MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 4644

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NT_187148	AGG	3	9	54169	54177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995382
1002	NT_187148	CAT	2	6	54179	54184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995382
1003	NT_187148	CGC	2	6	54196	54201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995382
1004	NT_187148	GAA	2	6	54219	54224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995382
1005	NT_187148	ACC	2	6	54273	54278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995382
1006	NT_187148	AGCC	2	8	54374	54381	25 %	0 %	25 %	50 %	399995383
1007	NT_187148	GA	3	6	54406	54411	50 %	0 %	50 %	0 %	399995383
1008	NT_187148	AGG	2	6	54413	54418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995383
1009	NT_187148	CTGC	2	8	54435	54442	0 %	25 %	25 %	50 %	399995383
1010	NT_187148	CG	3	6	54451	54456	0 %	0 %	50 %	50 %	399995383
1011	NT_187148	CGCT	2	8	54587	54594	0 %	25 %	25 %	50 %	399995383
1012	NT_187148	GGA	2	6	54869	54874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995384
1013	NT_187148	CCT	2	6	54901	54906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995384
1014	NT_187148	GCC	2	6	54921	54926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995384
1015	NT_187148	ACAA	2	8	54939	54946	75 %	0 %	0 %	25 %	399995384
1016	NT_187148	TGCC	2	8	54950	54957	0 %	25 %	25 %	50 %	399995384
1017	NT_187148	ATC	2	6	55017	55022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995384
1018	NT_187148	CGA	2	6	55042	55047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995384
1019	NT_187148	CCA	2	6	55141	55146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995384
1020	NT_187148	AG	3	6	55171	55176	50 %	0 %	50 %	0 %	399995384
1021	NT_187148	CCT	2	6	55212	55217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995384
1022	NT_187148	CGC	3	9	55250	55258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995384
1023	NT_187148	AAGC	2	8	55292	55299	50 %	0 %	25 %	25 %	399995384
1024	NT_187148	GAT	2	6	55300	55305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995384
1025	NT_187148	GCG	2	6	55330	55335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995384
1026	NT_187148	CAA	2	6	55388	55393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995384
1027	NT_187148	GAT	2	6	55424	55429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995384
1028	NT_187148	CAGCGG	2	12	55433	55444	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	399995384
1029	NT_187148	CTC	2	6	55547	55552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995384
1030	NT_187148	TCG	2	6	55581	55586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995384
1031	NT_187148	GCT	2	6	55602	55607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995384
1032	NT_187148	CCT	2	6	55657	55662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995384
1033	NT_187148	CGT	2	6	55675	55680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995384
1034	NT_187148	CAC	2	6	55841	55846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995384
1035	NT_187148	TGG	2	6	55897	55902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995384
1036	NT_187148	GAT	2	6	55909	55914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995384
1037	NT_187148	TGCC	2	8	55939	55946	0 %	25 %	25 %	50 %	399995384
1038	NT_187148	CG	3	6	55981	55986	0 %	0 %	50 %	50 %	399995384
1039	NT_187148	TCG	2	6	56035	56040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995384
1040	NT_187148	TCC	2	6	56112	56117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995384
1041	NT_187148	CCCTC	2	10	56230	56239	0 %	20 %	0 %	80 %	399995384
1042	NT_187148	GCCC	2	8	56328	56335	0 %	0 %	25 %	75 %	399995384
1043	NT_187148	CCG	2	6	56379	56384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995384
1044	NT_187148	TCGC	2	8	56389	56396	0 %	25 %	25 %	50 %	399995384
1045	NT_187148	GCC	2	6	56431	56436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995384
1046	NT_187148	CCG	2	6	56467	56472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995384
1047	NT_187148	GGCG	2	8	56477	56484	0 %	0 %	75 %	25 %	399995384
1048	NT_187148	TCAG	2	8	56529	56536	25 %	25 %	25 %	25 %	399995384
1049	NT_187148	TGACCG	2	12	56560	56571	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	399995384
1050	NT_187148	CGG	2	6	56584	56589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995384
1051	NT_187148	GCG	2	6	56615	56620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995384
1052	NT_187148	TCG	2	6	56659	56664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995384
1053	NT_187148	TGCC	2	8	56717	56724	0 %	25 %	25 %	50 %	399995384
1054	NT_187148	GAA	2	6	56756	56761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995384
1055	NT_187148	AGCA	2	8	56780	56787	50 %	0 %	25 %	25 %	399995384
1056	NT_187148	GAGG	2	8	56804	56811	25 %	0 %	75 %	0 %	399995384
1057	NT_187148	CAG	2	6	56822	56827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995384
1058	NT_187148	CG	3	6	56862	56867	0 %	0 %	50 %	50 %	399995384
1059	NT_187148	GAC	2	6	56903	56908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995384
1060	NT_187148	TGC	2	6	56959	56964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995384
1061	NT_187148	GCG	2	6	56991	56996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995384
1062	NT_187148	TCGCC	2	10	57013	57022	0 %	20 %	20 %	60 %	399995384
1063	NT_187148	CAG	2	6	57101	57106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995385
1064	NT_187148	GCA	2	6	57185	57190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995385
1065	NT_187148	GCTCG	2	10	57215	57224	0 %	20 %	40 %	40 %	399995385
1066	NT_187148	CGC	2	6	57336	57341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995385
1067	NT_187148	GAA	2	6	57469	57474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995385
1068	NT_187148	CTT	2	6	57509	57514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995385
1069	NT_187148	GAT	2	6	57849	57854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995386
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1072	NT_187148	GC	4	8	57972	57979	0 %	0 %	50 %	50 %	399995386
1073	NT_187148	CCG	2	6	58126	58131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995387
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1077	NT_187148	GCC	2	6	58391	58396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995388
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1081	NT_187148	AG	3	6	59003	59008	50 %	0 %	50 %	0 %	399995389
1082	NT_187148	GGCGC	2	10	59009	59018	0 %	0 %	60 %	40 %	399995389
1083	NT_187148	ACC	3	9	59022	59030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995389
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1086	NT_187148	TCG	2	6	59065	59070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995389
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1092	NT_187148	CCA	2	6	59145	59150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995389
1093	NT_187148	CATG	2	8	59176	59183	25 %	25 %	25 %	25 %	399995389
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1095	NT_187148	CTC	2	6	59248	59253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995389
1096	NT_187148	CA	3	6	59286	59291	50 %	0 %	0 %	50 %	399995389
1097	NT_187148	GC	3	6	59305	59310	0 %	0 %	50 %	50 %	399995389
1098	NT_187148	TCT	2	6	59321	59326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995389
1099	NT_187148	GTA	2	6	59370	59375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995389
1100	NT_187148	GAC	2	6	59382	59387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995389
1101	NT_187148	AAG	2	6	59439	59444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995389
1102	NT_187148	CTC	2	6	59454	59459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995389
1103	NT_187148	TGA	2	6	59474	59479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995389
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1105	NT_187148	GAGTTT	2	12	59507	59518	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	399995389
1106	NT_187148	GC	3	6	59531	59536	0 %	0 %	50 %	50 %	399995389
1107	NT_187148	ACGCA	2	10	59545	59554	40 %	0 %	20 %	40 %	399995389
1108	NT_187148	AGC	2	6	59619	59624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995390
1109	NT_187148	ACG	2	6	59660	59665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995390
1110	NT_187148	CG	3	6	59744	59749	0 %	0 %	50 %	50 %	399995390
1111	NT_187148	CGG	2	6	59776	59781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995390
1112	NT_187148	CCG	2	6	59841	59846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995390
1113	NT_187148	AGCG	2	8	59847	59854	25 %	0 %	50 %	25 %	399995390
1114	NT_187148	TGC	2	6	59866	59871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995390
1115	NT_187148	GAT	2	6	59906	59911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995390
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1117	NT_187148	CGG	2	6	60006	60011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995390
1118	NT_187148	GGCCA	2	10	60083	60092	20 %	0 %	40 %	40 %	399995390
1119	NT_187148	GCA	2	6	60169	60174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995390
1120	NT_187148	GC	3	6	60277	60282	0 %	0 %	50 %	50 %	399995390
1121	NT_187148	CGC	2	6	60534	60539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995391
1122	NT_187148	T	6	6	60549	60554	0 %	100 %	0 %	0 %	399995391
1123	NT_187148	GGC	2	6	60822	60827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995391
1124	NT_187148	GCC	2	6	60849	60854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995391
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