MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 270

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187130	CAGC	2	8	521	528	25 %	0 %	25 %	50 %	409248217
2	NT_187130	CTTC	2	8	1933	1940	0 %	50 %	0 %	50 %	409248218
3	NT_187130	TCGG	2	8	2124	2131	0 %	25 %	50 %	25 %	409248218
4	NT_187130	CCAG	2	8	2164	2171	25 %	0 %	25 %	50 %	409248218
5	NT_187130	TCTG	2	8	2179	2186	0 %	50 %	25 %	25 %	409248218
6	NT_187130	CGCT	2	8	2342	2349	0 %	25 %	25 %	50 %	409248218
7	NT_187130	GGCT	2	8	2442	2449	0 %	25 %	50 %	25 %	409248218
8	NT_187130	CAGC	2	8	3025	3032	25 %	0 %	25 %	50 %	409248219
9	NT_187130	CGAC	2	8	3042	3049	25 %	0 %	25 %	50 %	409248219
10	NT_187130	CCGC	2	8	4680	4687	0 %	0 %	25 %	75 %	409248220
11	NT_187130	GCTG	2	8	5016	5023	0 %	25 %	50 %	25 %	409248220
12	NT_187130	GTTA	2	8	5206	5213	25 %	50 %	25 %	0 %	409248220
13	NT_187130	CAGA	2	8	5488	5495	50 %	0 %	25 %	25 %	409248220
14	NT_187130	CGGA	2	8	5502	5509	25 %	0 %	50 %	25 %	409248220
15	NT_187130	GCTG	2	8	5920	5927	0 %	25 %	50 %	25 %	409248221
16	NT_187130	GCCA	2	8	5966	5973	25 %	0 %	25 %	50 %	409248221
17	NT_187130	TCGC	2	8	6030	6037	0 %	25 %	25 %	50 %	409248221
18	NT_187130	ATGT	2	8	6860	6867	25 %	50 %	25 %	0 %	409248221
19	NT_187130	AGGA	2	8	7481	7488	50 %	0 %	50 %	0 %	409248222
20	NT_187130	ATGG	2	8	9664	9671	25 %	25 %	50 %	0 %	409248225
21	NT_187130	CACC	2	8	10268	10275	25 %	0 %	0 %	75 %	409248225
22	NT_187130	TTCA	2	8	10321	10328	25 %	50 %	0 %	25 %	409248226
23	NT_187130	GCTC	2	8	10410	10417	0 %	25 %	25 %	50 %	409248226
24	NT_187130	TGTT	2	8	11021	11028	0 %	75 %	25 %	0 %	409248226
25	NT_187130	TCAA	2	8	11336	11343	50 %	25 %	0 %	25 %	409248226
26	NT_187130	GGCG	2	8	12376	12383	0 %	0 %	75 %	25 %	409248227
27	NT_187130	GGCG	2	8	12691	12698	0 %	0 %	75 %	25 %	409248227
28	NT_187130	AGCC	2	8	12764	12771	25 %	0 %	25 %	50 %	409248227
29	NT_187130	GATC	2	8	13645	13652	25 %	25 %	25 %	25 %	409248227
30	NT_187130	CGAG	2	8	14074	14081	25 %	0 %	50 %	25 %	409248227
31	NT_187130	GCTC	2	8	14266	14273	0 %	25 %	25 %	50 %	409248227
32	NT_187130	AACA	2	8	15191	15198	75 %	0 %	0 %	25 %	409248227
33	NT_187130	CAGA	2	8	17220	17227	50 %	0 %	25 %	25 %	409248229
34	NT_187130	GATT	2	8	17339	17346	25 %	50 %	25 %	0 %	409248230
35	NT_187130	TGCT	2	8	18629	18636	0 %	50 %	25 %	25 %	409248232
36	NT_187130	TGGT	2	8	18684	18691	0 %	50 %	50 %	0 %	409248232
37	NT_187130	AGCC	2	8	22913	22920	25 %	0 %	25 %	50 %	409248234
38	NT_187130	TGCT	2	8	23402	23409	0 %	50 %	25 %	25 %	409248236
39	NT_187130	GCCA	2	8	23509	23516	25 %	0 %	25 %	50 %	409248236
40	NT_187130	TGTA	2	8	25352	25359	25 %	50 %	25 %	0 %	409248236
41	NT_187130	GGCG	2	8	25890	25897	0 %	0 %	75 %	25 %	409248236
42	NT_187130	GAAA	2	8	25912	25919	75 %	0 %	25 %	0 %	409248236
43	NT_187130	GCCA	2	8	26274	26281	25 %	0 %	25 %	50 %	409248237
44	NT_187130	TTAT	2	8	26486	26493	25 %	75 %	0 %	0 %	409248237
45	NT_187130	CTTT	2	8	28160	28167	0 %	75 %	0 %	25 %	409248240
46	NT_187130	TGAT	2	8	28574	28581	25 %	50 %	25 %	0 %	409248240
47	NT_187130	ACCA	2	8	28800	28807	50 %	0 %	0 %	50 %	409248241
48	NT_187130	GCCA	2	8	28894	28901	25 %	0 %	25 %	50 %	409248241
49	NT_187130	AATT	2	8	30088	30095	50 %	50 %	0 %	0 %	409248242
50	NT_187130	GCCA	2	8	30375	30382	25 %	0 %	25 %	50 %	409248242
51	NT_187130	TGAT	2	8	30715	30722	25 %	50 %	25 %	0 %	409248242
52	NT_187130	GCGG	2	8	31115	31122	0 %	0 %	75 %	25 %	409248243
53	NT_187130	CGTC	2	8	31143	31150	0 %	25 %	25 %	50 %	409248243
54	NT_187130	CCGG	2	8	31362	31369	0 %	0 %	50 %	50 %	409248243
55	NT_187130	GATC	2	8	31653	31660	25 %	25 %	25 %	25 %	409248243
56	NT_187130	TAGT	2	8	33737	33744	25 %	50 %	25 %	0 %	409248244
57	NT_187130	ACTG	2	8	33972	33979	25 %	25 %	25 %	25 %	409248244
58	NT_187130	TGAT	2	8	34292	34299	25 %	50 %	25 %	0 %	409248245
59	NT_187130	AGGC	2	8	35267	35274	25 %	0 %	50 %	25 %	409248246
60	NT_187130	GACC	2	8	36345	36352	25 %	0 %	25 %	50 %	409248248
61	NT_187130	GCGG	2	8	36384	36391	0 %	0 %	75 %	25 %	409248248
62	NT_187130	ATTG	2	8	36704	36711	25 %	50 %	25 %	0 %	409248248
63	NT_187130	ACAT	2	8	37680	37687	50 %	25 %	0 %	25 %	409248249
64	NT_187130	CGCT	2	8	37813	37820	0 %	25 %	25 %	50 %	409248249
65	NT_187130	AGAA	2	8	37822	37829	75 %	0 %	25 %	0 %	409248249
66	NT_187130	ACCT	2	8	38091	38098	25 %	25 %	0 %	50 %	409248249
67	NT_187130	GGCA	2	8	38934	38941	25 %	0 %	50 %	25 %	409248251
68	NT_187130	TCAG	2	8	39655	39662	25 %	25 %	25 %	25 %	409248252
69	NT_187130	GATA	2	8	40010	40017	50 %	25 %	25 %	0 %	409248252
70	NT_187130	GGCT	2	8	42760	42767	0 %	25 %	50 %	25 %	409248255
71	NT_187130	TGGC	2	8	42818	42825	0 %	25 %	50 %	25 %	409248255
72	NT_187130	ACGC	2	8	43109	43116	25 %	0 %	25 %	50 %	409248255
73	NT_187130	TGAT	2	8	44199	44206	25 %	50 %	25 %	0 %	409248256
74	NT_187130	ATCC	2	8	45020	45027	25 %	25 %	0 %	50 %	409248257
75	NT_187130	TGGA	2	8	45348	45355	25 %	25 %	50 %	0 %	409248258
76	NT_187130	TACC	2	8	45467	45474	25 %	25 %	0 %	50 %	409248258
77	NT_187130	GGCG	2	8	46220	46227	0 %	0 %	75 %	25 %	409248258
78	NT_187130	CTGG	2	8	47976	47983	0 %	25 %	50 %	25 %	409248260
79	NT_187130	TGCG	2	8	48334	48341	0 %	25 %	50 %	25 %	409248261
80	NT_187130	CTGG	2	8	48515	48522	0 %	25 %	50 %	25 %	409248261
81	NT_187130	GCTG	2	8	48868	48875	0 %	25 %	50 %	25 %	409248261
82	NT_187130	GGCG	2	8	49354	49361	0 %	0 %	75 %	25 %	409248262
83	NT_187130	CAGG	2	8	50686	50693	25 %	0 %	50 %	25 %	409248263
84	NT_187130	GATC	2	8	51529	51536	25 %	25 %	25 %	25 %	409248264
85	NT_187130	GCAT	2	8	51978	51985	25 %	25 %	25 %	25 %	409248264
86	NT_187130	ATCG	2	8	52040	52047	25 %	25 %	25 %	25 %	409248264
87	NT_187130	GGAA	2	8	52124	52131	50 %	0 %	50 %	0 %	409248264
88	NT_187130	AGGC	2	8	52447	52454	25 %	0 %	50 %	25 %	409248264
89	NT_187130	TACG	2	8	53332	53339	25 %	25 %	25 %	25 %	409248266
90	NT_187130	AGCA	2	8	54902	54909	50 %	0 %	25 %	25 %	409248267
91	NT_187130	TGCC	2	8	55526	55533	0 %	25 %	25 %	50 %	409248268
92	NT_187130	TGCG	2	8	56399	56406	0 %	25 %	50 %	25 %	409248269
93	NT_187130	GCGG	2	8	57686	57693	0 %	0 %	75 %	25 %	409248270
94	NT_187130	GAGG	2	8	58028	58035	25 %	0 %	75 %	0 %	409248270
95	NT_187130	ATGC	2	8	58253	58260	25 %	25 %	25 %	25 %	409248270
96	NT_187130	GACG	2	8	59375	59382	25 %	0 %	50 %	25 %	409248271
97	NT_187130	CTTT	2	8	60431	60438	0 %	75 %	0 %	25 %	409248273
98	NT_187130	AATG	2	8	61456	61463	50 %	25 %	25 %	0 %	409248274
99	NT_187130	AACG	2	8	61564	61571	50 %	0 %	25 %	25 %	409248274
100	NT_187130	TCCG	2	8	62268	62275	0 %	25 %	25 %	50 %	409248274
101	NT_187130	CGGT	2	8	62411	62418	0 %	25 %	50 %	25 %	409248274
102	NT_187130	TGCC	2	8	62708	62715	0 %	25 %	25 %	50 %	409248274
103	NT_187130	GGAA	2	8	62739	62746	50 %	0 %	50 %	0 %	409248274
104	NT_187130	TGTA	2	8	62811	62818	25 %	50 %	25 %	0 %	409248274
105	NT_187130	GAAA	2	8	64083	64090	75 %	0 %	25 %	0 %	409248275
106	NT_187130	GTTC	2	8	64101	64108	0 %	50 %	25 %	25 %	409248275
107	NT_187130	GCGT	2	8	64362	64369	0 %	25 %	50 %	25 %	409248276
108	NT_187130	TCGT	2	8	64553	64560	0 %	50 %	25 %	25 %	409248276
109	NT_187130	CCAG	2	8	65229	65236	25 %	0 %	25 %	50 %	409248276
110	NT_187130	GATG	2	8	66325	66332	25 %	25 %	50 %	0 %	409248277
111	NT_187130	GCAA	2	8	66711	66718	50 %	0 %	25 %	25 %	409248277
112	NT_187130	GGTT	2	8	66774	66781	0 %	50 %	50 %	0 %	409248277
113	NT_187130	CGCA	2	8	66874	66881	25 %	0 %	25 %	50 %	409248277
114	NT_187130	CGCC	2	8	66937	66944	0 %	0 %	25 %	75 %	409248277
115	NT_187130	GGGC	2	8	68403	68410	0 %	0 %	75 %	25 %	409248278
116	NT_187130	ATCA	2	8	68848	68855	50 %	25 %	0 %	25 %	409248279
117	NT_187130	GTCA	2	8	69610	69617	25 %	25 %	25 %	25 %	409248280
118	NT_187130	TGGC	2	8	69733	69740	0 %	25 %	50 %	25 %	409248280
119	NT_187130	TGGG	2	8	69744	69751	0 %	25 %	75 %	0 %	409248280
120	NT_187130	GGCG	2	8	70333	70340	0 %	0 %	75 %	25 %	409248281
121	NT_187130	CCAG	2	8	70640	70647	25 %	0 %	25 %	50 %	409248281
122	NT_187130	CTGT	2	8	72558	72565	0 %	50 %	25 %	25 %	409248284
123	NT_187130	CCGC	2	8	72732	72739	0 %	0 %	25 %	75 %	409248285
124	NT_187130	CCGC	2	8	72916	72923	0 %	0 %	25 %	75 %	409248285
125	NT_187130	CAGT	2	8	74106	74113	25 %	25 %	25 %	25 %	409248286
126	NT_187130	CTTT	2	8	74471	74478	0 %	75 %	0 %	25 %	409248286
127	NT_187130	AAAT	2	8	74890	74897	75 %	25 %	0 %	0 %	409248286
128	NT_187130	GGTA	2	8	75642	75649	25 %	25 %	50 %	0 %	409248287
129	NT_187130	ATTG	2	8	75763	75770	25 %	50 %	25 %	0 %	409248287
130	NT_187130	CCAT	2	8	75839	75846	25 %	25 %	0 %	50 %	409248287
131	NT_187130	ATTG	2	8	77476	77483	25 %	50 %	25 %	0 %	409248289
132	NT_187130	AGTG	2	8	77653	77660	25 %	25 %	50 %	0 %	409248289
133	NT_187130	TCCG	2	8	78623	78630	0 %	25 %	25 %	50 %	409248289
134	NT_187130	GCCA	2	8	78805	78812	25 %	0 %	25 %	50 %	409248289
135	NT_187130	CTGC	2	8	79017	79024	0 %	25 %	25 %	50 %	409248289
136	NT_187130	ATTG	2	8	79798	79805	25 %	50 %	25 %	0 %	409248290
137	NT_187130	TTTA	2	8	80823	80830	25 %	75 %	0 %	0 %	409248292
138	NT_187130	GATT	2	8	81392	81399	25 %	50 %	25 %	0 %	409248293
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140	NT_187130	GATC	2	8	85351	85358	25 %	25 %	25 %	25 %	409248296
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.