MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NT_187122	TCG	2	6	24604	24609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247557
502	NT_187122	TAA	2	6	24628	24633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247557
503	NT_187122	TTG	2	6	24636	24641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247557
504	NT_187122	TCG	2	6	24672	24677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247557
505	NT_187122	GCC	2	6	24764	24769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247557
506	NT_187122	CAG	2	6	24857	24862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247557
507	NT_187122	CGGT	2	8	24903	24910	0 %	25 %	50 %	25 %	409247557
508	NT_187122	GCC	2	6	25035	25040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247557
509	NT_187122	GCG	2	6	25071	25076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247557
510	NT_187122	TAC	2	6	25129	25134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247557
511	NT_187122	TCG	2	6	25265	25270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247558
512	NT_187122	CAG	2	6	25333	25338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247558
513	NT_187122	CTG	2	6	25395	25400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247558
514	NT_187122	CTG	2	6	25417	25422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247558
515	NT_187122	CTGTTT	2	12	25444	25455	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	409247558
516	NT_187122	CAG	2	6	25456	25461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247558
517	NT_187122	GA	3	6	25527	25532	50 %	0 %	50 %	0 %	409247558
518	NT_187122	CGC	2	6	25534	25539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247558
519	NT_187122	ACC	2	6	25573	25578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247558
520	NT_187122	T	6	6	25585	25590	0 %	100 %	0 %	0 %	409247558
521	NT_187122	CAC	2	6	25611	25616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247558
522	NT_187122	GAAC	2	8	25725	25732	50 %	0 %	25 %	25 %	409247558
523	NT_187122	CCTG	2	8	25745	25752	0 %	25 %	25 %	50 %	409247558
524	NT_187122	CAGT	2	8	25773	25780	25 %	25 %	25 %	25 %	409247558
525	NT_187122	TTCAC	2	10	25796	25805	20 %	40 %	0 %	40 %	409247558
526	NT_187122	GCA	2	6	25844	25849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247558
527	NT_187122	CAG	2	6	25855	25860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247558
528	NT_187122	GAC	2	6	25911	25916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247558
529	NT_187122	AGC	2	6	25919	25924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247558
530	NT_187122	CGC	2	6	25989	25994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247558
531	NT_187122	GCAGC	2	10	26046	26055	20 %	0 %	40 %	40 %	409247558
532	NT_187122	CCA	2	6	26073	26078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247558
533	NT_187122	CAA	2	6	26079	26084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247558
534	NT_187122	GC	3	6	26097	26102	0 %	0 %	50 %	50 %	409247558
535	NT_187122	CAC	2	6	26122	26127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247558
536	NT_187122	TGG	2	6	26136	26141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247558
537	NT_187122	GAT	2	6	26245	26250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247558
538	NT_187122	CGAT	2	8	26333	26340	25 %	25 %	25 %	25 %	409247558
539	NT_187122	CAG	2	6	26437	26442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247558
540	NT_187122	CAC	2	6	26683	26688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247558
541	NT_187122	GCT	2	6	26706	26711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247558
542	NT_187122	CCCG	2	8	26828	26835	0 %	0 %	25 %	75 %	409247559
543	NT_187122	GAT	2	6	26836	26841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247559
544	NT_187122	GCT	2	6	26931	26936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247559
545	NT_187122	GGC	2	6	26989	26994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247559
546	NT_187122	ATT	2	6	27043	27048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247559
547	NT_187122	AGCG	2	8	27121	27128	25 %	0 %	50 %	25 %	409247559
548	NT_187122	GC	3	6	27141	27146	0 %	0 %	50 %	50 %	409247559
549	NT_187122	AG	3	6	27148	27153	50 %	0 %	50 %	0 %	409247559
550	NT_187122	GTTC	2	8	27168	27175	0 %	50 %	25 %	25 %	409247559
551	NT_187122	CGG	2	6	27186	27191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247559
552	NT_187122	GCT	2	6	27251	27256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247559
553	NT_187122	AGC	2	6	27348	27353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247560
554	NT_187122	GAT	2	6	27372	27377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247560
555	NT_187122	CGCCTG	2	12	27459	27470	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409247560
556	NT_187122	CTGCT	2	10	27492	27501	0 %	40 %	20 %	40 %	409247560
557	NT_187122	GCG	2	6	27531	27536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247560
558	NT_187122	TTTG	2	8	27537	27544	0 %	75 %	25 %	0 %	409247560
559	NT_187122	GAT	2	6	27552	27557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247560
560	NT_187122	CGCTTT	2	12	27570	27581	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	409247560
561	NT_187122	T	6	6	27579	27584	0 %	100 %	0 %	0 %	409247560
562	NT_187122	GGTC	2	8	27590	27597	0 %	25 %	50 %	25 %	409247560
563	NT_187122	CAG	2	6	27638	27643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247560
564	NT_187122	TTTC	2	8	27662	27669	0 %	75 %	0 %	25 %	409247560
565	NT_187122	CGG	2	6	27696	27701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247560
566	NT_187122	TGGCC	2	10	27746	27755	0 %	20 %	40 %	40 %	409247560
567	NT_187122	TTG	2	6	27761	27766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247560
568	NT_187122	TAC	2	6	27837	27842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247561
569	NT_187122	CAGACC	2	12	27863	27874	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	409247561
570	NT_187122	ATC	2	6	27882	27887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247561
571	NT_187122	CCA	2	6	27898	27903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247561
572	NT_187122	GCA	2	6	27931	27936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247561
573	NT_187122	ATCAG	2	10	27942	27951	40 %	20 %	20 %	20 %	409247561
574	NT_187122	CGCGC	2	10	27957	27966	0 %	0 %	40 %	60 %	409247561
575	NT_187122	GCA	2	6	28005	28010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247561
576	NT_187122	GCC	2	6	28017	28022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247561
577	NT_187122	CAT	2	6	28028	28033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247561
578	NT_187122	CAG	2	6	28052	28057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247561
579	NT_187122	TAA	2	6	28193	28198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247562
580	NT_187122	ACC	2	6	28244	28249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247562
581	NT_187122	GA	3	6	28320	28325	50 %	0 %	50 %	0 %	409247562
582	NT_187122	CAG	2	6	28338	28343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247562
583	NT_187122	GCC	2	6	28422	28427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247562
584	NT_187122	CAG	2	6	28505	28510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247562
585	NT_187122	CAC	2	6	28515	28520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247562
586	NT_187122	GCA	2	6	28562	28567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247562
587	NT_187122	GCG	2	6	28631	28636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247562
588	NT_187122	GCTT	2	8	28643	28650	0 %	50 %	25 %	25 %	409247562
589	NT_187122	CGC	2	6	28730	28735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247562
590	NT_187122	T	6	6	28743	28748	0 %	100 %	0 %	0 %	409247562
591	NT_187122	ACA	2	6	28775	28780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247562
592	NT_187122	CAC	2	6	28788	28793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247562
593	NT_187122	GAA	2	6	28797	28802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247562
594	NT_187122	G	6	6	28837	28842	0 %	0 %	100 %	0 %	409247562
595	NT_187122	CCA	2	6	28853	28858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247562
596	NT_187122	GCG	2	6	28916	28921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247562
597	NT_187122	ATG	2	6	28939	28944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247562
598	NT_187122	TGT	2	6	28957	28962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247563
599	NT_187122	ACC	2	6	28989	28994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247563
600	NT_187122	CCA	3	9	29053	29061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247563
601	NT_187122	ACA	2	6	29170	29175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247563
602	NT_187122	TGAA	2	8	29277	29284	50 %	25 %	25 %	0 %	409247563
603	NT_187122	TTTG	2	8	29951	29958	0 %	75 %	25 %	0 %	409247564
604	NT_187122	TAA	2	6	29962	29967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247564
605	NT_187122	TC	3	6	30097	30102	0 %	50 %	0 %	50 %	409247564
606	NT_187122	CGG	2	6	30173	30178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247564
607	NT_187122	GCA	2	6	30475	30480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247564
608	NT_187122	CAG	2	6	30497	30502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247564
609	NT_187122	CAGC	2	8	30538	30545	25 %	0 %	25 %	50 %	409247564
610	NT_187122	GA	3	6	30550	30555	50 %	0 %	50 %	0 %	409247564
611	NT_187122	TTG	2	6	30558	30563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247564
612	NT_187122	ACG	2	6	30680	30685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247565
613	NT_187122	T	6	6	30698	30703	0 %	100 %	0 %	0 %	409247565
614	NT_187122	CAG	2	6	30713	30718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247565
615	NT_187122	TTCG	2	8	30806	30813	0 %	50 %	25 %	25 %	409247565
616	NT_187122	GTT	2	6	30874	30879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247565
617	NT_187122	CTG	2	6	30893	30898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247565
618	NT_187122	GCGA	2	8	30899	30906	25 %	0 %	50 %	25 %	409247565
619	NT_187122	AAGTG	2	10	30983	30992	40 %	20 %	40 %	0 %	409247565
620	NT_187122	GAC	2	6	31015	31020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247565
621	NT_187122	CAA	2	6	31022	31027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247565
622	NT_187122	CGC	2	6	31033	31038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247565
623	NT_187122	GA	3	6	31050	31055	50 %	0 %	50 %	0 %	409247565
624	NT_187122	CGG	2	6	31084	31089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247565
625	NT_187122	CGTTCG	2	12	31131	31142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247565
626	NT_187122	TCA	2	6	31179	31184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247565
627	NT_187122	CCA	2	6	31186	31191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247565
628	NT_187122	GCA	2	6	31243	31248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247565
629	NT_187122	CCA	2	6	31318	31323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247565
630	NT_187122	CGG	2	6	31372	31377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247565
631	NT_187122	CG	3	6	31383	31388	0 %	0 %	50 %	50 %	409247565
632	NT_187122	GTA	2	6	31437	31442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247565
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634	NT_187122	GAA	2	6	31517	31522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247565
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639	NT_187122	GGC	2	6	31972	31977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247565
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647	NT_187122	CCG	2	6	32358	32363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247565
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650	NT_187122	AAT	3	9	32525	32533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247565
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653	NT_187122	GCC	2	6	33341	33346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247566
654	NT_187122	TGC	2	6	33352	33357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247566
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656	NT_187122	TCA	2	6	33536	33541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247567
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658	NT_187122	GATT	2	8	33583	33590	25 %	50 %	25 %	0 %	409247567
659	NT_187122	GGT	2	6	33625	33630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247567
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724	NT_187122	TGC	2	6	37037	37042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247570
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732	NT_187122	GCT	2	6	37531	37536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247570
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736	NT_187122	CGTT	2	8	37619	37626	0 %	50 %	25 %	25 %	409247570
737	NT_187122	AG	3	6	37759	37764	50 %	0 %	50 %	0 %	409247570
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741	NT_187122	CGGG	2	8	37875	37882	0 %	0 %	75 %	25 %	409247570
742	NT_187122	CAA	2	6	37885	37890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247570
743	NT_187122	CGC	2	6	37912	37917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247570
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745	NT_187122	TAA	2	6	37999	38004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247570
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747	NT_187122	ATA	2	6	38377	38382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247571
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749	NT_187122	GC	3	6	38585	38590	0 %	0 %	50 %	50 %	409247571
750	NT_187122	GC	3	6	38652	38657	0 %	0 %	50 %	50 %	409247571
751	NT_187122	GTTA	2	8	38669	38676	25 %	50 %	25 %	0 %	409247571
752	NT_187122	GGC	2	6	38691	38696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247571
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754	NT_187122	ATT	2	6	38808	38813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247571
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