 %	399995521
3990	NT_187148	GCC	2	6	209436	209441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995521
3991	NT_187148	GC	3	6	209442	209447	0 %	0 %	50 %	50 %	399995521
3992	NT_187148	CAT	2	6	209971	209976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995522
3993	NT_187148	CGA	2	6	209995	210000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995522
3994	NT_187148	CAC	2	6	210014	210019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995522
3995	NT_187148	CGAC	2	8	210030	210037	25 %	0 %	25 %	50 %	399995522
3996	NT_187148	GAG	2	6	210110	210115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995522
3997	NT_187148	TCGAGC	2	12	210327	210338	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	399995522
3998	NT_187148	CTC	2	6	210362	210367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995522
3999	NT_187148	GCC	2	6	210404	210409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995522
4000	NT_187148	GAT	2	6	210490	210495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995522

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