MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187113	AACG	2	8	291	298	50 %	0 %	25 %	25 %	409246393
2	NT_187113	CTGA	2	8	357	364	25 %	25 %	25 %	25 %	409246393
3	NT_187113	GGTC	2	8	1438	1445	0 %	25 %	50 %	25 %	409246394
4	NT_187113	GTTT	2	8	1794	1801	0 %	75 %	25 %	0 %	409246396
5	NT_187113	CGGG	2	8	2337	2344	0 %	0 %	75 %	25 %	409246397
6	NT_187113	GCGA	2	8	2579	2586	25 %	0 %	50 %	25 %	409246398
7	NT_187113	AGGC	2	8	2691	2698	25 %	0 %	50 %	25 %	409246398
8	NT_187113	TGAG	2	8	3456	3463	25 %	25 %	50 %	0 %	409246400
9	NT_187113	TAAA	2	8	3898	3905	75 %	25 %	0 %	0 %	409246401
10	NT_187113	TCGG	2	8	4156	4163	0 %	25 %	50 %	25 %	409246402
11	NT_187113	CATG	2	8	4497	4504	25 %	25 %	25 %	25 %	409246402
12	NT_187113	GCTC	2	8	4741	4748	0 %	25 %	25 %	50 %	409246403
13	NT_187113	TTGA	2	8	4758	4765	25 %	50 %	25 %	0 %	409246403
14	NT_187113	ATGT	2	8	4887	4894	25 %	50 %	25 %	0 %	409246403
15	NT_187113	CCAC	2	8	5298	5305	25 %	0 %	0 %	75 %	409246404
16	NT_187113	TGGC	2	8	6007	6014	0 %	25 %	50 %	25 %	409246405
17	NT_187113	TTCA	2	8	6091	6098	25 %	50 %	0 %	25 %	409246405
18	NT_187113	CCAG	2	8	6286	6293	25 %	0 %	25 %	50 %	409246405
19	NT_187113	AAAT	2	8	6486	6493	75 %	25 %	0 %	0 %	409246406
20	NT_187113	GACA	2	8	6952	6959	50 %	0 %	25 %	25 %	409246406
21	NT_187113	TGTT	2	8	7521	7528	0 %	75 %	25 %	0 %	409246406
22	NT_187113	TAAA	2	8	7650	7657	75 %	25 %	0 %	0 %	409246406
23	NT_187113	ACGG	2	8	8042	8049	25 %	0 %	50 %	25 %	409246406
24	NT_187113	TGGT	2	8	8346	8353	0 %	50 %	50 %	0 %	409246406
25	NT_187113	ATGC	2	8	8529	8536	25 %	25 %	25 %	25 %	409246407
26	NT_187113	CAGC	2	8	9176	9183	25 %	0 %	25 %	50 %	409246408
27	NT_187113	GCTG	2	8	9273	9280	0 %	25 %	50 %	25 %	409246408
28	NT_187113	CAGC	2	8	9618	9625	25 %	0 %	25 %	50 %	409246408
29	NT_187113	CCTG	2	8	10479	10486	0 %	25 %	25 %	50 %	409246409
30	NT_187113	ATCC	2	8	11408	11415	25 %	25 %	0 %	50 %	409246412
31	NT_187113	GCTG	2	8	11576	11583	0 %	25 %	50 %	25 %	409246412
32	NT_187113	AGCG	2	8	12110	12117	25 %	0 %	50 %	25 %	409246412
33	NT_187113	GAAA	2	8	12584	12591	75 %	0 %	25 %	0 %	409246412
34	NT_187113	AGGA	2	8	13788	13795	50 %	0 %	50 %	0 %	409246413
35	NT_187113	TGTT	2	8	13822	13829	0 %	75 %	25 %	0 %	409246414
36	NT_187113	CACG	2	8	14102	14109	25 %	0 %	25 %	50 %	409246414
37	NT_187113	AAGA	2	8	14135	14142	75 %	0 %	25 %	0 %	409246414
38	NT_187113	GCGA	2	8	14214	14221	25 %	0 %	50 %	25 %	409246414
39	NT_187113	GGCT	2	8	14790	14797	0 %	25 %	50 %	25 %	409246415
40	NT_187113	GCCA	2	8	15027	15034	25 %	0 %	25 %	50 %	409246415
41	NT_187113	TGCG	2	8	15048	15055	0 %	25 %	50 %	25 %	409246415
42	NT_187113	GAGT	2	8	16008	16015	25 %	25 %	50 %	0 %	409246417
43	NT_187113	CGGA	2	8	16175	16182	25 %	0 %	50 %	25 %	409246417
44	NT_187113	CTTG	2	8	16345	16352	0 %	50 %	25 %	25 %	409246418
45	NT_187113	TCAG	2	8	16357	16364	25 %	25 %	25 %	25 %	409246418
46	NT_187113	CTCC	2	8	17329	17336	0 %	25 %	0 %	75 %	409246419
47	NT_187113	TTGC	2	8	17630	17637	0 %	50 %	25 %	25 %	409246419
48	NT_187113	CAGC	2	8	19127	19134	25 %	0 %	25 %	50 %	409246421
49	NT_187113	TTCT	2	8	19852	19859	0 %	75 %	0 %	25 %	409246422
50	NT_187113	GGCT	2	8	20013	20020	0 %	25 %	50 %	25 %	409246422
51	NT_187113	CGAC	2	8	20736	20743	25 %	0 %	25 %	50 %	409246423
52	NT_187113	GCGT	2	8	21317	21324	0 %	25 %	50 %	25 %	409246423
53	NT_187113	AAAG	2	8	21456	21463	75 %	0 %	25 %	0 %	409246423
54	NT_187113	TGAA	2	8	22463	22470	50 %	25 %	25 %	0 %	409246424
55	NT_187113	TGCC	2	8	22693	22700	0 %	25 %	25 %	50 %	409246425
56	NT_187113	AGGA	2	8	24078	24085	50 %	0 %	50 %	0 %	409246426
57	NT_187113	TCGT	2	8	24319	24326	0 %	50 %	25 %	25 %	409246427
58	NT_187113	GCTG	2	8	24517	24524	0 %	25 %	50 %	25 %	409246427
59	NT_187113	CCAG	2	8	24961	24968	25 %	0 %	25 %	50 %	409246427
60	NT_187113	GGTA	2	8	25052	25059	25 %	25 %	50 %	0 %	409246427
61	NT_187113	TCAC	2	8	25750	25757	25 %	25 %	0 %	50 %	409246427
62	NT_187113	ATCA	2	8	26188	26195	50 %	25 %	0 %	25 %	409246428
63	NT_187113	ATAA	2	8	28273	28280	75 %	25 %	0 %	0 %	409246432
64	NT_187113	CTGG	2	8	28976	28983	0 %	25 %	50 %	25 %	409246434
65	NT_187113	CGGA	2	8	29208	29215	25 %	0 %	50 %	25 %	409246434
66	NT_187113	ACGA	2	8	29507	29514	50 %	0 %	25 %	25 %	409246434
67	NT_187113	AGGC	2	8	29853	29860	25 %	0 %	50 %	25 %	409246434
68	NT_187113	CGAC	2	8	30906	30913	25 %	0 %	25 %	50 %	409246434
69	NT_187113	ACGG	2	8	32180	32187	25 %	0 %	50 %	25 %	409246434
70	NT_187113	AACG	2	8	32704	32711	50 %	0 %	25 %	25 %	409246434
71	NT_187113	ATCG	2	8	33752	33759	25 %	25 %	25 %	25 %	409246434
72	NT_187113	ACCG	2	8	34477	34484	25 %	0 %	25 %	50 %	409246434
73	NT_187113	AACG	2	8	34819	34826	50 %	0 %	25 %	25 %	409246434
74	NT_187113	AGGC	2	8	34857	34864	25 %	0 %	50 %	25 %	409246434
75	NT_187113	CCGC	2	8	35060	35067	0 %	0 %	25 %	75 %	409246434
76	NT_187113	GGCA	2	8	35317	35324	25 %	0 %	50 %	25 %	409246434
77	NT_187113	TCAG	2	8	35708	35715	25 %	25 %	25 %	25 %	409246434
78	NT_187113	CGGG	2	8	36036	36043	0 %	0 %	75 %	25 %	409246434
79	NT_187113	GGCA	2	8	36253	36260	25 %	0 %	50 %	25 %	409246434
80	NT_187113	GCAG	2	8	36686	36693	25 %	0 %	50 %	25 %	409246434
81	NT_187113	CAGG	2	8	36753	36760	25 %	0 %	50 %	25 %	409246434
82	NT_187113	GGCG	2	8	36992	36999	0 %	0 %	75 %	25 %	409246435
83	NT_187113	GGCG	2	8	37274	37281	0 %	0 %	75 %	25 %	409246435
84	NT_187113	GCGG	2	8	38007	38014	0 %	0 %	75 %	25 %	409246435
85	NT_187113	GACA	2	8	38213	38220	50 %	0 %	25 %	25 %	409246435
86	NT_187113	GCTC	2	8	38791	38798	0 %	25 %	25 %	50 %	409246435
87	NT_187113	CTGG	2	8	39014	39021	0 %	25 %	50 %	25 %	409246435
88	NT_187113	ACCA	2	8	39732	39739	50 %	0 %	0 %	50 %	409246435
89	NT_187113	CTTC	2	8	40264	40271	0 %	50 %	0 %	50 %	409246436
90	NT_187113	GCTG	2	8	40865	40872	0 %	25 %	50 %	25 %	409246436
91	NT_187113	CCCG	2	8	41375	41382	0 %	0 %	25 %	75 %	409246436
92	NT_187113	GTTG	2	8	41801	41808	0 %	50 %	50 %	0 %	409246437
93	NT_187113	CTTT	2	8	42421	42428	0 %	75 %	0 %	25 %	409246437
94	NT_187113	CCAA	2	8	42547	42554	50 %	0 %	0 %	50 %	409246437
95	NT_187113	GGCG	2	8	43145	43152	0 %	0 %	75 %	25 %	409246437
96	NT_187113	GATG	2	8	43646	43653	25 %	25 %	50 %	0 %	409246437
97	NT_187113	ATCA	2	8	43720	43727	50 %	25 %	0 %	25 %	409246437
98	NT_187113	CACC	2	8	44748	44755	25 %	0 %	0 %	75 %	409246438
99	NT_187113	AAAT	2	8	44769	44776	75 %	25 %	0 %	0 %	409246438
100	NT_187113	TGGA	2	8	47634	47641	25 %	25 %	50 %	0 %	409246439
101	NT_187113	ATTC	2	8	48338	48345	25 %	50 %	0 %	25 %	409246440
102	NT_187113	TGTT	2	8	48468	48475	0 %	75 %	25 %	0 %	409246440
103	NT_187113	AATT	2	8	48548	48555	50 %	50 %	0 %	0 %	409246440
104	NT_187113	GTCT	2	8	48709	48716	0 %	50 %	25 %	25 %	409246440
105	NT_187113	TTTA	2	8	48743	48750	25 %	75 %	0 %	0 %	409246440

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.