MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187110	TCT	3	9	498	506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251171
2	NT_187110	GCA	2	6	541	546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251171
3	NT_187110	CAA	2	6	569	574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251171
4	NT_187110	CAC	2	6	589	594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251171
5	NT_187110	TGA	2	6	849	854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251172
6	NT_187110	CGC	2	6	934	939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251172
7	NT_187110	TAC	2	6	1132	1137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251172
8	NT_187110	GGC	2	6	1151	1156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251172
9	NT_187110	GCG	2	6	1172	1177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251172
10	NT_187110	AAG	2	6	1230	1235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251172
11	NT_187110	ACC	2	6	1283	1288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251172
12	NT_187110	GAA	2	6	1384	1389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251173
13	NT_187110	TCT	3	9	1436	1444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251173
14	NT_187110	GCG	2	6	1460	1465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251173
15	NT_187110	GAA	2	6	1496	1501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251173
16	NT_187110	AGC	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251173
17	NT_187110	TCG	2	6	1696	1701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251173
18	NT_187110	CTG	2	6	1865	1870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251173
19	NT_187110	AAG	2	6	2234	2239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251174
20	NT_187110	ATG	2	6	2295	2300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251174
21	NT_187110	ATC	2	6	2325	2330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251174
22	NT_187110	TAC	2	6	2361	2366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251174
23	NT_187110	TTG	2	6	2397	2402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251174
24	NT_187110	CAA	2	6	2443	2448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251174
25	NT_187110	AGC	2	6	2459	2464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251174
26	NT_187110	ATC	2	6	2499	2504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251174
27	NT_187110	TTC	2	6	2505	2510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251174
28	NT_187110	CGG	2	6	2674	2679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251174
29	NT_187110	TTG	2	6	2784	2789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251174
30	NT_187110	GGT	2	6	3182	3187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251175
31	NT_187110	TGA	2	6	3234	3239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251175
32	NT_187110	GCA	2	6	3465	3470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251175
33	NT_187110	TTC	2	6	3485	3490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251175
34	NT_187110	GCC	2	6	3649	3654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251175
35	NT_187110	TGA	2	6	3672	3677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251175
36	NT_187110	CGC	2	6	3700	3705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251175
37	NT_187110	CTT	2	6	3771	3776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251175
38	NT_187110	GAT	2	6	3805	3810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251175
39	NT_187110	TCT	2	6	3863	3868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251175
40	NT_187110	CGA	2	6	3957	3962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251175
41	NT_187110	GCA	3	9	3996	4004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251175
42	NT_187110	GAA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251175
43	NT_187110	CGC	2	6	4026	4031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251175
44	NT_187110	TCG	2	6	4055	4060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251175
45	NT_187110	CGT	2	6	4089	4094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251175
46	NT_187110	TTC	2	6	4222	4227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251175
47	NT_187110	CAG	2	6	4327	4332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251175
48	NT_187110	GCG	2	6	4521	4526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251175
49	NT_187110	GGT	2	6	4546	4551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251175
50	NT_187110	GCC	2	6	4561	4566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251175
51	NT_187110	AAT	2	6	4573	4578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251175
52	NT_187110	CGT	2	6	4851	4856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251176
53	NT_187110	TCG	2	6	4919	4924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251176
54	NT_187110	GCC	2	6	4963	4968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251176
55	NT_187110	CTG	2	6	4972	4977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251176
56	NT_187110	CGG	2	6	5046	5051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251176
57	NT_187110	GGA	2	6	5077	5082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409251176
58	NT_187110	TTC	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251176
59	NT_187110	CCA	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251176
60	NT_187110	GCG	2	6	5216	5221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251176
61	NT_187110	CCG	2	6	5255	5260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251176
62	NT_187110	GGT	2	6	5353	5358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251176
63	NT_187110	GCC	2	6	5446	5451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251176
64	NT_187110	GAT	2	6	5452	5457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251176
65	NT_187110	GAG	2	6	5525	5530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409251176
66	NT_187110	CAG	2	6	5536	5541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251176
67	NT_187110	GCC	2	6	5555	5560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251176
68	NT_187110	CCG	2	6	5604	5609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251176
69	NT_187110	ATC	2	6	5710	5715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251176
70	NT_187110	TGA	2	6	5871	5876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251176
71	NT_187110	CCA	2	6	5880	5885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251176
72	NT_187110	CAC	2	6	5902	5907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251176
73	NT_187110	GTG	2	6	5960	5965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251176
74	NT_187110	TTC	2	6	6011	6016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251176
75	NT_187110	CTT	2	6	6027	6032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251176
76	NT_187110	GCC	2	6	6076	6081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251176
77	NT_187110	CGC	2	6	6130	6135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251176
78	NT_187110	AGG	2	6	6227	6232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409251176
79	NT_187110	CGT	2	6	6234	6239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251176
80	NT_187110	CTT	2	6	6252	6257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251176
81	NT_187110	GCC	2	6	6471	6476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251177
82	NT_187110	CTG	2	6	6494	6499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251177
83	NT_187110	GCG	2	6	6531	6536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251177
84	NT_187110	CCG	2	6	6634	6639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251177
85	NT_187110	GCA	2	6	6664	6669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251177
86	NT_187110	ATC	2	6	6722	6727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251177
87	NT_187110	TTG	2	6	6758	6763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251177
88	NT_187110	CAG	2	6	6764	6769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251177
89	NT_187110	AGC	2	6	6777	6782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251177
90	NT_187110	CAG	2	6	6818	6823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251177
91	NT_187110	CGT	2	6	6917	6922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251177
92	NT_187110	CGG	2	6	6954	6959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251177
93	NT_187110	CGA	2	6	6967	6972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251177
94	NT_187110	TCG	2	6	7038	7043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251177
95	NT_187110	CGG	3	9	7048	7056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251177
96	NT_187110	ACG	2	6	7083	7088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251177
97	NT_187110	GGT	2	6	7126	7131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251177
98	NT_187110	CAG	2	6	7203	7208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251177
99	NT_187110	CAG	2	6	7232	7237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251177
100	NT_187110	GTT	2	6	7240	7245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251177
101	NT_187110	CAG	2	6	7265	7270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251177
102	NT_187110	ACT	2	6	7290	7295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251177
103	NT_187110	GCC	2	6	7311	7316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251177
104	NT_187110	CGA	2	6	7659	7664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251177
105	NT_187110	GGA	2	6	7732	7737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409251177
106	NT_187110	TGC	2	6	7995	8000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
107	NT_187110	CAT	2	6	8109	8114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251178
108	NT_187110	CAT	2	6	8130	8135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251178
109	NT_187110	TGT	3	9	8445	8453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251178
110	NT_187110	CGC	2	6	8487	8492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
111	NT_187110	CTG	2	6	8650	8655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
112	NT_187110	CGC	2	6	8679	8684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
113	NT_187110	AGT	2	6	8700	8705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251178
114	NT_187110	CGC	2	6	8901	8906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
115	NT_187110	CGC	2	6	8928	8933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
116	NT_187110	CGC	2	6	8937	8942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
117	NT_187110	CGT	2	6	8943	8948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
118	NT_187110	TCA	2	6	8996	9001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251178
119	NT_187110	CCG	2	6	9002	9007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
120	NT_187110	GTC	2	6	9010	9015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
121	NT_187110	ATC	2	6	9016	9021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251178
122	NT_187110	CGC	2	6	9138	9143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
123	NT_187110	CCA	2	6	9150	9155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251178
124	NT_187110	GGT	2	6	9211	9216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251178
125	NT_187110	ATC	2	6	9259	9264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251178
126	NT_187110	GCC	2	6	9295	9300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
127	NT_187110	TGC	2	6	9354	9359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
128	NT_187110	TGC	2	6	9483	9488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
129	NT_187110	CTG	2	6	9523	9528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
130	NT_187110	CGC	2	6	9612	9617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
131	NT_187110	CGC	2	6	9888	9893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
132	NT_187110	GAC	2	6	9973	9978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251178
133	NT_187110	CGC	2	6	9984	9989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
134	NT_187110	GCC	2	6	10003	10008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
135	NT_187110	GTC	2	6	10121	10126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
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155	NT_187110	CGC	2	6	10977	10982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
156	NT_187110	CGC	2	6	11070	11075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.