MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 4644

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NT_187148	GCC	2	6	156484	156489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995478
3002	NT_187148	CGG	2	6	156537	156542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995478
3003	NT_187148	GGC	2	6	156567	156572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995478
3004	NT_187148	ATC	2	6	156651	156656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995478
3005	NT_187148	CAT	2	6	157066	157071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995479
3006	NT_187148	ACG	2	6	157094	157099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995479
3007	NT_187148	GAA	2	6	157101	157106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995479
3008	NT_187148	TGC	2	6	157145	157150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995479
3009	NT_187148	TTCGGC	2	12	157243	157254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995479
3010	NT_187148	AGA	2	6	157259	157264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995479
3011	NT_187148	GGT	2	6	157292	157297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995479
3012	NT_187148	AAG	2	6	157402	157407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995479
3013	NT_187148	AGG	2	6	157418	157423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995479
3014	NT_187148	AAC	2	6	157593	157598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995479
3015	NT_187148	AGT	2	6	157608	157613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995479
3016	NT_187148	GCG	2	6	157655	157660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995479
3017	NT_187148	CAAA	2	8	157712	157719	75 %	0 %	0 %	25 %	399995479
3018	NT_187148	ATG	2	6	157753	157758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995479
3019	NT_187148	CGGTA	2	10	157780	157789	20 %	20 %	40 %	20 %	399995479
3020	NT_187148	GAC	2	6	157832	157837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995479
3021	NT_187148	GAGC	2	8	157874	157881	25 %	0 %	50 %	25 %	399995479
3022	NT_187148	ACG	2	6	157899	157904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995479
3023	NT_187148	AGA	2	6	157908	157913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995479
3024	NT_187148	CTC	2	6	158644	158649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995481
3025	NT_187148	CGC	2	6	158675	158680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995481
3026	NT_187148	GAC	2	6	158683	158688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995481
3027	NT_187148	GCC	2	6	158747	158752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995481
3028	NT_187148	CCGG	3	12	158775	158786	0 %	0 %	50 %	50 %	399995481
3029	NT_187148	TGC	2	6	158826	158831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995481
3030	NT_187148	TGGA	2	8	158840	158847	25 %	25 %	50 %	0 %	399995481
3031	NT_187148	GAGC	2	8	158848	158855	25 %	0 %	50 %	25 %	399995481
3032	NT_187148	TCG	2	6	158865	158870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995481
3033	NT_187148	CGC	2	6	159419	159424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995482
3034	NT_187148	CCTA	2	8	159425	159432	25 %	25 %	0 %	50 %	399995482
3035	NT_187148	CTG	2	6	159441	159446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995482
3036	NT_187148	CGA	2	6	159485	159490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995482
3037	NT_187148	CGG	2	6	159505	159510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995482
3038	NT_187148	TCC	2	6	159601	159606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995482
3039	NT_187148	GCC	2	6	159695	159700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995482
3040	NT_187148	CGAC	2	8	159715	159722	25 %	0 %	25 %	50 %	399995482
3041	NT_187148	CTCCG	2	10	159726	159735	0 %	20 %	20 %	60 %	399995482
3042	NT_187148	CGC	2	6	159752	159757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995482
3043	NT_187148	CGT	2	6	159763	159768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995482
3044	NT_187148	GGA	2	6	159834	159839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995482
3045	NT_187148	GAT	2	6	159858	159863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995482
3046	NT_187148	CGC	2	6	159890	159895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995482
3047	NT_187148	CG	3	6	159964	159969	0 %	0 %	50 %	50 %	399995482
3048	NT_187148	GACGAG	2	12	160002	160013	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	399995482
3049	NT_187148	GAA	2	6	160020	160025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995482
3050	NT_187148	GCG	2	6	160030	160035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995482
3051	NT_187148	TGC	2	6	160036	160041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995482
3052	NT_187148	CGG	2	6	160060	160065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995482
3053	NT_187148	TGC	2	6	160066	160071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995482
3054	NT_187148	TCGG	2	8	160132	160139	0 %	25 %	50 %	25 %	399995482
3055	NT_187148	CTG	2	6	160140	160145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995482
3056	NT_187148	CAG	2	6	160180	160185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995482
3057	NT_187148	ATCGCG	2	12	160243	160254	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	399995482
3058	NT_187148	GCT	2	6	160262	160267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995482
3059	NT_187148	GCTGGC	2	12	160325	160336	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	399995482
3060	NT_187148	GAT	2	6	160343	160348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995482
3061	NT_187148	TCG	2	6	160377	160382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995482
3062	NT_187148	GTG	2	6	160437	160442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995482
3063	NT_187148	CGC	2	6	160462	160467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995482
3064	NT_187148	GGC	2	6	160469	160474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995482
3065	NT_187148	GCG	2	6	160475	160480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995482
3066	NT_187148	AGG	2	6	160515	160520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995482
3067	NT_187148	AAG	2	6	160702	160707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995483
3068	NT_187148	TCC	2	6	160716	160721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995483
3069	NT_187148	CGC	2	6	160774	160779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995483
3070	NT_187148	CGG	2	6	160810	160815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995483
3071	NT_187148	GAA	2	6	160850	160855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995483
3072	NT_187148	CG	3	6	160868	160873	0 %	0 %	50 %	50 %	399995483
3073	NT_187148	TGTGGA	2	12	161008	161019	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	399995483
3074	NT_187148	CGA	2	6	161087	161092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995483
3075	NT_187148	TGC	2	6	161094	161099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995483
3076	NT_187148	CG	3	6	161114	161119	0 %	0 %	50 %	50 %	399995483
3077	NT_187148	GCTC	2	8	161245	161252	0 %	25 %	25 %	50 %	399995483
3078	NT_187148	GCC	2	6	161278	161283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995483
3079	NT_187148	GCG	2	6	161287	161292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995483
3080	NT_187148	GC	4	8	161368	161375	0 %	0 %	50 %	50 %	399995483
3081	NT_187148	CGG	2	6	161431	161436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995484
3082	NT_187148	AGA	2	6	161505	161510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995484
3083	NT_187148	GCCA	2	8	161573	161580	25 %	0 %	25 %	50 %	399995484
3084	NT_187148	TCG	2	6	161597	161602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3085	NT_187148	AGG	2	6	161626	161631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995484
3086	NT_187148	GCC	2	6	161686	161691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995484
3087	NT_187148	GC	3	6	161713	161718	0 %	0 %	50 %	50 %	399995484
3088	NT_187148	GCG	2	6	161726	161731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995484
3089	NT_187148	TCG	2	6	161777	161782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3090	NT_187148	CCAG	2	8	161787	161794	25 %	0 %	25 %	50 %	399995484
3091	NT_187148	CGC	2	6	161842	161847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995484
3092	NT_187148	CAT	2	6	161893	161898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995484
3093	NT_187148	CCG	2	6	161922	161927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995484
3094	NT_187148	GCC	3	9	161932	161940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995484
3095	NT_187148	GCG	2	6	161974	161979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995484
3096	NT_187148	GC	3	6	162035	162040	0 %	0 %	50 %	50 %	399995484
3097	NT_187148	CAG	2	6	162154	162159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3098	NT_187148	CGA	2	6	162186	162191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3099	NT_187148	TCG	2	6	162194	162199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3100	NT_187148	GCC	2	6	162215	162220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995484
3101	NT_187148	TCA	2	6	162251	162256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995484
3102	NT_187148	GA	3	6	162272	162277	50 %	0 %	50 %	0 %	399995484
3103	NT_187148	CGCGT	2	10	162312	162321	0 %	20 %	40 %	40 %	399995484
3104	NT_187148	GTG	2	6	162329	162334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995484
3105	NT_187148	CTT	2	6	162370	162375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995484
3106	NT_187148	GTCCTC	2	12	162391	162402	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	399995484
3107	NT_187148	CG	3	6	162466	162471	0 %	0 %	50 %	50 %	399995484
3108	NT_187148	CGA	2	6	162522	162527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3109	NT_187148	CTC	2	6	162541	162546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995484
3110	NT_187148	TTC	2	6	162556	162561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995484
3111	NT_187148	CGC	2	6	162570	162575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995484
3112	NT_187148	TCG	3	9	162584	162592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3113	NT_187148	CGG	3	9	162612	162620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995484
3114	NT_187148	CTT	2	6	162642	162647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995484
3115	NT_187148	CGT	2	6	162696	162701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3116	NT_187148	CGA	2	6	162747	162752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3117	NT_187148	ACATG	2	10	162840	162849	40 %	20 %	20 %	20 %	399995484
3118	NT_187148	TCGACG	2	12	162863	162874	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3119	NT_187148	CTC	2	6	162910	162915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995484
3120	NT_187148	TCT	2	6	162924	162929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995484
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3223	NT_187148	CGTCC	2	10	168153	168162	0 %	20 %	20 %	60 %	399995488
3224	NT_187148	GAT	2	6	168253	168258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995488
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3231	NT_187148	A	6	6	168687	168692	100 %	0 %	0 %	0 %	399995489
3232	NT_187148	CT	3	6	168728	168733	0 %	50 %	0 %	50 %	399995489
3233	NT_187148	GCG	2	6	168745	168750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995489
3234	NT_187148	CAG	2	6	168772	168777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995489
3235	NT_187148	TGC	2	6	168805	168810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995489
3236	NT_187148	GAC	3	9	168840	168848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995489
3237	NT_187148	GCG	2	6	168875	168880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995489
3238	NT_187148	ACG	2	6	168902	168907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995489
3239	NT_187148	GTC	2	6	168939	168944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995489
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3241	NT_187148	ATG	2	6	169108	169113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995489
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3344	NT_187148	AGG	2	6	174290	174295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995491
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3349	NT_187148	GTT	2	6	174619	174624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995491
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3354	NT_187148	TCG	2	6	174994	174999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995492
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3357	NT_187148	CAG	2	6	175207	175212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995492
3358	NT_187148	AC	3	6	175215	175220	50 %	0 %	0 %	50 %	399995492
3359	NT_187148	CG	3	6	175228	175233	0 %	0 %	50 %	50 %	399995492
3360	NT_187148	GGC	2	6	175254	175259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995492
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3362	NT_187148	AGC	2	6	175307	175312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995492
3363	NT_187148	C	6	6	175449	175454	0 %	0 %	0 %	100 %	399995492
3364	NT_187148	TCG	2	6	175511	175516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995492
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3366	NT_187148	GATC	2	8	175630	175637	25 %	25 %	25 %	25 %	399995492
3367	NT_187148	GCCG	2	8	175646	175653	0 %	0 %	50 %	50 %	399995492
3368	NT_187148	GAC	2	6	175752	175757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995492
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3371	NT_187148	CGA	2	6	175935	175940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995492
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3375	NT_187148	AGC	2	6	176126	176131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995492
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3379	NT_187148	ACTCGA	2	12	176526	176537	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	399995492
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3438	NT_187148	GCGGA	2	10	180703	180712	20 %	0 %	60 %	20 %	399995495
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3451	NT_187148	TGA	2	6	181821	181826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995498
3452	NT_187148	GATT	2	8	181883	181890	25 %	50 %	25 %	0 %	399995498
3453	NT_187148	GCC	2	6	181946	181951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995498
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3467	NT_187148	GCG	2	6	182527	182532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995498
3468	NT_187148	GCTT	2	8	182544	182551	0 %	50 %	25 %	25 %	399995498
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3477	NT_187148	TCG	3	9	182757	182765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995498
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3481	NT_187148	TCA	2	6	182848	182853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995498
3482	NT_187148	CGC	2	6	182940	182945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995498
3483	NT_187148	CAG	2	6	183068	183073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995498
3484	NT_187148	CGG	2	6	183122	183127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995498
3485	NT_187148	AGC	2	6	183147	183152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995498
3486	NT_187148	CAG	2	6	183278	183283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995498
3487	NT_187148	AGTCGG	2	12	183304	183315	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	399995498
3488	NT_187148	TTG	2	6	183321	183326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995498
3489	NT_187148	GC	4	8	183378	183385	0 %	0 %	50 %	50 %	399995498
3490	NT_187148	CAT	2	6	183388	183393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995498
3491	NT_187148	CCTT	2	8	183417	183424	0 %	50 %	0 %	50 %	399995498
3492	NT_187148	CTT	2	6	183442	183447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995498
3493	NT_187148	GCG	2	6	183460	183465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995498
3494	NT_187148	TCGT	2	8	183495	183502	0 %	50 %	25 %	25 %	399995498
3495	NT_187148	GC	3	6	183503	183508	0 %	0 %	50 %	50 %	399995498
3496	NT_187148	AGC	2	6	183642	183647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995498
3497	NT_187148	TCG	2	6	183754	183759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995498
3498	NT_187148	CG	3	6	183761	183766	0 %	0 %	50 %	50 %	399995498
3499	NT_187148	GAT	2	6	183778	183783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995498
3500	NT_187148	AGCC	2	8	183787	183794	25 %	0 %	25 %	50 %	399995498

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