MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 210

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187111	CACG	2	8	3300	3307	25 %	0 %	25 %	50 %	409251180
2	NT_187111	TGCC	2	8	3323	3330	0 %	25 %	25 %	50 %	409251180
3	NT_187111	TGCA	2	8	3570	3577	25 %	25 %	25 %	25 %	409251180
4	NT_187111	TGGC	2	8	3883	3890	0 %	25 %	50 %	25 %	409251180
5	NT_187111	CCAC	2	8	4265	4272	25 %	0 %	0 %	75 %	409251180
6	NT_187111	CCCG	2	8	4825	4832	0 %	0 %	25 %	75 %	409251180
7	NT_187111	ACTG	2	8	5081	5088	25 %	25 %	25 %	25 %	409251180
8	NT_187111	CTGT	2	8	5467	5474	0 %	50 %	25 %	25 %	409251180
9	NT_187111	GCAG	2	8	6752	6759	25 %	0 %	50 %	25 %	409251180
10	NT_187111	CGGG	2	8	7260	7267	0 %	0 %	75 %	25 %	409251180
11	NT_187111	GGCC	2	8	7799	7806	0 %	0 %	50 %	50 %	409251180
12	NT_187111	CTGC	2	8	8956	8963	0 %	25 %	25 %	50 %	409251180
13	NT_187111	CTGG	2	8	10359	10366	0 %	25 %	50 %	25 %	409251180
14	NT_187111	TCAG	2	8	11653	11660	25 %	25 %	25 %	25 %	409251182
15	NT_187111	CGCC	2	8	11768	11775	0 %	0 %	25 %	75 %	409251182
16	NT_187111	GGTC	2	8	11804	11811	0 %	25 %	50 %	25 %	409251182
17	NT_187111	CTGG	2	8	12745	12752	0 %	25 %	50 %	25 %	409251182
18	NT_187111	CGGG	2	8	13032	13039	0 %	0 %	75 %	25 %	409251182
19	NT_187111	TCGG	2	8	14305	14312	0 %	25 %	50 %	25 %	409251182
20	NT_187111	CGCC	2	8	15101	15108	0 %	0 %	25 %	75 %	409251182
21	NT_187111	TTGC	2	8	17434	17441	0 %	50 %	25 %	25 %	409251183
22	NT_187111	TTCA	2	8	17609	17616	25 %	50 %	0 %	25 %	409251184
23	NT_187111	CAGC	2	8	18172	18179	25 %	0 %	25 %	50 %	409251184
24	NT_187111	CAGG	2	8	18375	18382	25 %	0 %	50 %	25 %	409251184
25	NT_187111	CAGC	2	8	18980	18987	25 %	0 %	25 %	50 %	409251184
26	NT_187111	AGTG	2	8	21165	21172	25 %	25 %	50 %	0 %	409251186
27	NT_187111	CGAC	2	8	21193	21200	25 %	0 %	25 %	50 %	409251186
28	NT_187111	CCGC	2	8	22758	22765	0 %	0 %	25 %	75 %	409251187
29	NT_187111	ACGA	2	8	22795	22802	50 %	0 %	25 %	25 %	409251187
30	NT_187111	GCTT	2	8	23326	23333	0 %	50 %	25 %	25 %	409251188
31	NT_187111	CGAG	2	8	23350	23357	25 %	0 %	50 %	25 %	409251188
32	NT_187111	GCCA	2	8	23630	23637	25 %	0 %	25 %	50 %	409251188
33	NT_187111	CAGC	2	8	23669	23676	25 %	0 %	25 %	50 %	409251188
34	NT_187111	TGTT	2	8	24213	24220	0 %	75 %	25 %	0 %	409251189
35	NT_187111	ACGC	2	8	25260	25267	25 %	0 %	25 %	50 %	409251190
36	NT_187111	CCGC	2	8	25630	25637	0 %	0 %	25 %	75 %	409251190
37	NT_187111	GATC	2	8	25664	25671	25 %	25 %	25 %	25 %	409251190
38	NT_187111	CGGC	2	8	26398	26405	0 %	0 %	50 %	50 %	409251191
39	NT_187111	CCAG	2	8	26950	26957	25 %	0 %	25 %	50 %	409251191
40	NT_187111	CGTG	2	8	27286	27293	0 %	25 %	50 %	25 %	409251191
41	NT_187111	ATTC	2	8	27302	27309	25 %	50 %	0 %	25 %	409251191
42	NT_187111	CGAT	2	8	27768	27775	25 %	25 %	25 %	25 %	409251192
43	NT_187111	GACA	2	8	30201	30208	50 %	0 %	25 %	25 %	409251195
44	NT_187111	ACAG	2	8	30210	30217	50 %	0 %	25 %	25 %	409251195
45	NT_187111	GATC	2	8	30366	30373	25 %	25 %	25 %	25 %	409251195
46	NT_187111	GCCA	2	8	30616	30623	25 %	0 %	25 %	50 %	409251196
47	NT_187111	AAGC	2	8	31025	31032	50 %	0 %	25 %	25 %	409251196
48	NT_187111	GCCA	2	8	31126	31133	25 %	0 %	25 %	50 %	409251196
49	NT_187111	CATG	2	8	31190	31197	25 %	25 %	25 %	25 %	409251196
50	NT_187111	ATTC	2	8	32492	32499	25 %	50 %	0 %	25 %	409251198
51	NT_187111	GGCT	2	8	34824	34831	0 %	25 %	50 %	25 %	409251199
52	NT_187111	GGCA	2	8	34880	34887	25 %	0 %	50 %	25 %	409251199
53	NT_187111	GGCA	2	8	35462	35469	25 %	0 %	50 %	25 %	409251199
54	NT_187111	AGCG	2	8	35475	35482	25 %	0 %	50 %	25 %	409251199
55	NT_187111	GGAT	2	8	35586	35593	25 %	25 %	50 %	0 %	409251199
56	NT_187111	GCAG	2	8	35775	35782	25 %	0 %	50 %	25 %	409251199
57	NT_187111	GCCA	2	8	35922	35929	25 %	0 %	25 %	50 %	409251199
58	NT_187111	CGCC	2	8	36616	36623	0 %	0 %	25 %	75 %	409251199
59	NT_187111	CAGC	2	8	36629	36636	25 %	0 %	25 %	50 %	409251199
60	NT_187111	CTCG	2	8	36689	36696	0 %	25 %	25 %	50 %	409251200
61	NT_187111	CCGG	2	8	36966	36973	0 %	0 %	50 %	50 %	409251200
62	NT_187111	GGCT	2	8	37179	37186	0 %	25 %	50 %	25 %	409251200
63	NT_187111	TGGC	2	8	38152	38159	0 %	25 %	50 %	25 %	409251200
64	NT_187111	ACGC	2	8	38252	38259	25 %	0 %	25 %	50 %	409251200
65	NT_187111	GCGG	2	8	38473	38480	0 %	0 %	75 %	25 %	409251200
66	NT_187111	ATCG	2	8	39218	39225	25 %	25 %	25 %	25 %	409251200
67	NT_187111	CTGG	2	8	39896	39903	0 %	25 %	50 %	25 %	409251200
68	NT_187111	CACT	2	8	39907	39914	25 %	25 %	0 %	50 %	409251200
69	NT_187111	GGCT	2	8	40302	40309	0 %	25 %	50 %	25 %	409251200
70	NT_187111	CGGT	2	8	40427	40434	0 %	25 %	50 %	25 %	409251200
71	NT_187111	TGCT	2	8	40464	40471	0 %	50 %	25 %	25 %	409251200
72	NT_187111	CGCC	2	8	40825	40832	0 %	0 %	25 %	75 %	409251200
73	NT_187111	GGCG	2	8	41921	41928	0 %	0 %	75 %	25 %	409251201
74	NT_187111	GGCG	2	8	42164	42171	0 %	0 %	75 %	25 %	409251201
75	NT_187111	ATTC	2	8	43146	43153	25 %	50 %	0 %	25 %	409251204
76	NT_187111	ATGG	2	8	43191	43198	25 %	25 %	50 %	0 %	409251204
77	NT_187111	CTGG	2	8	43364	43371	0 %	25 %	50 %	25 %	409251204
78	NT_187111	TGAA	2	8	43480	43487	50 %	25 %	25 %	0 %	409251204
79	NT_187111	ATCG	2	8	44257	44264	25 %	25 %	25 %	25 %	409251205
80	NT_187111	GTCG	2	8	44284	44291	0 %	25 %	50 %	25 %	409251205
81	NT_187111	AATC	2	8	44442	44449	50 %	25 %	0 %	25 %	409251205
82	NT_187111	CAGC	2	8	45125	45132	25 %	0 %	25 %	50 %	409251206
83	NT_187111	TTTG	2	8	45679	45686	0 %	75 %	25 %	0 %	409251206
84	NT_187111	CAGG	2	8	45728	45735	25 %	0 %	50 %	25 %	409251206
85	NT_187111	AACG	2	8	46473	46480	50 %	0 %	25 %	25 %	409251207
86	NT_187111	GTTT	2	8	46982	46989	0 %	75 %	25 %	0 %	409251209
87	NT_187111	CGCC	2	8	47361	47368	0 %	0 %	25 %	75 %	409251209
88	NT_187111	AGCG	2	8	48479	48486	25 %	0 %	50 %	25 %	409251209
89	NT_187111	ACCG	2	8	48556	48563	25 %	0 %	25 %	50 %	409251209
90	NT_187111	TCAT	2	8	50424	50431	25 %	50 %	0 %	25 %	409251213
91	NT_187111	AGGT	2	8	51090	51097	25 %	25 %	50 %	0 %	409251213
92	NT_187111	GCCA	2	8	51325	51332	25 %	0 %	25 %	50 %	409251213
93	NT_187111	TTAA	2	8	51637	51644	50 %	50 %	0 %	0 %	409251214
94	NT_187111	CGGG	2	8	52364	52371	0 %	0 %	75 %	25 %	409251215
95	NT_187111	GCCA	2	8	52542	52549	25 %	0 %	25 %	50 %	409251215
96	NT_187111	CAGC	2	8	52809	52816	25 %	0 %	25 %	50 %	409251215
97	NT_187111	GTTA	2	8	52931	52938	25 %	50 %	25 %	0 %	409251215
98	NT_187111	GCGG	2	8	53811	53818	0 %	0 %	75 %	25 %	409251216
99	NT_187111	GCTG	2	8	54388	54395	0 %	25 %	50 %	25 %	409251217
100	NT_187111	CAAA	2	8	54854	54861	75 %	0 %	0 %	25 %	409251217
101	NT_187111	TTAT	2	8	55274	55281	25 %	75 %	0 %	0 %	409251218
102	NT_187111	GACA	2	8	55407	55414	50 %	0 %	25 %	25 %	409251218
103	NT_187111	ACTG	2	8	55606	55613	25 %	25 %	25 %	25 %	409251218
104	NT_187111	GGCG	2	8	57350	57357	0 %	0 %	75 %	25 %	409251220
105	NT_187111	GTGC	2	8	57679	57686	0 %	25 %	50 %	25 %	409251220
106	NT_187111	ATCT	2	8	57875	57882	25 %	50 %	0 %	25 %	409251220
107	NT_187111	GCCC	2	8	58063	58070	0 %	0 %	25 %	75 %	409251221
108	NT_187111	CCAG	2	8	58579	58586	25 %	0 %	25 %	50 %	409251221
109	NT_187111	GCCA	2	8	58728	58735	25 %	0 %	25 %	50 %	409251221
110	NT_187111	CATA	2	8	58786	58793	50 %	25 %	0 %	25 %	409251221
111	NT_187111	CCGC	3	12	58815	58826	0 %	0 %	25 %	75 %	409251221
112	NT_187111	CAGC	2	8	59280	59287	25 %	0 %	25 %	50 %	409251222
113	NT_187111	CGCC	2	8	60191	60198	0 %	0 %	25 %	75 %	409251223
114	NT_187111	GAAG	2	8	61082	61089	50 %	0 %	50 %	0 %	409251224
115	NT_187111	AGCC	2	8	61496	61503	25 %	0 %	25 %	50 %	409251224
116	NT_187111	GCCA	2	8	62167	62174	25 %	0 %	25 %	50 %	409251224
117	NT_187111	CCAG	3	12	62490	62501	25 %	0 %	25 %	50 %	409251225
118	NT_187111	GAGC	2	8	64892	64899	25 %	0 %	50 %	25 %	409251226
119	NT_187111	ACCG	2	8	64946	64953	25 %	0 %	25 %	50 %	409251226
120	NT_187111	CATT	2	8	65120	65127	25 %	50 %	0 %	25 %	409251226
121	NT_187111	GATC	2	8	65439	65446	25 %	25 %	25 %	25 %	409251227
122	NT_187111	ACCA	2	8	65530	65537	50 %	0 %	0 %	50 %	409251227
123	NT_187111	TCCA	2	8	66247	66254	25 %	25 %	0 %	50 %	409251227
124	NT_187111	CGTT	2	8	67841	67848	0 %	50 %	25 %	25 %	409251228
125	NT_187111	GGCA	2	8	67935	67942	25 %	0 %	50 %	25 %	409251228
126	NT_187111	GCCT	2	8	68086	68093	0 %	25 %	25 %	50 %	409251228
127	NT_187111	GGCA	2	8	69358	69365	25 %	0 %	50 %	25 %	409251229
128	NT_187111	ATTT	2	8	69437	69444	25 %	75 %	0 %	0 %	409251229
129	NT_187111	CATT	2	8	69637	69644	25 %	50 %	0 %	25 %	409251229
130	NT_187111	GATG	2	8	70168	70175	25 %	25 %	50 %	0 %	409251229
131	NT_187111	CTGC	2	8	70367	70374	0 %	25 %	25 %	50 %	409251229
132	NT_187111	TCCT	2	8	70605	70612	0 %	50 %	0 %	50 %	409251229
133	NT_187111	GACG	2	8	70760	70767	25 %	0 %	50 %	25 %	409251229
134	NT_187111	GAAA	2	8	70786	70793	75 %	0 %	25 %	0 %	409251229
135	NT_187111	TGGC	2	8	71351	71358	0 %	25 %	50 %	25 %	409251230
136	NT_187111	GGCG	2	8	71375	71382	0 %	0 %	75 %	25 %	409251230
137	NT_187111	GCGG	2	8	71465	71472	0 %	0 %	75 %	25 %	409251230
138	NT_187111	GGCA	2	8	71968	71975	25 %	0 %	50 %	25 %	409251230
139	NT_187111	CCTG	2	8	72068	72075	0 %	25 %	25 %	50 %	409251230
140	NT_187111	CTGG	3	12	72131	72142	0 %	25 %	50 %	25 %	409251230
141	NT_187111	TACC	2	8	72635	72642	25 %	25 %	0 %	50 %	409251231
142	NT_187111	CGTC	2	8	73731	73738	0 %	25 %	25 %	50 %	409251232
143	NT_187111	CCAT	2	8	73928	73935	25 %	25 %	0 %	50 %	409251232
144	NT_187111	TCCT	2	8	73996	74003	0 %	50 %	0 %	50 %	409251232
145	NT_187111	GGCA	2	8	75289	75296	25 %	0 %	50 %	25 %	409251234
146	NT_187111	TCAA	2	8	75398	75405	50 %	25 %	0 %	25 %	409251234
147	NT_187111	CTCA	2	8	75592	75599	25 %	25 %	0 %	50 %	409251234
148	NT_187111	GATA	2	8	76612	76619	50 %	25 %	25 %	0 %	409251235
149	NT_187111	CTGT	2	8	76653	76660	0 %	50 %	25 %	25 %	409251235
150	NT_187111	ACTG	2	8	77183	77190	25 %	25 %	25 %	25 %	409251236
151	NT_187111	GCCT	2	8	77267	77274	0 %	25 %	25 %	50 %	409251236
152	NT_187111	TCTG	2	8	77294	77301	0 %	50 %	25 %	25 %	409251236
153	NT_187111	GTAA	2	8	77392	77399	50 %	25 %	25 %	0 %	409251236
154	NT_187111	GCCA	2	8	79284	79291	25 %	0 %	25 %	50 %	409251238
155	NT_187111	CACG	2	8	79592	79599	25 %	0 %	25 %	50 %	409251238
156	NT_187111	GATC	2	8	79676	79683	25 %	25 %	25 %	25 %	409251238
157	NT_187111	AAGG	2	8	80211	80218	50 %	0 %	50 %	0 %	409251238
158	NT_187111	CCGC	2	8	80647	80654	0 %	0 %	25 %	75 %	409251238
159	NT_187111	CCCG	2	8	80919	80926	0 %	0 %	25 %	75 %	409251238
160	NT_187111	ATTA	2	8	82437	82444	50 %	50 %	0 %	0 %	409251240
161	NT_187111	GACC	2	8	83450	83457	25 %	0 %	25 %	50 %	409251240
162	NT_187111	ATTC	2	8	84155	84162	25 %	50 %	0 %	25 %	409251241
163	NT_187111	GCGG	2	8	84558	84565	0 %	0 %	75 %	25 %	409251241
164	NT_187111	CTGG	2	8	84794	84801	0 %	25 %	50 %	25 %	409251242
165	NT_187111	ATAG	2	8	84904	84911	50 %	25 %	25 %	0 %	409251242
166	NT_187111	TCCA	2	8	85184	85191	25 %	25 %	0 %	50 %	409251242
167	NT_187111	CGCC	2	8	85591	85598	0 %	0 %	25 %	75 %	409251243
168	NT_187111	CGAT	2	8	85740	85747	25 %	25 %	25 %	25 %	409251243
169	NT_187111	GCCT	2	8	87138	87145	0 %	25 %	25 %	50 %	409251244
170	NT_187111	ATTA	2	8	87915	87922	50 %	50 %	0 %	0 %	409251245
171	NT_187111	CGCC	2	8	88005	88012	0 %	0 %	25 %	75 %	409251245
172	NT_187111	CTGT	2	8	88290	88297	0 %	50 %	25 %	25 %	409251245
173	NT_187111	TCAG	2	8	88609	88616	25 %	25 %	25 %	25 %	409251246
174	NT_187111	CTGG	2	8	88728	88735	0 %	25 %	50 %	25 %	409251246
175	NT_187111	CTGG	2	8	88959	88966	0 %	25 %	50 %	25 %	409251246
176	NT_187111	ACAA	2	8	89281	89288	75 %	0 %	0 %	25 %	409251246
177	NT_187111	AAAT	2	8	89525	89532	75 %	25 %	0 %	0 %	409251247
178	NT_187111	CTGG	2	8	89658	89665	0 %	25 %	50 %	25 %	409251247
179	NT_187111	CAAG	2	8	89775	89782	50 %	0 %	25 %	25 %	409251247
180	NT_187111	TTGA	2	8	90619	90626	25 %	50 %	25 %	0 %	409251247
181	NT_187111	TCCT	2	8	90772	90779	0 %	50 %	0 %	50 %	409251248
182	NT_187111	CGCT	2	8	91465	91472	0 %	25 %	25 %	50 %	409251248
183	NT_187111	CTGC	2	8	91587	91594	0 %	25 %	25 %	50 %	409251248
184	NT_187111	CATG	2	8	92143	92150	25 %	25 %	25 %	25 %	409251250
185	NT_187111	GCCT	2	8	93085	93092	0 %	25 %	25 %	50 %	409251251
186	NT_187111	TCTT	2	8	93214	93221	0 %	75 %	0 %	25 %	409251252
187	NT_187111	CGTT	2	8	94179	94186	0 %	50 %	25 %	25 %	409251253
188	NT_187111	CGTT	2	8	95417	95424	0 %	50 %	25 %	25 %	409251254
189	NT_187111	ATTA	2	8	95512	95519	50 %	50 %	0 %	0 %	409251254
190	NT_187111	TTTC	2	8	96123	96130	0 %	75 %	0 %	25 %	409251255
191	NT_187111	GAAC	2	8	96545	96552	50 %	0 %	25 %	25 %	409251255
192	NT_187111	CCAG	2	8	96597	96604	25 %	0 %	25 %	50 %	409251255
193	NT_187111	AAAC	2	8	96702	96709	75 %	0 %	0 %	25 %	409251255
194	NT_187111	CGTT	2	8	97125	97132	0 %	50 %	25 %	25 %	409251256
195	NT_187111	ATAG	2	8	97448	97455	50 %	25 %	25 %	0 %	409251256
196	NT_187111	CCAG	2	8	97822	97829	25 %	0 %	25 %	50 %	409251256
197	NT_187111	CGTC	2	8	98125	98132	0 %	25 %	25 %	50 %	409251256
198	NT_187111	AACG	2	8	98322	98329	50 %	0 %	25 %	25 %	409251256
199	NT_187111	CTAT	2	8	99367	99374	25 %	50 %	0 %	25 %	409251257
200	NT_187111	ATCT	2	8	99479	99486	25 %	50 %	0 %	25 %	409251257
201	NT_187111	CTGC	2	8	99799	99806	0 %	25 %	25 %	50 %	409251257
202	NT_187111	GTTG	2	8	100444	100451	0 %	50 %	50 %	0 %	409251257
203	NT_187111	TTAA	2	8	100798	100805	50 %	50 %	0 %	0 %	409251258
204	NT_187111	CCAG	2	8	101807	101814	25 %	0 %	25 %	50 %	409251260
205	NT_187111	TTGA	2	8	101923	101930	25 %	50 %	25 %	0 %	409251260
206	NT_187111	CTGG	2	8	103738	103745	0 %	25 %	50 %	25 %	409251261
207	NT_187111	GGCG	2	8	104136	104143	0 %	0 %	75 %	25 %	409251262
208	NT_187111	AATT	2	8	104695	104702	50 %	50 %	0 %	0 %	409251262
209	NT_187111	CGGA	2	8	105140	105147	25 %	0 %	50 %	25 %	409251263
210	NT_187111	CAGT	2	8	105503	105510	25 %	25 %	25 %	25 %	409251263

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.