MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 4537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NT_187147	CTT	2	6	64623	64628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995084
1002	NT_187147	TCG	2	6	64680	64685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995085
1003	NT_187147	ATG	2	6	64761	64766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995085
1004	NT_187147	CGG	2	6	64790	64795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995085
1005	NT_187147	CAT	3	9	64838	64846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995085
1006	NT_187147	AT	3	6	64849	64854	50 %	50 %	0 %	0 %	399995085
1007	NT_187147	AGA	2	6	64870	64875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995085
1008	NT_187147	TAA	2	6	64892	64897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399995085
1009	NT_187147	ATG	2	6	64908	64913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995085
1010	NT_187147	GAG	2	6	64919	64924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995085
1011	NT_187147	C	6	6	65028	65033	0 %	0 %	0 %	100 %	399995085
1012	NT_187147	CGA	2	6	65038	65043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995085
1013	NT_187147	CCT	2	6	65224	65229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995085
1014	NT_187147	AGGA	2	8	65375	65382	50 %	0 %	50 %	0 %	399995085
1015	NT_187147	GC	3	6	65398	65403	0 %	0 %	50 %	50 %	399995085
1016	NT_187147	GAGCG	2	10	65551	65560	20 %	0 %	60 %	20 %	399995086
1017	NT_187147	AGTG	2	8	65614	65621	25 %	25 %	50 %	0 %	399995086
1018	NT_187147	TGC	2	6	65647	65652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995086
1019	NT_187147	GAT	2	6	65656	65661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995086
1020	NT_187147	CAA	2	6	65676	65681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995086
1021	NT_187147	ACC	2	6	65723	65728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995086
1022	NT_187147	CGA	2	6	65837	65842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995087
1023	NT_187147	TCG	2	6	65873	65878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995087
1024	NT_187147	TCG	2	6	65912	65917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995087
1025	NT_187147	AGG	2	6	65953	65958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995087
1026	NT_187147	CG	3	6	65973	65978	0 %	0 %	50 %	50 %	399995087
1027	NT_187147	ATC	2	6	66021	66026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995087
1028	NT_187147	GC	3	6	66040	66045	0 %	0 %	50 %	50 %	399995087
1029	NT_187147	GAG	2	6	66073	66078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995087
1030	NT_187147	CGC	2	6	66088	66093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995087
1031	NT_187147	CTT	2	6	66111	66116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995087
1032	NT_187147	CAAG	2	8	66125	66132	50 %	0 %	25 %	25 %	399995087
1033	NT_187147	GGC	2	6	66150	66155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995087
1034	NT_187147	GTC	2	6	66165	66170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995087
1035	NT_187147	GGT	2	6	66283	66288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995087
1036	NT_187147	GAACA	2	10	66321	66330	60 %	0 %	20 %	20 %	399995087
1037	NT_187147	GAC	2	6	66360	66365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995087
1038	NT_187147	AAG	2	6	66402	66407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995087
1039	NT_187147	GCC	2	6	66549	66554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995088
1040	NT_187147	CTC	2	6	66584	66589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995088
1041	NT_187147	GCGG	2	8	66723	66730	0 %	0 %	75 %	25 %	399995088
1042	NT_187147	GGT	2	6	66750	66755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995088
1043	NT_187147	CAGA	2	8	66792	66799	50 %	0 %	25 %	25 %	399995088
1044	NT_187147	GCC	2	6	66872	66877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995088
1045	NT_187147	CG	3	6	66936	66941	0 %	0 %	50 %	50 %	399995088
1046	NT_187147	GC	3	6	66975	66980	0 %	0 %	50 %	50 %	399995088
1047	NT_187147	TCC	2	6	67133	67138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995088
1048	NT_187147	AAGC	2	8	67203	67210	50 %	0 %	25 %	25 %	399995088
1049	NT_187147	GA	3	6	67251	67256	50 %	0 %	50 %	0 %	399995088
1050	NT_187147	GCGA	2	8	67560	67567	25 %	0 %	50 %	25 %	399995089
1051	NT_187147	TCG	3	9	67593	67601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995089
1052	NT_187147	AGAA	2	8	67625	67632	75 %	0 %	25 %	0 %	399995089
1053	NT_187147	GC	3	6	67641	67646	0 %	0 %	50 %	50 %	399995089
1054	NT_187147	CGC	2	6	67721	67726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995089
1055	NT_187147	GC	3	6	67751	67756	0 %	0 %	50 %	50 %	399995089
1056	NT_187147	GTC	2	6	67757	67762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995089
1057	NT_187147	GGT	2	6	67813	67818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995089
1058	NT_187147	GCG	2	6	67830	67835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995089
1059	NT_187147	CTTC	2	8	67963	67970	0 %	50 %	0 %	50 %	399995089
1060	NT_187147	TCGCGC	2	12	67992	68003	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	399995089
1061	NT_187147	CATC	2	8	68062	68069	25 %	25 %	0 %	50 %	399995089
1062	NT_187147	CGC	2	6	68166	68171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995090
1063	NT_187147	CTTG	2	8	68172	68179	0 %	50 %	25 %	25 %	399995090
1064	NT_187147	GC	3	6	68218	68223	0 %	0 %	50 %	50 %	399995090
1065	NT_187147	GAG	2	6	68224	68229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995090
1066	NT_187147	TGC	2	6	68245	68250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995090
1067	NT_187147	GCA	2	6	68301	68306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995090
1068	NT_187147	CGC	2	6	68332	68337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995090
1069	NT_187147	CG	3	6	68376	68381	0 %	0 %	50 %	50 %	399995090
1070	NT_187147	GATCG	2	10	68392	68401	20 %	20 %	40 %	20 %	399995090
1071	NT_187147	GC	3	6	68468	68473	0 %	0 %	50 %	50 %	399995090
1072	NT_187147	CAG	2	6	68476	68481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995090
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1075	NT_187147	CGG	2	6	68527	68532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995090
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1079	NT_187147	GAC	2	6	68791	68796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995090
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1081	NT_187147	GAG	2	6	68893	68898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995090
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1083	NT_187147	ATTGG	2	10	68954	68963	20 %	40 %	40 %	0 %	399995090
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1085	NT_187147	GAC	2	6	69097	69102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995090
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1087	NT_187147	AGC	2	6	69146	69151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995090
1088	NT_187147	CAA	2	6	69163	69168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995090
1089	NT_187147	GCA	2	6	69213	69218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995090
1090	NT_187147	ACG	2	6	69296	69301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995090
1091	NT_187147	CG	3	6	69300	69305	0 %	0 %	50 %	50 %	399995090
1092	NT_187147	GAG	2	6	69354	69359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995090
1093	NT_187147	TAT	2	6	69372	69377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995090
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1095	NT_187147	GC	4	8	69440	69447	0 %	0 %	50 %	50 %	399995091
1096	NT_187147	CA	3	6	69495	69500	50 %	0 %	0 %	50 %	399995091
1097	NT_187147	GCG	2	6	69506	69511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995091
1098	NT_187147	CGTC	2	8	69556	69563	0 %	25 %	25 %	50 %	399995091
1099	NT_187147	CG	4	8	69578	69585	0 %	0 %	50 %	50 %	399995091
1100	NT_187147	CA	4	8	69605	69612	50 %	0 %	0 %	50 %	399995091
1101	NT_187147	CTT	2	6	69623	69628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995091
1102	NT_187147	GCG	2	6	69865	69870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995091
1103	NT_187147	GCT	2	6	69890	69895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995091
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1105	NT_187147	GCG	2	6	69986	69991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995091
1106	NT_187147	TGC	2	6	69999	70004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995091
1107	NT_187147	AAC	2	6	70064	70069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995092
1108	NT_187147	TGCG	2	8	70282	70289	0 %	25 %	50 %	25 %	399995092
1109	NT_187147	AAG	2	6	70378	70383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995092
1110	NT_187147	AGC	2	6	70384	70389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995092
1111	NT_187147	CGA	2	6	70391	70396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995092
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1113	NT_187147	CAC	2	6	70510	70515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995092
1114	NT_187147	GGC	2	6	70546	70551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995092
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1116	NT_187147	GCTC	2	8	70581	70588	0 %	25 %	25 %	50 %	399995092
1117	NT_187147	CGA	2	6	70973	70978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995093
1118	NT_187147	GCA	2	6	70994	70999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995093
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1120	NT_187147	GT	3	6	71054	71059	0 %	50 %	50 %	0 %	399995093
1121	NT_187147	GCA	2	6	71069	71074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995093
1122	NT_187147	AACGT	2	10	71166	71175	40 %	20 %	20 %	20 %	399995093
1123	NT_187147	CTC	2	6	71181	71186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995093
1124	NT_187147	TTGA	2	8	71275	71282	25 %	50 %	25 %	0 %	399995093
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