MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 4644

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NT_187148	TC	3	6	80068	80073	0 %	50 %	0 %	50 %	399995406
1502	NT_187148	TCC	2	6	80075	80080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995406
1503	NT_187148	ATC	2	6	80361	80366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995406
1504	NT_187148	GCC	2	6	80377	80382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995406
1505	NT_187148	CGT	2	6	80478	80483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995407
1506	NT_187148	CGG	2	6	80517	80522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995407
1507	NT_187148	CCT	2	6	80553	80558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995407
1508	NT_187148	GC	3	6	80592	80597	0 %	0 %	50 %	50 %	399995407
1509	NT_187148	CGA	2	6	80634	80639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995407
1510	NT_187148	CTG	2	6	80721	80726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995407
1511	NT_187148	GCCG	2	8	80781	80788	0 %	0 %	50 %	50 %	399995407
1512	NT_187148	TGC	2	6	80850	80855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995407
1513	NT_187148	CCA	2	6	80967	80972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995407
1514	NT_187148	CT	3	6	81157	81162	0 %	50 %	0 %	50 %	399995407
1515	NT_187148	CCGC	2	8	81182	81189	0 %	0 %	25 %	75 %	399995407
1516	NT_187148	GAG	2	6	81196	81201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995407
1517	NT_187148	CGC	2	6	81210	81215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995407
1518	NT_187148	CGC	4	12	81246	81257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995407
1519	NT_187148	CGCT	2	8	81269	81276	0 %	25 %	25 %	50 %	399995407
1520	NT_187148	TGG	2	6	81333	81338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995407
1521	NT_187148	CGC	2	6	81450	81455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995408
1522	NT_187148	GCC	2	6	81479	81484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995408
1523	NT_187148	C	6	6	81510	81515	0 %	0 %	0 %	100 %	399995408
1524	NT_187148	GCC	2	6	81554	81559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995408
1525	NT_187148	TCG	2	6	81614	81619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995408
1526	NT_187148	CGC	2	6	81669	81674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995408
1527	NT_187148	CCA	2	6	81687	81692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995408
1528	NT_187148	ACA	2	6	81707	81712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995408
1529	NT_187148	GCA	2	6	81746	81751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995408
1530	NT_187148	TGA	2	6	81831	81836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995408
1531	NT_187148	CGTG	2	8	81855	81862	0 %	25 %	50 %	25 %	399995408
1532	NT_187148	CGG	2	6	81882	81887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995408
1533	NT_187148	GC	3	6	81899	81904	0 %	0 %	50 %	50 %	399995408
1534	NT_187148	TCAG	2	8	81920	81927	25 %	25 %	25 %	25 %	399995408
1535	NT_187148	GTC	2	6	81949	81954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995408
1536	NT_187148	ACGC	2	8	81992	81999	25 %	0 %	25 %	50 %	399995408
1537	NT_187148	ATG	2	6	82049	82054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995408
1538	NT_187148	GCTT	2	8	82728	82735	0 %	50 %	25 %	25 %	399995409
1539	NT_187148	CGA	2	6	82755	82760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995409
1540	NT_187148	GCGT	2	8	82814	82821	0 %	25 %	50 %	25 %	399995409
1541	NT_187148	GCA	2	6	82842	82847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995409
1542	NT_187148	AGG	2	6	82923	82928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995409
1543	NT_187148	CGT	2	6	82947	82952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995409
1544	NT_187148	AGC	2	6	83037	83042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995409
1545	NT_187148	TGA	2	6	83057	83062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995409
1546	NT_187148	GGC	3	9	83200	83208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995409
1547	NT_187148	AGG	2	6	83231	83236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995409
1548	NT_187148	CT	3	6	83248	83253	0 %	50 %	0 %	50 %	399995409
1549	NT_187148	CGT	2	6	83301	83306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995409
1550	NT_187148	CGA	2	6	83358	83363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995409
1551	NT_187148	CGG	2	6	83376	83381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995409
1552	NT_187148	AGC	2	6	83394	83399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995409
1553	NT_187148	GCG	2	6	83417	83422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995409
1554	NT_187148	AAC	2	6	83546	83551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995409
1555	NT_187148	GGT	2	6	83571	83576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995409
1556	NT_187148	TTG	2	6	83591	83596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995409
1557	NT_187148	TCG	2	6	83607	83612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995409
1558	NT_187148	CGG	2	6	83622	83627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995409
1559	NT_187148	CGA	2	6	83649	83654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995409
1560	NT_187148	TGAC	2	8	83655	83662	25 %	25 %	25 %	25 %	399995409
1561	NT_187148	GCC	2	6	83667	83672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995410
1562	NT_187148	TTC	2	6	83711	83716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995410
1563	NT_187148	CCGGA	2	10	83722	83731	20 %	0 %	40 %	40 %	399995410
1564	NT_187148	GCA	2	6	83766	83771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995410
1565	NT_187148	GCAA	2	8	83795	83802	50 %	0 %	25 %	25 %	399995410
1566	NT_187148	GTC	2	6	83806	83811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995410
1567	NT_187148	TCG	2	6	83909	83914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995410
1568	NT_187148	GAT	2	6	83923	83928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995410
1569	NT_187148	CGA	2	6	84018	84023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995410
1570	NT_187148	GACG	2	8	84072	84079	25 %	0 %	50 %	25 %	399995410
1571	NT_187148	GGC	2	6	84097	84102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995410
1572	NT_187148	CAG	2	6	84133	84138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995410
1573	NT_187148	TA	3	6	84175	84180	50 %	50 %	0 %	0 %	399995410
1574	NT_187148	GTC	2	6	84298	84303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995410
1575	NT_187148	GCC	2	6	84312	84317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995410
1576	NT_187148	GC	3	6	84366	84371	0 %	0 %	50 %	50 %	399995410
1577	NT_187148	CGG	2	6	84425	84430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995410
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1580	NT_187148	CTT	2	6	84508	84513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995410
1581	NT_187148	TCG	2	6	84530	84535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995410
1582	NT_187148	TGT	2	6	84576	84581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995410
1583	NT_187148	CGG	2	6	84583	84588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995410
1584	NT_187148	AGG	2	6	84597	84602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995410
1585	NT_187148	GCG	2	6	84697	84702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995410
1586	NT_187148	CAT	2	6	84712	84717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995410
1587	NT_187148	GCA	2	6	84752	84757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995410
1588	NT_187148	CGC	2	6	84770	84775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995410
1589	NT_187148	AGC	2	6	84778	84783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995410
1590	NT_187148	GGC	2	6	84794	84799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995411
1591	NT_187148	GCC	2	6	84810	84815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995411
1592	NT_187148	TGAT	2	8	84919	84926	25 %	50 %	25 %	0 %	399995411
1593	NT_187148	CG	3	6	85004	85009	0 %	0 %	50 %	50 %	399995411
1594	NT_187148	AAGG	2	8	85017	85024	50 %	0 %	50 %	0 %	399995411
1595	NT_187148	ATC	2	6	85107	85112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995411
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1597	NT_187148	GC	3	6	85151	85156	0 %	0 %	50 %	50 %	399995411
1598	NT_187148	GCGTC	2	10	85177	85186	0 %	20 %	40 %	40 %	399995411
1599	NT_187148	CTC	2	6	85191	85196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995411
1600	NT_187148	CCG	2	6	85223	85228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995411
1601	NT_187148	CGC	2	6	85301	85306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995411
1602	NT_187148	GGC	2	6	85337	85342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995411
1603	NT_187148	CGG	2	6	85427	85432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995411
1604	NT_187148	CG	3	6	85459	85464	0 %	0 %	50 %	50 %	399995411
1605	NT_187148	GC	3	6	85473	85478	0 %	0 %	50 %	50 %	399995411
1606	NT_187148	GA	3	6	85760	85765	50 %	0 %	50 %	0 %	399995412
1607	NT_187148	GAA	2	6	85918	85923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995412
1608	NT_187148	GC	4	8	85931	85938	0 %	0 %	50 %	50 %	399995412
1609	NT_187148	TGC	2	6	85940	85945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995412
1610	NT_187148	GGC	2	6	85950	85955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995412
1611	NT_187148	TCG	2	6	85973	85978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995412
1612	NT_187148	GAC	2	6	85986	85991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995412
1613	NT_187148	AAG	2	6	86116	86121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995412
1614	NT_187148	CGA	2	6	86165	86170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995412
1615	NT_187148	ACG	2	6	86183	86188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995412
1616	NT_187148	CGA	2	6	86232	86237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995412
1617	NT_187148	TCA	2	6	86243	86248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995412
1618	NT_187148	TCC	2	6	86381	86386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995412
1619	NT_187148	GCT	2	6	86460	86465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995412
1620	NT_187148	CAT	2	6	86466	86471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995412
1621	NT_187148	GAG	2	6	86629	86634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995412
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1623	NT_187148	GTC	2	6	86689	86694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995412
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1625	NT_187148	ATC	2	6	86716	86721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995412
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1874	NT_187148	GGA	2	6	99215	99220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995423
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1993	NT_187148	CTG	2	6	105132	105137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995428
1994	NT_187148	CGA	2	6	105146	105151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995428
1995	NT_187148	CTCG	2	8	105174	105181	0 %	25 %	25 %	50 %	399995428
1996	NT_187148	ATC	2	6	105244	105249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995429
1997	NT_187148	AGC	2	6	105323	105328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995429
1998	NT_187148	TCT	2	6	105375	105380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995429
1999	NT_187148	CCA	2	6	105383	105388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995429
2000	NT_187148	ACACAG	2	12	105459	105470	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	399995429

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