MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187111	TATCCG	2	12	3695	3706	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409251180
2	NT_187111	CAGCGT	2	12	5832	5843	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409251180
3	NT_187111	TCAGCG	2	12	6452	6463	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409251180
4	NT_187111	TTCACC	2	12	7507	7518	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	409251180
5	NT_187111	CGGTGA	2	12	9104	9115	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409251180
6	NT_187111	CGACGT	2	12	12920	12931	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409251182
7	NT_187111	ATGGTG	2	12	14032	14043	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	409251182
8	NT_187111	TGCCGT	2	12	16723	16734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251183
9	NT_187111	ACCGTT	2	12	17223	17234	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409251183
10	NT_187111	CAGCGA	2	12	22535	22546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251187
11	NT_187111	GCGTTT	2	12	26704	26715	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	409251191
12	NT_187111	ATCTGC	2	12	26831	26842	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409251191
13	NT_187111	CCCATC	2	12	28218	28229	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	409251192
14	NT_187111	CCGCAG	2	12	29668	29679	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409251195
15	NT_187111	GCGGCC	2	12	34687	34698	0 %	0 %	50 %	50 %	409251199
16	NT_187111	AGCGGC	2	12	36558	36569	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409251199
17	NT_187111	TCCAGC	2	12	36954	36965	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409251200
18	NT_187111	TTCGCC	2	12	38333	38344	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	409251200
19	NT_187111	CGCCAG	2	12	41552	41563	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409251200
20	NT_187111	TATTGA	2	12	43205	43216	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	409251204
21	NT_187111	GTTCGC	2	12	47427	47438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251209
22	NT_187111	ATTGAT	2	12	57035	57046	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	409251220
23	NT_187111	GCCAGC	2	12	58131	58142	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409251221
24	NT_187111	GCCTTT	2	12	60034	60045	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	409251223
25	NT_187111	TTTCCG	2	12	69204	69215	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	409251229
26	NT_187111	CAAAGA	2	12	72425	72436	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	409251231
27	NT_187111	GACGGC	2	12	74140	74151	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409251233
28	NT_187111	GCCGCT	2	12	75908	75919	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409251234
29	NT_187111	CCAGCG	2	12	78770	78781	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409251238
30	NT_187111	CATCGA	2	12	79824	79835	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409251238
31	NT_187111	CGCCAG	2	12	81618	81629	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409251238
32	NT_187111	GCTTAT	2	12	83730	83741	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	409251240
33	NT_187111	GGAAGC	2	12	83804	83815	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	409251240
34	NT_187111	ACCGAT	2	12	85076	85087	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409251242
35	NT_187111	CCGTTC	2	12	87857	87868	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	409251245
36	NT_187111	CGTTTC	2	12	89268	89279	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	409251246
37	NT_187111	CCGGAT	2	12	93117	93128	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409251251
38	NT_187111	TTTCAC	2	12	94010	94021	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	409251253
39	NT_187111	CAGCGC	2	12	97106	97117	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409251256
40	NT_187111	CAGATC	2	12	97508	97519	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409251256
41	NT_187111	CGCTCA	2	12	98448	98459	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409251256
42	NT_187111	GTGCGA	2	12	105039	105050	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409251263

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.