MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 353

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187119	TGA	2	6	3022	3027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247111
2	NT_187119	CAG	2	6	3035	3040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247111
3	NT_187119	GAT	2	6	3069	3074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247111
4	NT_187119	TTC	2	6	3160	3165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247111
5	NT_187119	TGC	2	6	3247	3252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247111
6	NT_187119	TAG	2	6	3316	3321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247111
7	NT_187119	GAC	2	6	3483	3488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247111
8	NT_187119	CTG	2	6	3530	3535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247112
9	NT_187119	CTT	2	6	3559	3564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247112
10	NT_187119	CCA	2	6	3618	3623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247112
11	NT_187119	GGC	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247112
12	NT_187119	TTC	2	6	3719	3724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247112
13	NT_187119	TAA	2	6	3757	3762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247113
14	NT_187119	CTG	2	6	3766	3771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247113
15	NT_187119	AGC	2	6	3773	3778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247113
16	NT_187119	CCA	2	6	3843	3848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247113
17	NT_187119	TGT	2	6	3884	3889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247113
18	NT_187119	TAA	2	6	4014	4019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247113
19	NT_187119	GCC	2	6	4183	4188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247113
20	NT_187119	TAA	2	6	4249	4254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247113
21	NT_187119	CCT	2	6	4368	4373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247113
22	NT_187119	ATT	2	6	4444	4449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247113
23	NT_187119	GCT	2	6	4491	4496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247113
24	NT_187119	TGA	2	6	4508	4513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247113
25	NT_187119	CAT	2	6	4567	4572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247113
26	NT_187119	ACC	2	6	4653	4658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247114
27	NT_187119	ATC	2	6	4664	4669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247114
28	NT_187119	TGG	2	6	4732	4737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247114
29	NT_187119	ACC	2	6	4773	4778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247114
30	NT_187119	GCG	2	6	4908	4913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247114
31	NT_187119	TCA	2	6	4926	4931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247114
32	NT_187119	GGC	2	6	4958	4963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247114
33	NT_187119	GTT	2	6	4993	4998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247114
34	NT_187119	GCG	2	6	5112	5117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247114
35	NT_187119	TAT	2	6	5137	5142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247114
36	NT_187119	GCA	2	6	5725	5730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247116
37	NT_187119	TTC	2	6	5756	5761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247116
38	NT_187119	CAG	2	6	6059	6064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247116
39	NT_187119	CCT	2	6	6201	6206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247117
40	NT_187119	GCC	2	6	6219	6224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247117
41	NT_187119	CGA	2	6	6308	6313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247117
42	NT_187119	GCC	2	6	6370	6375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247117
43	NT_187119	CCG	2	6	6407	6412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247117
44	NT_187119	TCC	2	6	6457	6462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247117
45	NT_187119	CGT	2	6	6465	6470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247117
46	NT_187119	CGC	2	6	6606	6611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247117
47	NT_187119	TGA	2	6	6644	6649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247117
48	NT_187119	GCC	2	6	6717	6722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247117
49	NT_187119	ACG	2	6	6952	6957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247117
50	NT_187119	GGA	2	6	7039	7044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247117
51	NT_187119	TGC	2	6	7075	7080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247117
52	NT_187119	TCA	2	6	7105	7110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247117
53	NT_187119	CTG	2	6	7118	7123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247117
54	NT_187119	CCT	2	6	7166	7171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247117
55	NT_187119	GAA	2	6	7484	7489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247118
56	NT_187119	TCG	2	6	7512	7517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247118
57	NT_187119	GAA	2	6	7544	7549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247118
58	NT_187119	CCA	2	6	7582	7587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247118
59	NT_187119	ATC	2	6	7592	7597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247118
60	NT_187119	CGA	2	6	7621	7626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247118
61	NT_187119	AGA	2	6	7681	7686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247118
62	NT_187119	ATC	2	6	7827	7832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247118
63	NT_187119	ATT	2	6	7854	7859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247118
64	NT_187119	CGC	2	6	7863	7868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247118
65	NT_187119	CAA	2	6	7874	7879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247118
66	NT_187119	TAT	2	6	7963	7968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247119
67	NT_187119	CAG	2	6	8064	8069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247119
68	NT_187119	GAA	2	6	8114	8119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247119
69	NT_187119	GCT	2	6	8284	8289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247119
70	NT_187119	AGA	2	6	8428	8433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247119
71	NT_187119	TAA	2	6	8452	8457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247119
72	NT_187119	AAC	2	6	8499	8504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247119
73	NT_187119	AGA	2	6	8575	8580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247119
74	NT_187119	GCA	2	6	8606	8611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247119
75	NT_187119	CGA	2	6	8748	8753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247119
76	NT_187119	GCA	2	6	8975	8980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247120
77	NT_187119	GTC	2	6	8996	9001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247120
78	NT_187119	CGC	2	6	9033	9038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247120
79	NT_187119	CAA	2	6	9041	9046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247120
80	NT_187119	AGC	2	6	9162	9167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247120
81	NT_187119	TCC	2	6	9223	9228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247120
82	NT_187119	GCG	2	6	9233	9238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247120
83	NT_187119	CAG	2	6	9326	9331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247120
84	NT_187119	ATT	2	6	9434	9439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247120
85	NT_187119	CTC	2	6	9672	9677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247120
86	NT_187119	CGG	2	6	9715	9720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247120
87	NT_187119	TGA	2	6	9778	9783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247120
88	NT_187119	GCG	2	6	9876	9881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247120
89	NT_187119	AGC	2	6	9882	9887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247120
90	NT_187119	CTG	2	6	9902	9907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247120
91	NT_187119	CGG	2	6	10042	10047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247120
92	NT_187119	GAA	2	6	10082	10087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247120
93	NT_187119	CAG	2	6	10169	10174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247120
94	NT_187119	GCG	2	6	10185	10190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247120
95	NT_187119	AAG	2	6	10191	10196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247120
96	NT_187119	AAG	2	6	10226	10231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247120
97	NT_187119	TGA	2	6	10232	10237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247120
98	NT_187119	TGA	2	6	10254	10259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247121
99	NT_187119	AAC	2	6	10322	10327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247121
100	NT_187119	GGT	2	6	10336	10341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247121
101	NT_187119	ATC	2	6	10614	10619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247121
102	NT_187119	ATA	2	6	10647	10652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247121
103	NT_187119	AGT	2	6	10723	10728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247121
104	NT_187119	CTA	2	6	10735	10740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247121
105	NT_187119	TCT	2	6	10881	10886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247121
106	NT_187119	CAT	2	6	10957	10962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247121
107	NT_187119	TGG	2	6	10965	10970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247121
108	NT_187119	GCG	2	6	10971	10976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247121
109	NT_187119	CAA	2	6	11045	11050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247121
110	NT_187119	CGC	2	6	11053	11058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247121
111	NT_187119	GGA	2	6	11128	11133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247121
112	NT_187119	GAT	2	6	11174	11179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247121
113	NT_187119	GCA	2	6	11305	11310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247121
114	NT_187119	CCA	2	6	11313	11318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247121
115	NT_187119	TCG	2	6	11355	11360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247121
116	NT_187119	GCC	2	6	11467	11472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247121
117	NT_187119	ATT	2	6	11480	11485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247121
118	NT_187119	GGT	2	6	11491	11496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247121
119	NT_187119	ATG	2	6	11505	11510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247121
120	NT_187119	TTA	2	6	11583	11588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247121
121	NT_187119	TTC	2	6	11621	11626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247121
122	NT_187119	TTA	2	6	11781	11786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247122
123	NT_187119	TGT	2	6	11818	11823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247122
124	NT_187119	ATT	2	6	11843	11848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247122
125	NT_187119	TTC	2	6	11872	11877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247122
126	NT_187119	GCC	2	6	11899	11904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247122
127	NT_187119	CGG	2	6	11920	11925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247122
128	NT_187119	CGG	2	6	11979	11984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247122
129	NT_187119	TTG	2	6	12051	12056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247122
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247	NT_187119	AAC	2	6	19980	19985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247137
248	NT_187119	GGC	2	6	20051	20056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247137
249	NT_187119	ACA	2	6	20077	20082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247137
250	NT_187119	CTT	2	6	20162	20167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247137
251	NT_187119	GGA	2	6	20202	20207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247137
252	NT_187119	GAC	2	6	20423	20428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247138
253	NT_187119	TCG	2	6	20515	20520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247138
254	NT_187119	GAT	2	6	20538	20543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247138
255	NT_187119	CTT	2	6	20689	20694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247139
256	NT_187119	AGT	2	6	20708	20713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247139
257	NT_187119	GAT	2	6	20774	20779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247139
258	NT_187119	CTG	3	9	21019	21027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247139
259	NT_187119	CAG	2	6	21035	21040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247139
260	NT_187119	TCT	2	6	21085	21090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247139
261	NT_187119	ACT	2	6	21147	21152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247139
262	NT_187119	GTA	2	6	21161	21166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247139
263	NT_187119	GAA	2	6	21226	21231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247140
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265	NT_187119	GCC	2	6	21343	21348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247140
266	NT_187119	CAA	2	6	21405	21410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247140
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269	NT_187119	CGA	2	6	21684	21689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247141
270	NT_187119	CTT	2	6	21695	21700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247141
271	NT_187119	CAC	2	6	21707	21712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247141
272	NT_187119	CTT	2	6	21760	21765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247141
273	NT_187119	ATG	2	6	21780	21785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247141
274	NT_187119	GTT	2	6	22161	22166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247142
275	NT_187119	TGA	2	6	22199	22204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247142
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277	NT_187119	ACG	2	6	22361	22366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247143
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281	NT_187119	ACG	2	6	22762	22767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247144
282	NT_187119	TGC	2	6	22768	22773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247144
283	NT_187119	GAC	2	6	22794	22799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247144
284	NT_187119	GCT	3	9	22944	22952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247145
285	NT_187119	AGC	2	6	22963	22968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247145
286	NT_187119	GTT	2	6	22980	22985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247145
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290	NT_187119	CGC	2	6	23151	23156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247145
291	NT_187119	ACG	2	6	23233	23238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247145
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335	NT_187119	CAG	3	9	26108	26116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247151
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342	NT_187119	TTA	2	6	27440	27445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247153
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344	NT_187119	CTG	2	6	27473	27478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247153
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351	NT_187119	ATC	2	6	27974	27979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247154
352	NT_187119	CAT	2	6	28209	28214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247154
353	NT_187119	GAA	2	6	28254	28259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247154

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.