MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 2714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NT_187124	GC	3	6	133899	133904	0 %	0 %	50 %	50 %	409247791
2502	NT_187124	ACG	2	6	133917	133922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247791
2503	NT_187124	CGG	2	6	134007	134012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247791
2504	NT_187124	ACGTCA	2	12	134048	134059	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409247791
2505	NT_187124	GAA	2	6	134083	134088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247791
2506	NT_187124	CG	3	6	134154	134159	0 %	0 %	50 %	50 %	409247791
2507	NT_187124	CGTC	2	8	134165	134172	0 %	25 %	25 %	50 %	409247791
2508	NT_187124	CAG	2	6	134203	134208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247791
2509	NT_187124	CCGC	2	8	134213	134220	0 %	0 %	25 %	75 %	409247791
2510	NT_187124	GCAA	2	8	134315	134322	50 %	0 %	25 %	25 %	409247791
2511	NT_187124	TTC	2	6	134356	134361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247791
2512	NT_187124	TTG	2	6	134433	134438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247791
2513	NT_187124	CCAC	2	8	134590	134597	25 %	0 %	0 %	75 %	409247792
2514	NT_187124	ATG	2	6	134637	134642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247792
2515	NT_187124	CGT	2	6	134812	134817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247792
2516	NT_187124	TAC	2	6	134870	134875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247792
2517	NT_187124	TCA	2	6	134884	134889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247792
2518	NT_187124	GCT	2	6	134899	134904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247792
2519	NT_187124	CGCAG	2	10	134992	135001	20 %	0 %	40 %	40 %	409247792
2520	NT_187124	CGG	2	6	135025	135030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247792
2521	NT_187124	TAAT	2	8	135057	135064	50 %	50 %	0 %	0 %	409247792
2522	NT_187124	CCA	2	6	135066	135071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247792
2523	NT_187124	GCG	2	6	135081	135086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247792
2524	NT_187124	GCA	2	6	135098	135103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247792
2525	NT_187124	TCA	2	6	135160	135165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247792
2526	NT_187124	CG	3	6	135228	135233	0 %	0 %	50 %	50 %	409247792
2527	NT_187124	GCC	2	6	135255	135260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247792
2528	NT_187124	CGT	2	6	135367	135372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247792
2529	NT_187124	TGG	2	6	135426	135431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247792
2530	NT_187124	TTG	2	6	135446	135451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247792
2531	NT_187124	GCG	2	6	135461	135466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247792
2532	NT_187124	ATG	2	6	135534	135539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247793
2533	NT_187124	ATTA	2	8	135545	135552	50 %	50 %	0 %	0 %	409247793
2534	NT_187124	CGG	3	9	135659	135667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247793
2535	NT_187124	GTG	2	6	135672	135677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247793
2536	NT_187124	TGA	2	6	135685	135690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247793
2537	NT_187124	AAAG	2	8	135713	135720	75 %	0 %	25 %	0 %	409247793
2538	NT_187124	CAT	2	6	135755	135760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247793
2539	NT_187124	GC	3	6	135766	135771	0 %	0 %	50 %	50 %	409247793
2540	NT_187124	CTG	2	6	135795	135800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247793
2541	NT_187124	GAA	2	6	135809	135814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247793
2542	NT_187124	TGC	2	6	135937	135942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247793
2543	NT_187124	GGT	2	6	135962	135967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247793
2544	NT_187124	TGA	2	6	136000	136005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247793
2545	NT_187124	GGC	2	6	136022	136027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247793
2546	NT_187124	GGC	2	6	136037	136042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247793
2547	NT_187124	AGC	2	6	136138	136143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247793
2548	NT_187124	ATT	2	6	136158	136163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247793
2549	NT_187124	GAT	2	6	136172	136177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247793
2550	NT_187124	TGC	2	6	136202	136207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247793
2551	NT_187124	TAT	2	6	136424	136429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247794
2552	NT_187124	GGC	2	6	136457	136462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247794
2553	NT_187124	ACTG	2	8	136574	136581	25 %	25 %	25 %	25 %	409247794
2554	NT_187124	GAA	2	6	136602	136607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247794
2555	NT_187124	TGC	2	6	136618	136623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247794
2556	NT_187124	CG	3	6	136635	136640	0 %	0 %	50 %	50 %	409247794
2557	NT_187124	GCA	2	6	136646	136651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247794
2558	NT_187124	GC	3	6	136837	136842	0 %	0 %	50 %	50 %	409247794
2559	NT_187124	TGG	2	6	136843	136848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247794
2560	NT_187124	CG	3	6	136902	136907	0 %	0 %	50 %	50 %	409247794
2561	NT_187124	GC	3	6	136956	136961	0 %	0 %	50 %	50 %	409247794
2562	NT_187124	GCC	2	6	136969	136974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247794
2563	NT_187124	GCG	2	6	137017	137022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247794
2564	NT_187124	GGCT	2	8	137067	137074	0 %	25 %	50 %	25 %	409247794
2565	NT_187124	AGA	2	6	137272	137277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247794
2566	NT_187124	ATG	3	9	137343	137351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247794
2567	NT_187124	AAG	2	6	137401	137406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247794
2568	NT_187124	CTGC	2	8	137438	137445	0 %	25 %	25 %	50 %	409247794
2569	NT_187124	GGC	2	6	137450	137455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247794
2570	NT_187124	GGT	2	6	137600	137605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247794
2571	NT_187124	CGA	2	6	137681	137686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247794
2572	NT_187124	GGC	2	6	137729	137734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247794
2573	NT_187124	GGC	2	6	137739	137744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247794
2574	NT_187124	GCA	2	6	137753	137758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247794
2575	NT_187124	CGA	2	6	137774	137779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247794
2576	NT_187124	GC	3	6	137787	137792	0 %	0 %	50 %	50 %	409247794
2577	NT_187124	AAT	2	6	138085	138090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247795
2578	NT_187124	TGG	2	6	138114	138119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247795
2579	NT_187124	GCG	2	6	138149	138154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247795
2580	NT_187124	CAGC	2	8	138169	138176	25 %	0 %	25 %	50 %	409247795
2581	NT_187124	TGC	2	6	138225	138230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247795
2582	NT_187124	CTG	2	6	138275	138280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247795
2583	NT_187124	CGTAC	2	10	138293	138302	20 %	20 %	20 %	40 %	409247795
2584	NT_187124	CAA	2	6	138338	138343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247795
2585	NT_187124	CAA	2	6	138384	138389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247795
2586	NT_187124	TGC	2	6	138402	138407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247795
2587	NT_187124	AG	3	6	138538	138543	50 %	0 %	50 %	0 %	409247795
2588	NT_187124	TGA	2	6	138571	138576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247795
2589	NT_187124	ATG	2	6	138581	138586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247795
2590	NT_187124	ATC	2	6	138603	138608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247795
2591	NT_187124	ATCGCG	2	12	138618	138629	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409247795
2592	NT_187124	GGCG	2	8	138646	138653	0 %	0 %	75 %	25 %	409247795
2593	NT_187124	TGG	2	6	138777	138782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247795
2594	NT_187124	CGG	2	6	138783	138788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247795
2595	NT_187124	ACT	2	6	138802	138807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247795
2596	NT_187124	CGT	2	6	138881	138886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247795
2597	NT_187124	CGC	2	6	138915	138920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247795
2598	NT_187124	ATGG	2	8	138965	138972	25 %	25 %	50 %	0 %	409247795
2599	NT_187124	CGC	2	6	139016	139021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247796
2600	NT_187124	GGT	2	6	139058	139063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247796
2601	NT_187124	AAT	2	6	139127	139132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247796
2602	NT_187124	CGG	2	6	139135	139140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247796
2603	NT_187124	CGA	2	6	139222	139227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247796
2604	NT_187124	GC	3	6	139255	139260	0 %	0 %	50 %	50 %	409247796
2605	NT_187124	CTG	2	6	139295	139300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247796
2606	NT_187124	GGC	2	6	139424	139429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247796
2607	NT_187124	CCAGCG	2	12	139549	139560	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409247796
2608	NT_187124	GCAG	2	8	139594	139601	25 %	0 %	50 %	25 %	409247796
2609	NT_187124	T	6	6	139613	139618	0 %	100 %	0 %	0 %	409247796
2610	NT_187124	ATG	2	6	139635	139640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247796
2611	NT_187124	CAT	2	6	139645	139650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247796
2612	NT_187124	CGC	2	6	139696	139701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247796
2613	NT_187124	AG	5	10	139718	139727	50 %	0 %	50 %	0 %	409247796
2614	NT_187124	CAG	2	6	139754	139759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247796
2615	NT_187124	ATA	2	6	139848	139853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247796
2616	NT_187124	TGG	2	6	139869	139874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247796
2617	NT_187124	TTG	2	6	140099	140104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247796
2618	NT_187124	AGA	2	6	140144	140149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247796
2619	NT_187124	GAA	2	6	140152	140157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247796
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2621	NT_187124	GGATG	2	10	140231	140240	20 %	20 %	60 %	0 %	409247796
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.