MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NT_187135	AAT	2	6	30130	30135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248398
502	NT_187135	TGA	2	6	30197	30202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248398
503	NT_187135	TTC	2	6	30383	30388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248398
504	NT_187135	TAC	2	6	30391	30396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248398
505	NT_187135	A	6	6	30397	30402	100 %	0 %	0 %	0 %	409248398
506	NT_187135	CCTT	2	8	30408	30415	0 %	50 %	0 %	50 %	409248398
507	NT_187135	ATG	2	6	30483	30488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248398
508	NT_187135	ATC	2	6	30497	30502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248398
509	NT_187135	CAA	2	6	30562	30567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248398
510	NT_187135	AG	3	6	30605	30610	50 %	0 %	50 %	0 %	409248398
511	NT_187135	A	7	7	30682	30688	100 %	0 %	0 %	0 %	409248398
512	NT_187135	AT	3	6	30737	30742	50 %	50 %	0 %	0 %	409248398
513	NT_187135	CTT	2	6	30753	30758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248398
514	NT_187135	CGT	2	6	30956	30961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248398
515	NT_187135	ATA	2	6	30962	30967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248398
516	NT_187135	TCA	2	6	31012	31017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248398
517	NT_187135	T	7	7	31046	31052	0 %	100 %	0 %	0 %	409248398
518	NT_187135	TA	3	6	31121	31126	50 %	50 %	0 %	0 %	409248398
519	NT_187135	GTT	2	6	31183	31188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248398
520	NT_187135	CAG	2	6	31195	31200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248398
521	NT_187135	T	6	6	31232	31237	0 %	100 %	0 %	0 %	409248398
522	NT_187135	TA	3	6	31477	31482	50 %	50 %	0 %	0 %	409248398
523	NT_187135	TTTA	2	8	31511	31518	25 %	75 %	0 %	0 %	409248398
524	NT_187135	CAC	2	6	31525	31530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248398
525	NT_187135	TTA	2	6	31570	31575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248398
526	NT_187135	ATA	2	6	31689	31694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248398
527	NT_187135	GCC	2	6	31700	31705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248398
528	NT_187135	AGC	2	6	31736	31741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248398
529	NT_187135	AAG	2	6	31761	31766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248398
530	NT_187135	TCT	2	6	31893	31898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248398
531	NT_187135	CAT	2	6	31918	31923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248398
532	NT_187135	TA	3	6	31936	31941	50 %	50 %	0 %	0 %	409248398
533	NT_187135	TAT	2	6	31972	31977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248398
534	NT_187135	TGT	2	6	32100	32105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248398
535	NT_187135	AAT	2	6	32165	32170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248398
536	NT_187135	CAA	2	6	32192	32197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248398
537	NT_187135	T	6	6	32210	32215	0 %	100 %	0 %	0 %	409248398
538	NT_187135	AGC	2	6	32261	32266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248398
539	NT_187135	TGC	2	6	32390	32395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248398
540	NT_187135	AAC	2	6	32423	32428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248398
541	NT_187135	TGAC	2	8	32471	32478	25 %	25 %	25 %	25 %	409248398
542	NT_187135	AAT	2	6	32512	32517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248398
543	NT_187135	AT	3	6	32614	32619	50 %	50 %	0 %	0 %	409248398
544	NT_187135	GCA	2	6	32625	32630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248398
545	NT_187135	ACT	2	6	32672	32677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248398
546	NT_187135	GCA	2	6	32773	32778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248398
547	NT_187135	CAAC	2	8	32782	32789	50 %	0 %	0 %	50 %	409248398
548	NT_187135	ATG	2	6	32939	32944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248398
549	NT_187135	AGC	2	6	33021	33026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248398
550	NT_187135	GCTT	2	8	33081	33088	0 %	50 %	25 %	25 %	409248398
551	NT_187135	TTG	2	6	33183	33188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248398
552	NT_187135	GTA	2	6	33211	33216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248398
553	NT_187135	CA	3	6	33243	33248	50 %	0 %	0 %	50 %	409248398
554	NT_187135	CAG	2	6	33304	33309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248398
555	NT_187135	GGC	2	6	33314	33319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248398
556	NT_187135	TGG	2	6	33378	33383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248398
557	NT_187135	ATTA	2	8	33386	33393	50 %	50 %	0 %	0 %	409248398
558	NT_187135	ACC	2	6	33431	33436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248398
559	NT_187135	ATA	2	6	33446	33451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248398
560	NT_187135	TAGC	2	8	33517	33524	25 %	25 %	25 %	25 %	409248398
561	NT_187135	TCA	2	6	33528	33533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248398
562	NT_187135	TCA	2	6	33594	33599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248398
563	NT_187135	GAAA	2	8	33770	33777	75 %	0 %	25 %	0 %	409248398
564	NT_187135	CTCG	2	8	33790	33797	0 %	25 %	25 %	50 %	409248398
565	NT_187135	GATA	2	8	33802	33809	50 %	25 %	25 %	0 %	409248398
566	NT_187135	GCT	2	6	33820	33825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248398
567	NT_187135	GAT	2	6	33913	33918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248398
568	NT_187135	TTG	2	6	33919	33924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248398
569	NT_187135	TAA	2	6	33985	33990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248398
570	NT_187135	ATTG	2	8	34031	34038	25 %	50 %	25 %	0 %	409248399
571	NT_187135	AGC	2	6	34061	34066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248399
572	NT_187135	A	6	6	34086	34091	100 %	0 %	0 %	0 %	409248399
573	NT_187135	CAC	2	6	34164	34169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248399
574	NT_187135	GTC	2	6	34183	34188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248399
575	NT_187135	TCT	2	6	34241	34246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248399
576	NT_187135	GC	3	6	34307	34312	0 %	0 %	50 %	50 %	409248399
577	NT_187135	CAG	2	6	34447	34452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248399
578	NT_187135	ACC	2	6	34496	34501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248399
579	NT_187135	CGATA	2	10	34554	34563	40 %	20 %	20 %	20 %	409248399
580	NT_187135	CAGC	2	8	34621	34628	25 %	0 %	25 %	50 %	409248399
581	NT_187135	CAC	2	6	34758	34763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248399
582	NT_187135	TA	3	6	34765	34770	50 %	50 %	0 %	0 %	409248399
583	NT_187135	TGCA	2	8	34958	34965	25 %	25 %	25 %	25 %	409248399
584	NT_187135	CAC	2	6	34995	35000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248399
585	NT_187135	TGT	2	6	35068	35073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248399
586	NT_187135	TGA	2	6	35112	35117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248399
587	NT_187135	GAA	2	6	35182	35187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248399
588	NT_187135	CAAAT	2	10	35188	35197	60 %	20 %	0 %	20 %	409248399
589	NT_187135	GA	4	8	35220	35227	50 %	0 %	50 %	0 %	409248399
590	NT_187135	CAA	2	6	35232	35237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248399
591	NT_187135	TTA	2	6	35264	35269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248399
592	NT_187135	AGG	2	6	35280	35285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248399
593	NT_187135	CCA	2	6	35301	35306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248399
594	NT_187135	AGAT	2	8	35483	35490	50 %	25 %	25 %	0 %	409248399
595	NT_187135	TGAG	2	8	35495	35502	25 %	25 %	50 %	0 %	409248399
596	NT_187135	GCA	2	6	35579	35584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248399
597	NT_187135	AGCT	2	8	35710	35717	25 %	25 %	25 %	25 %	409248399
598	NT_187135	AAC	2	6	35810	35815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248399
599	NT_187135	CTG	2	6	35886	35891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248399
600	NT_187135	TAA	2	6	35919	35924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248399
601	NT_187135	ATAAA	2	10	35935	35944	80 %	20 %	0 %	0 %	409248399
602	NT_187135	TGAT	2	8	35959	35966	25 %	50 %	25 %	0 %	409248399
603	NT_187135	ATA	2	6	35968	35973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248399
604	NT_187135	ACCAT	2	10	35981	35990	40 %	20 %	0 %	40 %	409248399
605	NT_187135	TTA	2	6	36231	36236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248399
606	NT_187135	CAA	2	6	36241	36246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248399
607	NT_187135	A	6	6	36296	36301	100 %	0 %	0 %	0 %	409248399
608	NT_187135	ATT	2	6	36340	36345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248399
609	NT_187135	CAT	2	6	36366	36371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248399
610	NT_187135	GCC	2	6	36407	36412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248399
611	NT_187135	ATTT	2	8	36430	36437	25 %	75 %	0 %	0 %	409248399
612	NT_187135	TAA	2	6	36472	36477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248399
613	NT_187135	TATC	2	8	36480	36487	25 %	50 %	0 %	25 %	409248399
614	NT_187135	TAC	3	9	36528	36536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248399
615	NT_187135	TTA	2	6	36593	36598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248399
616	NT_187135	AC	3	6	36611	36616	50 %	0 %	0 %	50 %	409248399
617	NT_187135	CAA	2	6	36630	36635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248399
618	NT_187135	CCAA	2	8	36755	36762	50 %	0 %	0 %	50 %	409248399
619	NT_187135	AT	5	10	36914	36923	50 %	50 %	0 %	0 %	409248399
620	NT_187135	TCT	2	6	36926	36931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248399
621	NT_187135	T	6	6	36943	36948	0 %	100 %	0 %	0 %	409248399
622	NT_187135	GCA	2	6	36996	37001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248399
623	NT_187135	AAT	2	6	37025	37030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248399
624	NT_187135	GC	3	6	37034	37039	0 %	0 %	50 %	50 %	409248399
625	NT_187135	TGAAA	2	10	37071	37080	60 %	20 %	20 %	0 %	409248399
626	NT_187135	AT	4	8	37153	37160	50 %	50 %	0 %	0 %	409248399
627	NT_187135	AAC	2	6	37234	37239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248399
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629	NT_187135	ACA	2	6	37316	37321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248399
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870	NT_187135	CG	3	6	52203	52208	0 %	0 %	50 %	50 %	409248412
871	NT_187135	CGCTT	2	10	52349	52358	0 %	40 %	20 %	40 %	409248412
872	NT_187135	GA	3	6	52394	52399	50 %	0 %	50 %	0 %	409248412
873	NT_187135	ACG	3	9	52400	52408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248412
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880	NT_187135	CGG	2	6	52810	52815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248414
881	NT_187135	CCG	2	6	52831	52836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248414
882	NT_187135	TAT	2	6	52942	52947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248415
883	NT_187135	AAG	2	6	52969	52974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248415
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