MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 4537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NT_187147	TCG	3	9	183527	183535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995206
3002	NT_187147	G	6	6	183551	183556	0 %	0 %	100 %	0 %	399995206
3003	NT_187147	GGC	2	6	183562	183567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995206
3004	NT_187147	CGT	2	6	183709	183714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995206
3005	NT_187147	GCCC	2	8	183754	183761	0 %	0 %	25 %	75 %	399995206
3006	NT_187147	GCCTT	2	10	183822	183831	0 %	40 %	20 %	40 %	399995206
3007	NT_187147	TCG	2	6	183849	183854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995206
3008	NT_187147	GTT	2	6	183949	183954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995206
3009	NT_187147	TTC	2	6	184103	184108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995206
3010	NT_187147	CCG	2	6	184202	184207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995206
3011	NT_187147	GCC	2	6	184230	184235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995206
3012	NT_187147	GAG	2	6	184247	184252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995206
3013	NT_187147	CTC	2	6	184282	184287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995206
3014	NT_187147	GGC	2	6	184402	184407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995207
3015	NT_187147	TCCG	2	8	184416	184423	0 %	25 %	25 %	50 %	399995207
3016	NT_187147	TGA	2	6	184502	184507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995207
3017	NT_187147	TCA	2	6	184782	184787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995208
3018	NT_187147	CGC	2	6	184803	184808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995208
3019	NT_187147	GC	4	8	184846	184853	0 %	0 %	50 %	50 %	399995208
3020	NT_187147	GGA	2	6	184859	184864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995208
3021	NT_187147	TGA	2	6	184870	184875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995208
3022	NT_187147	TCA	2	6	185141	185146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995209
3023	NT_187147	TG	3	6	185216	185221	0 %	50 %	50 %	0 %	399995209
3024	NT_187147	TGA	2	6	185241	185246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995209
3025	NT_187147	TAC	2	6	185628	185633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995210
3026	NT_187147	AGC	2	6	185658	185663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995210
3027	NT_187147	TCG	2	6	185688	185693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995210
3028	NT_187147	CTG	2	6	185807	185812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995210
3029	NT_187147	CGA	2	6	185926	185931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995210
3030	NT_187147	CGT	2	6	186004	186009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995210
3031	NT_187147	CTA	2	6	186055	186060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995210
3032	NT_187147	CGA	2	6	186115	186120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995210
3033	NT_187147	TGG	2	6	186179	186184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995210
3034	NT_187147	CG	3	6	186210	186215	0 %	0 %	50 %	50 %	399995210
3035	NT_187147	ACG	2	6	186227	186232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995210
3036	NT_187147	TTCG	2	8	186271	186278	0 %	50 %	25 %	25 %	399995210
3037	NT_187147	CGG	2	6	186283	186288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995210
3038	NT_187147	TCGAT	2	10	186360	186369	20 %	40 %	20 %	20 %	399995210
3039	NT_187147	T	6	6	186380	186385	0 %	100 %	0 %	0 %	399995210
3040	NT_187147	ATT	2	6	186432	186437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995210
3041	NT_187147	CGG	2	6	186483	186488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995210
3042	NT_187147	CGA	3	9	186586	186594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995210
3043	NT_187147	GAA	2	6	186632	186637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995210
3044	NT_187147	TCT	2	6	186651	186656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995210
3045	NT_187147	CTT	3	9	186682	186690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995210
3046	NT_187147	TCC	2	6	186707	186712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995210
3047	NT_187147	GAA	2	6	186736	186741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995210
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3049	NT_187147	CAC	2	6	186781	186786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995210
3050	NT_187147	CGG	2	6	186805	186810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995210
3051	NT_187147	CGC	2	6	186813	186818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995210
3052	NT_187147	GC	3	6	186824	186829	0 %	0 %	50 %	50 %	399995210
3053	NT_187147	AGC	2	6	186941	186946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995210
3054	NT_187147	GC	3	6	187007	187012	0 %	0 %	50 %	50 %	399995210
3055	NT_187147	ACT	2	6	187122	187127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995210
3056	NT_187147	GCC	2	6	187139	187144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995210
3057	NT_187147	ATTG	2	8	187198	187205	25 %	50 %	25 %	0 %	399995210
3058	NT_187147	GCC	2	6	187313	187318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995210
3059	NT_187147	GTG	2	6	187390	187395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995210
3060	NT_187147	CTAT	2	8	188440	188447	25 %	50 %	0 %	25 %	399995211
3061	NT_187147	ACA	2	6	188452	188457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995211
3062	NT_187147	ACG	2	6	188463	188468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995211
3063	NT_187147	CG	3	6	188467	188472	0 %	0 %	50 %	50 %	399995211
3064	NT_187147	TGC	2	6	188497	188502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995211
3065	NT_187147	TTC	2	6	188505	188510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995211
3066	NT_187147	GC	3	6	188580	188585	0 %	0 %	50 %	50 %	399995211
3067	NT_187147	CGGG	2	8	188641	188648	0 %	0 %	75 %	25 %	399995211
3068	NT_187147	CAA	2	6	188657	188662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995211
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3070	NT_187147	CGG	2	6	188719	188724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995211
3071	NT_187147	CTTGAC	2	12	188817	188828	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	399995211
3072	NT_187147	AC	3	6	188847	188852	50 %	0 %	0 %	50 %	399995211
3073	NT_187147	CAA	2	6	188882	188887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995211
3074	NT_187147	AGCT	2	8	188917	188924	25 %	25 %	25 %	25 %	399995211
3075	NT_187147	A	6	6	188934	188939	100 %	0 %	0 %	0 %	399995211
3076	NT_187147	CCA	2	6	189116	189121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995211
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3078	NT_187147	TAG	2	6	189163	189168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995211
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3080	NT_187147	GGACAA	2	12	189206	189217	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	399995211
3081	NT_187147	ATA	2	6	189222	189227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399995211
3082	NT_187147	CGAT	2	8	189239	189246	25 %	25 %	25 %	25 %	399995211
3083	NT_187147	GGT	2	6	189345	189350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995211
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3086	NT_187147	CAGG	2	8	189464	189471	25 %	0 %	50 %	25 %	399995211
3087	NT_187147	A	6	6	189558	189563	100 %	0 %	0 %	0 %	399995211
3088	NT_187147	ATG	3	9	189767	189775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995212
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3090	NT_187147	GAG	2	6	189835	189840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995212
3091	NT_187147	TTC	2	6	189841	189846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995212
3092	NT_187147	GGA	2	6	189933	189938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995212
3093	NT_187147	GCC	2	6	189964	189969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995212
3094	NT_187147	GC	4	8	189976	189983	0 %	0 %	50 %	50 %	399995212
3095	NT_187147	GC	3	6	189993	189998	0 %	0 %	50 %	50 %	399995212
3096	NT_187147	TCG	2	6	190018	190023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995212
3097	NT_187147	GCT	2	6	190075	190080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995212
3098	NT_187147	GAA	2	6	190108	190113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995212
3099	NT_187147	GCG	2	6	190142	190147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995212
3100	NT_187147	TCA	2	6	190167	190172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995212
3101	NT_187147	AGT	2	6	190182	190187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995212
3102	NT_187147	TAA	2	6	190229	190234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399995213
3103	NT_187147	GTG	2	6	190248	190253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995213
3104	NT_187147	CCG	2	6	190467	190472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995213
3105	NT_187147	G	6	6	190474	190479	0 %	0 %	100 %	0 %	399995213
3106	NT_187147	TCG	2	6	190480	190485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995213
3107	NT_187147	CTG	2	6	190488	190493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995213
3108	NT_187147	GCCG	2	8	190495	190502	0 %	0 %	50 %	50 %	399995213
3109	NT_187147	TCG	2	6	190519	190524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995213
3110	NT_187147	TC	3	6	190530	190535	0 %	50 %	0 %	50 %	399995213
3111	NT_187147	CGC	2	6	190539	190544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995213
3112	NT_187147	CGT	2	6	190550	190555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995213
3113	NT_187147	TGAA	2	8	190586	190593	50 %	25 %	25 %	0 %	399995213
3114	NT_187147	ATGC	2	8	190721	190728	25 %	25 %	25 %	25 %	399995214
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3116	NT_187147	CAT	2	6	190790	190795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995214
3117	NT_187147	AGGC	2	8	190896	190903	25 %	0 %	50 %	25 %	399995215
3118	NT_187147	ACA	2	6	190973	190978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995215
3119	NT_187147	AAG	2	6	191038	191043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995215
3120	NT_187147	CG	3	6	191075	191080	0 %	0 %	50 %	50 %	399995215
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3233	NT_187147	CAA	3	9	198268	198276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995223
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3237	NT_187147	GAG	2	6	198503	198508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995223
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3243	NT_187147	CAT	2	6	198949	198954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995223
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3484	NT_187147	TCA	2	6	210868	210873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995236
3485	NT_187147	TTC	2	6	211012	211017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995236
3486	NT_187147	TC	3	6	211031	211036	0 %	50 %	0 %	50 %	399995236
3487	NT_187147	AGA	2	6	211136	211141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995236
3488	NT_187147	TGGC	2	8	211627	211634	0 %	25 %	50 %	25 %	399995237
3489	NT_187147	GGC	2	6	211727	211732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995237
3490	NT_187147	TGTGA	2	10	211789	211798	20 %	40 %	40 %	0 %	399995237
3491	NT_187147	AGC	2	6	211850	211855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995238
3492	NT_187147	GTCG	2	8	211872	211879	0 %	25 %	50 %	25 %	399995238
3493	NT_187147	AGAA	2	8	211907	211914	75 %	0 %	25 %	0 %	399995238
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3497	NT_187147	GTCA	2	8	211984	211991	25 %	25 %	25 %	25 %	399995238
3498	NT_187147	CCGT	2	8	212032	212039	0 %	25 %	25 %	50 %	399995238
3499	NT_187147	CATT	2	8	212045	212052	25 %	50 %	0 %	25 %	399995238
3500	NT_187147	GTC	2	6	212062	212067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995238

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