MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 212

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187109	GC	3	6	500	505	0 %	0 %	50 %	50 %	409251068
2	NT_187109	GC	3	6	508	513	0 %	0 %	50 %	50 %	409251068
3	NT_187109	CG	4	8	604	611	0 %	0 %	50 %	50 %	409251068
4	NT_187109	GC	3	6	813	818	0 %	0 %	50 %	50 %	409251068
5	NT_187109	CG	3	6	1058	1063	0 %	0 %	50 %	50 %	409251068
6	NT_187109	GC	3	6	2056	2061	0 %	0 %	50 %	50 %	409251069
7	NT_187109	CG	3	6	2291	2296	0 %	0 %	50 %	50 %	409251069
8	NT_187109	GC	3	6	2454	2459	0 %	0 %	50 %	50 %	409251069
9	NT_187109	CA	3	6	2929	2934	50 %	0 %	0 %	50 %	409251069
10	NT_187109	GC	3	6	3662	3667	0 %	0 %	50 %	50 %	409251070
11	NT_187109	CG	3	6	4283	4288	0 %	0 %	50 %	50 %	409251070
12	NT_187109	GC	3	6	4550	4555	0 %	0 %	50 %	50 %	409251071
13	NT_187109	GC	3	6	4698	4703	0 %	0 %	50 %	50 %	409251071
14	NT_187109	GC	3	6	4846	4851	0 %	0 %	50 %	50 %	409251071
15	NT_187109	GC	3	6	5794	5799	0 %	0 %	50 %	50 %	409251071
16	NT_187109	GC	3	6	5909	5914	0 %	0 %	50 %	50 %	409251071
17	NT_187109	CA	3	6	6310	6315	50 %	0 %	0 %	50 %	409251072
18	NT_187109	CG	3	6	6430	6435	0 %	0 %	50 %	50 %	409251072
19	NT_187109	CG	3	6	7003	7008	0 %	0 %	50 %	50 %	409251072
20	NT_187109	GA	3	6	8495	8500	50 %	0 %	50 %	0 %	409251074
21	NT_187109	GC	3	6	8976	8981	0 %	0 %	50 %	50 %	409251074
22	NT_187109	CT	3	6	10365	10370	0 %	50 %	0 %	50 %	409251075
23	NT_187109	GA	3	6	10953	10958	50 %	0 %	50 %	0 %	409251076
24	NT_187109	GC	3	6	11298	11303	0 %	0 %	50 %	50 %	409251076
25	NT_187109	AT	3	6	11558	11563	50 %	50 %	0 %	0 %	409251076
26	NT_187109	AC	3	6	11749	11754	50 %	0 %	0 %	50 %	409251076
27	NT_187109	GC	4	8	12475	12482	0 %	0 %	50 %	50 %	409251076
28	NT_187109	AT	3	6	13577	13582	50 %	50 %	0 %	0 %	409251077
29	NT_187109	CT	3	6	13709	13714	0 %	50 %	0 %	50 %	409251077
30	NT_187109	CG	3	6	15577	15582	0 %	0 %	50 %	50 %	409251079
31	NT_187109	GA	3	6	17607	17612	50 %	0 %	50 %	0 %	409251082
32	NT_187109	GC	3	6	17906	17911	0 %	0 %	50 %	50 %	409251083
33	NT_187109	GC	3	6	18739	18744	0 %	0 %	50 %	50 %	409251083
34	NT_187109	AC	3	6	20846	20851	50 %	0 %	0 %	50 %	409251085
35	NT_187109	GC	3	6	22390	22395	0 %	0 %	50 %	50 %	409251087
36	NT_187109	CG	3	6	22490	22495	0 %	0 %	50 %	50 %	409251087
37	NT_187109	CT	3	6	23452	23457	0 %	50 %	0 %	50 %	409251089
38	NT_187109	GC	3	6	23852	23857	0 %	0 %	50 %	50 %	409251089
39	NT_187109	CG	3	6	24589	24594	0 %	0 %	50 %	50 %	409251089
40	NT_187109	CG	3	6	26886	26891	0 %	0 %	50 %	50 %	409251091
41	NT_187109	GC	3	6	27037	27042	0 %	0 %	50 %	50 %	409251091
42	NT_187109	GC	3	6	27081	27086	0 %	0 %	50 %	50 %	409251091
43	NT_187109	GC	3	6	27615	27620	0 %	0 %	50 %	50 %	409251092
44	NT_187109	CG	3	6	28142	28147	0 %	0 %	50 %	50 %	409251092
45	NT_187109	GC	3	6	29746	29751	0 %	0 %	50 %	50 %	409251094
46	NT_187109	GC	3	6	30100	30105	0 %	0 %	50 %	50 %	409251094
47	NT_187109	CG	3	6	30152	30157	0 %	0 %	50 %	50 %	409251094
48	NT_187109	CG	3	6	30227	30232	0 %	0 %	50 %	50 %	409251094
49	NT_187109	TG	3	6	30531	30536	0 %	50 %	50 %	0 %	409251094
50	NT_187109	CT	3	6	30876	30881	0 %	50 %	0 %	50 %	409251095
51	NT_187109	GC	3	6	31953	31958	0 %	0 %	50 %	50 %	409251097
52	NT_187109	TG	3	6	32102	32107	0 %	50 %	50 %	0 %	409251097
53	NT_187109	AC	3	6	32182	32187	50 %	0 %	0 %	50 %	409251097
54	NT_187109	CT	3	6	32546	32551	0 %	50 %	0 %	50 %	409251097
55	NT_187109	GC	3	6	33117	33122	0 %	0 %	50 %	50 %	409251098
56	NT_187109	GC	3	6	33273	33278	0 %	0 %	50 %	50 %	409251098
57	NT_187109	GC	3	6	33298	33303	0 %	0 %	50 %	50 %	409251098
58	NT_187109	GC	3	6	33837	33842	0 %	0 %	50 %	50 %	409251098
59	NT_187109	CG	3	6	34040	34045	0 %	0 %	50 %	50 %	409251099
60	NT_187109	TG	3	6	34260	34265	0 %	50 %	50 %	0 %	409251099
61	NT_187109	GC	3	6	34587	34592	0 %	0 %	50 %	50 %	409251099
62	NT_187109	GC	3	6	34823	34828	0 %	0 %	50 %	50 %	409251100
63	NT_187109	AC	3	6	34941	34946	50 %	0 %	0 %	50 %	409251100
64	NT_187109	AC	3	6	35104	35109	50 %	0 %	0 %	50 %	409251100
65	NT_187109	CG	3	6	35679	35684	0 %	0 %	50 %	50 %	409251101
66	NT_187109	CG	3	6	35917	35922	0 %	0 %	50 %	50 %	409251101
67	NT_187109	GC	3	6	36495	36500	0 %	0 %	50 %	50 %	409251103
68	NT_187109	GC	3	6	36765	36770	0 %	0 %	50 %	50 %	409251103
69	NT_187109	GC	5	10	36813	36822	0 %	0 %	50 %	50 %	409251103
70	NT_187109	CG	3	6	37049	37054	0 %	0 %	50 %	50 %	409251103
71	NT_187109	GC	3	6	37279	37284	0 %	0 %	50 %	50 %	409251104
72	NT_187109	CG	3	6	37487	37492	0 %	0 %	50 %	50 %	409251104
73	NT_187109	AG	3	6	38350	38355	50 %	0 %	50 %	0 %	409251105
74	NT_187109	GC	3	6	38859	38864	0 %	0 %	50 %	50 %	409251105
75	NT_187109	GC	4	8	40700	40707	0 %	0 %	50 %	50 %	409251107
76	NT_187109	GC	3	6	41867	41872	0 %	0 %	50 %	50 %	409251108
77	NT_187109	CG	3	6	41968	41973	0 %	0 %	50 %	50 %	409251108
78	NT_187109	CA	3	6	42982	42987	50 %	0 %	0 %	50 %	409251110
79	NT_187109	GC	4	8	43147	43154	0 %	0 %	50 %	50 %	409251110
80	NT_187109	TC	3	6	44354	44359	0 %	50 %	0 %	50 %	409251112
81	NT_187109	CG	3	6	44373	44378	0 %	0 %	50 %	50 %	409251112
82	NT_187109	CA	3	6	44719	44724	50 %	0 %	0 %	50 %	409251112
83	NT_187109	TC	3	6	44925	44930	0 %	50 %	0 %	50 %	409251113
84	NT_187109	AT	3	6	45760	45765	50 %	50 %	0 %	0 %	409251114
85	NT_187109	GC	3	6	46218	46223	0 %	0 %	50 %	50 %	409251115
86	NT_187109	CT	3	6	46557	46562	0 %	50 %	0 %	50 %	409251115
87	NT_187109	GC	3	6	47263	47268	0 %	0 %	50 %	50 %	409251115
88	NT_187109	GC	3	6	48312	48317	0 %	0 %	50 %	50 %	409251116
89	NT_187109	GC	3	6	49570	49575	0 %	0 %	50 %	50 %	409251118
90	NT_187109	CG	3	6	50018	50023	0 %	0 %	50 %	50 %	409251119
91	NT_187109	AG	3	6	50250	50255	50 %	0 %	50 %	0 %	409251119
92	NT_187109	CA	3	6	50292	50297	50 %	0 %	0 %	50 %	409251119
93	NT_187109	GC	3	6	50512	50517	0 %	0 %	50 %	50 %	409251119
94	NT_187109	GC	3	6	50627	50632	0 %	0 %	50 %	50 %	409251119
95	NT_187109	GC	3	6	51201	51206	0 %	0 %	50 %	50 %	409251120
96	NT_187109	GC	3	6	51431	51436	0 %	0 %	50 %	50 %	409251120
97	NT_187109	CG	3	6	52371	52376	0 %	0 %	50 %	50 %	409251121
98	NT_187109	GC	3	6	52855	52860	0 %	0 %	50 %	50 %	409251121
99	NT_187109	GC	3	6	53969	53974	0 %	0 %	50 %	50 %	409251122
100	NT_187109	GC	3	6	54615	54620	0 %	0 %	50 %	50 %	409251122
101	NT_187109	GC	3	6	54691	54696	0 %	0 %	50 %	50 %	409251122
102	NT_187109	TG	3	6	54943	54948	0 %	50 %	50 %	0 %	409251123
103	NT_187109	GC	3	6	55424	55429	0 %	0 %	50 %	50 %	409251123
104	NT_187109	GC	4	8	56987	56994	0 %	0 %	50 %	50 %	409251125
105	NT_187109	GC	3	6	57579	57584	0 %	0 %	50 %	50 %	409251125
106	NT_187109	GA	3	6	57832	57837	50 %	0 %	50 %	0 %	409251125
107	NT_187109	CG	3	6	58039	58044	0 %	0 %	50 %	50 %	409251125
108	NT_187109	GT	4	8	59090	59097	0 %	50 %	50 %	0 %	409251128
109	NT_187109	GA	3	6	59185	59190	50 %	0 %	50 %	0 %	409251128
110	NT_187109	CG	3	6	59232	59237	0 %	0 %	50 %	50 %	409251128
111	NT_187109	CG	3	6	59501	59506	0 %	0 %	50 %	50 %	409251128
112	NT_187109	GC	3	6	59698	59703	0 %	0 %	50 %	50 %	409251128
113	NT_187109	AC	3	6	59739	59744	50 %	0 %	0 %	50 %	409251128
114	NT_187109	TG	3	6	59882	59887	0 %	50 %	50 %	0 %	409251128
115	NT_187109	TC	3	6	60100	60105	0 %	50 %	0 %	50 %	409251129
116	NT_187109	GA	3	6	60183	60188	50 %	0 %	50 %	0 %	409251129
117	NT_187109	GC	3	6	60444	60449	0 %	0 %	50 %	50 %	409251129
118	NT_187109	GC	3	6	61502	61507	0 %	0 %	50 %	50 %	409251130
119	NT_187109	CA	3	6	62068	62073	50 %	0 %	0 %	50 %	409251131
120	NT_187109	GC	3	6	62158	62163	0 %	0 %	50 %	50 %	409251131
121	NT_187109	GA	3	6	62786	62791	50 %	0 %	50 %	0 %	409251133
122	NT_187109	CG	3	6	63720	63725	0 %	0 %	50 %	50 %	409251134
123	NT_187109	GC	3	6	64242	64247	0 %	0 %	50 %	50 %	409251134
124	NT_187109	GC	3	6	64830	64835	0 %	0 %	50 %	50 %	409251134
125	NT_187109	CG	3	6	64895	64900	0 %	0 %	50 %	50 %	409251134
126	NT_187109	CG	3	6	65644	65649	0 %	0 %	50 %	50 %	409251135
127	NT_187109	GC	3	6	65684	65689	0 %	0 %	50 %	50 %	409251135
128	NT_187109	GC	4	8	65840	65847	0 %	0 %	50 %	50 %	409251135
129	NT_187109	TC	3	6	65874	65879	0 %	50 %	0 %	50 %	409251135
130	NT_187109	GC	3	6	66403	66408	0 %	0 %	50 %	50 %	409251136
131	NT_187109	GT	3	6	66816	66821	0 %	50 %	50 %	0 %	409251136
132	NT_187109	CG	3	6	67194	67199	0 %	0 %	50 %	50 %	409251136
133	NT_187109	TC	3	6	67872	67877	0 %	50 %	0 %	50 %	409251137
134	NT_187109	TC	3	6	68528	68533	0 %	50 %	0 %	50 %	409251138
135	NT_187109	CG	3	6	68910	68915	0 %	0 %	50 %	50 %	409251139
136	NT_187109	GC	3	6	68996	69001	0 %	0 %	50 %	50 %	409251139
137	NT_187109	GC	3	6	69658	69663	0 %	0 %	50 %	50 %	409251139
138	NT_187109	AT	3	6	71082	71087	50 %	50 %	0 %	0 %	409251141
139	NT_187109	AT	3	6	71971	71976	50 %	50 %	0 %	0 %	409251141
140	NT_187109	GC	3	6	72783	72788	0 %	0 %	50 %	50 %	409251142
141	NT_187109	CG	3	6	72852	72857	0 %	0 %	50 %	50 %	409251142
142	NT_187109	GC	3	6	73256	73261	0 %	0 %	50 %	50 %	409251142
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.