MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 5500

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NT_187115	CAGC	2	8	162221	162228	25 %	0 %	25 %	50 %	409246663
3002	NT_187115	TGA	2	6	162251	162256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246663
3003	NT_187115	CG	3	6	162260	162265	0 %	0 %	50 %	50 %	409246663
3004	NT_187115	TCA	2	6	162281	162286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246663
3005	NT_187115	CCG	2	6	162315	162320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246663
3006	NT_187115	GCCC	2	8	162347	162354	0 %	0 %	25 %	75 %	409246663
3007	NT_187115	CGC	2	6	162359	162364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246663
3008	NT_187115	GCG	2	6	162376	162381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246663
3009	NT_187115	GGC	2	6	162422	162427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246663
3010	NT_187115	CT	3	6	162504	162509	0 %	50 %	0 %	50 %	409246663
3011	NT_187115	ACT	2	6	162529	162534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246663
3012	NT_187115	GCTG	2	8	162544	162551	0 %	25 %	50 %	25 %	409246663
3013	NT_187115	CAG	2	6	162626	162631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246663
3014	NT_187115	CAG	2	6	162837	162842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246663
3015	NT_187115	TTG	2	6	162863	162868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246663
3016	NT_187115	GCC	2	6	163009	163014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246664
3017	NT_187115	CAT	2	6	163023	163028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246664
3018	NT_187115	CGC	2	6	163033	163038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246664
3019	NT_187115	GCG	2	6	163275	163280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246664
3020	NT_187115	TGT	2	6	163281	163286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246664
3021	NT_187115	GC	3	6	163419	163424	0 %	0 %	50 %	50 %	409246664
3022	NT_187115	AAT	2	6	163429	163434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246664
3023	NT_187115	GCGG	2	8	163541	163548	0 %	0 %	75 %	25 %	409246664
3024	NT_187115	CAT	2	6	163558	163563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246664
3025	NT_187115	GCC	2	6	163580	163585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246664
3026	NT_187115	CCG	2	6	163665	163670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246664
3027	NT_187115	CCG	2	6	163677	163682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246664
3028	NT_187115	ATA	2	6	163775	163780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246664
3029	NT_187115	CCG	2	6	163811	163816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246664
3030	NT_187115	CGC	2	6	163839	163844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246664
3031	NT_187115	TTCA	2	8	164074	164081	25 %	50 %	0 %	25 %	409246664
3032	NT_187115	GTACCG	2	12	164185	164196	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409246665
3033	NT_187115	CACTTC	2	12	164237	164248	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	409246665
3034	NT_187115	GCCA	2	8	164253	164260	25 %	0 %	25 %	50 %	409246665
3035	NT_187115	TTC	2	6	164279	164284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246665
3036	NT_187115	CGG	2	6	164413	164418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246665
3037	NT_187115	GCC	2	6	164526	164531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246665
3038	NT_187115	AAT	2	6	164732	164737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246665
3039	NT_187115	ATT	2	6	164763	164768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246665
3040	NT_187115	CT	4	8	164772	164779	0 %	50 %	0 %	50 %	409246665
3041	NT_187115	ACA	2	6	165329	165334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246666
3042	NT_187115	AGCAA	2	10	165369	165378	60 %	0 %	20 %	20 %	409246666
3043	NT_187115	ATT	2	6	165392	165397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246666
3044	NT_187115	T	6	6	165422	165427	0 %	100 %	0 %	0 %	409246666
3045	NT_187115	AAT	2	6	165443	165448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246666
3046	NT_187115	TTA	2	6	165461	165466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246666
3047	NT_187115	CAA	2	6	165476	165481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246666
3048	NT_187115	CTAA	2	8	165491	165498	50 %	25 %	0 %	25 %	409246666
3049	NT_187115	TCAG	2	8	165517	165524	25 %	25 %	25 %	25 %	409246666
3050	NT_187115	TGA	2	6	165570	165575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246666
3051	NT_187115	A	6	6	165575	165580	100 %	0 %	0 %	0 %	409246666
3052	NT_187115	T	7	7	165612	165618	0 %	100 %	0 %	0 %	409246666
3053	NT_187115	ATT	2	6	165637	165642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246666
3054	NT_187115	ATC	2	6	165695	165700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246666
3055	NT_187115	GCC	2	6	165701	165706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246666
3056	NT_187115	TAT	2	6	165817	165822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246666
3057	NT_187115	AAG	2	6	165876	165881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246666
3058	NT_187115	TCG	2	6	165963	165968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246666
3059	NT_187115	TAG	2	6	165978	165983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246666
3060	NT_187115	GCT	2	6	165988	165993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246666
3061	NT_187115	TCT	2	6	166064	166069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246666
3062	NT_187115	CT	3	6	166068	166073	0 %	50 %	0 %	50 %	409246666
3063	NT_187115	CTG	2	6	166147	166152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246666
3064	NT_187115	GAG	2	6	166178	166183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409246666
3065	NT_187115	CGC	2	6	166207	166212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246666
3066	NT_187115	CTT	2	6	166240	166245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246666
3067	NT_187115	CGC	2	6	166287	166292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246666
3068	NT_187115	GCC	2	6	166304	166309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246666
3069	NT_187115	GCG	2	6	166353	166358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246666
3070	NT_187115	CTG	2	6	166370	166375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246666
3071	NT_187115	TCT	2	6	166422	166427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246666
3072	NT_187115	GGACA	2	10	166448	166457	40 %	0 %	40 %	20 %	409246666
3073	NT_187115	CAT	2	6	166489	166494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246666
3074	NT_187115	GGC	2	6	166496	166501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246666
3075	NT_187115	CGC	2	6	166537	166542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246666
3076	NT_187115	CCG	2	6	166557	166562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246666
3077	NT_187115	GCG	2	6	166622	166627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246666
3078	NT_187115	TGAT	2	8	166708	166715	25 %	50 %	25 %	0 %	409246667
3079	NT_187115	CGT	2	6	166719	166724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246667
3080	NT_187115	GAA	2	6	166746	166751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246667
3081	NT_187115	CGG	2	6	166777	166782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246667
3082	NT_187115	TCA	2	6	166786	166791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246667
3083	NT_187115	CCG	2	6	166870	166875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246667
3084	NT_187115	GAA	2	6	166881	166886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246667
3085	NT_187115	CAG	2	6	166892	166897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246667
3086	NT_187115	GGC	2	6	167042	167047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246667
3087	NT_187115	ATG	2	6	167089	167094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246667
3088	NT_187115	CGA	2	6	167105	167110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246667
3089	NT_187115	CCG	2	6	167122	167127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246667
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3091	NT_187115	CTG	2	6	167142	167147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246667
3092	NT_187115	CGG	2	6	167207	167212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246667
3093	NT_187115	CTT	2	6	167252	167257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246667
3094	NT_187115	CTGG	2	8	167264	167271	0 %	25 %	50 %	25 %	409246667
3095	NT_187115	GCC	2	6	167308	167313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246667
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3097	NT_187115	ATG	2	6	167332	167337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246667
3098	NT_187115	CG	3	6	167436	167441	0 %	0 %	50 %	50 %	409246667
3099	NT_187115	AG	3	6	167450	167455	50 %	0 %	50 %	0 %	409246667
3100	NT_187115	CTG	2	6	167457	167462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246667
3101	NT_187115	ATG	2	6	167484	167489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246667
3102	NT_187115	CAA	2	6	167495	167500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246667
3103	NT_187115	GAA	2	6	167526	167531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246667
3104	NT_187115	GCC	2	6	167553	167558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246667
3105	NT_187115	CCG	2	6	167608	167613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246667
3106	NT_187115	GCT	2	6	167618	167623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246667
3107	NT_187115	GTC	2	6	167664	167669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246667
3108	NT_187115	ATT	2	6	167826	167831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246667
3109	NT_187115	CAA	2	6	167928	167933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246667
3110	NT_187115	GGC	2	6	167951	167956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246667
3111	NT_187115	CGG	3	9	167993	168001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246667
3112	NT_187115	GGC	2	6	168027	168032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246667
3113	NT_187115	ATC	2	6	168060	168065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246667
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3116	NT_187115	GCGCC	2	10	168180	168189	0 %	0 %	40 %	60 %	409246667
3117	NT_187115	TTA	2	6	168286	168291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246667
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3119	NT_187115	TGC	2	6	168304	168309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246667
3120	NT_187115	GTAT	2	8	168318	168325	25 %	50 %	25 %	0 %	409246667
3121	NT_187115	GGA	2	6	168335	168340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409246667
3122	NT_187115	TTG	2	6	168723	168728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246668
3123	NT_187115	GT	3	6	168756	168761	0 %	50 %	50 %	0 %	409246668
3124	NT_187115	GC	3	6	168800	168805	0 %	0 %	50 %	50 %	409246668
3125	NT_187115	GCT	2	6	168825	168830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246668
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3128	NT_187115	ATC	2	6	168980	168985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246668
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3130	NT_187115	CTG	2	6	169008	169013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246668
3131	NT_187115	TCG	2	6	169024	169029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246668
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3134	NT_187115	CCAG	2	8	169085	169092	25 %	0 %	25 %	50 %	409246668
3135	NT_187115	GC	3	6	169150	169155	0 %	0 %	50 %	50 %	409246668
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3142	NT_187115	CAGT	2	8	169413	169420	25 %	25 %	25 %	25 %	409246668
3143	NT_187115	TGGC	2	8	169447	169454	0 %	25 %	50 %	25 %	409246668
3144	NT_187115	CTG	2	6	169483	169488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246668
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3200	NT_187115	CGC	2	6	172383	172388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246672
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3232	NT_187115	A	6	6	174645	174650	100 %	0 %	0 %	0 %	409246675
3233	NT_187115	CAC	2	6	174670	174675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246675
3234	NT_187115	TGG	2	6	174690	174695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246675
3235	NT_187115	TGG	2	6	174786	174791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246675
3236	NT_187115	CAA	2	6	174794	174799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246675
3237	NT_187115	GC	3	6	174804	174809	0 %	0 %	50 %	50 %	409246675
3238	NT_187115	GGC	2	6	174923	174928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246675
3239	NT_187115	GC	3	6	174993	174998	0 %	0 %	50 %	50 %	409246675
3240	NT_187115	CGG	2	6	175017	175022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246675
3241	NT_187115	CAG	2	6	175028	175033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246675
3242	NT_187115	CTT	2	6	175115	175120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246675
3243	NT_187115	CGG	3	9	175141	175149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246675
3244	NT_187115	GAT	2	6	175153	175158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246675
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3367	NT_187115	TCG	2	6	182075	182080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246682
3368	NT_187115	CCG	2	6	182183	182188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246682
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3387	NT_187115	TGC	2	6	183166	183171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246683
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3485	NT_187115	ACC	2	6	187554	187559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246684
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3487	NT_187115	CGC	2	6	187593	187598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246684
3488	NT_187115	CAA	2	6	187625	187630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246684
3489	NT_187115	ACA	2	6	187660	187665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246684
3490	NT_187115	TAA	2	6	187757	187762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246684
3491	NT_187115	TTC	2	6	187793	187798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246684
3492	NT_187115	GGC	2	6	187898	187903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246684
3493	NT_187115	ACC	2	6	187917	187922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246684
3494	NT_187115	TTC	2	6	187928	187933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246684
3495	NT_187115	ACGG	2	8	187942	187949	25 %	0 %	50 %	25 %	409246684
3496	NT_187115	GCC	2	6	187964	187969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246684
3497	NT_187115	CAT	2	6	188092	188097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246684
3498	NT_187115	TGC	2	6	188128	188133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246685
3499	NT_187115	CCA	2	6	188240	188245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246685
3500	NT_187115	TGG	2	6	188251	188256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246685

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