MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187135	AAAAC	2	10	4172	4181	80 %	0 %	0 %	20 %	409248373
2	NT_187135	TTGCT	2	10	7177	7186	0 %	60 %	20 %	20 %	409248379
3	NT_187135	TGAGT	2	10	8629	8638	20 %	40 %	40 %	0 %	409248381
4	NT_187135	ATGGC	2	10	10471	10480	20 %	20 %	40 %	20 %	409248382
5	NT_187135	AACTA	2	10	10738	10747	60 %	20 %	0 %	20 %	409248382
6	NT_187135	CGTGC	2	10	12795	12804	0 %	20 %	40 %	40 %	409248386
7	NT_187135	CCCCG	2	10	13285	13294	0 %	0 %	20 %	80 %	409248386
8	NT_187135	CCCGG	2	10	16421	16430	0 %	0 %	40 %	60 %	409248391
9	NT_187135	ACCGT	2	10	18376	18385	20 %	20 %	20 %	40 %	409248394
10	NT_187135	AAACA	2	10	20969	20978	80 %	0 %	0 %	20 %	409248398
11	NT_187135	CTTTC	2	10	22276	22285	0 %	60 %	0 %	40 %	409248398
12	NT_187135	TTTAT	2	10	24000	24009	20 %	80 %	0 %	0 %	409248398
13	NT_187135	TAAAT	2	10	25703	25712	60 %	40 %	0 %	0 %	409248398
14	NT_187135	AAGAC	2	10	25999	26008	60 %	0 %	20 %	20 %	409248398
15	NT_187135	TGAGT	2	10	27355	27364	20 %	40 %	40 %	0 %	409248398
16	NT_187135	CAAAT	2	10	27845	27854	60 %	20 %	0 %	20 %	409248398
17	NT_187135	AATGC	2	10	28797	28806	40 %	20 %	20 %	20 %	409248398
18	NT_187135	CCCTG	2	10	28878	28887	0 %	20 %	20 %	60 %	409248398
19	NT_187135	CGATA	2	10	34554	34563	40 %	20 %	20 %	20 %	409248399
20	NT_187135	CAAAT	2	10	35188	35197	60 %	20 %	0 %	20 %	409248399
21	NT_187135	ATAAA	2	10	35935	35944	80 %	20 %	0 %	0 %	409248399
22	NT_187135	ACCAT	2	10	35981	35990	40 %	20 %	0 %	40 %	409248399
23	NT_187135	TGAAA	2	10	37071	37080	60 %	20 %	20 %	0 %	409248399
24	NT_187135	CCCAC	2	10	37982	37991	20 %	0 %	0 %	80 %	409248399
25	NT_187135	ACCAC	2	10	38528	38537	40 %	0 %	0 %	60 %	409248399
26	NT_187135	GCGTA	2	10	39269	39278	20 %	20 %	40 %	20 %	409248399
27	NT_187135	CAATC	2	10	39619	39628	40 %	20 %	0 %	40 %	409248399
28	NT_187135	TGCCA	2	10	42668	42677	20 %	20 %	20 %	40 %	409248400
29	NT_187135	CGCTT	2	10	52349	52358	0 %	40 %	20 %	40 %	409248412
30	NT_187135	GCTGG	2	10	54516	54525	0 %	20 %	60 %	20 %	409248420
31	NT_187135	GGAAT	2	10	55138	55147	40 %	20 %	40 %	0 %	409248422
32	NT_187135	CTGCG	2	10	56577	56586	0 %	20 %	40 %	40 %	409248424
33	NT_187135	TGTCG	2	10	56627	56636	0 %	40 %	40 %	20 %	409248424
34	NT_187135	AGAAA	2	10	58198	58207	80 %	0 %	20 %	0 %	409248429
35	NT_187135	CGCAG	2	10	59598	59607	20 %	0 %	40 %	40 %	409248435
36	NT_187135	TCGTT	2	10	63593	63602	0 %	60 %	20 %	20 %	409248440
37	NT_187135	CGATT	2	10	69425	69434	20 %	40 %	20 %	20 %	409248451
38	NT_187135	GGCAG	2	10	72821	72830	20 %	0 %	60 %	20 %	409248453
39	NT_187135	GCGAT	2	10	73036	73045	20 %	20 %	40 %	20 %	409248453
40	NT_187135	CCGGG	2	10	73066	73075	0 %	0 %	60 %	40 %	409248453
41	NT_187135	GAACT	2	10	79669	79678	40 %	20 %	20 %	20 %	409248455
42	NT_187135	GTGAT	2	10	80676	80685	20 %	40 %	40 %	0 %	409248456
43	NT_187135	CTGGA	2	10	81317	81326	20 %	20 %	40 %	20 %	409248457

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.