MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187129	CAT	4	12	340	351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248211
2	NT_187129	CAA	2	6	364	369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248211
3	NT_187129	TCT	2	6	390	395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248211
4	NT_187129	TGT	2	6	437	442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248211
5	NT_187129	GCT	2	6	462	467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248211
6	NT_187129	CTT	3	9	526	534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248211
7	NT_187129	T	6	6	671	676	0 %	100 %	0 %	0 %	409248211
8	NT_187129	GCA	2	6	924	929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248211
9	NT_187129	CAA	2	6	994	999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248211
10	NT_187129	CG	3	6	1646	1651	0 %	0 %	50 %	50 %	409248212
11	NT_187129	TCC	2	6	1763	1768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409248212
12	NT_187129	GCG	2	6	1774	1779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248212
13	NT_187129	CAG	2	6	2011	2016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248212
14	NT_187129	CCGC	2	8	2036	2043	0 %	0 %	25 %	75 %	409248212
15	NT_187129	GCC	2	6	2066	2071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248212
16	NT_187129	TCG	2	6	2087	2092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248212
17	NT_187129	CGT	2	6	2106	2111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248212
18	NT_187129	GTT	2	6	2157	2162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248212
19	NT_187129	TG	3	6	2168	2173	0 %	50 %	50 %	0 %	409248212
20	NT_187129	TTCGCT	2	12	2350	2361	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	409248212
21	NT_187129	CAGC	2	8	2439	2446	25 %	0 %	25 %	50 %	409248212
22	NT_187129	AT	3	6	2543	2548	50 %	50 %	0 %	0 %	409248212
23	NT_187129	TCA	2	6	2549	2554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248212
24	NT_187129	GGT	2	6	2587	2592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248212
25	NT_187129	CAG	2	6	2668	2673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248212
26	NT_187129	CAA	2	6	2766	2771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248212
27	NT_187129	GC	3	6	2799	2804	0 %	0 %	50 %	50 %	409248212
28	NT_187129	TGA	2	6	2811	2816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248212
29	NT_187129	TCA	2	6	2862	2867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248212
30	NT_187129	GGT	2	6	2892	2897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248212
31	NT_187129	CTG	2	6	2950	2955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248212
32	NT_187129	GATG	2	8	2968	2975	25 %	25 %	50 %	0 %	409248212
33	NT_187129	GA	3	6	2979	2984	50 %	0 %	50 %	0 %	409248212
34	NT_187129	CGG	2	6	3125	3130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248212
35	NT_187129	GAT	2	6	3156	3161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248212
36	NT_187129	GGCT	2	8	3184	3191	0 %	25 %	50 %	25 %	409248212
37	NT_187129	ATGCG	2	10	3230	3239	20 %	20 %	40 %	20 %	409248212
38	NT_187129	CAT	3	9	3265	3273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248212
39	NT_187129	GTT	2	6	3305	3310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248213
40	NT_187129	T	6	6	3377	3382	0 %	100 %	0 %	0 %	409248213
41	NT_187129	AGCG	2	8	3389	3396	25 %	0 %	50 %	25 %	409248213
42	NT_187129	CGG	2	6	3439	3444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248213
43	NT_187129	GTT	2	6	3511	3516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248213
44	NT_187129	AAG	2	6	4141	4146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248214
45	NT_187129	CA	3	6	4176	4181	50 %	0 %	0 %	50 %	409248214
46	NT_187129	ATG	2	6	4268	4273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248214
47	NT_187129	CTG	2	6	4441	4446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248214
48	NT_187129	GAA	2	6	4455	4460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248214
49	NT_187129	GAA	2	6	4554	4559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248214
50	NT_187129	AAT	2	6	5063	5068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248215
51	NT_187129	ATT	2	6	5076	5081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248215
52	NT_187129	CTC	2	6	5099	5104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409248215
53	NT_187129	TATGA	2	10	5109	5118	40 %	40 %	20 %	0 %	409248215
54	NT_187129	ATA	2	6	5134	5139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248215
55	NT_187129	GAA	2	6	5161	5166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248215
56	NT_187129	TTA	2	6	5250	5255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248215
57	NT_187129	GAT	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248215
58	NT_187129	AAAG	2	8	5269	5276	75 %	0 %	25 %	0 %	409248215
59	NT_187129	GCTT	2	8	5294	5301	0 %	50 %	25 %	25 %	409248215
60	NT_187129	TA	3	6	5307	5312	50 %	50 %	0 %	0 %	409248215
61	NT_187129	TACC	2	8	5315	5322	25 %	25 %	0 %	50 %	409248215
62	NT_187129	ATA	2	6	5380	5385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248215
63	NT_187129	TTA	2	6	5471	5476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248215
64	NT_187129	TTC	2	6	5596	5601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248215
65	NT_187129	GA	3	6	5613	5618	50 %	0 %	50 %	0 %	409248215
66	NT_187129	CTG	2	6	5692	5697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248215

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.