MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187124	CGCTG	2	10	3600	3609	0 %	20 %	40 %	40 %	409247666
2	NT_187124	CCGCT	2	10	4618	4627	0 %	20 %	20 %	60 %	409247668
3	NT_187124	GTTTA	2	10	5182	5191	20 %	60 %	20 %	0 %	409247668
4	NT_187124	GAAGG	2	10	9484	9493	40 %	0 %	60 %	0 %	409247671
5	NT_187124	CGCGG	2	10	9795	9804	0 %	0 %	60 %	40 %	409247671
6	NT_187124	CGGCG	2	10	11122	11131	0 %	0 %	60 %	40 %	409247673
7	NT_187124	GCGCC	2	10	16037	16046	0 %	0 %	40 %	60 %	409247678
8	NT_187124	ACTTC	2	10	18129	18138	20 %	40 %	0 %	40 %	409247679
9	NT_187124	TTTCA	2	10	22268	22277	20 %	60 %	0 %	20 %	409247683
10	NT_187124	TAGCG	2	10	23452	23461	20 %	20 %	40 %	20 %	409247684
11	NT_187124	AAATC	2	10	24207	24216	60 %	20 %	0 %	20 %	409247685
12	NT_187124	GTAAA	2	10	28024	28033	60 %	20 %	20 %	0 %	409247688
13	NT_187124	AGGAG	2	10	28951	28960	40 %	0 %	60 %	0 %	409247689
14	NT_187124	AGCTG	2	10	29221	29230	20 %	20 %	40 %	20 %	409247689
15	NT_187124	CAGGC	2	10	30580	30589	20 %	0 %	40 %	40 %	409247690
16	NT_187124	ATTTT	2	10	38729	38738	20 %	80 %	0 %	0 %	409247698
17	NT_187124	GCAAC	2	10	42873	42882	40 %	0 %	20 %	40 %	409247704
18	NT_187124	GCATT	2	10	43207	43216	20 %	40 %	20 %	20 %	409247705
19	NT_187124	GCGAG	2	10	43530	43539	20 %	0 %	60 %	20 %	409247706
20	NT_187124	CGGCG	2	10	44262	44271	0 %	0 %	60 %	40 %	409247706
21	NT_187124	AGCCC	2	10	44906	44915	20 %	0 %	20 %	60 %	409247707
22	NT_187124	ACATG	2	10	45232	45241	40 %	20 %	20 %	20 %	409247708
23	NT_187124	CCAGC	2	10	46667	46676	20 %	0 %	20 %	60 %	409247709
24	NT_187124	GCGAC	2	10	47254	47263	20 %	0 %	40 %	40 %	409247709
25	NT_187124	CCAGC	2	10	47736	47745	20 %	0 %	20 %	60 %	409247710
26	NT_187124	GGCGC	2	10	49799	49808	0 %	0 %	60 %	40 %	409247712
27	NT_187124	GCGCG	2	10	54100	54109	0 %	0 %	60 %	40 %	409247717
28	NT_187124	TGGCC	2	10	56484	56493	0 %	20 %	40 %	40 %	409247720
29	NT_187124	CCGGC	2	10	58665	58674	0 %	0 %	40 %	60 %	409247722
30	NT_187124	ATGGC	2	10	60756	60765	20 %	20 %	40 %	20 %	409247723
31	NT_187124	GCACA	2	10	62191	62200	40 %	0 %	20 %	40 %	409247725
32	NT_187124	TTAAA	2	10	63620	63629	60 %	40 %	0 %	0 %	409247727
33	NT_187124	GATTA	2	10	66383	66392	40 %	40 %	20 %	0 %	409247731
34	NT_187124	GTACT	2	10	67188	67197	20 %	40 %	20 %	20 %	409247731
35	NT_187124	GAAAA	2	10	68527	68536	80 %	0 %	20 %	0 %	409247733
36	NT_187124	GCGTC	2	10	68878	68887	0 %	20 %	40 %	40 %	409247733
37	NT_187124	GCCCG	2	10	69743	69752	0 %	0 %	40 %	60 %	409247735
38	NT_187124	AGCGC	2	10	69823	69832	20 %	0 %	40 %	40 %	409247735
39	NT_187124	AGGCA	2	10	71951	71960	40 %	0 %	40 %	20 %	409247737
40	NT_187124	GGAAG	2	10	73098	73107	40 %	0 %	60 %	0 %	409247738
41	NT_187124	GGCCT	2	10	73136	73145	0 %	20 %	40 %	40 %	409247738
42	NT_187124	GTTAT	2	10	78798	78807	20 %	60 %	20 %	0 %	409247743
43	NT_187124	GAAAA	2	10	79127	79136	80 %	0 %	20 %	0 %	409247743
44	NT_187124	AACAG	2	10	79486	79495	60 %	0 %	20 %	20 %	409247744
45	NT_187124	CAAAA	2	10	80406	80415	80 %	0 %	0 %	20 %	409247745
46	NT_187124	CGCGC	3	15	81820	81834	0 %	0 %	40 %	60 %	409247746
47	NT_187124	GACAA	2	10	82146	82155	60 %	0 %	20 %	20 %	409247746
48	NT_187124	TTATT	2	10	84755	84764	20 %	80 %	0 %	0 %	409247751
49	NT_187124	CCACT	2	10	88483	88492	20 %	20 %	0 %	60 %	409247753
50	NT_187124	ATTCT	2	10	90959	90968	20 %	60 %	0 %	20 %	409247755
51	NT_187124	GGCAG	2	10	91963	91972	20 %	0 %	60 %	20 %	409247757
52	NT_187124	CATTT	2	10	93504	93513	20 %	60 %	0 %	20 %	409247758
53	NT_187124	TTCAT	2	10	97363	97372	20 %	60 %	0 %	20 %	409247763
54	NT_187124	GATCA	2	10	102002	102011	40 %	20 %	20 %	20 %	409247768
55	NT_187124	CGGCG	2	10	102416	102425	0 %	0 %	60 %	40 %	409247768
56	NT_187124	GCAAT	2	10	102865	102874	40 %	20 %	20 %	20 %	409247768
57	NT_187124	GGCAA	2	10	108011	108020	40 %	0 %	40 %	20 %	409247772
58	NT_187124	CCACG	2	10	109750	109759	20 %	0 %	20 %	60 %	409247775
59	NT_187124	TGACC	2	10	110185	110194	20 %	20 %	20 %	40 %	409247775
60	NT_187124	CAGTC	2	10	110875	110884	20 %	20 %	20 %	40 %	409247775
61	NT_187124	GCGCA	2	10	113039	113048	20 %	0 %	40 %	40 %	409247777
62	NT_187124	CCGCG	2	10	118442	118451	0 %	0 %	40 %	60 %	409247781
63	NT_187124	CAATG	2	10	119086	119095	40 %	20 %	20 %	20 %	409247781
64	NT_187124	ACCAC	2	10	120194	120203	40 %	0 %	0 %	60 %	409247782
65	NT_187124	CGTTT	2	10	121162	121171	0 %	60 %	20 %	20 %	409247783
66	NT_187124	GCCGC	2	10	121343	121352	0 %	0 %	40 %	60 %	409247783
67	NT_187124	GCCGG	2	10	123804	123813	0 %	0 %	60 %	40 %	409247784
68	NT_187124	TCGCG	2	10	126848	126857	0 %	20 %	40 %	40 %	409247787
69	NT_187124	CGGCG	2	10	127580	127589	0 %	0 %	60 %	40 %	409247788
70	NT_187124	TTCGT	2	10	128592	128601	0 %	60 %	20 %	20 %	409247789
71	NT_187124	GCGAG	2	10	129395	129404	20 %	0 %	60 %	20 %	409247789
72	NT_187124	GATGG	2	10	129525	129534	20 %	20 %	60 %	0 %	409247789
73	NT_187124	GCCCA	2	10	129970	129979	20 %	0 %	20 %	60 %	409247789
74	NT_187124	GGCGT	2	10	132001	132010	0 %	20 %	60 %	20 %	409247790
75	NT_187124	CAGTA	2	10	133437	133446	40 %	20 %	20 %	20 %	409247791
76	NT_187124	CGCAG	2	10	134992	135001	20 %	0 %	40 %	40 %	409247792
77	NT_187124	CGTAC	2	10	138293	138302	20 %	20 %	20 %	40 %	409247795
78	NT_187124	GGATG	2	10	140231	140240	20 %	20 %	60 %	0 %	409247796
79	NT_187124	GATGA	2	10	144049	144058	40 %	20 %	40 %	0 %	409247800
80	NT_187124	CGGCG	2	10	145588	145597	0 %	0 %	60 %	40 %	409247801

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.