MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 6474

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NT_187127	TAC	2	6	162377	162382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248000
3002	NT_187127	TGC	2	6	162402	162407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248000
3003	NT_187127	TGC	2	6	162411	162416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248000
3004	NT_187127	CGA	2	6	162461	162466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248000
3005	NT_187127	CGC	2	6	162484	162489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248000
3006	NT_187127	AATG	2	8	162550	162557	50 %	25 %	25 %	0 %	409248001
3007	NT_187127	TCCCT	2	10	162588	162597	0 %	40 %	0 %	60 %	409248001
3008	NT_187127	CTG	2	6	162632	162637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248001
3009	NT_187127	ACGC	2	8	162657	162664	25 %	0 %	25 %	50 %	409248001
3010	NT_187127	GCT	2	6	162737	162742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248002
3011	NT_187127	GCCGG	2	10	162809	162818	0 %	0 %	60 %	40 %	409248002
3012	NT_187127	AT	3	6	162830	162835	50 %	50 %	0 %	0 %	409248002
3013	NT_187127	GCC	2	6	162910	162915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248002
3014	NT_187127	G	6	6	162929	162934	0 %	0 %	100 %	0 %	409248002
3015	NT_187127	A	6	6	162945	162950	100 %	0 %	0 %	0 %	409248002
3016	NT_187127	AGT	2	6	162983	162988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248002
3017	NT_187127	GGGC	2	8	163004	163011	0 %	0 %	75 %	25 %	409248002
3018	NT_187127	AT	3	6	163019	163024	50 %	50 %	0 %	0 %	409248002
3019	NT_187127	AAG	2	6	163098	163103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248002
3020	NT_187127	ATC	2	6	163401	163406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248002
3021	NT_187127	ATC	2	6	163458	163463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248002
3022	NT_187127	GTT	2	6	163499	163504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248002
3023	NT_187127	A	8	8	163558	163565	100 %	0 %	0 %	0 %	409248002
3024	NT_187127	TCA	2	6	163632	163637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248002
3025	NT_187127	AAG	2	6	163651	163656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248002
3026	NT_187127	GTTTCA	2	12	163663	163674	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	409248002
3027	NT_187127	GA	3	6	163689	163694	50 %	0 %	50 %	0 %	409248002
3028	NT_187127	GAC	2	6	163816	163821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248003
3029	NT_187127	CCGC	2	8	163826	163833	0 %	0 %	25 %	75 %	409248003
3030	NT_187127	C	6	6	163855	163860	0 %	0 %	0 %	100 %	409248003
3031	NT_187127	AAT	2	6	163897	163902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248003
3032	NT_187127	GATCTT	2	12	163936	163947	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	409248003
3033	NT_187127	AT	3	6	163965	163970	50 %	50 %	0 %	0 %	409248003
3034	NT_187127	CAT	2	6	164023	164028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248003
3035	NT_187127	CAA	2	6	164132	164137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248005
3036	NT_187127	A	6	6	164153	164158	100 %	0 %	0 %	0 %	409248005
3037	NT_187127	GTT	2	6	164176	164181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248005
3038	NT_187127	CCT	2	6	164199	164204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409248005
3039	NT_187127	AAG	2	6	164228	164233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248005
3040	NT_187127	CTG	2	6	164348	164353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248006
3041	NT_187127	TTC	2	6	164361	164366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248006
3042	NT_187127	CTG	2	6	164396	164401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248006
3043	NT_187127	TGC	3	9	164431	164439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248006
3044	NT_187127	TCAAC	2	10	164553	164562	40 %	20 %	0 %	40 %	409248007
3045	NT_187127	GCGG	2	8	164677	164684	0 %	0 %	75 %	25 %	409248008
3046	NT_187127	AG	3	6	164691	164696	50 %	0 %	50 %	0 %	409248008
3047	NT_187127	ATCA	2	8	164767	164774	50 %	25 %	0 %	25 %	409248008
3048	NT_187127	GAT	2	6	164843	164848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248008
3049	NT_187127	GCA	2	6	164899	164904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248008
3050	NT_187127	CTGGCG	2	12	164925	164936	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248008
3051	NT_187127	TGG	3	9	164956	164964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248008
3052	NT_187127	AGA	2	6	165014	165019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248008
3053	NT_187127	GGC	2	6	165077	165082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248008
3054	NT_187127	CTG	2	6	165093	165098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248008
3055	NT_187127	GCTG	2	8	165158	165165	0 %	25 %	50 %	25 %	409248008
3056	NT_187127	AC	3	6	165183	165188	50 %	0 %	0 %	50 %	409248008
3057	NT_187127	GGC	2	6	165254	165259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248008
3058	NT_187127	GGC	2	6	165334	165339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248008
3059	NT_187127	GGT	2	6	165371	165376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248008
3060	NT_187127	GAC	2	6	165394	165399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248008
3061	NT_187127	TGAT	2	8	165487	165494	25 %	50 %	25 %	0 %	409248008
3062	NT_187127	AAG	2	6	165640	165645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248008
3063	NT_187127	GCAG	2	8	165653	165660	25 %	0 %	50 %	25 %	409248008
3064	NT_187127	CGA	2	6	166218	166223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248009
3065	NT_187127	ACC	2	6	166247	166252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248009
3066	NT_187127	CAT	2	6	166264	166269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248009
3067	NT_187127	A	6	6	166331	166336	100 %	0 %	0 %	0 %	409248009
3068	NT_187127	CGC	2	6	166347	166352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248009
3069	NT_187127	CCTGCG	2	12	166412	166423	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409248009
3070	NT_187127	CGATA	2	10	166449	166458	40 %	20 %	20 %	20 %	409248009
3071	NT_187127	GTT	2	6	166614	166619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248009
3072	NT_187127	GCG	2	6	166652	166657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248009
3073	NT_187127	CTG	2	6	166699	166704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248009
3074	NT_187127	CAT	2	6	166729	166734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248009
3075	NT_187127	ACA	2	6	166776	166781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248009
3076	NT_187127	GCA	2	6	166818	166823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248009
3077	NT_187127	GCA	2	6	166833	166838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248009
3078	NT_187127	GCT	2	6	166857	166862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248009
3079	NT_187127	AGC	2	6	166892	166897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248009
3080	NT_187127	CAG	2	6	166909	166914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248009
3081	NT_187127	CAG	2	6	166969	166974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248009
3082	NT_187127	GCG	2	6	167056	167061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248009
3083	NT_187127	AGC	2	6	167069	167074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248009
3084	NT_187127	A	6	6	167101	167106	100 %	0 %	0 %	0 %	409248009
3085	NT_187127	GCCA	2	8	167115	167122	25 %	0 %	25 %	50 %	409248009
3086	NT_187127	CCAG	2	8	167145	167152	25 %	0 %	25 %	50 %	409248009
3087	NT_187127	GAT	2	6	167170	167175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248009
3088	NT_187127	CCA	2	6	167186	167191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248009
3089	NT_187127	GCC	2	6	167194	167199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248009
3090	NT_187127	GC	3	6	167213	167218	0 %	0 %	50 %	50 %	409248009
3091	NT_187127	AAT	2	6	167269	167274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248009
3092	NT_187127	GCC	2	6	167356	167361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248009
3093	NT_187127	CGA	3	9	167390	167398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248009
3094	NT_187127	GCT	2	6	167419	167424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248009
3095	NT_187127	TCA	2	6	167613	167618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248009
3096	NT_187127	CCG	2	6	167796	167801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248010
3097	NT_187127	GCA	2	6	167817	167822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248010
3098	NT_187127	CCGG	2	8	167836	167843	0 %	0 %	50 %	50 %	409248010
3099	NT_187127	CGA	2	6	167866	167871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248010
3100	NT_187127	GAA	2	6	167872	167877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248010
3101	NT_187127	T	7	7	168011	168017	0 %	100 %	0 %	0 %	409248010
3102	NT_187127	CTG	2	6	168091	168096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248010
3103	NT_187127	CAGC	2	8	168112	168119	25 %	0 %	25 %	50 %	409248010
3104	NT_187127	GGA	2	6	168207	168212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248010
3105	NT_187127	CCGGG	2	10	168309	168318	0 %	0 %	60 %	40 %	409248010
3106	NT_187127	TGG	2	6	168320	168325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248010
3107	NT_187127	T	6	6	168367	168372	0 %	100 %	0 %	0 %	409248010
3108	NT_187127	ACG	2	6	168413	168418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248010
3109	NT_187127	CGG	2	6	168436	168441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248010
3110	NT_187127	CAA	2	6	168481	168486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248010
3111	NT_187127	CTG	2	6	168523	168528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248010
3112	NT_187127	ATT	2	6	168953	168958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248011
3113	NT_187127	CAA	2	6	168984	168989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248011
3114	NT_187127	A	7	7	169061	169067	100 %	0 %	0 %	0 %	409248011
3115	NT_187127	TTC	2	6	169092	169097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248011
3116	NT_187127	AGT	2	6	169103	169108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248011
3117	NT_187127	CGC	2	6	169177	169182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248011
3118	NT_187127	ACT	2	6	169226	169231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248011
3119	NT_187127	ATC	2	6	169277	169282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248011
3120	NT_187127	ATG	2	6	169292	169297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248011
3121	NT_187127	GCT	2	6	169298	169303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248011
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3481	NT_187127	ACC	2	6	190136	190141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248037
3482	NT_187127	CGA	2	6	190158	190163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248037
3483	NT_187127	GCA	2	6	190257	190262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248037
3484	NT_187127	T	6	6	190285	190290	0 %	100 %	0 %	0 %	409248037
3485	NT_187127	CCA	2	6	190291	190296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248037
3486	NT_187127	GTC	2	6	190334	190339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248037
3487	NT_187127	CTG	2	6	190406	190411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248038
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3490	NT_187127	GTT	2	6	190871	190876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248038
3491	NT_187127	CAT	2	6	190880	190885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248038
3492	NT_187127	TGT	2	6	190982	190987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248038
3493	NT_187127	TCA	2	6	190989	190994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248038
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3497	NT_187127	GCT	2	6	191107	191112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248039
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3500	NT_187127	GTG	2	6	191152	191157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248039

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