MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 6474

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NT_187127	TGC	2	6	297230	297235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248141
5502	NT_187127	ACA	2	6	297263	297268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248141
5503	NT_187127	CTG	2	6	297295	297300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248141
5504	NT_187127	GAT	2	6	297330	297335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248141
5505	NT_187127	AGATTG	2	12	297365	297376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248141
5506	NT_187127	GGA	2	6	297423	297428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248141
5507	NT_187127	TCA	2	6	297473	297478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248141
5508	NT_187127	GCTGGT	2	12	297525	297536	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	409248141
5509	NT_187127	CCGT	2	8	297546	297553	0 %	25 %	25 %	50 %	409248141
5510	NT_187127	GCG	2	6	297670	297675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248141
5511	NT_187127	TTA	2	6	297718	297723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248141
5512	NT_187127	TTGCC	2	10	297734	297743	0 %	40 %	20 %	40 %	409248141
5513	NT_187127	GCT	2	6	297756	297761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248141
5514	NT_187127	GAA	2	6	297765	297770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248141
5515	NT_187127	GGT	2	6	297774	297779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248141
5516	NT_187127	CGC	2	6	297794	297799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248141
5517	NT_187127	T	7	7	297836	297842	0 %	100 %	0 %	0 %	409248141
5518	NT_187127	CGTC	2	8	298088	298095	0 %	25 %	25 %	50 %	409248142
5519	NT_187127	TGTT	2	8	298523	298530	0 %	75 %	25 %	0 %	409248143
5520	NT_187127	CAAA	2	8	298574	298581	75 %	0 %	0 %	25 %	409248143
5521	NT_187127	ATG	2	6	298603	298608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248144
5522	NT_187127	TGC	2	6	298620	298625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248144
5523	NT_187127	TGA	2	6	298689	298694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248144
5524	NT_187127	GCG	2	6	298715	298720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248144
5525	NT_187127	CGC	2	6	298836	298841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248144
5526	NT_187127	ATCTT	2	10	298895	298904	20 %	60 %	0 %	20 %	409248144
5527	NT_187127	GCC	2	6	298938	298943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248144
5528	NT_187127	TGT	2	6	298953	298958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248144
5529	NT_187127	AGC	2	6	298959	298964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248144
5530	NT_187127	GCAC	2	8	298977	298984	25 %	0 %	25 %	50 %	409248144
5531	NT_187127	GTA	2	6	299038	299043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248144
5532	NT_187127	TGG	2	6	299045	299050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248144
5533	NT_187127	CTT	2	6	299224	299229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248145
5534	NT_187127	CG	3	6	299253	299258	0 %	0 %	50 %	50 %	409248145
5535	NT_187127	CG	4	8	299302	299309	0 %	0 %	50 %	50 %	409248145
5536	NT_187127	ATCG	2	8	299393	299400	25 %	25 %	25 %	25 %	409248145
5537	NT_187127	GCG	2	6	299521	299526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248145
5538	NT_187127	CTT	2	6	299567	299572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248145
5539	NT_187127	GTA	2	6	299600	299605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248145
5540	NT_187127	CAC	2	6	299627	299632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248145
5541	NT_187127	CGG	2	6	299641	299646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248145
5542	NT_187127	GCT	2	6	299782	299787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248145
5543	NT_187127	CGC	2	6	299806	299811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248145
5544	NT_187127	AG	3	6	299853	299858	50 %	0 %	50 %	0 %	409248145
5545	NT_187127	CGT	3	9	299893	299901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248145
5546	NT_187127	CGC	2	6	299917	299922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248145
5547	NT_187127	GGCG	2	8	299974	299981	0 %	0 %	75 %	25 %	409248145
5548	NT_187127	TCA	2	6	299989	299994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248145
5549	NT_187127	CGCCAG	2	12	300005	300016	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409248145
5550	NT_187127	CAG	2	6	300026	300031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248145
5551	NT_187127	TCG	2	6	300048	300053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248145
5552	NT_187127	GTT	2	6	300104	300109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248145
5553	NT_187127	CGT	2	6	300115	300120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248145
5554	NT_187127	GAAC	2	8	300185	300192	50 %	0 %	25 %	25 %	409248145
5555	NT_187127	ACC	2	6	300204	300209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248145
5556	NT_187127	GTT	2	6	300265	300270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248145
5557	NT_187127	CGG	2	6	300343	300348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248145
5558	NT_187127	CGT	2	6	300511	300516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248145
5559	NT_187127	CGG	2	6	300577	300582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248145
5560	NT_187127	TCG	2	6	300630	300635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248145
5561	NT_187127	TGG	2	6	300646	300651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248145
5562	NT_187127	GCC	2	6	300653	300658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248145
5563	NT_187127	TGGC	2	8	300666	300673	0 %	25 %	50 %	25 %	409248145
5564	NT_187127	AGAT	2	8	300715	300722	50 %	25 %	25 %	0 %	409248145
5565	NT_187127	GAA	2	6	300809	300814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248145
5566	NT_187127	CGC	2	6	300847	300852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248145
5567	NT_187127	TAC	2	6	300866	300871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248145
5568	NT_187127	TGGG	2	8	300936	300943	0 %	25 %	75 %	0 %	409248145
5569	NT_187127	TTG	2	6	300960	300965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248145
5570	NT_187127	AGTT	2	8	300988	300995	25 %	50 %	25 %	0 %	409248145
5571	NT_187127	GAC	2	6	301027	301032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248145
5572	NT_187127	TGCG	2	8	301159	301166	0 %	25 %	50 %	25 %	409248145
5573	NT_187127	GCT	2	6	301175	301180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248145
5574	NT_187127	GCT	2	6	301227	301232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248145
5575	NT_187127	TCA	2	6	301300	301305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248145
5576	NT_187127	GGCG	2	8	301591	301598	0 %	0 %	75 %	25 %	409248146
5577	NT_187127	ATTA	2	8	301634	301641	50 %	50 %	0 %	0 %	409248146
5578	NT_187127	CAA	2	6	301644	301649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248146
5579	NT_187127	CAGT	2	8	301653	301660	25 %	25 %	25 %	25 %	409248146
5580	NT_187127	ACC	2	6	301738	301743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248147
5581	NT_187127	CGC	2	6	301772	301777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248147
5582	NT_187127	TGGC	3	12	301778	301789	0 %	25 %	50 %	25 %	409248147
5583	NT_187127	GCG	2	6	301837	301842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248147
5584	NT_187127	CAG	2	6	301883	301888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248147
5585	NT_187127	GGC	2	6	301906	301911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248147
5586	NT_187127	GAG	2	6	301940	301945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248147
5587	NT_187127	TGC	2	6	302039	302044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248147
5588	NT_187127	TGT	2	6	302146	302151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248147
5589	NT_187127	CAG	2	6	302177	302182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248147
5590	NT_187127	TCG	2	6	302184	302189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248147
5591	NT_187127	CGG	2	6	302200	302205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248147
5592	NT_187127	TTC	2	6	302288	302293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248147
5593	NT_187127	GATA	2	8	302299	302306	50 %	25 %	25 %	0 %	409248147
5594	NT_187127	TCG	2	6	302376	302381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248147
5595	NT_187127	GAT	2	6	302545	302550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248147
5596	NT_187127	TCG	2	6	302574	302579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248147
5597	NT_187127	TCA	2	6	302641	302646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248147
5598	NT_187127	GC	3	6	302695	302700	0 %	0 %	50 %	50 %	409248147
5599	NT_187127	GCG	2	6	302720	302725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248147
5600	NT_187127	CAC	2	6	302777	302782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248147
5601	NT_187127	CGC	2	6	302803	302808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248147
5602	NT_187127	GC	3	6	302844	302849	0 %	0 %	50 %	50 %	409248147
5603	NT_187127	CGG	2	6	302851	302856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248147
5604	NT_187127	ATA	2	6	302903	302908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248147
5605	NT_187127	GCC	2	6	302942	302947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248147
5606	NT_187127	CT	3	6	303021	303026	0 %	50 %	0 %	50 %	409248147
5607	NT_187127	GAT	2	6	303089	303094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248147
5608	NT_187127	ATC	2	6	303137	303142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248147
5609	NT_187127	GGTCG	2	10	303155	303164	0 %	20 %	60 %	20 %	409248147
5610	NT_187127	TGC	2	6	303270	303275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248147
5611	NT_187127	CGC	2	6	303280	303285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248147
5612	NT_187127	GATA	2	8	303340	303347	50 %	25 %	25 %	0 %	409248147
5613	NT_187127	CCA	2	6	303359	303364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248147
5614	NT_187127	TTG	2	6	303379	303384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248147
5615	NT_187127	GATA	2	8	303467	303474	50 %	25 %	25 %	0 %	409248148
5616	NT_187127	GGT	2	6	303477	303482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248148
5617	NT_187127	GCG	2	6	303542	303547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248148
5618	NT_187127	GCC	2	6	303570	303575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248148
5619	NT_187127	CCAGA	2	10	303626	303635	40 %	0 %	20 %	40 %	409248148
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5621	NT_187127	CGGTT	2	10	303693	303702	0 %	40 %	40 %	20 %	409248148
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5987	NT_187127	GGCT	2	8	323331	323338	0 %	25 %	50 %	25 %	409248172
5988	NT_187127	GCTG	2	8	323367	323374	0 %	25 %	50 %	25 %	409248172
5989	NT_187127	ATG	2	6	323424	323429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248172
5990	NT_187127	GCC	2	6	323434	323439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248172
5991	NT_187127	CAT	2	6	323474	323479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248172
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5995	NT_187127	CGA	2	6	323750	323755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248173
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5999	NT_187127	GCCA	2	8	323856	323863	25 %	0 %	25 %	50 %	409248173
6000	NT_187127	CAG	2	6	323871	323876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248173

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