MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 6474

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187127	TAAAT	2	10	291	300	60 %	40 %	0 %	0 %	409247874
2	NT_187127	CAA	2	6	302	307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247874
3	NT_187127	CACG	2	8	472	479	25 %	0 %	25 %	50 %	409247874
4	NT_187127	AGC	2	6	519	524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247874
5	NT_187127	CGTG	2	8	637	644	0 %	25 %	50 %	25 %	409247874
6	NT_187127	ATC	3	9	714	722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247874
7	NT_187127	CCG	2	6	906	911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247875
8	NT_187127	T	6	6	916	921	0 %	100 %	0 %	0 %	409247875
9	NT_187127	GAG	2	6	926	931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247875
10	NT_187127	GAC	2	6	946	951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247875
11	NT_187127	TCAGG	2	10	962	971	20 %	20 %	40 %	20 %	409247875
12	NT_187127	GAA	2	6	1012	1017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247875
13	NT_187127	ACT	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247875
14	NT_187127	AAC	2	6	1133	1138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247875
15	NT_187127	CGA	2	6	1153	1158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247875
16	NT_187127	TGG	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247875
17	NT_187127	ACATC	2	10	1384	1393	40 %	20 %	0 %	40 %	409247875
18	NT_187127	TGA	2	6	1426	1431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247875
19	NT_187127	CGG	2	6	1470	1475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247875
20	NT_187127	AGA	2	6	1519	1524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247875
21	NT_187127	A	6	6	1672	1677	100 %	0 %	0 %	0 %	409247875
22	NT_187127	CG	3	6	1695	1700	0 %	0 %	50 %	50 %	409247875
23	NT_187127	TAT	2	6	1748	1753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247875
24	NT_187127	ATG	2	6	2073	2078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247876
25	NT_187127	TGA	2	6	2099	2104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247876
26	NT_187127	CAG	2	6	2238	2243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247876
27	NT_187127	TTATT	2	10	2267	2276	20 %	80 %	0 %	0 %	409247876
28	NT_187127	CGG	2	6	2326	2331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247876
29	NT_187127	G	6	6	2614	2619	0 %	0 %	100 %	0 %	409247876
30	NT_187127	GCT	2	6	2678	2683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247876
31	NT_187127	AGG	2	6	2734	2739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247876
32	NT_187127	TGG	2	6	2745	2750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247876
33	NT_187127	CG	3	6	2791	2796	0 %	0 %	50 %	50 %	409247876
34	NT_187127	TTGA	2	8	2817	2824	25 %	50 %	25 %	0 %	409247876
35	NT_187127	CTGC	2	8	2829	2836	0 %	25 %	25 %	50 %	409247876
36	NT_187127	GATG	2	8	2846	2853	25 %	25 %	50 %	0 %	409247876
37	NT_187127	TTC	2	6	2857	2862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247876
38	NT_187127	TGCGT	2	10	2864	2873	0 %	40 %	40 %	20 %	409247876
39	NT_187127	TCG	2	6	2881	2886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247876
40	NT_187127	CAGG	2	8	2966	2973	25 %	0 %	50 %	25 %	409247876
41	NT_187127	CTG	2	6	3015	3020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247876
42	NT_187127	GCGCG	2	10	3038	3047	0 %	0 %	60 %	40 %	409247876
43	NT_187127	GGC	2	6	3065	3070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247876
44	NT_187127	CAA	2	6	3098	3103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247876
45	NT_187127	AAC	2	6	3147	3152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247876
46	NT_187127	ACG	2	6	3157	3162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247876
47	NT_187127	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247876
48	NT_187127	GC	3	6	3329	3334	0 %	0 %	50 %	50 %	409247876
49	NT_187127	GCAGT	2	10	3348	3357	20 %	20 %	40 %	20 %	409247876
50	NT_187127	GGA	2	6	3410	3415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247876
51	NT_187127	CGG	2	6	3424	3429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247876
52	NT_187127	CAG	2	6	3572	3577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247876
53	NT_187127	CGA	2	6	3587	3592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247876
54	NT_187127	CAC	2	6	3617	3622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247876
55	NT_187127	CAA	2	6	3724	3729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247877
56	NT_187127	GAA	2	6	3733	3738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247877
57	NT_187127	CCCG	2	8	3779	3786	0 %	0 %	25 %	75 %	409247877
58	NT_187127	GGA	2	6	3795	3800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247877
59	NT_187127	GGT	2	6	3801	3806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247877
60	NT_187127	GGC	2	6	3869	3874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247877
61	NT_187127	A	6	6	3892	3897	100 %	0 %	0 %	0 %	409247877
62	NT_187127	GC	3	6	3917	3922	0 %	0 %	50 %	50 %	409247877
63	NT_187127	CGG	2	6	3927	3932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247877
64	NT_187127	GCA	2	6	3942	3947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247877
65	NT_187127	GGC	2	6	3993	3998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247877
66	NT_187127	CGG	2	6	4061	4066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247877
67	NT_187127	GGATC	2	10	4071	4080	20 %	20 %	40 %	20 %	409247877
68	NT_187127	AAC	2	6	4081	4086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247877
69	NT_187127	TCG	2	6	4092	4097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247877
70	NT_187127	CAGAT	2	10	4100	4109	40 %	20 %	20 %	20 %	409247877
71	NT_187127	GGC	2	6	4195	4200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247877
72	NT_187127	TGA	2	6	4220	4225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247877
73	NT_187127	GAT	2	6	4230	4235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247877
74	NT_187127	GAA	2	6	4284	4289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247877
75	NT_187127	GGC	2	6	4303	4308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247877
76	NT_187127	TGC	2	6	4350	4355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247877
77	NT_187127	TGATG	2	10	4368	4377	20 %	40 %	40 %	0 %	409247877
78	NT_187127	CTG	2	6	4390	4395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247877
79	NT_187127	GATGCG	2	12	4408	4419	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409247877
80	NT_187127	CGT	2	6	4603	4608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247877
81	NT_187127	CTG	2	6	4645	4650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247877
82	NT_187127	AGA	2	6	4682	4687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247877
83	NT_187127	GAC	2	6	4693	4698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247877
84	NT_187127	CAG	3	9	4717	4725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247877
85	NT_187127	TTA	2	6	4754	4759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247877
86	NT_187127	GCAT	2	8	4806	4813	25 %	25 %	25 %	25 %	409247877
87	NT_187127	CAA	2	6	4855	4860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247877
88	NT_187127	CGC	2	6	4869	4874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247877
89	NT_187127	CAG	2	6	4906	4911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247877
90	NT_187127	CAC	2	6	4941	4946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247877
91	NT_187127	ATT	2	6	4948	4953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247877
92	NT_187127	GCG	2	6	4958	4963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247877
93	NT_187127	GAA	2	6	4996	5001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247877
94	NT_187127	TGAT	2	8	5011	5018	25 %	50 %	25 %	0 %	409247877
95	NT_187127	GCGCT	2	10	5027	5036	0 %	20 %	40 %	40 %	409247878
96	NT_187127	GTG	2	6	5092	5097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247878
97	NT_187127	A	7	7	5109	5115	100 %	0 %	0 %	0 %	409247878
98	NT_187127	GC	3	6	5203	5208	0 %	0 %	50 %	50 %	409247879
99	NT_187127	AGC	2	6	5209	5214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247879
100	NT_187127	ATC	2	6	5278	5283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247879
101	NT_187127	TGG	3	9	5293	5301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247879
102	NT_187127	ACC	2	6	5449	5454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247879
103	NT_187127	GTT	2	6	5474	5479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247879
104	NT_187127	CTT	2	6	5540	5545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247879
105	NT_187127	TAT	2	6	5639	5644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247879
106	NT_187127	CTGA	2	8	5652	5659	25 %	25 %	25 %	25 %	409247879
107	NT_187127	GTT	2	6	5711	5716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247879
108	NT_187127	TAA	2	6	5723	5728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247879
109	NT_187127	CTGG	2	8	5735	5742	0 %	25 %	50 %	25 %	409247879
110	NT_187127	TGA	2	6	5801	5806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247879
111	NT_187127	CCTG	2	8	5827	5834	0 %	25 %	25 %	50 %	409247879
112	NT_187127	ACC	2	6	5835	5840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247879
113	NT_187127	CTGC	2	8	5901	5908	0 %	25 %	25 %	50 %	409247879
114	NT_187127	GCC	2	6	6162	6167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247879
115	NT_187127	GTCG	2	8	6210	6217	0 %	25 %	50 %	25 %	409247879
116	NT_187127	AAG	2	6	6298	6303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247879
117	NT_187127	AGA	2	6	6310	6315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247879
118	NT_187127	CTGG	2	8	6386	6393	0 %	25 %	50 %	25 %	409247879
119	NT_187127	CAG	2	6	6408	6413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247879
120	NT_187127	GCGAT	2	10	6418	6427	20 %	20 %	40 %	20 %	409247879
121	NT_187127	AGA	2	6	6428	6433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247879
122	NT_187127	GCC	2	6	6459	6464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247879
123	NT_187127	TGT	2	6	6487	6492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247879
124	NT_187127	GTG	2	6	6525	6530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247879
125	NT_187127	CTACGA	2	12	6533	6544	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409247879
126	NT_187127	GGA	2	6	6659	6664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247879
127	NT_187127	TG	3	6	6679	6684	0 %	50 %	50 %	0 %	409247879
128	NT_187127	ATGC	2	8	6717	6724	25 %	25 %	25 %	25 %	409247879
129	NT_187127	GC	4	8	6749	6756	0 %	0 %	50 %	50 %	409247879
130	NT_187127	AAG	2	6	6772	6777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247879
131	NT_187127	AGA	2	6	6785	6790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247879
132	NT_187127	GCGT	2	8	6823	6830	0 %	25 %	50 %	25 %	409247879
133	NT_187127	A	6	6	6905	6910	100 %	0 %	0 %	0 %	409247880
134	NT_187127	TCGCCT	2	12	6948	6959	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	409247880
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250	NT_187127	TAT	2	6	12871	12876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247884
251	NT_187127	GGC	2	6	12892	12897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247884
252	NT_187127	CGG	3	9	12921	12929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247884
253	NT_187127	GCT	2	6	12988	12993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247884
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256	NT_187127	CG	3	6	13027	13032	0 %	0 %	50 %	50 %	409247884
257	NT_187127	GATG	2	8	13114	13121	25 %	25 %	50 %	0 %	409247884
258	NT_187127	ATT	2	6	13235	13240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247884
259	NT_187127	TGA	2	6	13243	13248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247884
260	NT_187127	GC	3	6	13293	13298	0 %	0 %	50 %	50 %	409247884
261	NT_187127	CGCTGG	2	12	13311	13322	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409247884
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