MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187124	ACC	2	6	2876	2881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247665
2	NT_187124	CAT	2	6	2909	2914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247665
3	NT_187124	TCA	2	6	2977	2982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247665
4	NT_187124	CTT	2	6	3125	3130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247665
5	NT_187124	GCT	2	6	3161	3166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247665
6	NT_187124	GCC	2	6	3187	3192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247665
7	NT_187124	ATG	2	6	3246	3251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247665
8	NT_187124	CAG	2	6	3312	3317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247665
9	NT_187124	TGT	2	6	3318	3323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247665
10	NT_187124	TCC	2	6	3393	3398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247666
11	NT_187124	CCT	2	6	3421	3426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247666
12	NT_187124	CGC	2	6	3483	3488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247666
13	NT_187124	GAT	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247666
14	NT_187124	CAT	2	6	3568	3573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247666
15	NT_187124	CTG	2	6	3683	3688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247666
16	NT_187124	GAC	2	6	3797	3802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247666
17	NT_187124	GCC	2	6	3838	3843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247666
18	NT_187124	CAC	2	6	3917	3922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247666
19	NT_187124	TTA	2	6	3928	3933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247666
20	NT_187124	CTC	2	6	4052	4057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247667
21	NT_187124	TGA	2	6	4156	4161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247667
22	NT_187124	CGC	2	6	4204	4209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247667
23	NT_187124	TTA	2	6	4275	4280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247667
24	NT_187124	CAT	2	6	4409	4414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247668
25	NT_187124	GAA	2	6	4569	4574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247668
26	NT_187124	GCT	2	6	4646	4651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247668
27	NT_187124	GTC	2	6	4696	4701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247668
28	NT_187124	GAT	2	6	5019	5024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247668
29	NT_187124	TGC	2	6	5059	5064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247668
30	NT_187124	ATT	2	6	5106	5111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247668
31	NT_187124	GAA	2	6	5121	5126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247668
32	NT_187124	TCG	2	6	5210	5215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247668
33	NT_187124	GCA	2	6	5422	5427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247669
34	NT_187124	GAA	2	6	5533	5538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247669
35	NT_187124	GAA	2	6	5562	5567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247669
36	NT_187124	AGA	2	6	5673	5678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247669
37	NT_187124	GTG	2	6	5809	5814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247669
38	NT_187124	CAG	2	6	5925	5930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247669
39	NT_187124	CAG	2	6	5947	5952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247669
40	NT_187124	TCT	2	6	6038	6043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247670
41	NT_187124	TTC	2	6	6133	6138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247670
42	NT_187124	AAC	2	6	6163	6168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247670
43	NT_187124	GTT	2	6	6217	6222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247670
44	NT_187124	AGC	2	6	6245	6250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247670
45	NT_187124	GCT	2	6	6296	6301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247670
46	NT_187124	GGC	2	6	6305	6310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247670
47	NT_187124	CAA	2	6	6372	6377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247670
48	NT_187124	GTG	2	6	6389	6394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247670
49	NT_187124	CGA	2	6	6401	6406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247670
50	NT_187124	CGA	2	6	6422	6427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247670
51	NT_187124	GTT	2	6	6428	6433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247670
52	NT_187124	GAT	2	6	6630	6635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247670
53	NT_187124	CAT	2	6	6748	6753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247670
54	NT_187124	GAT	2	6	6826	6831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247670
55	NT_187124	ATA	2	6	6911	6916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247670
56	NT_187124	CCG	2	6	7375	7380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247671
57	NT_187124	TGC	2	6	7470	7475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247671
58	NT_187124	GGT	2	6	7476	7481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247671
59	NT_187124	TGA	2	6	7509	7514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247671
60	NT_187124	TCC	2	6	7542	7547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247671
61	NT_187124	GAT	2	6	7555	7560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247671
62	NT_187124	CTG	2	6	7615	7620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247671
63	NT_187124	TAA	2	6	7797	7802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247671
64	NT_187124	GCC	2	6	7812	7817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247671
65	NT_187124	CTC	2	6	7854	7859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247671
66	NT_187124	ATA	2	6	7862	7867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247671
67	NT_187124	GGC	2	6	7924	7929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247671
68	NT_187124	CCA	2	6	8048	8053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247671
69	NT_187124	GCA	2	6	8100	8105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247671
70	NT_187124	CTG	2	6	8122	8127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247671
71	NT_187124	CGG	2	6	8162	8167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247671
72	NT_187124	CGG	2	6	8210	8215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247671
73	NT_187124	TGA	2	6	8241	8246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247671
74	NT_187124	GCG	2	6	8266	8271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247671
75	NT_187124	GAC	2	6	8302	8307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247671
76	NT_187124	ATA	2	6	8384	8389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247671
77	NT_187124	CGC	2	6	8391	8396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247671
78	NT_187124	TGG	2	6	8402	8407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247671
79	NT_187124	CTG	2	6	8509	8514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247671
80	NT_187124	GCT	2	6	8520	8525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247671
81	NT_187124	GGA	2	6	8772	8777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247671
82	NT_187124	AGA	2	6	8796	8801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247671
83	NT_187124	CAG	2	6	8848	8853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247671
84	NT_187124	GAA	2	6	8968	8973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247671
85	NT_187124	CGA	2	6	9044	9049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247671
86	NT_187124	GAA	2	6	9096	9101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247671
87	NT_187124	GGC	2	6	9109	9114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247671
88	NT_187124	TGA	2	6	9236	9241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247671
89	NT_187124	ATC	2	6	9275	9280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247671
90	NT_187124	GAA	2	6	9349	9354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247671
91	NT_187124	GCC	2	6	9356	9361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247671
92	NT_187124	TAT	2	6	9435	9440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247671
93	NT_187124	CGG	3	9	9509	9517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247671
94	NT_187124	CGC	2	6	9760	9765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247671
95	NT_187124	ATC	2	6	9862	9867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247671
96	NT_187124	AGC	2	6	9908	9913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247671
97	NT_187124	GAT	2	6	9924	9929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247671
98	NT_187124	GAC	2	6	9970	9975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247671
99	NT_187124	TGG	2	6	10043	10048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247671
100	NT_187124	ATT	2	6	10420	10425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247672
101	NT_187124	CAG	2	6	10622	10627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247672
102	NT_187124	ATC	2	6	10665	10670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247672
103	NT_187124	TCA	2	6	11014	11019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247672
104	NT_187124	CAT	2	6	11632	11637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247674
105	NT_187124	CGT	2	6	11684	11689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247674
106	NT_187124	AGG	2	6	11712	11717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247674
107	NT_187124	GCG	2	6	11796	11801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247674
108	NT_187124	CAA	2	6	11813	11818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247674
109	NT_187124	TGA	2	6	12043	12048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247674
110	NT_187124	GAC	2	6	12080	12085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247674
111	NT_187124	GAA	2	6	12086	12091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247674
112	NT_187124	GAC	2	6	12092	12097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247674
113	NT_187124	ATG	2	6	12122	12127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247674
114	NT_187124	GGC	2	6	12140	12145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247674
115	NT_187124	CGC	2	6	12453	12458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247675
116	NT_187124	CAA	2	6	12552	12557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247675
117	NT_187124	GCG	2	6	12671	12676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247675
118	NT_187124	TAA	2	6	12861	12866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247675
119	NT_187124	GCT	2	6	12918	12923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247675
120	NT_187124	GCC	2	6	13087	13092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247675
121	NT_187124	GAC	2	6	13219	13224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247675
122	NT_187124	TGC	2	6	13253	13258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247675
123	NT_187124	CTG	2	6	13300	13305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247675
124	NT_187124	TTA	2	6	13374	13379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247675
125	NT_187124	TGA	2	6	13434	13439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247675
126	NT_187124	TCG	2	6	13446	13451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247675
127	NT_187124	CAG	2	6	13507	13512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247675
128	NT_187124	CGC	2	6	13562	13567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247675
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226	NT_187124	ATT	2	6	20834	20839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247681
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230	NT_187124	ATC	2	6	20975	20980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247681
231	NT_187124	ATA	2	6	21004	21009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247681
232	NT_187124	ATT	2	6	21047	21052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247681
233	NT_187124	TTA	2	6	21110	21115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247681
234	NT_187124	AGC	2	6	21122	21127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247681
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239	NT_187124	CTG	2	6	21618	21623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247682
240	NT_187124	GCC	2	6	21796	21801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247682
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242	NT_187124	ATC	2	6	21841	21846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247682
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247	NT_187124	CCG	2	6	22456	22461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247683
248	NT_187124	CGG	2	6	22462	22467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247683
249	NT_187124	GTA	2	6	22547	22552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247683
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400	NT_187124	CCA	2	6	32982	32987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247692
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497	NT_187124	AGA	2	6	39485	39490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247699
498	NT_187124	ACA	2	6	39578	39583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247699
499	NT_187124	GGC	2	6	39588	39593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247699
500	NT_187124	TGG	2	6	39601	39606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247699

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