MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187119	TCCA	2	8	3182	3189	25 %	25 %	0 %	50 %	409247111
2	NT_187119	AAAG	2	8	4148	4155	75 %	0 %	25 %	0 %	409247113
3	NT_187119	GCAC	2	8	4680	4687	25 %	0 %	25 %	50 %	409247114
4	NT_187119	TGGT	2	8	4785	4792	0 %	50 %	50 %	0 %	409247114
5	NT_187119	AAAC	2	8	4858	4865	75 %	0 %	0 %	25 %	409247114
6	NT_187119	ATGT	2	8	6156	6163	25 %	50 %	25 %	0 %	409247116
7	NT_187119	CAAA	2	8	6166	6173	75 %	0 %	0 %	25 %	409247116
8	NT_187119	ATCC	2	8	6238	6245	25 %	25 %	0 %	50 %	409247117
9	NT_187119	GTGC	2	8	6501	6508	0 %	25 %	50 %	25 %	409247117
10	NT_187119	CAGC	2	8	6740	6747	25 %	0 %	25 %	50 %	409247117
11	NT_187119	CAGG	2	8	6979	6986	25 %	0 %	50 %	25 %	409247117
12	NT_187119	GTGC	2	8	7176	7183	0 %	25 %	50 %	25 %	409247117
13	NT_187119	CTGT	2	8	7690	7697	0 %	50 %	25 %	25 %	409247118
14	NT_187119	GATG	2	8	8368	8375	25 %	25 %	50 %	0 %	409247119
15	NT_187119	GCTG	2	8	8655	8662	0 %	25 %	50 %	25 %	409247119
16	NT_187119	CGTC	2	8	8697	8704	0 %	25 %	25 %	50 %	409247119
17	NT_187119	TTAA	2	8	9293	9300	50 %	50 %	0 %	0 %	409247120
18	NT_187119	AGTC	2	8	10711	10718	25 %	25 %	25 %	25 %	409247121
19	NT_187119	AACG	2	8	12556	12563	50 %	0 %	25 %	25 %	409247123
20	NT_187119	GTAC	2	8	12778	12785	25 %	25 %	25 %	25 %	409247123
21	NT_187119	ATAC	2	8	12870	12877	50 %	25 %	0 %	25 %	409247123
22	NT_187119	GAAT	2	8	14294	14301	50 %	25 %	25 %	0 %	409247126
23	NT_187119	GCGT	2	8	14705	14712	0 %	25 %	50 %	25 %	409247126
24	NT_187119	CAGA	2	8	14845	14852	50 %	0 %	25 %	25 %	409247127
25	NT_187119	GTAC	2	8	14876	14883	25 %	25 %	25 %	25 %	409247127
26	NT_187119	CCAG	2	8	14908	14915	25 %	0 %	25 %	50 %	409247127
27	NT_187119	CAGC	2	8	14935	14942	25 %	0 %	25 %	50 %	409247127
28	NT_187119	CAGA	2	8	15274	15281	50 %	0 %	25 %	25 %	409247127
29	NT_187119	ATCG	2	8	15335	15342	25 %	25 %	25 %	25 %	409247127
30	NT_187119	ACTG	2	8	16559	16566	25 %	25 %	25 %	25 %	409247131
31	NT_187119	ACCA	2	8	16713	16720	50 %	0 %	0 %	50 %	409247131
32	NT_187119	CAAC	2	8	17174	17181	50 %	0 %	0 %	50 %	409247131
33	NT_187119	TGGC	2	8	17237	17244	0 %	25 %	50 %	25 %	409247131
34	NT_187119	AACA	2	8	17766	17773	75 %	0 %	0 %	25 %	409247131
35	NT_187119	GCCA	2	8	17944	17951	25 %	0 %	25 %	50 %	409247132
36	NT_187119	CAGA	2	8	18045	18052	50 %	0 %	25 %	25 %	409247132
37	NT_187119	GCTG	2	8	18680	18687	0 %	25 %	50 %	25 %	409247134
38	NT_187119	ACCA	2	8	19614	19621	50 %	0 %	0 %	50 %	409247136
39	NT_187119	ATTG	2	8	20614	20621	25 %	50 %	25 %	0 %	409247138
40	NT_187119	CAGC	2	8	20671	20678	25 %	0 %	25 %	50 %	409247139
41	NT_187119	GGTT	2	8	21350	21357	0 %	50 %	50 %	0 %	409247140
42	NT_187119	GCAT	2	8	21644	21651	25 %	25 %	25 %	25 %	409247141
43	NT_187119	TCAG	2	8	22329	22336	25 %	25 %	25 %	25 %	409247143
44	NT_187119	GACC	2	8	24067	24074	25 %	0 %	25 %	50 %	409247147
45	NT_187119	AACC	2	8	24695	24702	50 %	0 %	0 %	50 %	409247148
46	NT_187119	TTGA	2	8	26952	26959	25 %	50 %	25 %	0 %	409247152
47	NT_187119	TGTT	2	8	27396	27403	0 %	75 %	25 %	0 %	409247153
48	NT_187119	TGCC	2	8	27533	27540	0 %	25 %	25 %	50 %	409247153
49	NT_187119	TGGC	2	8	27806	27813	0 %	25 %	50 %	25 %	409247153
50	NT_187119	TTTC	2	8	27844	27851	0 %	75 %	0 %	25 %	409247153
51	NT_187119	CCAG	2	8	27933	27940	25 %	0 %	25 %	50 %	409247154
52	NT_187119	ACAA	2	8	28587	28594	75 %	0 %	0 %	25 %	409247155

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.