MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187135	CGC	2	6	377	382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248366
2	NT_187135	GCC	2	6	507	512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248366
3	NT_187135	TGC	2	6	515	520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248366
4	NT_187135	CGT	2	6	523	528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248366
5	NT_187135	GCT	2	6	540	545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248366
6	NT_187135	TGT	2	6	810	815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248366
7	NT_187135	GCC	2	6	817	822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248366
8	NT_187135	CGC	2	6	823	828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248366
9	NT_187135	CAG	2	6	850	855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248366
10	NT_187135	GCG	2	6	984	989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248366
11	NT_187135	CAG	2	6	1033	1038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248366
12	NT_187135	CGG	2	6	1071	1076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248366
13	NT_187135	GCG	2	6	1104	1109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248366
14	NT_187135	ATG	3	9	1123	1131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248366
15	NT_187135	GGA	2	6	1214	1219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248367
16	NT_187135	GCC	2	6	1242	1247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248367
17	NT_187135	TTC	2	6	1270	1275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248367
18	NT_187135	CTG	2	6	1296	1301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248367
19	NT_187135	ACA	2	6	1645	1650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248368
20	NT_187135	CAC	2	6	1705	1710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248368
21	NT_187135	GCC	3	9	1719	1727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248368
22	NT_187135	ATG	2	6	1761	1766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248368
23	NT_187135	ATG	2	6	1768	1773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248368
24	NT_187135	CAG	2	6	1851	1856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248368
25	NT_187135	GAC	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248369
26	NT_187135	GCC	2	6	2354	2359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248369
27	NT_187135	GCG	2	6	2418	2423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248369
28	NT_187135	GCG	2	6	2631	2636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248369
29	NT_187135	CGA	2	6	2736	2741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248369
30	NT_187135	CGG	2	6	2842	2847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248369
31	NT_187135	GGC	2	6	3329	3334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248370
32	NT_187135	ATT	2	6	3455	3460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248370
33	NT_187135	CAT	2	6	3462	3467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248370
34	NT_187135	GAT	2	6	3472	3477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248370
35	NT_187135	AGC	2	6	3629	3634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248371
36	NT_187135	AGC	2	6	3672	3677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248371
37	NT_187135	GAA	2	6	3685	3690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248371
38	NT_187135	GCA	2	6	3694	3699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248371
39	NT_187135	AAT	2	6	3742	3747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248372
40	NT_187135	CGT	2	6	3751	3756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248372
41	NT_187135	TAA	2	6	3777	3782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248372
42	NT_187135	GCA	2	6	3787	3792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248372
43	NT_187135	GAT	2	6	3799	3804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248372
44	NT_187135	ATA	2	6	3842	3847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248372
45	NT_187135	ATT	2	6	4077	4082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248373
46	NT_187135	ATA	2	6	4107	4112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248373
47	NT_187135	TGT	2	6	4129	4134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248373
48	NT_187135	GAA	2	6	4286	4291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248373
49	NT_187135	ATA	2	6	4485	4490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248374
50	NT_187135	TTG	2	6	4642	4647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248375
51	NT_187135	CGT	2	6	4818	4823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248376
52	NT_187135	GAA	2	6	4893	4898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248376
53	NT_187135	TTA	2	6	4916	4921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248376
54	NT_187135	CAT	2	6	5462	5467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248377
55	NT_187135	GGC	2	6	5568	5573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248377
56	NT_187135	GTT	2	6	5745	5750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248377
57	NT_187135	GGC	2	6	5753	5758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248377
58	NT_187135	GAC	2	6	5772	5777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248377
59	NT_187135	GAA	2	6	5793	5798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248377
60	NT_187135	GAC	2	6	5876	5881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248377
61	NT_187135	TTG	2	6	5941	5946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248377
62	NT_187135	GAA	2	6	5982	5987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248377
63	NT_187135	GGC	2	6	6020	6025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248377
64	NT_187135	GCA	2	6	6038	6043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248377
65	NT_187135	GCA	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248377
66	NT_187135	GAC	2	6	6069	6074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248377
67	NT_187135	AGC	2	6	6079	6084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248377
68	NT_187135	GGA	2	6	6185	6190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248377
69	NT_187135	CTG	2	6	6195	6200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248377
70	NT_187135	CTG	2	6	6258	6263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248377
71	NT_187135	GTT	2	6	6308	6313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248377
72	NT_187135	TGA	2	6	6362	6367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248377
73	NT_187135	TCT	2	6	6384	6389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248377
74	NT_187135	GTC	2	6	6390	6395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248377
75	NT_187135	GGT	2	6	6538	6543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248378
76	NT_187135	AGC	2	6	6608	6613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248378
77	NT_187135	TCA	2	6	6686	6691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248378
78	NT_187135	TTC	2	6	6714	6719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248378
79	NT_187135	TCA	2	6	6992	6997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248379
80	NT_187135	GCA	2	6	6999	7004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248379
81	NT_187135	ATT	2	6	7171	7176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248379
82	NT_187135	AGA	2	6	7232	7237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248379
83	NT_187135	CAC	2	6	7450	7455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248379
84	NT_187135	ATT	2	6	8273	8278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248381
85	NT_187135	TGC	2	6	8296	8301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248381
86	NT_187135	CAG	2	6	8493	8498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248381
87	NT_187135	GAA	2	6	9066	9071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248381
88	NT_187135	CAT	2	6	9191	9196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248381
89	NT_187135	GAT	2	6	9233	9238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248381
90	NT_187135	GTT	2	6	9322	9327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248381
91	NT_187135	TAT	2	6	9328	9333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248381
92	NT_187135	CTG	2	6	9404	9409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248381
93	NT_187135	ATC	2	6	9419	9424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248381
94	NT_187135	TGA	2	6	9499	9504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248381
95	NT_187135	GAT	2	6	9623	9628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248381
96	NT_187135	TCA	2	6	9661	9666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248381
97	NT_187135	TAA	2	6	9804	9809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248381
98	NT_187135	TAA	2	6	9855	9860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248381
99	NT_187135	ATT	2	6	10256	10261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248382
100	NT_187135	ATA	2	6	10525	10530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248382
101	NT_187135	CAA	2	6	10702	10707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248382
102	NT_187135	GTA	2	6	10885	10890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248382
103	NT_187135	AAT	2	6	10968	10973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248382
104	NT_187135	ATT	2	6	10981	10986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248382
105	NT_187135	AGT	2	6	11027	11032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248382
106	NT_187135	GCG	2	6	11059	11064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248382
107	NT_187135	CAA	2	6	11097	11102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248382
108	NT_187135	AAC	2	6	11432	11437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248383
109	NT_187135	CTG	2	6	11453	11458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248383
110	NT_187135	GTA	2	6	11490	11495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248383
111	NT_187135	TCT	2	6	11574	11579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248383
112	NT_187135	ATG	2	6	11725	11730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248384
113	NT_187135	CTT	2	6	11744	11749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248384
114	NT_187135	AAC	2	6	11781	11786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248384
115	NT_187135	CAA	2	6	12237	12242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248385
116	NT_187135	CAG	2	6	12563	12568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248386
117	NT_187135	AGC	2	6	12651	12656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248386
118	NT_187135	GTC	2	6	13013	13018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248386
119	NT_187135	CCG	2	6	13060	13065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248386
120	NT_187135	GGC	2	6	13151	13156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248386
121	NT_187135	GCC	2	6	13230	13235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248386
122	NT_187135	AGG	2	6	13249	13254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248386
123	NT_187135	GCT	2	6	13423	13428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248387
124	NT_187135	GTA	2	6	13573	13578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248387
125	NT_187135	GCT	2	6	13635	13640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248387
126	NT_187135	TAA	2	6	14015	14020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248388
127	NT_187135	TGA	2	6	14042	14047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248388
128	NT_187135	GCA	2	6	14070	14075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248388
129	NT_187135	TCA	2	6	14104	14109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248388
130	NT_187135	GAT	2	6	14169	14174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248388
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